Wyszukiwarka
Katedra Biotechnologii Molekularnej i Mikrobiologii
Publikacje
Filtry
wszystkich: 455
Katalog Publikacji
Rok 2009
-
Antarctic, cold-adapted beta-galactosidase of Pseudoalteromonas sp. 22b as an effective tool for alkyl galactopyranosides synthesis
PublikacjaPrzedstawione jest zastosowanie arktycznej beta-galaktozydazy Pseudoalteromonas sp. 22b do katalizy syntezy alkilowych galaktopyranozydów. Njwyższą wydajność syntezy uzyskuje się przy pH 6-9 i 10-30% stężenia wody. Podobnie jak dla mezofilnych beta-galaktozydaz enzym antarktyczny syntetyzował najwydajniej kiedy reakcja przebiega w mieszaninie buforu i rozpuszczalnika organiczego (poniżej 50%, v/v).
-
Badania epidemiologiczne populacji kobiet gminy Przodkowo w kierunku toksoplazmozy
PublikacjaW pracy przedstawiono badania dotyczące rozpowszechnienia toksoplazmozy wśród grupy kobiet w wieku 12-81 lat zamieszkujących teren typowej wiejskiej gminy Przodkowo w województwie pomorskim. Analizowano częstość występowania specyficznych przeciwciał IgG i IgM anty-Toxoplasma gondii oraz awidność przeciwciał IgG w tej grupie społecznej.
-
Benzonaza(R): możliwości praktycznych zastosowań.
PublikacjaBenzonaza znajduje zastosowanie w efektywnym obniżaniu lepkości i usuwaniu kwasów nukleinowych z roztworów białkowych. Zbadano w praktyce jej możliwości aplikacyjne w oczyszczaniu białek rekombinantowych wiążących jednoniciowe DNA (ang. SSB - single stranded DNA binding protein).
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublikacjaInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Characterization of a cryptic plasmid pSFKW33 from Shewanella sp. 33b
PublikacjaA cryptic plasmid pSFKW33 from psychrotrophic bacterium Shewanella sp. 33B, an isolate from the Gulf of Gdansk (the Baltic Sea), was sequenced and characterized. It is an 8021 bpcircular molecule with 38% GC content, which shows a distinctive nucleotide sequence without homology to other known plasmids. The nucleotide sequence analysis predicts eight open reading frames. The deduced amino acid sequence of ORF-1 shared significant...
Rok 2003
-
Antarctic marine bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b as a source of cold adapted á-galaktosidase.
PublikacjaAntarktyczny morski szczep Pseudoalteromonas sp. 22b. jest źródłem wewnątrzkomórkowej beta-galaktozy. Enzym ten wykazuje wysoką aktywność hydrolizy laktozy w zakresie temperatur od 0 do 20 st. C oraz pH 6,0-8,0. W niniejszej pracy opisano metodykę uzyskania homogennego preparatu tego enzymu, oraz pełną charakterystykę jego własności enzymatycznych i kinetycznych.
-
Chimeric Dr fimbriae with a Herpes Simplex virus type 1 epitope as a model for a recombinant vaccine.
PublikacjaBiałko adhezyny DraE uropatogennych szczepów E. coli Dr+ zostało wykorzystane jako nośnik 11a a determinanty antygenowej glikoproteiny D wirusa HSV ty-pu 1. Sekwencja kodująca epitop HSV została wklonowana do genu draE w obrębie regionu N- terminalnego eksponowanej powierzchniowo domeny 2. Ekspresjachimerycznych białek DraE-HSV została potwierdzona za pomocą mikroskopii immunofluorescencyjnej i elektronowej.
Rok 2018
-
Antibacterial polyurethanes, modifed with cinnamaldehyde, as potential materials for fabrication of wound dressings
PublikacjaThe epidermis is a skin layer, which protects an organism from the different factors of external environment. Therefore, the fast and effective regeneration of epidermis is important. Potential materials used for epidermis regeneration may be polyurethane scaffolds in form of the thin permeable layers. One and main disadvantage of such polyurethane scaffolds are their lack of antibacterial and antifungal properties. The great proposition...
