Wyniki wyszukiwania dla: phylogenetics

• Analyzing sets of phylogenetic trees obtained from bayesian MCMC process using topology metrics

  Publikacja

  • D. Bogdanowicz

  - Rok 2009

  The reconstruction of evolutionary trees is one of the primary objectives in phylogenetics. Such a tree represents historical evolutionary relationship between different species or organisms. Tree comparisons are used for multiple purposes, from unveiling the history of species to deciphering evolutionary associations amongorganisms and geographical areas.In the paper, we describe a general method for comparing hylogenetic trees....

• Analyzing sets of phylogenetic trees using metrics

  Publikacja

  • D. Bogdanowicz

  - Applicationes Mathematicae - Rok 2011

  The reconstruction of evolutionary trees is one of the primary objectives in phylogenetics. Such a tree represents historical evolutionary relationships between different species or organisms. Tree comparisons are used for multiple purposes, from unveiling the history of species to deciphering evolutionary associations among organisms and geographical areas. In this paper, we describe a general method for comparing phylogenetictrees...

  Pełny tekst do pobrania w portalu

• TreeCmp: Comparison of Trees in Polynomial Time

  Publikacja

  • D. Bogdanowicz
  • K. Giaro
  • B. Wróbel

  - Evolutionary Bioinformatics - Rok 2012

  Metryki filogenetyczne umożliwiają ocenę jakości wyników analizy filogenetycznej oraz wiarygodności algorytmów przeprowadzających taką analizę. Aplikacja TreeCmp oferuje efektywne, wielomianowe implementacje ośmiu takich metryk (dla drzew nieukorzenionych i zawierających korzeń) zdefiniowanych dla dowolnych filogenez (nie koniecznie binarnych). Program ten jako pierwszy umożliwia wyznaczanie nowych metryk, definiowanych w oparciu...

  Pełny tekst do pobrania w portalu