prof. dr hab. Józef Kur
Employment
Publications
Filters
total: 162
Catalog Publications
-
Current status of toxoplasmosis vaccine development
PublicationToksoplazmoza, choroba wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest szeroko rozpowszechniona na całym świecie. Zarażenie tym pasożytem stanowi bardzo poważny problem medyczny i weterynaryjny, ponieważ jest przyczyną ciężkiej wrodzonej postaci choroby (tzw. toksoplazmozy wrodzonej) oraz poronień, które dotyczą zarówno ludzi jak i zwierząt domowych. Toksoplazmoza może mieć także ciężki przebieg u osób upośledzoną...
-
Cloning, expression, and purification of a recombinant cold-adapted β-galactosidase from antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b
PublicationAntarktyczny szczep, gram-ujemnych bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b, wyizolowanych z przewodu pokarmowego kryla z gatunku Thyssanoessa macrura, jest producentem wewnątrzkomórkowej zimnolubnej beta-galaktozydazy. Białko to jest homotetramerem, w którym każda z jednostek monomeru zbudowana jest z 1028 reszt aminokwasowych. Gen kodujący ten enzym został sklonowany i eksprymowany w komórkach E. coli. Następnie z zastosowaniem procedury...
-
Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences
PublicationZaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...
-
A new cold-adapted beta-D-galactosidase from the Antarctic Arthrobacter sp. 32c - gene cloning, overexpression, purification and properties
PublicationThe development of a new cold-active β-D-galactosidases and microorganisms that efficiently ferment lactose is of high biotechnological interest, particularly for lactose removal in milk and dairy products at low temperatures and for cheese whey bioremediation processes with simultaneous bio-ethanol production. In this article, we present a new β-D-galactosidase as a candidate to be applied in the above mentioned biotechnological...
-
Evaluation of immune responses in sheep induced by DNA immunization with genes encoding GRA1, GRA4, GRA6 and GRA7 antigens of Toxoplasma gondii
PublicationW niniejszej pracy oszacowano odpowiedź immunologiczną owiec szczepionych domięśniowo szczepionkami DNA zawierającymi geny kodujące cztery antygeny granul o dużej gęstości (GAR1, GRA4, GRA6 oraz GRA7) Toxoplasma gondii. Wykazano, iż wykorzystanie DNA plazmidu pGRA7 indukuje znaczący poziom przeciwciał IgG-2 anty-GRA7 oraz IFN-gammma, podczas gdy iniekcja pGRA1, pGRA4 oraz pGRA6 stymuluje odpowiedź przeciwciał IgG1 z ograniczoną...
-
A novel cold-active beta-D-galactosidase from the Paracoccus sp. 32d - gene cloning, purification and characterization
PublicationBeta-D-galactosidase (EC 3.2.1.23) catalyze the hydrolysis of terminal non-reducing beta-D-galactose residues in beta-D-galactosides. Cold-active beta-D-galactosidases have recently become a focus of attention of researchers and dairy product manufactures owing to theirs ability to: (I) eliminate of lactose from refrigerated milk for people afflicted with lactose intolerance, (II) convert lactose to glucose and galactose which...
-
Cloning and characterization of a novel cold-active glycoside hydrolase family 1 enzyme with beta-glucosidase, beta-fucosidase and beta-galactosidase activities.
PublicationBackground: Cold-active enzymes, sourced from cold-adapted organisms, are characterized by high catalytic efficiencies at low temperatures compared with their mesophilic counterparts, which have poor activity. This property makes them advantageous for biotechnology applications as it: (i) saves energy costs, (ii) shortens the times for processes operated at low temperatures, (iii) protects thermosensitive substrates or products...
-
A novel cold-active β-D-galactosidase with transglycosylation activity from the Antarctic Arthrobacter sp. 32cB - gene cloning, purification and characterization
PublicationA gene encoding a novel β-D-galactosidase from the psychrotolerant Antarctic bacterium Arthrobacter sp. 32cB was isolated, cloned and expressed in Escherichia coli. The active form of recombinant β-D-galactosidase consists of two subunits with a combined molecular weight of approximately 257 kDa. The enzyme's maximum activity towards o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside was determined as occurring at 28 °C and pH 8.0. However, it...
