Year 2006

• Remote task submission and publishing in BeesyCluster: security and efficiency of Web Service interface

  Publication

  • P. Czarnul
  • M. Bajor
  • M. Frączak
  • A. Banaszczyk
  • M. Fiszer
  • K. Ramczykowska

  - Year 2006

  Prezentujemy nowy system BeesyCluster, który stanowi łatwy w użyciu portal dostępowy do rozszerzalnej sieci usług wdrożonych i opublikowanych na klastrach/komputerach PC z wirtualnymi płatnościami za wykorzystanie usług. Administratorzy/użytkownicy mogą dołączać klastry/komputery PC dostępne poprzez SSH kliknięciem myszy bez konieczności dalszej konfiguracji na klastrze/komputerze PC udostępniającego. Ponadto, użytkownicy mogą...

• System informacji przestrzennej do analizy, wizualizacji i zdalnego udostępniania danych o infrastrukturach krytycznych

  Publication

  • K. Bikonis
  • P. Czarnul
  • Z. Łubniewski
  • A. Partyka
  • A. Stepnowski
  • H. Krawczyk
  • A. Ruciński

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2006

  Ochrona ludności, jak i infrastruktur krytycznych państwa przed różnego rodzaju zagrożeniami w postaci ataków terrorystycznych, katastrof naturalnych, itp. wymaga w obecnej dobie podejmowania zdecydowanych i skutecznych działań. Powstajace zaawansowane narzędzia z dziedziny technologii informacyjnych i komunikacyjnych coraz skuteczniej pomagają przewidywać możliwość wystąpienia tych zagrożeń oraz wspomagać podejmowanie działań...

• Wydajne obliczenia na klastrach i gridach

  Publication

  • P. Czarnul

  - Year 2006

  Niniejszy rozdział omawia standardy, technologie jak równieżtechniki zrównoleglania wykorzystywane w skalowalnych obliczeniach na klastrach i gridach. Autor przedstawia również tendencje rozwojowe tej dziedziny wskazując problemy i potencjalne ich rozwiązania. W szczególności rozdział odnosi się do równoległych aplikacji uruchamianych na dużych klastrach obliczeniowych oraz technologii pozwalających na kontrolowane współdzieleniezasobów...

Year 2005

• Efektywne i bezpieczne zarządzanie i przechowywanie danych o użytkownikach, usługach i klastrach w systemie BeesyCluster

  Publication

  • P. Czarnul
  • P. Buszkiewicz
  • M. Klawikowski
  • M. Bajor
  • A. Banaszczyk
  • M. Fiszer
  • M. Frączak
  • J. Rakiej
  • K. Ramczykowska
  • K. Suchcicki

  - Year 2005

  Praca omawia problem bezpiecznego, niezawodnego i wydajnego dostępu do danych w ramach systemu BeesyCluster, który stanowi portal dostępowy do rozproszonej sieci klastrów oraz komputerów PC. BeesyCluster umożliwia użytkownikom dostęp do wielu różnych klastrów poprzez WWW/Web Services, jak również zdalne uruchamianie aplikacji z uwzględnieniem systemów LSF oraz PBS, wypożyczanie usług innym użytkownikom i wspomaga pracę grupową....

• New user-guided and ckpt-based checkpointing libraries for parallel MPI applications

  Publication

  • P. Czarnul
  • M. Frączak

  - Year 2005

  Praca prezentuje szczególy projektowe i implementacyjne jak również wyniki wydajnościowe dwóch nowych bibliotek checkpointingu opracowanych przez autorów dla równoległych aplikacji MPI. Pierwsz biblioteka, tzw. user-guided wymaga od programisty dostarczenia funkcji pakujących i rozpakowujących stan procesu, ale dostarcza łatwego w użyciu API z wykorzystaniem stałych MPI. Wykorzystuje funkcje I/O MPI-2 lub dedykowany proces master...

• Non-linear electrical properties of myocardium in computer simulation

  Publication

  • K. Grzęda
  • P. Czarnul
  • A. Z. Nowakowski

  - Year 2005

  Pomiar impedancji elektrycznej jest obiecującą metodą monitorowania stanu mięśnia sercowego, szczególnie podczas niedokrwienia. Typową metodą pomiaru jest rejestrowanie odpowiedzi-napięcia na pobudzenie prądowe. Odpowiedź jest często aproksymowana jako liniowa względem pobudzenia. Artykuł jest poświęcony oszacowaniu rzędu wielkości nieliniowych komponentów w odpowiedzi.

