PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera

Milena Kordalewska; Jolanta Kalita; Zofia Bakuła; Anna Brillowska-Dąbrowska; Tomasz Jagielski

doi:10.1093/mmy/myy106

PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera

Abstrakt

Fungi of the Scopulariopsis genus, commonly found in the environment, are opportunistic pathogens that can cause various types of human infections. So far, no efficient molecular method has been developed for species differentiation among Scopulariopsis and related genera. In order to advance this field, we have evaluated performance of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays, based on cytochrome c oxidase subunit 1 and β-tubulin genes. The assays resulted in 2–10 restriction patterns, depending on the gene amplified and restriction enzyme applied. Pooled analysis of the patterns allowed to propose an algorithm, that can be successfully used for an accurate species-specific identification of 21 species of the Scopulariopsis-like fungi.

Cytowania

1

CrossRef
0

Web of Science
2

Scopus

Autorzy (5)

Cytuj jako

Pełna treść

pełna treść publikacji nie jest dostępna w portalu

pełna treść artykułu zobacz w serwisie zewnętrznym otwiera się w nowej karcie

Słowa kluczowe

IDENTIFICATION, OPPORTUNISTIC PATHOGENS, PCR, RFLP, SCOPULARIOPSIS

Informacje szczegółowe

Kategoria:

Publikacja w czasopiśmie

Typ:

artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR

Opublikowano w:

MEDICAL MYCOLOGY nr 57, strony 643 - 648,
ISSN: 1369-3786

Język:

angielski

Rok wydania:

2019

Opis bibliograficzny:

Kordalewska M., Kalita J., Bakuła Z., Brillowska-Dąbrowska A., Jagielski T.: PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera// MEDICAL MYCOLOGY. -Vol. 57, iss. 5 (2019), s.643-648

DOI: