Search results for: MPI

• Checkpointing of Parallel MPI Applications using MPI One-sided API with Support for Byte-addressable Non-volatile RAM

  Publication

  • P. Dorożyński
  • P. Czarnul
  • A. Malinowski
  • K. Czuryło
  • Ł. Dorau
  • M. Maciejewski
  • P. Skowron

  - Year 2016

  The increasing size of computational clusters results in an increasing probability of failures, which in turn requires application checkpointing in order to survive those failures. Traditional checkpointing requires data to be copied from application memory into persistent storage medium, which increases application execution time as it is usually done in a separate step. In this paper we propose to use emerging byte-addressable...

  Full text to download in external service

• BC-MPI: running an mpi application on multiple clusters with beesycluster connectivity

  Publication

  • P. Czarnul

  - Year 2007

  W artykule zaproponowano nowy pakiet BC-MPI, który umożliwiauruchomienie aplikacji MPI na wielu klastrach z różnymi implementacjami MPI. Wykorzystuje dedykowane implementacje MPIdo komunikacji wewnątrz klastrów oraz tryb MPI THREAD MULTIPLE dokomunikacji pomiędzy klastrami w dodatkowych wątkach aplikacji MPI. Ponadto, aplikacja BC-MPI może być automatycznie skompilowanai uruchomiona przez warstwę pośrednią BeesyCluster. BeesyClusterumożliwia...

  Full text to download in external service

• Performance and Power-Aware Modeling of MPI Applications for Cluster Computing

  Publication

  • J. Proficz
  • P. Czarnul

  - Year 2016

  The paper presents modeling of performance and power consumption when running parallel applications on modern cluster-based systems. The model includes basic so-called blocks representing either computations or communication. The latter includes both point-to-point and collective communication. Real measurements were performed using MPI applications and routines run on three different clusters with both Infiniband and Gigabit Ethernet...

  Full text available to download

• Towards Easy-to-Use Checkpointing of MPI Applications within CLUSTERIX.

  Publication

  • P. Czarnul
  • A. Urbaniak
  • M. Frączak

  - Year 2004

  W literaturze wymienia się wiele bibliotek/systemów zarówno poziomu jądra jak i użytkownika, które wspomagają zapisywanie i odtwarzanie stanu procesów. W odniesieniu do aplikacji równoległych, jest to jednak zadanie cały czas trudne. Praca prezentuje nasze podejście do zapisywania/odtwarzania stanu aplikacji MPI wspomagane przez programistę, które wykorzystane będzie w środowisku projektu CLUSTERIX tj. zintegrowanej grupie klastrów...

• Object serialization and remote exception pattern for distributed C++/MPI application

  Publication

  • T. M. Boiński
  • K. Bańczyk
  • H. Krawczyk

  - LECTURE NOTES IN COMPUTER SCIENCE - Year 2007

  MPI is commonly used standard in development of scientific applications. It focuses on interlanguage operability and is not very well object oriented. The paper proposes a general pattern enabling design of distributed and object oriented applications. It also presents its sample implementations and performance tests.

• A Solution to Image Processing with Parallel MPI I/O and Distributed NVRAM Cache

  Publication

  • A. Malinowski
  • P. Czarnul

  - Scalable Computing: Practice and Experience - Year 2018

  The paper presents a new approach to parallel image processing using byte addressable, non-volatile memory (NVRAM). We show that our custom built MPI I/O implementation of selected functions that use a distributed cache that incorporates NVRAMs located in cluster nodes can be used for efficient processing of large images. We demonstrate performance benefits of such a solution compared to a traditional implementation without NVRAM...

  Full text available to download

• New user-guided and ckpt-based checkpointing libraries for parallel MPI applications

  Publication

  • P. Czarnul
  • M. Frączak

  - Year 2005

  Praca prezentuje szczególy projektowe i implementacyjne jak również wyniki wydajnościowe dwóch nowych bibliotek checkpointingu opracowanych przez autorów dla równoległych aplikacji MPI. Pierwsz biblioteka, tzw. user-guided wymaga od programisty dostarczenia funkcji pakujących i rozpakowujących stan procesu, ale dostarcza łatwego w użyciu API z wykorzystaniem stałych MPI. Wykorzystuje funkcje I/O MPI-2 lub dedykowany proces master...

• MAI Journal

  Journals

  eISSN: 2230-6862

• Three levels of fail-safe mode in MPI I/O NVRAM distributed cache

  Publication

  • A. Malinowski
  • P. Czarnul

  - Procedia Computer Science - Year 2018

  The paper presents architecture and design of three versions for fail-safe data storage in a distributed cache using NVRAM in cluster nodes. In the first one, cache consistency is assured through additional buffering write requests. The second one is based on additional write log managers running on different nodes. The third one benefits from synchronization with a Parallel File System (PFS) for saving data into a new file which...

  Full text available to download

• Portable parallel simulator using MPI for 2D and 3D domains: design and performance testing

  Publication

  • P. Czarnul
  • K. Grzęda

  - Year 2005

  W artykule prezentujemy szczegóły projektowo-implementacyjne naszego modularnego kodu symulacyjnego z wykorzystaniem MPI, w tym nakładaniem obliczeń i komunikacji. Podkreślamy modularność naszej implementacji pozwalającą na łatwą adaptację kodu dla innych zasotosowań. Prezentujemy związek pomiędzy przyspieszeniem obliczeń, rozmiarem i kształtami trójwymiarowych domen z różnymi stosunkami liczby węzłów aktualizowanych przez procesor...