• Portable parallel simulator using MPI for 2D and 3D domains: design and performance testing

  Publication

  • P. Czarnul
  • K. Grzęda

  - Year 2005

  W artykule prezentujemy szczegóły projektowo-implementacyjne naszego modularnego kodu symulacyjnego z wykorzystaniem MPI, w tym nakładaniem obliczeń i komunikacji. Podkreślamy modularność naszej implementacji pozwalającą na łatwą adaptację kodu dla innych zasotosowań. Prezentujemy związek pomiędzy przyspieszeniem obliczeń, rozmiarem i kształtami trójwymiarowych domen z różnymi stosunkami liczby węzłów aktualizowanych przez procesor...

Year 2004

• Analysis of non-linear properties of cardiomyocyte cellular membranes.

  Publication

  • K. Grzęda
  • A. Z. Nowakowski
  • P. Czarnul

  - Year 2004

  Nieliniowe właściwości błon komórkowych kardiomiocytów są dotychczas słabo poznane. W pracy zamodelowano błonę komórkową przy pomocy modelu Beelera-Reutera w modyfikacji Drouharda-Roberge. Przeprowadzono symulacje z użyciem pobudzenia napięciowego o częstotliwości 1 lub 100 kHz i wartości skutecznej 1 lub 10 mV. Prądy płynące przez błonę rozpatrywano jako odpowiedź. Stwierdzono odpowiedź na częstotliwości podstawowej oraz jej drugiej...

• BeesyCluster: Architektura systemu dostepu do sieci klastrów przez WWW/Web Services.

  Publication

  • P. Czarnul
  • M. Bajor
  • A. Banaszczyk
  • P. Buszkiewicz
  • M. Fiszer
  • M. Fraczak
  • M. Klawikowski
  • J. Rakiej
  • K. Ramczykowska
  • K. Suchcicki

  - Year 2004

  Niniejsza praca prezentuje system BeesyCluster, który integruje rozproszone klastry poprzez łatwy w użyciu interfejs WWW oraz Web Services. W wersji pilotowej system uruchomiony zostanie w charakterze portalu dostępowego do klastrów gdańskiej sieci TASK wykorzystując 128-procesorowy klaster galera oraz 256-procesorowy 64-bitowy klaster holk jak również laboratoria badawcze Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. System, oparty o technologię...

• Język opisu usług sieciowych WSDL.

  Publication

  • P. Czarnul

  - Year 2004

  Niniejszy rozdział opisuje WSDL - język opisu usług sieciowych. Rozdział zawiera wprowadzenie w tematykę usług sieciowych (Web Services), również w odniesieniu do innych technologii przetwarzania rozproszonego jak CORBA, RMI. W szczególności przedstawiono podobieństwa i różnice w opisie metod udostępnianych do wywołania klientowi w WSDL oraz IDL. Elementy standardu WSDL omówiono na przykładzie usługi sieciowej do zdalnego uruchomienia...

• Parallel simulations of electrophysiological phenomena in myocardium on large 32 and 64-bit Linux clusters.

  Publication

  • P. Czarnul
  • K. Grzęda

  - Year 2004

  W pracy podjęto badania i przeprowadzono symulacje zjawisk elektrofizjologicznych w mięśniu sercowym z wykorzystaniem wytworzonego w tym celu oprogramowania równoległego opartego na MPI. Zaimplementowano i zbadano ulepszenia kodu prowadzące do uzyskania dobrej skalowalności oraz przeprowadzono testy wydajności na najnowszych 32 i 64-bitowych klastrach linuksowych. Praca stanowi próbę równoległej implementacji znanego podejścia...

• Rozproszone usługi obliczeniowe na klastrach TASK z dostępem przez WWW i Web Services.

  Publication

  • P. Czarnul
  • M. Bajor
  • A. Banaszczyk
  • P. Buszkiewicz
  • M. Fiszer
  • M. Frączak
  • M. Klawikowski
  • J. Rakiej
  • K. Ramczykowska
  • K. Suchcicki

  - Year 2004

  Artykuł omawia architekturę i doświadczenia wstępnych faz specyfikacji wymagań i analizy projektu, który umożliwi zdalne wykorzystanie równoległych klastrów i/lub superkomputerów sieci TASK przez użytkowników z rozproszonych geograficznie lokalizacji. System zapewni dotychczasowym i nowym użytkownikom klastrów i superkomputerów TASK zdalne uruchamianie i zarządzanie aplikacjami, bibliotekami równoległymi i sekwencyjnymi poprzez...

• Towards Easy-to-Use Checkpointing of MPI Applications within CLUSTERIX.

  Publication

  • P. Czarnul
  • A. Urbaniak
  • M. Frączak

  - Year 2004

  W literaturze wymienia się wiele bibliotek/systemów zarówno poziomu jądra jak i użytkownika, które wspomagają zapisywanie i odtwarzanie stanu procesów. W odniesieniu do aplikacji równoległych, jest to jednak zadanie cały czas trudne. Praca prezentuje nasze podejście do zapisywania/odtwarzania stanu aplikacji MPI wspomagane przez programistę, które wykorzystane będzie w środowisku projektu CLUSTERIX tj. zintegrowanej grupie klastrów...