Rok 2022
-
Antibiotic resistance, virulence, and phylogenetic analysis of Escherichia coli strains isolated from free-living birds in human habitats
PublikacjaWild birds can be colonized by bacteria, which are often resistant to antibiotics and have various virulence profiles. The aim of this study was to analyze antibiotic resistance mechanisms and virulence profiles in relation to the phylogenetic group of E. coli strains that were isolated from the GI tract of wildfowl. Out of 241 faecal samples, presence of E. coli resistant to a cephalosporin (ESBL/AmpC) was estimated for 33 isolates...
-
Breastfeeding as a regulating factor of the development of the intestinal microbiome in the early stages of life
PublikacjaSince the first bacterial inhabitants of the human gastrointestinal tract were identified, a lot of research into the study of the human microbiome and its effects on health has been conducted. Currently, it is accepted that humans have a symbiotic relationship with the gut microbiome, though the specifics of this relationship are not well understood. The microbiome of neonates constantly changes and appears to influence many facets...
Rok 2007
-
Antygeny rekombinantowe Toxoplasma gondii jako narzędzie w diagnostyce toksoplazmozy
Publikacja -
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublikacjaWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
Rok 2019
-
ANTYGENY REKOMBINANTOWE W DIAGNOSTYCE SEROLOGICZNEJ BORELIOZY
PublikacjaBorelioza jest najczęstszą chorobą odkleszczową dotykającą mieszkańców półkuli północnej. Chorobę tę wywołują bakterie zakwalifikowane do grupy Borrelia burgdorferi sensu lato. Współcześnie podstawą diagnostyki laboratoryjnej boreliozy jest dwustopniowe badanie serologiczne. Pierwszym etapem jest test immunoenzymatyczny (ELISA), jeżeli wynik badania jest dodatni lub wątpliwy jako test potwierdzający stosuje się technikę Western...
-
Charakterystyka oporności Klebsiella pneumoniae New Delhi na karbapenemy
PublikacjaBakterie Klebsiella pneumoniae New Delhi, posiadające gen oporności na karbapenemy (blaNDM) zostały po raz pierwszy wyizolowane w 2008 roku w Szwecji od pacjenta wcześniej hospitalizowanego w Indiach. Bakterie te szybko rozprzestrzeniają się po całym świecie, a od 2011 roku występują również w Polsce. Stanowią one wysokie ryzyko epidemiologiczne, ponieważ gen oporności na karbapenemy przekazywany jest pomiędzy bakteriami poprzez...
Rok 2010
-
Application of recombinant antigens in serodiagnosis of swine toxoplasmosis and prevalence of Toxoplasma gondii infection among pigs in Poland
PublikacjaNiniejsza praca przedstawia częstość występowania toksoplazmozy w populacji świń obejmującej 1754 osobników pochodzących z różnych regionów Polski, która określona została z wykorzystaniem testu IgG ELISA opartego na antygenie natywnym pasożyta. Specyficzne przeciwciała anty-T. gondii klasy IgG zostały wykryte u 19,2% zwierząt z testowanej grupy. Ponadto w pracy oszacowano użyteczność diagnostyczną w rozpoznawaniu toksoplazmozy...
-
Characterization of exceptionally thermostable single-stranded DNA-binding proteins from Thermotoga maritima and Thermotoga neapolitana
PublikacjaBACKGROUND: In recent years, there has been an increasing interest in SSBs because they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods.RESULTS: We report the characterization of single-stranded DNA binding proteins (SSBs) from the thermophilic bacteria Thermotoga maritima (TmaSSB) and Thermotoga neapolitana (TneSSB). They are the smallest known bacterial SSB proteins, consisting of 141 and 142 amino...
Rok 2020
-
Application of safirinium N-hydroxysuccinimide esters to derivatization of peptides for high-resolution mass spectrometry, tandem mass spectrometry, and fluorescent labeling of bacterial cells
PublikacjaMass spectrometry methods are commonly used in the identification of peptides and biomarkers. Due to a relatively low abundance of proteins in biological samples, there is a need for the development of novel derivatization methods that would improve MS detection limits. Hence, novel fluorescent N-hydroxysuccinimide esters of dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-2-ium carboxylates (Safirinium P dyes) have been synthesized. The...