-
Usefulness of Toxoplasma gondii recombinant antigens (GRA1, GRA7 and SAG1) in an immunoglobulin G avidity test for the serodiagnosis of toxoplasmosis
PublicationOpisano wykorzystanie mieszanki trzech antygenów rekombinantowych (GRA1, GRA7 i SAG1) Toxoplasma gondii w serodiagnostyce toksoplazmozy z wykorzystaniem oznaczenia awidności przeciwciał klasy IgG. Zastosowana mieszanka może z powodzeniem zastąpić całkowity lizat antygenów natywnych który obecnie stosowany jest w komercyjnie dostępnych zestawach. Ponadto wykazano, że zastosowane antgeny rekombinantowe różnicują fazy choroby lepiej...
-
Use of MAG1 recombinant antigen for diagnosis of Toxoplasma gondii infection in humans
PublicationPraca opisuje klonowanie, oczyszczanie oraz zastosowanie w immunodiagnostyce toksoplazmozy antygenu rekombinantowego macierzy cyst tkankowych (MAG1) Toxoplasma gondii. Zastosowany system ekspresyjny pozwolił uzyskać dużą ilość rekombinantowego antygenu, który następnie wykorzystano w teście ELISA do wykrywania specyficzych przeciwciał anty-T. gondii klasy IgG w surowicach pacjentów chorych na toksoplazmozę. W przeprowadzonych badaniach...
-
Toxoplasma gondii: an evaluation of diagnostic value of recombinant antigens in a murine model
PublicationPraca dotyczy oceny użyteczności sześciu rekombinantowych białek antygenowych Toxoplasma gondii (GRA1, GRA6, GRA7, p35, SAG1 i SAG2) w diagnozowaniu doświadczalnej toksoplazmozy u myszy. Przeprowadzone badania pozwoliły na określenie stopnia reaktywności zastosowanych antygenów z surowicami z wczesnej i przewlekłej toksoplazmozy. W przypadku ostrej fazy choroby obserwowano silną odpowiedź humoralną na antygeny GRA7, GRA6 i p35,...
-
Toxoplasma gondii: Recombinant GRA5 antigen for detection of immunoglobulin G antibodies using enzyme-linked immunosorbent assay
PublicationW publikacji po raz pierwszy oszacowano przydatność diagnostyczną antygenu rekombinantowego GRA5 Toxoplasma gondii do serodiagnostyki toksoplazmozy u ludzi. Do celu wykorzystano pulę surowic pochodzącą od 189 pacjentów chorych na toksoplazmozę wczesną, podostrą i przewlekłą oraz od 31 pacjentów zdrowych , które testowano z wykorzystaniem metody ELISA. Specyficzne przeciwciała anty-GRA5 klasy IgG wykryto w 70,9% surowic seropozytywnych....
-
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublicationTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Molecular aspects of biogenesis of Escherichia coli Dr Fimbriae: characterization of DraB-DraE complexes
PublicationHemaglutynina Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jest fimbrialnym homopolimerem zbudowanym z podjednostek białkowych DraE kodowanych przez operon dra. Operon dra zawiera geny draB i draC, kodujące białka homologiczne do białek (białko opiekuńcze-białko kanałotwórcze) zaangażowanych w procesie biogenezy struktur polimerycznych eksprymowanych powierzchniowo. Białko DraB jest jednym z białek periplazmatycznych, należącym...
-
Serodiagnosis of Toxoplasma gondii infection in farm animals (horses, swine, and sheep) by enzyme-linked immunosorbent assay using chimeric antigens
PublicationToxoplasma gondii infects all warm-blooded animals including humans, causing serious public health problems and great economic loss in the animal husbandry. Commonly used serological tests for diagnosis of toxoplasmosis involve preparation of whole Toxoplasma lysate antigen (TLA) from tachyzoites. The production of this antigen is associated with high costs and lengthy preparation and the possibility of staff infection. There are...
-
A new Toxoplasma gondii chimeric antigen containing fragments of SAG2, GRA1, and ROP1 proteins—impact of immunodominant sequences size on its diagnostic usefulness
PublicationThis study presents the first evaluation of new Toxoplasma gondii recombinant chimeric antigens containing three immunodominant regions of SAG2, GRA1, and one of two ROP1 fragments differing in length for the serodiagnosis of human toxoplasmosis. The recombinant chimeric antigens SAG2-GRA1-ROP1L (with large fragment of ROP1, 85-396 amino acid residues) and SAG2-GRA1-ROP1S (with a small fragment of ROP1, 85-250 amino acid residues)...
