Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale

Justyna Leibner-Ciszak; Anita Dobrowolska; Beata Krawczyk; Aleksandra Kaszuba; Paweł Stączek

Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale

Abstract

W celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów. W przedstawionym opracowaniu wykorzystano szczepy kliniczne wyizolowane ze skóry, palców i paznokci. Za pomocą PCR MP i metody RAPD przebadano 11 izolatów T. rubrum, 40 izolatów T. interdigitale i 14 izolatów M. canis. Z zastosowaniem techniki PCR MP wyróżniono 5 typów (z 1 podtypem) charakterystycznych dla T. rubrum i 7 typów charakterystycznych dla T. interdigitale. Analiza przeprowadzona metodą RAPD ujawniła 5 typów T. rubrum i 4 typy T. interdigitale. Nie zaobserwowano zróżnicowania w przypadku izolatów M. canis. Wyniki te wskazują, że PCR MP to niezawodna metoda na zróżnicowanie wewnątrzgatunkowe T. rubrum i T. interdigitale o podobnej sile dyskryminacji jak metoda RAPD.

Authors (5)

Cite as

Full text

download paper

downloaded 13 times

Publication version: Accepted or Published Version
License: Copyright (2010 SGM)

Keywords

Details

Category:: Articles
Type:: artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
Published in:: JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY no. 59, pages 185 - 192,
ISSN: 0022-2615
Language:: English
Publication year:: 2010
Bibliographic description:: Leibner-Ciszak J., Dobrowolska A., Krawczyk B., Kaszuba A., Stączek P.: Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale// JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY. -Vol. 59, iss. 2 (2010), s.185-192
Verified by:: Gdańsk University of Technology