Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale

Justyna Leibner-Ciszak; Anita Dobrowolska; Beata Krawczyk; Aleksandra Kaszuba; Paweł Stączek

Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale

Abstract

W celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów. W przedstawionym opracowaniu wykorzystano szczepy kliniczne wyizolowane ze skóry, palców i paznokci. Za pomocą PCR MP i metody RAPD przebadano 11 izolatów T. rubrum, 40 izolatów T. interdigitale i 14 izolatów M. canis. Z zastosowaniem techniki PCR MP wyróżniono 5 typów (z 1 podtypem) charakterystycznych dla T. rubrum i 7 typów charakterystycznych dla T. interdigitale. Analiza przeprowadzona metodą RAPD ujawniła 5 typów T. rubrum i 4 typy T. interdigitale. Nie zaobserwowano zróżnicowania w przypadku izolatów M. canis. Wyniki te wskazują, że PCR MP to niezawodna metoda na zróżnicowanie wewnątrzgatunkowe T. rubrum i T. interdigitale o podobnej sile dyskryminacji jak metoda RAPD.

Authors (5)

Cite as

Full text

full text is not available in portal

full content of the article see on external site open in new tab

Keywords

Details

Category:: Articles
Type:: artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
Published in:: JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY no. 59, pages 185 - 192,
ISSN: 0022-2615
Language:: English
Publication year:: 2010
Bibliographic description:: Leibner-Ciszak J., Dobrowolska A., Krawczyk B., Kaszuba A., Stączek P.: Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale// JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY. -Vol. 59, iss. 2 (2010), s.185-192
Verified by:: Gdańsk University of Technology