Search
Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period.
Abstract
Analiza genetyki populacji i określenie powiązań filogenetycznych pomiędzy szczepami może być niezwykle użytecznym podejściem w określaniu rozprzestrzeniania się wzorów genetycznych różnych gatunków bakterii na potrzeby epidemiologiczne. Nie ma danych, które opisywałyby długoterminowe sytuacje epidemiologiczne powodowane przez wielolekooporne, oportunistyczne szczepy Klebsiella oxytoca metodami molekularnymi. Celem przedstawionych badań była ocena różnorodności genetycznej szczepów K. oxytoca izolowanych przez ponad 50 lat z wykorzystaniem metod genetycznych ITS-PCR i PCR MP dla dużej kolekcji szczepów pozyskiwanych od pacjentów z kilku szpitali w Polsce. Analiza filogenetyczna oparta na ITS-PCR wyodrębniła sześć odrębnych grup. Zidentyfikowano dwie główne grupy Kox i KoY, odpowiednio z czterema i dwiema podgrupami wewnątrz Kox i KoY. Typowanie z zastosowaniem metody PCR MP wykazało wyższy poziom różnorodności genetycznej. Jednak wszystkie szczepy K. oxytoca były również podzielone na sześć grup genotypowych (KoA, KoB, KoC, koD, KoE i KoF). Podsumowując, możemy stwierdzić, że metody genotypowania ITS-PCR i PCR MP są przydatne w określeniu filogenetycznych relacji genetycznych K. oxytoca.
Authors (4)
-
Stanisław Kałużewski
Cite as
Full text
full text is not available in portal
Keywords
Details
- Category:
- Articles
- Type:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Published in:
-
EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES
no. 28,
pages 1263 - 1266,
ISSN: 0934-9723 - Language:
- English
- Publication year:
- 2009
- Bibliographic description:
- Stojowska K., Krawczyk B., Kałużewski S., Kur J.: Retrospective analysis of genetic diversity of Klebsiella oxytoca isolated in Poland over a 50-year period. // EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY & INFECTIOUS DISEASES. -Vol. 28, nr. iss. 10 (2009), s.1263-1266
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 71 times
Recommended for you
PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains
- B. Krawczyk,
- J. Leibner-Ciszak,
- A. Mielech
- + 2 authors
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
- J. Leibner-Ciszak,
- A. Dobrowolska,
- B. Krawczyk
- + 2 authors
Technika PCR MP (PCR Melting Profile) - możliwości zastosowania w badaniach epidemiologicznych
- B. Krawczyk,
- J. Leibner,
- A. Samet
- + 1 authors