-
Comparison of immune response in sheep immunized with DNA vaccine encoding Toxoplasma gondii GRA7 antigen in different adjuvant formulations
PublicationPraca przedstawia badania dotyczące odpowiedzi immunologicznej owiec immunizowanych plazmidowym DNA kodującym antygen granul GRA7 Toxoplasma gondii w trzech różnych formulacjach adjuvanta. Sześćdziesiąt owiec było szczepionych domięśniowo z DNa plazmidów. Dwanaście otrzymało liposomową formę plazmidu pVAXIgGRA7, 12 formulację z Emulsigen P plazmidu pVAXIgGRA7 1 12 formulację z Emulsigen D plazmidu pVAXIgGRA7. Wszystkie zwierzęta...
-
Induction of immune responses in sheep by vaccination with liposome-entrapped DNA complexes encoding Toxoplasma gondii MIC3 gene
PublicationToxoplasma gondii is a parasite that has been extensively studied due to its medical and veterinary importance in terminating pregnancies. Consequently, a satisfactory vaccine is required to control itsadverse effects on pregnant animals. The microneme protein, MIC3, is a major adhesion protein that binds to the surface of host cells and parasites, and is therefore a potential vaccine against T. gondii.The viability of MIC3 as...
-
Hydrophilic domain II of Escherichia coli Dr fimbriae facilitates cell invasion
PublicationStosując techniki mutagenezy ukierunkowanej oraz mikroskopii elektronowej stwierdzono, że hydrofilowa domena II białka podjednostkowego DraE fimbrii jest odpowiedzialna za inwazję komórki. Otrzymane wyniki są zgodne z interpretacją, że fenotypy fimbrii Dr wiązania i inwazji komórki HeLa mogą być oddzielone.
-
Genetic and biochemical characterization of yeasts isolated from Antarctic soil samples
PublicationThe Polish Arctowski Station is situated in the maritime Antarctic on the western shore ot' Admiralty Bay and encompasses terrestrial habitats which are not perma-nently covered by ice, in contrast to morę than 90% of the island's surface area. Over the past several decades, stud-ies exploring the soils of those habitats have revealed a considerable diversity of bacteria, filamentous fungi, and, to a lesser extent, yeasts; however,...
-
Characterisation of Escherichia coli isolates from the blood of haematological adult patients with bacteraemia: translocation from gut to blood requires the cooperation of multiple virulence factors
PublicationThe aim of the study was to investigate whether there are unique pathotypes of Escherichia coli capable of transmission from the gastrointestinal tract to the vascular bed. The study included E. coli strains isolated from clinical materials collected from 115 patients suffering from haematologic malignancies diagnosed with bacteraemia. The genotyping techniques established that 89 E. coli isolates from the blood had the same genotype...
-
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublicationPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
A surface-exposed DraD protein of uropathogenic Escherichia coli bearing Dr fimbriae may be expressed and secreted independently from DraC usher and DraE adhesin
PublicationOperon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ odpowiedzialny jest za proces bakteryjnej adhezji i inwazji. Operon dra kodujący fimbrie Dr zawiera sześć otwartych ramek odczytu - draA, draB, draC, draD, draP oraz draE. Fimbrie Dr zlokalizowane na powierzchni komórki bakteryjnej, zbudowane są z podjednostek białka DraE. Niewiele wiadomo na temat powierzchniowej ekspresji białka DraD oraz jego roli w procesie biogenezy fimbrii...
-
A study on the interaction of rhodamine B with methylthioadenosine phosphorylase protein sourced from an Antarctic soil metagenomic library.
PublicationThe presented study examines the phenomenon of the fluorescence under UV light excitation (312 nm) of E. coli cells expressing a novel metagenomic-derived putative methylthioadenosine phosphorylase gene, called rsfp, grown on LB agar supplemented with a fluorescent dye rhodamine B. For this purpose, an rsfp gene was cloned and expressed in an LMG194 E. coli strain using an arabinose promoter. The resulting RSFP protein was purified...