-
Association of Genes Related to Oxidative Stress with the Extent of Coronary Atherosclerosis
PublikacjaOxidative stress is believed to play a critical role in atherosclerosis initiation and progression. In line with this, in a group of 1099 subjects, we determined eight single nucleotide polymorphisms (SNPs) related to oxidative stress (PON1 c.575A>G, MPO c.463G>A, SOD2 c.47T>C, GCLM c.590C>T, NOS3 c.894G>T, NOS3 c.786T>C, CYBA c.214C>T, and CYBA c.932A>G) and assessed the extent of atherosclerosis in coronary arteries based on...
-
Ciprofloxacin-modified degradable hybrid polyurethane-polylactide porous scaffolds developed for potential use as an antibacterial scaffold for regeneration of skin
PublikacjaThe aim of the performed study was to fabricate an antibacterial and degradable scaffold that may be used in the field of skin regeneration. To reach the degradation criterion for the biocompatible polyurethane (PUR), obtained by using amorphous α,ω-dihydroxy(ethylene-butylene adipate) macrodiol (PEBA), was used and processed with so-called “fast-degradable” polymer polylactide (PLA) (5 or 10 wt %). To meet the antibacterial requirement...
Rok 2014
-
Assembly of Lipopolysaccharide in Escherichia coli Requires the Essential LapB Heat Shock Protein
PublikacjaHere, we describe two new heat shock proteins involved in the assembly of LPS in Escherichia coli, LapA and LapB (lipopolysaccharide assembly protein A and B). lapB mutants were identified based on an increased envelope stress response. Envelope stress responsive pathways control key steps in LPS biogenesis and respond to defects in the LPS assembly. Accordingly, the LPS content in ΔlapB or Δ(lapA lapB) mutants was elevated, with...
-
Bacterial consortium an axenic cultures isolated from activated sewage sludge for biodegradation of imidazolium-based ionic liquid
PublikacjaExtensive research and increasing number of potential industrial applications made ionic liquids (ILs) important materials in design of new, cleaner technologies. Together with the technological applicability, the environmental fate of these chemicals is considered and significant efforts are being made in designing strategies to mitigate their potential negative impacts. Many ILs are proven to be poorly biodegradable and relatively...
-
Budowa biofilmu chorobotwórczych drożdży i jego wpływ na oporność
PublikacjaBiofilm jest najpowszechniej występującą formą wzrostu mikroorganizmów w naturze. Ze względu na wysoką oporność na antybiotyki, jest on istotnym czynnikiem przewlekłych i nawracających zakażeń grzybiczych. Struktura biofilmu umożliwia dostarczenie składników odżywczych do głębszych warstw komórek i odprowadzenie metabolitów. Macierz zewnątrzkomórkowa pełni funkcję ochronne przed niekorzystnymi warunkami środowiska, a także utrudnia...
-
BUDOWA I AKTYWNOŚĆ BIAŁEK NALEŻĄCYCH DO RODZINY TET
PublikacjaBiałka należące do rodziny TET (Tet1, Tet2, Tet3) są enzymami wykazującymi aktywność względem 5-metylocytozyny, która jest ważnym markerem epigenetycznym odgrywającym kluczową rolę w trakcie rozwoju organizmu i mającym istotny wpływ na poziom ekspresji genów. Białka TET przekształcają 5-metylocytozynę do 5-hydroksymetylocytozyny, 5-formylocytozyny i 5-karboksylocytozyny w trakcie następujących po sobie trzech reakcji utleniania....
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria Desulfotalea psychrophila, Flavobacterium psychrophilum, Psychrobacter arcticus, Psychrobacter cryohalolentis, Psychromonas ingrahamii, Psychroflexus torquis, and Photobacterium profundum
PublikacjaBackground: Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) play essential roles in DNA replication, recombination and repair in Bacteria, Archaea and Eukarya. In recent years, there has been an increasing interest in SSBs, since they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods. Results: We report the characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria Desulfotalea...
Rok 2023
-
Asymptomatic Bacteriuria in Kidney Transplant Recipients—A Narrative Review
PublikacjaUrinary tract infections (UTIs) are the most prevalent complications in kidney transplant (KTx) recipients. The most frequent finding in this group of patients is asymptomatic bacteriuria (ASB). Here, we provide an overview of the available evidence regarding ASB in KTx recipients, including its etiopathology, clinical impact and management. There is a growing body of evidence from clinical trials that screening for and treating...
