Filters
total: 941
-
Catalog
Search results for: computation
-
Explicit solvent repulsive scaling replica exchange molecular dynamics ( RS‐REMD ) in molecular modeling of protein‐glycosaminoglycan complexes
PublicationGlycosaminoglcyans (GAGs), linear anionic periodic polysaccharides, are crucial for many biologically relevant functions in the extracellular matrix. By interacting with proteins GAGs mediate processes such as cancer development, cell proliferation and the onset of neurodegenerative diseases. Despite this eminent importance of GAGs, they still represent a limited focus for the computational community in comparison to other classes...
-
A coarse‐grained approach to NMR ‐data‐assisted modeling of protein structures
PublicationThe ESCASA algorithm for analytical estimation of proton positions from coarse-grained geometry developed in our recent work has been implemented in modeling protein structures with the highly coarse-grained UNRES model of polypeptide chains (two sites per residue) and nuclear magnetic resonance (NMR) data. A penalty function with the shape of intersecting gorges was applied to treat ambiguous distance restraints, which automatically...
-
On the joint time-frequency characteristics of chemical oscillations
PublicationZaprezentowano rezultaty analizy czasowo-częstotliwościowej rejestrów potencjałowych oscylacyjnej reakcji Biełousowa-Żabotyńskiego (BŻ). Wybraną reprezentację czasowo-częstotliwościową w postaci algorytmu STFT zastosowano do analizy typowych przebiegów reakcji BŻ, prowadzonej w układzie zamkniętym. Zaprezentowano spektrogramy STFT ukazujące czasowo-częstotliwościową strukturę oscylacji regularnych, mieszanych i chaotycznych. Na...
-
International Conference on Computational Semiotics for Games and New Media
Conferences -
International Conference on Computational Intelligence, Robotics and Autonomous Systems
Conferences -
European Conference on Computational Learning Theory (Now in COLT)
Conferences -
International Conference on Intelligent Text Processing and Computational Linguistics
Conferences -
IEEE Conference on Cognitive and Computational Aspects of Situation Management
Conferences -
International Conference on Practical Applications of Computational Biology & Bioinformatics
Conferences -
IEEE Workshop on Computational Intelligence in Vehicles and Vehicular Systems
Conferences -
International Conference on Computational Intelligence for Modelling, Control and Automation
Conferences -
International Meeting on High Performance Computing for Computational Science
Conferences -
IEEE Symposium on Computational Intelligence in Image and Signal Processing
Conferences -
Kyoto International Conference on Computational Geometry and Graph Theory
Conferences -
IEEE Symposium on Computational Intelligence for Security and Defence Applications
Conferences -
International Conference on Computational Collective Intelligence (International Conference on Computational Collective Intelligence: Semantic Web, Social Networks and Multiagent Systems)
Conferences -
IEEE Symposium on Computational Intelligence in Multi-Criteria Decision-Making
Conferences -
IEEE Workshop on Computational Intelligence in Biometrics: Theory, Algorithms, and Applications
Conferences -
IEEE Symposium on Computational intelligence for Multimedia Signal and Vision Processing
Conferences -
IEEE International Conference on Computational Intelligence for Measurement Systems and Applications
Conferences -
Conference on Learning Theory (Annual Conference on Computational Learning Theory)
Conferences -
Conference on Games (IEEE Symposium on Computational Intelligence and Games CIG)
Conferences -
MOLECULAR SIMULATIONS OF NEOCARZINOSTATIN CHROMOPHORE RELEASE MECHANISM
Publication -
Construction of highly stable parallel two-step Runge-Kutta methods for delay differential equations
PublicationW pracy pokazano, że każda A-stabilna dwukrokowa metoda Rungego-Kutty dla równań różniczkowych zwyczajnych rzędu p1 i rzędu etapowego q=p1 może być uogólniona do P-stabilnej metody dla równań różniczkowych z opóźnieniem zbieżnej jednostajnie z rzędem p=p1.
-
Digital Humanities – Challenges for Humanities in the Digital Society Era – Foreword
Publication -
Initializing the EM Algorithm for Univariate Gaussian, Multi-Component, Heteroscedastic Mixture Models by Dynamic Programming Partitions
Publication -
Derivation of continuous explicit two-step Runge-Kutta methods oforder three
PublicationW pracy podana jest konstrukcja ciągłych rozszerzeń dla nowych reprezentacji dwukrokowych metod Rungego-Kutty rzędu trzeciego. Podane zostały metody oceny błędu lokalnego metody oraz opisany został sposób implementacji tych metod dla zmiennego kroku. Przeprowadzono szereg eksperymentów numerycznych pokazujących ich efektywność i konkurencyjność dla programu dde23 z Matlabu.