-
Immunological response of sheep to injections of plasmids encoding Toxoplasma gondii SAG1 and ROP1 genes
PublicationInfection with the intracellular protozoan parasite Toxo¬plasma gondii (T. gondii) causes health problems to both humans and livestock and has a large economic impact worldwide. The immune response in sheep following infection with T. gondii was evaluated using six different combinations of plasmid DNA, recombinant antigen and adjuvant. Sheep were generally vaccinated twice by intramuscular injection with plasmid DNA containing...
-
Prime-Boost Vaccination with Toxoplasma Lysate Antigen, but Not with a Mixture of Recombinant Protein Antigens, Leads to Reduction of Brain Cyst Formation in BALB/c Mice
PublicationIntroduction Infection with the ubiquitous parasite Toxoplasma gondii is a threat for immunocompro- mised patients and pregnant women and effective immune-prophylaxis is still lacking. Methods Here we tested a mixture of recombinant T . gondii antigens expressed in different develop- mental stages, i.e., SAG1, MAG1 and GRA7 (SMG), and a lysate derived from T . gondii tachyzoites (TLA) for prophylactic vaccination against cyst formation....
-
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublicationAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
-
The optimal mixture of Toxoplasma gondii recombinant antigens (GRA1, P22, ROP1) for diagnosis of ovine toxoplasmosis
PublicationToxoplasmosis, caused by Toxoplasma gondii, is the major parasitic disease affecting sheep. Infection not only results in significant reproductive losses in these animals, but has public health implications since consumption of infected meat can facilitate zoonotic transmission. Although several serological tests are currently used for diagnosis of ovine toxoplasmosis, production of reliable reagents is a constraint and therefore...
-
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
PublicationW pracy pokazano użyteczność dwóch nowych metod do typowania molekularnego Staphylococcus aureus, ADSRRS-fingerprinting (Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites) i PCR MP (PCR melting profile). Przebadano 37 szczepów Staphylococcus aureus izolowanych od pacjentów z czyracznością. Jako metodę referencyjną zastosowano REA-PFGE. Okazało się, że izolaty Staphylococcus aureus z nosa od niektórych pacjentów...
-
Application of SSB-like protein from Thermus aquaticus in multiplex PCR of human Y-STR markers identification
PublicationW tej publikacji prezentujemy zastosowanie białka SSB-podobnego Thermus aquaticus (TaqSSB) w reakcji multiplex PCR w celu identyfikacji markerów ludzkiego Y-STR. Wykorzystanie termostabilnego białka TaqSSB chroni lub redukuje tworzenie przez startery struktur dimerycznych, które powodują hamowanie hybrydyzacji starterów do badanego DNA i redukują ilość starterów dostępnych w reakcji PCR.
-
Characterization of exceptionally thermostable single-stranded DNA-binding proteins from Thermotoga maritima and Thermotoga neapolitana
PublicationBACKGROUND: In recent years, there has been an increasing interest in SSBs because they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods.RESULTS: We report the characterization of single-stranded DNA binding proteins (SSBs) from the thermophilic bacteria Thermotoga maritima (TmaSSB) and Thermotoga neapolitana (TneSSB). They are the smallest known bacterial SSB proteins, consisting of 141 and 142 amino...
-
PCR melting profile (PCR MP) - a new tool for differentiation of Candida albicans strains
PublicationPo raz pierwszy przedstawiliśmy użyteczność techniki PCR MP opartej na metodzie ligacji adaptorów (LM PCR) i obniżonej temperaturze denaturacji w cyklach PCR do wewnątrzgatunkowego różnicowania szczepów Candida albicans. Przebadaliśmy 123 szczepy Candida albicans z zastosowaniem trzech metod genotypowania: PCR MP, REA-PFGE i RAPD i uzyskaliśmy odpowiednio 27, 26 i 25 unikalnych genotypów. Zaprezentowane dane pokazały, że technika...