-
Between therapy effect and false-positive result in animal experimentation
PublikacjaDespite the animal models’ complexity, researchers tend to reduce the number of animals in experiments for expenses and ethical concerns. This tendency makes the risk of false-positive results, as statistical significance, the primary criterion to validate findings, often fails if testing small samples. This study aims to highlight such risks using an example from experimental regenerative therapy and propose a machine-learning...
Rok 2012
-
Awidność przeciwciał IgG jako ważny test diagnostyczny w rozpoznawaniu aktywnej toksoplazmozy - stan obecny i nowe możliwości.
PublikacjaW artykule opisano problem diagnostyki toksoplazmozy ze szczególnym uwzględnieniem metody awidności przeciwciał klasy IgG. Test oznaczania awidności przeciwciał IgG swoistych dla T. gondii jest użytecznym wskaźnikiem serologicznym toksoplazmozy, który w wielu przypadkach na podstawie pojedynczego badania surowicy pacjenta pozwala potwierdzić lub wykluczyć aktywną postać choroby. W pierwotnej, aktywnej toksoplazmozie przeciwciała...
Rok 2021
-
Bacteriophages as potential tools for use in antimicrobial therapy and vaccine development
PublikacjaThe constantly growing number of people suffering from bacterial, viral, or fungal infections, parasitic diseases, and cancers prompts the search for innovative methods of disease prevention and treatment, especially based on vaccines and targeted therapy. An additional problem is the global threat to humanity resulting from the increasing resistance of bacteria to commonly used antibiotics. Conventional vaccines based on bacteria...
-
Biofilm bakteryjny uropatogennych szczepów E. coli Dr+ jako czynnik indukujący przewlekłość zakażeń dróg moczowych ograniczający ich leczenie
PublikacjaZakażenia dróg moczowych (ZUM) stanowią jedne z najczęściej występujących infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku miliony osób na świecie. Problematyka tych zakażeń wynika z ich przewlekłości i nawrotów, pomimo stosowania terapii antybiotykowej oraz ciągle wzrastającej lekooporności uropatogenów je wywołujących. Dominującym czynnikiem etiologicznym ZUM są uropatogenne szczepy E. coli (UPECs), wykazujące zdolność do adhezji,...
-
Borrelia burgdorferi BmpA-BBK32 and BmpA-BBA64: New Recombinant Chimeric Proteins with Potential Diagnostic Value
PublikacjaCurrently, the diagnosis of Lyme disease is based mostly on two-tiered serologic testing. In the new generation of immunoenzymatic assays, antigens comprise whole-cell lysates of members of the Borrelia burgdorferi sensu lato (s.l.) species complex, with the addition of selected recombinant proteins. Due to the high diversity of members of the B. burgdorferi s.l. genospecies and the low degree of conservation among the amino acid...
-
Characterization of d-xylose reductase, XyrB, from Aspergillus niger
PublikacjaD-xylose reductase is a member of the aldo-keto reductase family, and is involved in D-xylose and L-arabinose conversion through the Pentose Catabolic Pathway (PCP) in fungi. In this study, we biochemically characterized a newly identified second D-xylose reductase (XyrB) from Aspergillus niger. This NADPH-dependent reductase is able to efficiently convert D-xylose and L-arabinose, and it has the highest affinity for these sugars...
-
Charakterystyka genetyczna szczepów Klebsiella pneumoniae izolowanych od pacjentów po przeszczepieniu nerki oraz badanie wpływu leków immunosupresyjnych na ekspresję genów bakteryjnych
PublikacjaBakterie z gatunku Klebsiella pneumoniae należą do oportunistycznych patogenów odpowiedzialnych za zakażenia szpitalne. Drobnoustroje te wykazują skłonność do oporności wielolekowej i wysokiej wirulencji, co stanowi poważne zagrożenie dla pacjentów nieimmunokompetentnych. Wśród pacjentów po transplantacji nerki zakażenia układu moczowego (ZUM) stanowią najczęstszą przyczynę powikłań infekcyjnych. Mechanizmy molekularne leżące u...