-
Cooperative mobile guards in grids
PublicationPraca dotyczy problemu strzeżenia dwuwymiarowych krat ortogonalnych, przy założeniu, że obszar widoczności strażnika obejmuje jedną ulicę oraz wszystkie ulice ją przecinające. Rozważano wariant straży słabo współpracujących, w którym dodatkowo każdy strażnik musi widzieć przynajmniej jednego innego strażnika. Podano dowód NP-trudności problemu optymalizacyjnego w przypadku ogólnym, algorytm dokładny o złożoności O(n log n) dla...
-
Toward a universal Embedded-Atom Method: II. A set of transferable denisty and dimmer referenced embedding energy functions for all elements of the periodic table as tool for removing two gauge degrees of freedom in EAM potentials
PublicationZestaw kluczowych właściwości homodwuatomowych cząsteczek o Z ≤ 103 (równowagowa odległość między atomami re, energia dysocjacji DO, Liczba falowa drgań ωe) zostały zestawione na bazie dostępnych danych eksperymantalnych oraz obliczeń za pomocą teorii funkcjonałów gęstości elektronowej B3LYP/SBKJC.
-
Resolving the role of podoplanin in the motility of papillary thyroid carcinoma-derived cells using RNA sequencing
Publication -
A Review: Structural Shape and Stress Control Techniques and their Applications
PublicationThis review article presents prior studies on controlling shape and stress in flexible structures. The study offers a comprehensive survey of literature concerning the adjustment and regulation of shape, stress, or both in structures and emphasizes such control’s importance. The control of systems is classified into three primary classes: nodal movement control, axial force control, and controlling the two classes concurrently....
-
Differential equations with integral boundary conditions
PublicationStosuje się metodę iteracji monotonicznych opartą na dolnym i górnym rozwiązaniu. Przy jednostronnym warunku Lipschitza uzyskano pewne wyniki dotyczące rozwiązań zwyczajnych równań różniczkowych z całkowym warunkiem brzegowym. Sformułowano warunki dostateczne na istnienie jedynego rozwiązania (lub rozwiązań ekstremalnych) w pewnym segmencie. Podano przykłady ilustrujące przyjęte założenia.
-
Existence of solutions of boundary value problems for differential equations with delayed arguments.
PublicationPodane zostały warunki dostateczne na istnienie i jednoznaczność rozwiązań problemów brzegowych dla równań różniczkowych z odchylonymi argumentami.Problem istnienia ekstremalnych rozwiązań również był przedmiotem badań. Podano konstrukcję monotonicznych iteracji i pokazano, że iteracje te są zbieżne do szukanego rozwiązania. Praca zawiera przykłady które ilustrują ogólną teorię.
-
Monotone and numerical analytic- methods for differential equations.
PublicationPraca dotyczy problemu różniczkowo-całkowego (typu Fredholma) z ogólnym warunkiem początkowo-brzegowo-całkowym. W pierwszej części pracy, stosując metodę iteracji monotonicznych, sformułowano warunki dostateczne które gwarantują, że dyskutowany problem ma rozwiązanie ekstremalne w zbiorze generowanym przez dolne i górne rozwiązania. Rozważania teoretyczne poparto przykładem i dyskusją. W drugiej części pracy zastosowano metodę...
-
Waveform relaxation methods for periodic differential-functional systems.
PublicationPrzedmiotem badań były układy różniczkowo-funkcyjne z warunkiem okresowym.Prawą stronę układu z argumentem funkcyjnym przedstawiono w nowej formie wygodnej do stosowania metody relaksacyjnej ''waveform''. Podano warunki dostateczne (dyskutowano dwa typy takich warunków) przy których wyjściowy problem ma rozwiązanie i odpowiednie ciągi relaksacyjne są do niego zbieżne. Dyskutowano w szczegółach przedstawiony problem numeryczny...
-
Applications of water molecules for analysis of macromolecule properties
Publication -
Mechanism of recognition of parallel G-quadruplexes by DEAH/RHAU helicase DHX36 explored by molecular dynamics simulations
Publication -
Application of Structural Control Systems for the Cables of Cable-Stayed Bridges: State-of-the-Art and State-of-the-Practice
PublicationStay cables are one of the key elements of cable-stayed bridges and are characterized by lightweight, low inherent damping, and high flexibility. They are continuously subjected to small-to large-amplitude vibrations due to various types of dynamic loads that may, in the long term, cause fatigue and fracture problems for the cable system, and may eventually compromise the safety of cable-stayed bridges. Thus, several countermeasures...
-
A Comparison between MD and EXAFS extracted Structural Data for TernaryRbBr(1-x)Ix.
