A novel method of Mycobacterium tuberculosis complex strain differentiation using polymorphic GC-rich gene sequences.
Abstrakt
Tuberculosis is one of the leading infectious diseases. In this work, a new genotyping method of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) complex strain is presented. 27 Mtb genomes were analyzed for the presence of length polymorphism within polymorphic GC-rich gene sequences. Four genes, Rv3345c, Rv3507, Rv0747 and Rv3511, showing variation in length depending on the Mtb strain were selected for designing primer sequences flanking variable regions for the PCR method. Identification of 16 genotypes among 27 analyzed genomes demonstrated usefulness of our genotyping method in differentiation of Mtb genomes based on sequence polymorphism in the four PGRS genes.
Cytowania
-
3
CrossRef
-
0
Web of Science
-
3
Scopus
Autor (1)
Cytuj jako
Pełna treść
pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Inne
- Typ:
- supllement, wydanie specjalne, dodatek
- Opublikowano w:
-
Acta Biochimica Polonica
nr 62,
strony 317 - 322,
ISSN: 0001-527X - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2015
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.18388/abp.2015_1037
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 133 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
PCR-Based Genotyping of Mycobacterium tuberculosis with New GC-Rich Repeated Sequences and IS6110 Inverted Repeats Used as Primers.
- R. Kotłowski,
- I. C. Shamputa,
- N. A. El Aila
- + 4 autorów
Molecular characterization of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Poland by use of multiple genetic markers
- A. Sajduda,
- J. Dziadek,
- R. Kotłowski
- + 1 autorów