Search results for: PROLYL ISOMERASE

• Identification of Substrates of Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl Cis/Trans Isomerases and Their Collective Essentiality in Escherichia Coli

  Publication

  • G. Klein-Raina
  • P. Wojtkiewicz
  • D. Biernacka
  • A. Stupak
  • P. Gorzelak
  • S. Raina

  - INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES - Year 2020

  Protein folding often requires molecular chaperones and folding catalysts, such as peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs). The Escherichia coli cytoplasm contains six well-known PPIs, although a requirement of their PPIase activity, the identity of their substrates and relative enzymatic contribution is unknown. Thus, strains lacking all periplasmic and one of the cytoplasmic PPIs were constructed. Measurement of their PPIase...

  Full text available to download

• Crystal structures of the DsbG disulfide isomerase reveal an unstable disulfide

  Publication

  • B. Heras
  • M. A. Edeling
  • H. J. Schirra
  • S. Raina
  • J. L. Martin

  - PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA - Year 2004

  Dsb proteins control the formation and rearrangement of disulfide bonds during the folding of secreted and membrane proteins in bacteria. DsbG, a member of this family, has disulfide bond isomerase and chaperone activity. Here, we present two crystal structures of DsbG at 1.7- and 2.0-Angstrom resolution that are meant to represent the reduced and oxidized forms, respectively. The oxidized structure, however, reveals a mixture...

  Full text to download in external service

• Multicopy Suppressor Analysis of Strains Lacking Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases Identifies Three New PPIase Activities in Escherichia coli That Includes the DksA Transcription Factor

  Publication

  • P. Wojtkiewicz
  • D. Biernacka
  • P. Gorzelak
  • A. Stupak
  • G. Klein-Raina
  • S. Raina

  - INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES - Year 2020

  Consistent with a role in catalyzing rate-limiting step of protein folding, removal of genes encoding cytoplasmic protein folding catalysts belonging to the family of peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs) in Escherichia coli confers conditional lethality. To address the molecular basis of the essentiality of PPIs, a multicopy suppressor approach revealed that overexpression of genes encoding chaperones (DnaK/J and GroL/S),...

  Full text available to download

• Gracjana Klein-Raina dr hab.

  People

  Laboratorium Genetyki Bakterii

• Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase

  Publication

  • S. Milewski
  • A. Janiak
  • M. Wojciechowski

  - ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS - Year 2006

  Centra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...

  Full text to download in external service

• Distant Non-Obvious Mutations Influence the Activity of a Hyperthermophilic Pyrococcus furiosus Phosphoglucose Isomerase

  Publication

  • K. Subramanian
  • K. Mitusińska
  • J. Raedts
  • F. Almourfi
  • H. Joosten
  • S. Hendriks
  • S. Sedelnikova
  • S. Kengen
  • W. Hagen
  • A. Góra... and 4 others

  - Biomolecules - Year 2019

  Full text to download in external service

• Electron scattering on C3H6 isomers

  Publication

  • C. Szmytkowski
  • S. Kwitnewski

  - JOURNAL OF PHYSICS B-ATOMIC MOLECULAR AND OPTICAL PHYSICS - Year 2002

  Zmierzono całkowity przekrój czynny na rozproszenie elektronów na dwóch izomerach strukturalnych węglowodoru C3H6 dla energii 0.5-370 eV. Wykorzystano spektometr pracujący w oparciu o liniową metodę transmisyjną. Zaobserwowano wyraźny efekt izomeryczny. Uzyskane wyniki porównano z wcześniejszymi danymi eksperymentalnymi oraz obliczeniami.

• Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.

  Publication

  • S. Milewski
  • A. Janiak
  • J. Nowak
  • M. Wojciechowski

  - Year 2004

  Struktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...

• Crystallization and preliminary X-ray analysis of the isomerase domain of glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans

  Publication

  • J. Olchowy
  • R. Jędrzejczak
  • S. Milewski
  • W. Rypniewski

  - Year 2005

  Syntaza glukozamino-6-fosforanu (EC 2.6.1.16) katalizuje pierwszy, praktycznie nieodwracalny etap w szlaku biosyntezy heksozoamin, którego produktem końcowym jest UDP-GlcNAc, kluczowy substrat dla tworzenia ściany komórkowej drobnoustrojów. Otrzymano kryształy domeny izomerazowej syntazy GlcN-6-P z Candida albicans, składającej się z reszt 346-712 (42 kDa). Analiza rentgenograficzna kryształu wykazała, że należy on do grupy przestrzennej...

• QSRR Evaluation of the New Anticancer Sulfonamides in View of the cis-trans Isomerism

  Publication

  • P. Kawczak
  • M. Belka
  • J. Slawinski
  • T. Baczek

  - Current Pharmaceutical Analysis - Year 2017

  Full text to download in external service