-
Toxoplasma gondii: Chimeric Dr fimbriae as a recombinant vaccine against toxoplasmosis
PublicationW publikacji przedstawiono protekcyjne i immunogenne właściowści chimerycznych fimbrii typu Dr zawierających sekwencje epitopowe antygenów SAG1, MAG1 oraz GRA1 Toxoplasma gondii. Uzyskane wyniki porównano z właściwościami immunogennymi antygenowych białek rekombinantowych oraz poliwalentnego antygenu natywnego. Antygeny rekombinantowe indukują silną odpowiedź immunologiczną i w 89% zapobiegają formowaniu się cyst w mózgu myszy....
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublicationWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
Structural studies of a cold-adapted dimeric Beta-D-galactosidase from Paracoccus sp. 32d
PublicationThe crystal structure of a novel dimeric [beta]-D-galactosidase from Paracoccus sp. 32d (Par[beta]DG) was solved in space group P212121 at a resolution of 2.4 Å by molecular replacement with multiple models using the BALBES software. This enzyme belongs to glycoside hydrolase family 2 (GH2), similar to the tetrameric and hexameric [beta]-D-galactosidases from Escherichia coli and Arthrobacter sp. C2-2, respectively. It is the second...
-
A new human IgG avidity test, using mixtures of recombinant antigens (rROP1, rSAG2, rGRA6), for the diagnosis of difficult-to-identify phases of toxoplasmosis
PublicationThe preliminary diagnostic utility of two mixtures of Toxoplasma gondii recombinant antigens (rROP1+rSAG2 and rROP1+rGRA6) in IgG ELISA and IgG avidity test has been evaluated. A total of 173 serum samples from patients with toxoplasmosis and seronegative people were examined. The sensitivity of IgG ELISA for rROP1+rSAG2 and rROP1+rGRA6 was 91.1% and 76.7%, respectively, while the reactivity for sera from patients where acute toxoplasmosis...
-
Characterization of a cryptic plasmid pSFKW33 from Shewanella sp. 33b
PublicationA cryptic plasmid pSFKW33 from psychrotrophic bacterium Shewanella sp. 33B, an isolate from the Gulf of Gdansk (the Baltic Sea), was sequenced and characterized. It is an 8021 bpcircular molecule with 38% GC content, which shows a distinctive nucleotide sequence without homology to other known plasmids. The nucleotide sequence analysis predicts eight open reading frames. The deduced amino acid sequence of ORF-1 shared significant...
-
Two highly thermostable paralogous single-stranded DNA-binding proteins from Thermoanaerobacter tengcongensis
PublicationThe thermophilic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis has two single-stranded DNA-binding (SSB) proteins, designated TteSSB2 and TteSSB3. In a SSB complementation assay in Escherichia coli, only TteSSB3 took over the in vivo function of EcoSSB. We have cloned the ssb genes obtained by PCR and have developed E. coli overexpression systems. The TteSSB2 and TteSSB3 consist of 153 and 150 amino acids with a calculated molecular...
-
A subset of two adherence systems, acute pro-inflammatory pap genes and invasion coding dra, fim, or sfa, increases the risk of Escherichia coli translocation to the bloodstream
PublicationAn analysis of the phylogenetic distribution and virulence genes of Escherichia coli isolates which predispose this bacteria to translocate from the urinary tract to the bloodstream is presented. One-dimensional analysis indicated that the occurrence of P fimbriae and α-hemolysin coding genes is more frequent among the E. coli which cause bacteremia. However, a two-dimensional analysis revealed that a combination of genes coding...
-
Preclusion of irreversible destruction of Dr adhesin structures by a high activation barrier for the unfolding stage of the fimbrial DraE subunit
PublicationFimbrie Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli stanowią przykład eksponowanych powierzchniowo struktur adhezyjnych podlegających biogenezie według zakonserwowanego, pośród bakterii Gram-ujemnych, systemu "chaperone-usher" ("białko opiekuńcze-zewnątrzbłonowe białko kanałowe"). Powyższe struktury adhezyjne są niezbędne w procesie specyficznej adhezji bakterii do receptorów zlokalizowanych na powierzchni docelowych komórek gospodarza....
-
New recombinant chimeric antigens, P35-MAG1, MIC1-ROP1, and MAG1-ROP1, for the serodiagnosis of human toxoplasmosis
PublicationThe aim of the study was to evaluate the usefulness of 3 chimeric Toxoplasma gondii antigens, P35-MAG1,MIC1-ROP1 andMAG1-ROP1, in the serodiagnosis of an acute toxoplasmosis in humans. Proteins were produced as fusion proteins containing His tags ends and then further purified by metal affinity chromatography. Their application for the diagnosis of recently acquired T. gondii infection was tested in IgG and IgM enzyme-linked immunosorbent...
