Urodziła się w Słupsku (24.03.1986).
W 2005 roku ukończyła I Liceum Ogólnokształcące im. Jana II Sobieskiego w Wejherowie i rozpoczęła studia na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej. Po ich ukończeniu w 2010 rozpoczęła pracę naukową na tej uczelni, uzyskując w 2014 roku stopień doktora nauk chemicznych. Tematem jej rozprawy doktorskiej, wykonywanej pod kierunkiem prof. Marka Biziuka oraz dr Caluma Morrisona (Uniwersytet w Glasgow) było „Opracowanie charakterystyki metamfetaminy oraz jej zanieczyszczeń otrzymanych na drodze syntezy metodą EMDE pod względem składu enancjomerycznego”. W 2014  zatrudniona na stanowisko asystenta w Katedrze Chemii Analitycznej, Wydziału Chemicznego PG. Od 2015 jest zatrudniona na stanowisku adiunkta w tej samej katedrze.

Działalność naukowa Justyny Płotki-Wasylki skupiona jest na poszukiwaniu i opracowywaniu nowych metodyk analitycznych do oznaczania związków bioaktywnych na poziomie śladowym w próbkach charakteryzujących się skomplikowanym składem matrycy. Główny nurt jej zainteresowań oparty jest na badaniach związanych z bezpieczeństwem i jakością żywności pod względem zawartości amin biogennych, w tym żywności dla niemowląt, napojów alkoholowych (wino, piwo) i powiązanych produktów. Badania prowadzi zgodnie z zasadami tzw. Zielonej Chemii Analitycznej (Green Analytical Chemistry, GAC).