Search
Search results for: LINIOWO SKALUJĄCE SIĘ OBLICZENIA DFT
-
Large-scale DFT calculations in implicit solvent-A case study on the T4 lysozyme L99A/M102Q protein
PublicationW ostatnich latach zaproponowano szereg modeli typu implicit solvent, ktore bazują na bezpośrednim rozwiązaniu niejednorodnego równania Poissona w przestrzeni rzeczywistej. Modele te charakteryzują się elegancją, ponieważ wnęka, w której umieszczona jest molekuła substancji rozpuszczanej zdefiniowana jest bezpośrednio w funkcji gęstości elektronowej, a rozkład ładunku jest w sposób samouzgodniony polaryzowany dzięki reakcji dielektryka,...
-
Radix-4 dft butterfly realization with the use of the modified quadratic residue number system
PublicationW pracy przedstawiono algorytm realizacji mnożenia zespolonego z użyciem zmodyfikowanego kwadratowego zmodyfikowanego systemu liczbowego (mqrns) oraz jego zastosowanie do wykonania obliczenia motylkowego dft dla podstawy 4. pokazano też wstępne rezultaty implementacji w układzie xilinx fpga.
-
Radix-4 dft butterfly realization with the use of the modified quadratic residue number system
PublicationW pracy zaprezentowano projektowanie i realizację obliczenia motylkowego dft dla podstawy 4 z użyciem zespolonego systemu resztowego (CRNS) i zmodyfikowanego kwadratowego systemu resztowego (MQRNS). System MQRNS oprócz własności dekompozycyjnych pozwala na realizację mnożenia zespolonego przy zastosowaniu trzech mnożeń rzeczywistych. Przedstawiono konwertery wejściowy CRNS/MQRNS i wyjściowy MQRNS/CRNS, mnożenie zespolone w MQRNS,...
-
Chemically Selective Alternatives to Photoferroelectrics for Polarization-Enhanced Photocatalysis: The Untapped Potential of Hybrid Inorganic Nanotubes
PublicationLinear-scaling density functional theory simulation of methylated imogolite nanotubes (NTs) elucidates the interplay between wall-polarization, bands separation, charge-transfer excitation, and tunable electrostatics inside and outside the NT-cavity. The results suggest that integration of polarization-enhanced selective photocatalysis and chemical separation into one overall dipole-free material should be possible.
-
Arbutin: Isolation, X-ray structure and computional studies
PublicationArbutin, an active component originated from Serratula quinquefolia for skin-whitening use and treating skin related allergic inflammation, was characterized by microanalysis, FTIR, UV-Vis, multinuclear NMR spectroscopy, and single crystal X-ray diffraction method. The geometries of the studied compound were optimized in singlet states using the density functional theory (DFT) method with B3LYP functional. Electronic spectra were...
-
DFT and NBO theoretical study of protonation of tri-tert-butoxysilanethiol and its anion
PublicationWykonano obliczenia kwantowo-chemiczne metodą DFT dla tri-tert-butoksysilanotiolu oraz jego protonowanych i deprotonowanych form, zarówno na atomie tlenu jak i siarki. Przeanalizowano bilans energetyczny dla protonowania anionu w próżni i w fazie wodnej (stosując model IPCM). Zaobserwowano skrócenie wiązania Si-S w wyniku protonowania na atomie tlenu. Zmiany długości wiązań Si-O i Si-S zostały zinterpretowane w oparciu o analizę...
-
Theoretical pKa prediction of O-phosphoserine in aqueous solution
PublicationSprawdzono zdolność modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM) do przewidywania wartości pKa w roztworze wodnym dla O-fosfoseryny (P-Ser). Obliczenia przeprowadzono w ramach teorii funkcjonału gęstości (DFT) przy użyciu funkcjonałów B3LYP i M06-2X oraz baz 6-31+G(d) and 6-31+G(d,p). Obliczenia na poziomie B3LYP/6-31+G(d,p) przy użyciu modelu solwatacji SMD zapewniają doskonałą zgodność z doświadczeniem, pod warunkiem uwzględnienia...
-
Synthesis, spectroscopy and computational studies of some biologically important hydroxyhaloquinolines and their novel derivatives
PublicationA series crystalline compounds of methyl and phosphinyl derivatives of 2-methylquinolin-8-ol (1a) and related 5,7-dichloro-2-methylquinolin-8-ol (1b) were quantitatively prepared and characterized by microanalysis, IR, UV-vis and multinuclear NMR spectroscopy. Five of them have been characterized by single crystal X-ray diffraction method. The known compounds, 8-methoxy-2-methylquinoline (2a) and 8-methoxyquinoline (2d), were synthesised...