-
Cloning, expression, and biochemical characterization of a coldactive GDSL-esterase of a Pseudomonas sp. S9 isolated from Spitsbergen island soil
PublicationAn estS9 gene, encoding an esterase of the psychrotolerant bacterium Pseudomonas sp. S9 was cloned and sequenced. The deduced sequence revealed a protein of 636 amino acid residues with a molecular mass of 69 kDa.Further amino acid sequence analysis revealed that the EstS9 enzyme contained a G-D-S-L motif centered at a catalytic serine, an N-terminal catalytic domain and a C-terminal autotransporter domain. Two recombinant E. coli...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublicationW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
A highly thermostable, homodimeric single-stranded DNA-binding protein from Deinococcus radiopugnans
PublicationWe report the identification and characterization of the single-stranded DNA-binding protein (SSB) from the mesophile and highly radiation-resistant Deinococcus radiopugnans (DrpSSB). PCR-derived DNA fragment containing the complete structural gene for DrpSSB protein was cloned and expressed in Escherichia coli. The gene consisting of an open reading frame of 900 nucleotides encodes a protein of 300 amino acids with a calculated...
-
A novel chemiluminescent immunoassay for detection of Toxoplasma gondii IgG in human sera
PublicationThis study describes Toxoplasma gondii IgG chemiluminescent immunoassay (CLIA) based on the use of a novel immunochemical reagents in the form of the conjugates of original acridinium ester (AE) labels attached to antibodies and SAG2-GRA1-ROP1L chimeric antigen and shows that this test is useful for diagnostic purposes.
-
Identification of antigen Ag43 in uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains and defining its role in the pathogenesis of urinary tract infections
PublicationUrinary tract infections (UTIs) caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC) are among the most common bacterial infectious diseases in the developed world. The urovirulence of UPEC is mainly associated with the surface-exposed fimbrial adhesins and adhesins of the autotransporter (AT) family. The best studied of theses proteins is antigen 43 (Ag43) mediating cell aggregation, adhesion and biofilm development as the causes of...
-
First report of seroprevalence of Toxoplasma gondii infection in sheep in Pomerania, northern Poland
PublicationIntroduction and objective. Toxoplasmosis is parasitic disease which has economic relevance for both veterinary and human medicine. In sheep, toxoplasmosis is a major cause of abortion and can thus cause reproductive problems. The current study aimed to determine the occurrence of anti-Toxoplasma gondii IgG antibodies in sheep from 13 districts of northern Poland and thereby obtain actual data about T. gondii seroprevalence in...
-
Principles and applications of Ligation Mediated PCR methods for DNA-based typing of microbial organisms
PublicationA significant number of DNA-based techniques has been introduced into the field of microorganisms’ characterization and taxonomy. These genomic fingerprinting methods were developed to detect DNA sequence polymorphisms by using general principles, such as restriction endonuclease analysis, molecular hybridization, and PCR amplification. In recent years, some alternative techniques based on ligation of oligonucleotide adapters before...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria Desulfotalea psychrophila, Flavobacterium psychrophilum, Psychrobacter arcticus, Psychrobacter cryohalolentis, Psychromonas ingrahamii, Psychroflexus torquis, and Photobacterium profundum
PublicationBackground: Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) play essential roles in DNA replication, recombination and repair in Bacteria, Archaea and Eukarya. In recent years, there has been an increasing interest in SSBs, since they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods. Results: We report the characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria Desulfotalea...
-
Intra-operative biopsy in chronic sinusitis detects pathogenic Escherichia coli that carry fimG/H, fyuA and agn43 genes coding biofilm formation
PublicationThe aim of this study was to investigate whether or not surgical biopsy of sinus tissue in chronic sinusitis, not responsive to treatment, would detect E. coli. We intended to evaluate E. coli virulence genes, therefore dispute the causal role of such an unusual microorganism in chronic sinusitis, as well as consider effective pathogen-targeted therapy. Patients with E. coli isolated by intra-operative puncture biopsy were included...
seen 2414 times