Filters
total: 2866
filtered: 2264
-
Catalog
- Publications 2264 available results
- Journals 23 available results
- Conferences 1 available results
- Publishing Houses 3 available results
- People 74 available results
- Inventions 24 available results
- Projects 13 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 5 available results
- e-Learning Courses 126 available results
- Events 12 available results
- Open Research Data 320 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: DNAK/J
-
Diagnosis of Brain Tumors Through Global Specific DNA Methylation Analysis
Publication -
Molecular Diagnostics of Brain Tumours by Measuring the 5-Methylcytosine Level in Their DNA
Publication -
P04.06 Temozolomide influence on global DNA methylation in glioblastoma cell lines
Publication -
Effects of Base π-Stacking on Damage to DNA by Low-Energy Electrons
Publication -
Direct cloning of heavy metal resistance genes from metagenomic DNA
Publication -
Cross section calculations for electron scattering from DNA and RNA bases.
PublicationPoliczono różniczkowy i scałkowany przekrój czynny na rozproszenie sprężyste elektronów (w przybliżeniu atomów niezależnych) na uracylu, cytozynie, guaninie, adeninie i tyminie w zakresie energii od 50-4000 eV. W przybliżeniu modelu BEB policzono również przekroje czynne na jonizację tych molekuł.
-
Cross sections for electron scattering from selected components of DNA and RNA
PublicationWykorzystując metodę atomów niezależnych obliczono różniczkowe i całkowite przekroje czynne na sprężyste rozproszenie elektronów na wybranych drobinach, będących analogami składników DNA i RNA. Przekroje te obliczono w zakresie energii zderzenia od 50eV do 200 eV dla następujących drobin: C4H8O, C4H8O2, C5H10O2 oraz H3PO4. Przy użyciu metody BEB (binary-ecounter Bethe method) dla powyższych związków obliczono również przekroje...
-
Trójwymiarowe obrazowanie dna morskiego ze szczególnym uwzględnieniem wód płytkich
PublicationW ostatnim dziesięcioleciu nabrały znaczenia obserwacje szerokokątne (ang. swath scan) przy pomocy sonarów bocznych i sonarów wielowiązkowych. Wynikiem pomiarów dokonywanych przy pomocy sonarów wielowiązkowych jest jednak duża liczba danych geoprzestrzennych o precyzyjnie określonej referencji geograficznej, charakteryzujących się zróżnicowaną dynamiką i posiadających zróżnicowaną rozdzielczość. Stwarza to problemy w procesie...
-
Thermodynamic and electrostatic properties of ternary Oxytricha nova TEBP-DNA complex
PublicationZa pomocą metod chemi obliczeniowej badano właściwości molekularne kompleksu telomerowego białka TEBP z Oxytricha nova w kompleksie trójskkładnikowym z DNA o sekwencji telomerowej. Wyliczone wartości energii kompleksowania wskazują specyficznie na jedną z dróg tworzenia kompleksu, gdzie wpierw podjednostka alfa łaczy się z DNA a następnie podjednostka beta dołącza się do takiego dwuskładnikowego kompleksu. Policzone rozkłady molekularnego...
-
DNA modification by 1-nitroacridine derivatives. Comparison of 32P-Postlabeling and restriction enzyme analysis method for the detection of DNA adducts formed by 1-nitroacridines C-1748 and C-857
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny, zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. Metoda 32P-postlabellingu wykazała, że pochodne C-1748 i C-857 tworzą od 4-6 adduktów DNA w systemie komórkowym i bezkomórkowym o innym rozkładzie plam chromatograficznych, jednakże niezależnym od zastosowanego systemu aktywacyjnego. Metoda enzymatycznej analizy restrykcyjnej pozwoliła natomiast śledzić kinetykę...
-
Stanowisko maślaka błotnego Suillus flavidus(Fr.: Fr.) J. S. Presl. w rezerwacie przyrody ''Mierzeja Sarbska'' koło Łeby = A site of bolete Suillus flavidus (Fr: Fr.)J.S. Presl. In Nature reserve ''Mierzeja Sarbska'' near Łeba Town
PublicationW pracy przedstawiono stanowisko maślaka błotnego zlokalizowane w rezerwacie przyrody ''mierzeja Sarbska'' koło Łeby oraz zamieszczono opis opis gatunku
-
Synteza i zastosowanie ditiofosforanów acylowych w reakcji tioacylowania.** 2002, 92 s. 86 rys. 26 tab. bibliogr. 107 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /28.12.2001/. P. Gdań., Wydz. Chemiczny. Promotor: prof. dr hab. J. Rachoń.
Publication.
-
Modyfikacja asfaltów naftowych polimerami. Mechanizm oddziaływań polimer-matryca asfaltowa.**2002, 161 s. 75 rys. 32 tab. bibliogr. 178 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /30.09.2002/ Wydz. Chem. Promotor: prof. dr hab. inż. J. Hupka.