-
Conformational analysis of N-isopropylbenzohydroxamic acids:Crystal structure, DFT and NMR studies
PublicationCelem pracy było znalezienie różnic strukturalnych dwóch wybranych kwasów N-izopropylobenzhydroksamowych, które rzutują na ich zaobserwowaną wcześniej zróżnicowaną reaktywność wobec odczynników elektrofilowych i porównanie ich budowy z budową znanych kwasów N-metylobenzhydroksamowych. Na podstawie analizy rentgenostrukturalnej monokryształu, obliczeń kwantowo-mechanicznych metodami ab initio oraz DFT w fazie gazowej oraz wyników...
-
Electronic structure and charge distribution in DyBa2Cu3O7: The ab initio approach
PublicationW pracy wykonano obliczenia kwantowomechaniczne struktury elektronowej nadprzewodzącego materiału DyBa2Cu3O7 (Dy123) metodą FP-LAPW (full potential - linearized augmented plane wave) w ramach formalizmu DFT (density functional theory) stosując przybliżenie GGA (generalized gradient approximation). Ze względu na silne oddziaływania korelacyjne elektronów 4f w atomie Dy zastosowano dodatkowo poprawkę kulombowską U w ramach modelu...
-
Theoretical study of the structure, energetics and vibrational frequencies of water-acetone and water-2-butanone complexes
PublicationKompleksy acetonu i 2-butanonu z 0-2 cząsteczkami wody połączonymi wiązaniem wodorowym z tlenem karbonylowym zbadano z wykorzystaniem teorii funkcjonału gęstości (DFT) na poziomie B3LYP/6-311++G(d,p). Obliczenia w fazie gazowej uzupełniono o optymalizacje w otoczeniu rozpuszczalnika, symulowanego za pomocą modelu polaryzowalnego kontinuum (PCM). Częstości drgań oscylacyjnych otrzymane na podstawie zależności empirycznej sa zgodne...
-
Buckling resistance of a metal column in a corrugated sheet silo - experiments and non-linear stability calculations
PublicationThe results of experimental and numerical tests of a single corrugated sheet silo column’s buckling resistance are presented in this study. The experiments were performed in a real silo with and without bulk solid (wheat). A very positive impact of the bulk solid on the column buckling resistance occurred. The experimental results were first compared to the buckling resistance calculated by Eurocode 3 formulae. The comparison revealed that...
-
Hydration of simple amides. FTIR spectra of HDO and theoretical studies
PublicationZastosowano metodę ważonych widm różnicowych do opisu hydratacji amidów w roztworach wodnych: formamidu, N-metyloformamidu, N,N-dimetyloformaidu, acetamidu, N-metyloacetamidu, N,N-dimetyloacetamidu. Narzędziem wspomagającym interpretację wyników eksperymentalnych są struktury agregatów solwatacyjnych wokół cząsteczki substancji rozpuszczonej uzyskane na podstawie obliczeń teoretycznych metodą ab initio z korelacją elektronową...
-
Electronic structure of TbBa2Cu3O7
PublicationW pracy wykonano obliczenia kwantowomechaniczne struktury elektronowej hipotetycznego materiału TbBa2Cu3O7 (Dy123) metodą FP-LAPW (full potential - linearized augmented plane wave) w ramach formalizmu DFT (density functional theory) stosując przybliżenie GGA (generalized gradient approximation). Ze względu na silne oddziaływania korelacyjne elektronów 4f w atomie Tb zastosowano dodatkowo poprawkę kulombowską U w ramach modelu...
-
Effects of Urea and Trimethylamine-N-oxide on the Properties of Water and the Secondary Structure of Hen Egg White Lysozyme
PublicationW celu określenia sposobu hydratacji mocznika i N-tlenku trimetyloaminy, wykorzystano spektroskopię oscylacyjną FTIR. Dane eksperymentalne, otrzymane z pomiarów widm oscylacyjnych wody półciężkiej (HDO) rozcieńczonej izotopowo w wodnych roztworach badanych związków, analizowane były za pomocą "metody widm różnicowych". Strukturalno-energetyczna charakterystyka wody zaburzonej przez cząsteczki osmolitów wskazuje, że woda zaburzona...
-
Kompleksy metali przejściowych zawierające ligand R2P-P
PublicationBadania obejmują kompleksy metali przejściowych zawierające ligandy fosfanylofosfinidenowe oraz fosfanylofosfidowe. Kompleksy te są pochodnymi kompleksów fosfinidenowych oraz fosfidowych, gdzie grupa alkilowa została zastąpiona grupą fosfanylową (R’2P). W pracy można wydzielić trzy główne obszary badań. Pierwszym było zbadanie reaktywności R2PP(SiMe3)Li względem diamidowych bądź β-diketiminowych kompleksów cyrkonu zawierających...