-
Cloning, expression in Komagataella phaffii, and biochemical characterization of recombinant sequence variants of Pseudomonas sp. S9 GDSL-esterase
PublikacjaTwo recombinant Komagataella phaffii (formerly Pichia pastoris) yeast strains for production of two sequential variants of EstS9 esterase from psychrotolerant bacterium Pseudomonas sp. S9, i.e. αEstS9N (a two-domain enzyme consisting of a catalytic domain and an autotransporter domain) and αEstS9Δ (a single-domain esterase) were constructed. However, only one of recombinant K. phaffii strains, namely Komagataella phaffii X-33/pPICZαestS9Δ,...
Rok 2013
-
Beta-galactosidases from a psychrotolerant Arthrobacter isolates and their potential use
PublikacjaEnzymes from extremophiles, especially psychrophiles and psychrotolerant microorganisms are currently intensively studied because of their unusual structural and functional properties. One of these enzymes is a cold-adapted - galactosidase (EC 3.2.1.23) which catalyzes the hydrolysis of - 1,4-glycosidic bonds in -galactosides. The most common - galactoside is lactose, a disaccharide which makes up 2-7% of milk. The majority of...
-
Beta-Galactosidases of Pseudoalteromonas sp. – Characteristics and application for lactose hydrolysis and galactopyranosides synthesis
PublikacjaBeta-galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It has biotechnological applications in the dairy industry for the production of milk with a low content of lactose and galactooligosacharides for use in healthy food. The transgalactosylation activity of beta-galactosidase can be used in the synthesis of alkyl galactopyranosides. Due to the fact that conditions of...
-
B-GALACTOSIDASE ARTHROBACTER SP. 32cB - OBTAINING THE GENE SEQUENCE, CONSTRUCTION OF THE EXPRESSION SYSTEM, BIOSYNTHESIS AND BIOCHEMICAL CHARACTERIZATION OF THE ENZYME
PublikacjaINTRODUCTION: β-Galactosidase is an enzyme which catalyzes the hydrolysis of O glycosidic bond in β-galactosides. Another activity of β galactosidase is a transglycosylation activity. The main industrial use of this protein is the hydrolysis of lactose in milk in a cooling conditions. Synthesis of galactooligosaccharides, which are mostly used as a prebiotics added to some foods or available as dietary supplements, is only one...
-
Białka prokariotycznego systemu MMR: rola oraz interakcje
PublikacjaUszkodzenia komórkowego DNA w postaci błędnie sparowanych lub niesparowanych zasad azotowych są wynikiem niewłaściwie zachodzących procesów metabolizmu DNA, takich jak replikacja, rekombinacja oraz naprawa DNA. Utrwalenie tego rodzaju zmian prowadzi do powstania mutacji. System MMR (ang. DNA mismatch repair) usuwa te uszkodzenia przyczyniając się do zwiększenia wierności replikacji DNA oraz utrzymania stabilności genomu komórki....
-
Biochemical characteristic of biofilm of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains.
PublikacjaUrinary tract infections caused by Escherichia coli are very common health problem in the developed countries. The virulence of the uropathogenic E. coli Dr+ IH11128 is determined by Dr fimbriae, which are homopolymeric structures composed of DraE subunits with the DraD protein capping the fiber. In this study, we have analyzed the structural and biochemical properties of biofilms developed by E. coli strains expressing Dr fimbriae...
-
BIODIVERSITY OF YEASTS ISOLATED FROM CAVES OF THE POLISH TATRA MOUNTAINS, AND ITS BIOTECHNOLOGICAL POTENTIAL
PublikacjaMost of the Earth’s biosphere is permanently or periodically exposed to temperatures below 5°C. Cold habitats harbor a wide diversity of psychrophiles. For many years Antarctica has been the geographic area preferred for studying the diversity and properties of cold-adapted microorganisms. However, the non-Antarctic habitats like Himalayas or Alps are also extensively explored. The Tatra Mountains are Europe’s second-highest massif...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublikacjaSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNAinsequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination.Although there are differences in amino acid...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublikacjaSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNA insequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination. Although there are differences in amino...
-
Cloning and characterization of a novel cold-active glycoside hydrolase family 1 enzyme with beta-glucosidase, beta-fucosidase and beta-galactosidase activities.