• Towards Efficient Parallel Image Processing on Cluster Grids Using GIMP.

  Publication

  • P. Czarnul
  • A. Ciereszko
  • M. Frączak

  - Year 2004

  Ze względu na fakt, iż niewielu użytkowników posiada wiedzę niezbędną do wykorzystania niskopoziomowych bibliotek programowania równoległego w celu przyspieszenia działania programów operujących na obrazach, proponujemy plugin do znanej aplikacji GIMP, który umożliwia potokowe wykonanie szeregu filtrów na obrazach załadowanych przez plugin. Prezentujemy szczegóły implementacyjne, scenariusze testowe i wyniki na klastrach, potencjalnie...

Year 2003

• Architecture and implementation of distributed data storage using Web Services, CORBA i PVM. W: Proceedings. PPAM 2003. Parallel Processing and Applied Mathematics. Fifth International Conference. Częstochowa, 7-10 September 2003. Architektura i implementacja rozproszonego zarządzania danymi używając systemów Web Services, CORBA i PVN.

  Publication

  • P. Czarnul

  - LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE - Year 2003

  Proponujemy architekturę i jej implementację PVMWeb Cluster I/O przeznaczoną do rozproszonego zarządzania danymi. Dane zapisywane są w systemie Web Services z geograficznie odległych klientów lub przez wywołania CORBA z wewnątrz danego klastra co oferuje lepsze osiągi.

• Dynamic load balancing with data partitioning for efficient paralel compu-ting.**2003, 227 s. 214 rys. 9 tab. bibliogr. 160 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /14.01.2003/ Wydz. ETI Promotor: prof. dr hab. inż. H. Krawczyk. Dynamiczne równoważenie obciążenia z podziałem danych dla efektywnego prze-twarzania równoległego.

  Publication

  • P. Czarnul

  - Year 2003

  ...

• Programming, tunning and automatic parallelization of irregular divide and conquer applications in DAMPVM/DAC.

  Publication

  • P. Czarnul

  - INTERNATIONAL JOURNAL OF HIGH PERFORMANCE COMPUTING APPLICATIONS - Year 2003

  Artykuł prezentuje nowy, obiektowo zorientowany wzorzec programowy DAMPVM/DAC, który zimplementowany został z użyciem systemu DAMPVM i umożliwia automatyczny podział nieregularnych aplikacji "Dziel i zwyciężaj" (DAC) w czasie ich działania.

• PVM Web Cluster: integration of PVM clusters using Web services and CORBA.

  Publication

  • P. Czarnul

  - LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE - Year 2003

  Proponujemy nową architekturę i jej implementację PVM Web Cluster, która umożliwia łatwe zrównoleglanie wykonania zadań PVM zarówno na geograficznie rozproszone klastry PVM jak i wewnątrz nich. Uruchamianie zadań jest wykonywane poprzez wywołanie usługi sieciowej (Web service), która negocjuje najlepszy klaster (klastry) dla danego zadania i komunikuje się z klastrami za pomocą standardu CORBA.

Year 2002

• Development and tuning of irregular divide-and-conquer applications in DAMPVM/DAC

  Publication

  • P. Czarnul

  - Year 2002

  This work presents implementations and tuning experiences with parallel irregular applications developed using the object oriented framework DAM-PVM/DAC. It is implemented on top of DAMPVM and provides automatic partitioning of irregular divide-and-conquer (DAC) applications at runtime and dynamic mapping to processors taking into account their speeds and even loads by other user processes. New implementations of parallel applications...

  Full text to download in external service

• Mixed electromagnetic - circuits modeling and parallelization for rigorouscharacterization of cosite interference in wireless communication channels. W: UGC 2002 Homepage [online]. Department of Defense High Performance Com- puting Modernization Program. Users Group Conference 2002. Austin, Texas, USA. June 10-14, 2002. [Dostęp: 15 grudnia**2002]. Dostępny w World Wide Web: http://www.hpcmo.hpc.mil/Htdocs/UGC/UGC02/paper/[45 slajdów]. Modelowanie układów elektromagnetycznych i zrównoleglanie w celu określenia wzajemnych oddziaływań w bezprzewodowych kanałach komunikacyjnych.

  Publication

  • C. D. Sarris
  • P. Czarnul

  - Year 2002

  Równoległe działanie sąsiadujące modułów nadawczo-odbiorczych typowo prowa-dzi do efektów ubocznych z powodu wzajemnych oddziaływań, które obniżają pa-rametry sieci. W celu scharakteryzowania takich efektów, zaprezentowano roz-wiązanie równań Maxwella w dziedzinie czasu z modelowaniem efektów nielinio-wych.