Inserts amplification for knockout cassette construction

Opis

The goal of the study was to obtain optimal conditions for amplification of upstream and downstream genes fragments and introduce a cleavage site for restriction enzymes into them thanks to which it will be possible to clone fragments into a plasmid containing elements of the knockout cassette. The constructed cassettes will enable the removal of the tested genes from the C. albicans SC5314 genome using the SAT1-flipper method.

The deletion of tested genes encoding enzymes O-acetylhomoserine sulfhydrylases Met15p, homoserine O-acetyltransferases Met2p and cystathionine-γ-synthases Str2p enable the assessment of the impact of those enzymes on the phenotype of cells, on the virulence of the strain, and allows to recognize the in vivo function of the tested proteins in L-methionine biosynthesis.

The studies were financially supported from the project OPUS 20 financed by the National Science Centre (No. UMO-2020/39/B/NZ7/01519).

Plik z danymi badawczymi

Inserts amplification for knockout cassette construction.zip

778.9 kB, S3 ETag 289772929df6d9dbe2510418cfb8a2ce-1, pobrań: 64

Hash pliku liczony jest ze wzoru
hexmd5(md5(part1)+md5(part2)+...)-{parts_count} gdzie pojedyncza część pliku jest wielkości 512 MB

Przykładowy skrypt do wyliczenia:
https://github.com/antespi/s3md5

pobierz

Informacje szczegółowe o pliku

Licencja:: otwiera się w nowej karcie

CC BY

Uznanie autorstwa
Dane surowe:: Dane zawarte w datasecie nie zostały w żaden sposób przetworzone.

Informacje szczegółowe

Rok publikacji:

2023

Data zatwierdzenia:

2023-03-30

Język danych badawczych:

angielski

Dyscypliny:

nauki chemiczne (Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych)

DOI:

10.34808/xak8-rr65

Finansowanie:

Enzymy szlaku biosyntezy L-metioniny jako nowe cele molekularne dla chemoterapii przeciwgrzybowej

Weryfikacja:

Politechnika Gdańska

Słowa kluczowe

Powiązane zasoby

dane badawcze Identification and cloning of C. albicans SC5314 genes encoding L-methionine biosynthetic pathway enzymes.
dane badawcze L-Homoserine O-acetyltransferase (CaMet2p) activity and inhibition
dane badawcze Overproduction of CaMet15p native and His-tag versions.
dane badawcze Overproduction of homoserine O-acetyltransferase (CaMet2p) native and His-tag versions.
dane badawcze Antifungal activity of L-homoserine O-acetyltransferase (CaMet2p) inhibitors.
dane badawcze Overproduction of CaStr2p native and His-tag versions.
dane badawcze Plasmids pMET2M1 and pMET15M1 with the SAT1 Flipper knockout cassette construction

Cytuj jako

Autorzy

wyświetlono 130 razy

Wyszukiwarka