PublicationStrukturę trójskładnikowych soli poddano analizie za pomocą metody EXAFS i symulacji M-D. Przedyskutowano przydatność używanego w symulacjach potencjału oddziaływań międzyatomowych.
-
Analytical predictions for the buckling of a nanoplate subjected to non-uniform compression based on the four-variable plate theory
PublicationIn the present study, the buckling analysis of the rectangular nanoplate under biaxial non-uniform compression using the modified couple stress continuum theory with various boundary conditions has been considered. The simplified first order shear deformation theory (S-FSDT) has been employed and the governing differential equations have been obtained using the Hamilton’s principle. An analytical approach has been applied to obtain...
-
Review of Segmentation Methods for Coastline Detection in SAR Images
PublicationSynthetic aperture radar (SAR) images acquired by airborne sensors or remote sensing satellites contain the necessary information that can be used to investigate various objects of interest on the surface of the Earth, including coastlines. The coastal zone is of great economic importance and is also very densely populated. The intensive and increasing use of coasts and changes of coastlines motivate researchers to try to assess...
-
A Comprehensive Review: Applications of the Kozeny–Carman Model in Engineering with Permeability Dynamics
PublicationIn this review article, we investigate the dynamic nature of the Kozeny–Carman Model concerning permeability and its application in engineering contexts. Providing insights into the changing dynamics of permeability within mining, petroleum, and geotechnical engineering, among other engineering applications. While some are complex and require additional modifcations to be applicable, others are simple and still function in specifc...
-
Quasi-solutions for generalized second order differential equations with deviating arguments
PublicationThis paper deal with boundary value problems for generalized second order differential equations with deviating arguments. Existence of quasi-solutions and solutions are proved by monotone iterative method. Examples with numerical results are added.
-
On the Buckling Response of Axially Pressurized Nanotubes Based on a Novel Nonlocal Beam Theory
PublicationIn the present study, the buckling analysis of single-walled carbon nanotubes (SWCNT) on the basis of a new refined beam theory is analyzed. The SWCNT is modeled as an elastic beam subjected to unidirectional compressive loads. To achieve this aim, the new proposed beam theory has only one unknown variable which leads to one equation similar to Euler beam theory and is also free from any shear correction factors. The equilibrium...
-
Buckling Analysis of a Micro Composite Plate with Nano Coating Based on the Modified Couple Stress Theory
PublicationThe present study investigates the buckling of a thick sandwich plate under the biaxial non-uniform compression using the modified couple stress theory with various boundary conditions. For this purpose, the top and bottom faces are orthotropic graphene sheets and for the central core the isotropic soft materials are investigated. The simplified first order shear deformation theory (S-FSDT) is employed and the governing differential...
-
Differential Quadrature Method for Dynamic Buckling of Graphene Sheet Coupled by a Viscoelastic Medium Using Neperian Frequency Based on Nonlocal Elasticity Theory
PublicationIn the present study, the dynamic buckling of the graphene sheet coupled by a viscoelastic matrix was studied. In light of the simplicity of Eringen's non-local continuum theory to considering the nanoscale influences, this theory was employed. Equations of motion and boundary conditions were obtained using Mindlin plate theory by taking nonlinear strains of von Kármán and Hamilton's principle into account. On the other hand, a...
-
Toward mechanosynthesis of diamondoid structures: V. Silicon as the material of choice for preliminary implementation of intermediate generation of nano-machine systems
PublicationStosując ostatnio wprowadzony przez Drexlera ''moduł skalowany stałą sieciową'' KLM, porównano dwa potencjalne nano-materiały, krzem i diament. Szczegółowe porównanie właściwości fizycznych i chemicznych wykazuje, że krzem może być rozważany jako materiał z wyboru dla pierwotnej implementacji pośredniej generacji nano-systemów.
-
Towards mechanosynthesis of diamondoid structures: iv. The strategy for preliminary implementation of elenbogen's ''mater as software'' concept
PublicationOpublikowana wcześniej (Molecular Electronics and Molecular Electronic Devices, Vol. 1, Chap. 2, CRC Press, Inc. 1993, pp. 31-83) strategia budowy molekularnych urządzeń ulektronicznych w oparciu o polisilany jest rozszerzona w kierunku koncepcji Ellenbogena ''mater as software'' poprzez rozważenie użycia zamkniętej jednościennej nanorórki jako ostrza STM w celu umożliwienia manipulacji cząsteczkami sililenu.
-
THE PERFORMANCE OF SELECTED AB INITIO METHODS IN ESTIMATING ELECTRON BINDING ENERGIES OF SUPERHALOGEN ANIONS
Publication -
From the Dynamic Lattice Liquid Algorithm to the Dedicated Parallel Computer – mDLL Machine
Publication