Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity

Abstrakt

We demonstrate here a new class of DNA‐based nanoswitches that, upon enzymatic repair, could undergo a conformational change mechanism leading to a change in fluorescent signal. Such folding‐upon‐repair DNA nanoswitches are synthetic DNA sequences containing O6‐methyl‐guanine (O6‐MeG) nucleobases and labelled with a fluorophore/quencher optical pair. The nanoswitches are rationally designed so that only upon enzymatic demethylation of the O6‐MeG nucleobases they can form stable intramolecular Hoogsteen interactions and fold into an optically active triplex DNA structure. We have first characterized the folding mechanism induced by the enzymatic repair activity through fluorescent experiments and Molecular Dynamics simulations. We then demonstrated that the folding‐upon‐repair DNA nanoswitches are suitable and specific substrates for different methyltransferase enzymes including the human homologue (hMGMT) and they allow the screening of novel potential methyltransferase inhibitors.

Cytowania

  • 1 0

    CrossRef

  • 0

    Web of Science

  • 0

    Scopus

Autorzy (8)

  • Zdjęcie użytkownika  Nada Farag

    Nada Farag

  • Zdjęcie użytkownika  Rosanna Mattossovich

    Rosanna Mattossovich

  • Zdjęcie użytkownika  Rosa Merlo

    Rosa Merlo

  • Zdjęcie użytkownika dr inż. Łukasz Nierzwicki

    Łukasz Nierzwicki dr inż.

    • University of California Riverside
  • Zdjęcie użytkownika dr Giulia Palermo

    Giulia Palermo dr

  • Zdjęcie użytkownika  Alessandro Porchetta

    Alessandro Porchetta

  • Zdjęcie użytkownika  Giuseppe Perugino

    Giuseppe Perugino

  • Zdjęcie użytkownika dr Francesco Ricci

    Francesco Ricci dr

Cytuj jako

Pełna treść

pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Publikacja w czasopiśmie
Typ:
artykuły w czasopismach
Opublikowano w:
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION nr 133, strony 7359 - 7365,
ISSN: 1433-7851
Język:
angielski
Rok wydania:
2021
Opis bibliograficzny:
Farag N., Mattossovich R., Merlo R., Nierzwicki Ł., Palermo G., Porchetta A., Perugino G., Ricci F.: Folding‐upon‐repair DNA nanoswitches for monitoring DNA repair enzymes activity// ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION -Vol. 133,iss. 13 (2021), s.7359-7365
DOI:
Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1002/ange.202016223
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 75 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi