Wyniki wyszukiwania dla: MOTORY MOLEKULARNE

• The importance of the shape of the protein-water interface of a kinesin motor domain for dynamics of the surface atoms of the protein

  Publikacja

  • A. Kuffel
  • J. Zielkiewicz

  - PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS - Rok 2012

  Single kinesin motor domain immersed in water has been investigated using molecular dynamics. It has been found that local properties of water in solvation shell change along with the nature of neighboring protein surface. However, a detailed analysis leads to the conclusion that the geometrical features of hydrogen bonds and overall structure of kinesin hydration water is not very different from bulk water. The local values of...

  Pełny tekst do pobrania w serwisie zewnętrznym

• Badanie, metodami dynamiki molekularnej, hydratacji domeny katalitycznej cząsteczki kinezyny oraz wpływu efektów hydratacyjnych na jej funkcjonalność motoryczną

  Publikacja

  • A. Kuffel

  - Rok 2013

  Celem pracy było zbadanie właściwości wody solwatacyjnej wokół domeny motorycznej kinezyny oraz pomiędzy kinezyną a dimerem tubulinowym. Ponadto, analizowany był wpływ rozpuszczalnika na siłę generowaną przez szyjkę łącznikową kinezyny. Dane otrzymane zostały z użyciem symulacji komputerowych. Odkryto liniową korelację pomiędzy współczynnikami dyfuzji wody solwatacyjnej i ruchliwością sąsiadujących atomów białka. Wpływ wody na...