PublikacjaBackground: Cold-active enzymes, sourced from cold-adapted organisms, are characterized by high catalytic efficiencies at low temperatures compared with their mesophilic counterparts, which have poor activity. This property makes them advantageous for biotechnology applications as it: (i) saves energy costs, (ii) shortens the times for processes operated at low temperatures, (iii) protects thermosensitive substrates or products...
Rok 2008
Rok 2017
-
BIOSYNTEZA ESTERAZY Z PSEUDOMONAS SP. S9 W KOMÓRKACH PICHIA PASTORIS, OCZYSZCZANIE I CHARAKTERYSTYKA
PublikacjaEnzymy lipolityczne ze względu na swoje unikalne właściwości takie jak stereo-, chemo- i regiospecyficzność znajdują szereg zastosowań w różnych gałęziach przemysłu. Lipazy i esterazy wykorzystywane są w przemyśle chemicznym, farmaceutycznym, spożywczym oraz w syntezie organicznej. W ramach wcześniejszych badań zidentyfikowałam i scharakteryzowałam aktywną w niskiej temperaturze esterazę z Pseudomonas sp. S9. Esteraza Pseudomonas...
Rok 2011
-
Cardinal regenerative features of the MRL mouse
PublikacjaIn this review, we discuss recent studies relating to major features of adult MRL mouse biology that contribute to the regenerative responses seen. These include an increased inflammatory cell profile, a unique glycolytic metabolic state typically found during embryogenesis, and a cell cycle phenotype of DNA damage and G2/M arrest. These traits have been found in other mammalian and non-mammalian regenerative systems. How these...
Rok 2016
-
Changes in gene methylation patterns in neonatal murine hearts: Implications for the regenerative potential
PublikacjaBackground The neonatal murine heart is able to regenerate after severe injury; this capacity however, quickly diminishes and it is lost within the first week of life. DNA methylation is an epigenetic mechanism which plays a crucial role in development and gene expression regulation. Under investigation here are the changes in DNA methylation and gene expression patterns which accompany the loss of regenerative potential. Results The...
-
Cloning, expression, and biochemical characterization of a coldactive GDSL-esterase of a Pseudomonas sp. S9 isolated from Spitsbergen island soil
PublikacjaAn estS9 gene, encoding an esterase of the psychrotolerant bacterium Pseudomonas sp. S9 was cloned and sequenced. The deduced sequence revealed a protein of 636 amino acid residues with a molecular mass of 69 kDa.Further amino acid sequence analysis revealed that the EstS9 enzyme contained a G-D-S-L motif centered at a catalytic serine, an N-terminal catalytic domain and a C-terminal autotransporter domain. Two recombinant E. coli...
-
Cold-Active beta-Galactosidases: Sources, Biochemical Properties and Their Biotechnological Potential
Publikacjabeta-D-Galactosidases have been studied extensively in terms of their application to a variety of industrial technologies. To date, considerable research efforts have been devoted to characterization of new cold-active beta-D-galactosidases which were isolated directly from selected species of bacteria and yeasts, as well as with the use of metagenomic approaches. This chapter will provide a review of current research towards cold-active...
Rok 2015
-
Characterisation of Escherichia coli isolates from the blood of haematological adult patients with bacteraemia: translocation from gut to blood requires the cooperation of multiple virulence factors
PublikacjaThe aim of the study was to investigate whether there are unique pathotypes of Escherichia coli capable of transmission from the gastrointestinal tract to the vascular bed. The study included E. coli strains isolated from clinical materials collected from 115 patients suffering from haematologic malignancies diagnosed with bacteraemia. The genotyping techniques established that 89 E. coli isolates from the blood had the same genotype...
-
Characterization of a single-stranded DNA-binding-like Protein from Nanoarchaeum equitans - a nucleic acid binding protein with broad substrate specificity
PublikacjaBackground SSB (single-stranded DNA-binding) proteins play an essential role in all living cells and viruses, as they are involved in processes connected with ssDNA metabolism. There has recently been an increasing interest in SSBs, since they can be applied in molecular biology techniques and analytical methods. Nanoarchaeum equitans, the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota, is a hyperthermophilic, nanosized,...