Identyfikacja 20 nowych rejonów zmiennych w genomach Staphylococcus aureus przydatnych do genotypowania koagulazo-dodatnich gronkowców
Abstract
W pracy zidentyfikowano 20 nowych rejonów zmiennych w genomach gronkowca złocistego przydatnych do badań epidemiologicznych metodą PCR. Teoretyczna analiza 35 genomów metodą PCR z udziałem 20 nowych regionów zmiennych pozwoliła na uzyskanie większej liczby genotypów w porównaniu do dwóch metod referencyjnych: REA-PFGE z udziałem endonukleazy SmaI oraz metody MLVA z udziałem 16 rejonów zmiennych.
Author (1)
Cite as
Full text
download paper
downloaded 127 times
- Publication version
- Accepted or Published Version
- License
- open in new tab
Keywords
Details
- Category:
- Articles
- Type:
- artykuły w czasopismach recenzowanych i innych wydawnictwach ciągłych
- Published in:
-
Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia
no. 69,
pages 93 - 103,
ISSN: 0025-8601 - Language:
- Polish
- Publication year:
- 2017
- Bibliographic description:
- Kotłowski R.: Identyfikacja 20 nowych rejonów zmiennych w genomach Staphylococcus aureus przydatnych do genotypowania koagulazo-dodatnich gronkowców// Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia. -Vol. 69., nr. 2 (2017), s.93-103
- Bibliography: test
-
- Couvé-Deacon E, Mons F, Garnier F i inni. Neonatal Outbreak of Methicillin-Resi- stant Staphylococcus aureus Clone Geraldine: A Bundle of Measures to Halt Transmis- sion. Infect Control Hosp Epidemiol 2017; 38: 749-51. open in new tab
- Genotypowanie S. aureus
- Dzierżanowska D. Patogeny bakteryjne zakażeń szpitalnych. W: Zakażenia szpitalne. Red. D.Dzierżanowska. Wydawnictwo α-medica press, Bielsko-Biała, 2008, 11.
- Kaïret K, Ho E, Van Kerkhoven D i inni. USA300, A strain of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus, crossing Belgium's borders: outbreak of skin and soft tissue infections in a hospital in Belgium. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2017; 36: 905-9. open in new tab
- Katoh K, Misawa K, Kuma K i inni. MAFFT: a novel method for rapid multiple sequ- ence alignment based on fast Fourier transform. Nucleic Acids Res 2002; 15: 3059-66. open in new tab
- Poddar SK, Sawyer MH, Connor JD. Evaluation of PCR assays in presence of anti- body to thermostable DNA polymerases for detection of microbial agents: avoiding false negative results for specimen containing low-titer agent. J Clin Lab Anal 1998; 12: 238-41. open in new tab
- Pomorska-Wesołowska M, Małyszek K, Romaniszyn D i inni. Molekularna charaktery- styka szczepów Staphylococcus aureus izolowanych z zakażeń miejsca operowanego u pacjentów południowej Polski. Med Dosw Microbiol 2017; 69: 15-25.
- Sobral D, Schwarz S, Bergonier D i inni. High throughput multiple locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA) of Staphylococcus aureus from human, animal and food sources. PLoS One 2012; 7:e33967. open in new tab
- Autor Autora: 80-233 Gdańsk, ul. Narutowicza 11/12, Katedra Biotechnologii Molekularnej i Mikrobiologii, email: romkotlo@pg.gda.pl.
- Verified by:
- Gdańsk University of Technology
seen 190 times
Recommended for you
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
- B. Krawczyk,
- J. Leibner,
- W. Barańska-Rybak
- + 2 authors
2007