Publication.
-
Efekty dynamiczne w silosach.**2003, 292 s. 120 rys. 8 tab. bibliogr. 240 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /26.03.2003/. Politechnika Gdańska, Wydz. Inż. Lądowej. Promotor: dr hab. inż. J. Tejchman, prof. nadzw. PG.
Publication.
-
Ciągłość i przemiana idei utylitaryzmu. W: Etyczne podstawy ekonomii -teoria i praktyka. Red.nauk. J. Kubka. Gdańsk: Zakł. Nauk. Filoz. Wydz. Zarz. i Ekon. P. Gdań.**2003 s. 83-99 bibliogr.17 poz.
PublicationW artykule na tle prezentacji historii idei utylitaryzmu przeanalizowanomiejsce i rolę tej koncepcji jako filozofii moralnej dla świata biznesu.
-
Oddziaływanie wybranych elementów przekształtnika energoelektronicznego nagenerację zaburzeń przewodzonych.**2002, 134 s. 125 rys. bibliogr. 102 poz. Rozprawa doktorska /17.12.2002/. PG, Wydz. Elektrotech. Automat. Promotor: dr hab. inż. Piotr J. Chrzan, prof. nadzw. PG
PublicationW rozprawie przedstawiono sposób obliczania generowanych zaburzeń elektroma-gnetycznych przewodzonych z układu przekształtnika do sieci zasilającej. Ce-lem pracy było opracowanie, w oparciu o symulację komputerową i badania eks-perymentalne, modeli wybranych elementów układu przekształtnika energoelek-tronicznego, pozwalających na określanie poziomów zaburzeń elektromagnetycz-nych przewodzonych w układach symulacyjnych. Zakres...
-
Decisional-DNA-Based Digital Twin Implementation Architecture for Virtual Engineering Objects
PublicationDigital twin (DT) is an enabling technology that integrates cyber and physical spaces. It is well-fitted for manufacturing setup since it can support digitalized assets and data analytics for product and process control. Conventional manufacturing setups are still widely used all around the world for the fabrication of large-scale production. This article proposes a general DT implementation architecture for engineering objects/artifacts...
-
DNAffinity: a machine-learning approach to predict DNA binding affinities of transcription factors
PublicationWe present a physics-based machine learning approach to predict in vitro transcription factor binding affinities from structural and mechanical DNA properties directly derived from atomistic molecular dynamics simulations. The method is able to predict affinities obtained with techniques as different as uPBM, gcPBM and HT-SELEX with an excellent performance, much better than existing algorithms. Due to its nature, the method can...
-
How acidic amino acid residues facilitate DNA target site selection
PublicationDespite the negative charge of the DNA backbone, acidic residues (Asp/Glu) commonly participate in the base readout, with a strong preference for cytosine. In fact, in the solved DNA/protein structures, cytosine is recognized almost exclusively by Asp/Glu through a direct hydrogen bond, while at the same time, adenine, regardless of its amino group, shows no propensity for Asp/Glu. Here, we analyzed the contribution of Asp/Glu...
-
Prediction based on integration of Decisional DNA and a feature selection algorithm Relief-F
PublicationThe paper presents prediction model based on Decisional DNA and Set of experienced integrated with Relief_F algorithm for feature selection
-
Wpływ dodatku kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) na właściwości mechaniczne żeli żelatynowych
PublicationKwasy nukleinowe cieszą się coraz większym zainteresowaniem pod względem zastosowania ich w przemyśle farmaceutycznym, kosmetycznym oraz żywnościowym. Określono wpływ dodatku długo- i krótkołańcuchowych kwasów nukleinowych na właściwości mechaniczne żeli żelatynowych. Badania wykazały występowanie specyficznych interakcji pomiędzy żelatyną a kwasami nukleinowymi oraz pozwoliły na ocenę wpływu tych oddziaływań na twardość, kohezyjność,...
-
Altered levels of circulating nuclear and mitochondrial DNA in patients with Papillary Thyroid Cancer
Publication -
Mechanisms of Damage to DNA Labeled with Electrophilic Nucleobases Induced by Ionizing or UV Radiation
PublicationHypoxia—a hallmark of solid tumors—makes hypoxic cells radioresistant. On the other hand, DNA, the main target of anticancer therapy, is not sensitive to the near UV photons and hydrated electrons, one of the major products of water radiolysis under hypoxic conditions. A possible way to overcome these obstacles to the efficient radio- and photodynamic therapy of cancer is to sensitize the cellular DNA to electrons and/or ultraviolet...
-
A Colorimetric Microplate Assay for DNA-Binding Activity of His-Tagged MutS Protein
PublicationA simple microplate method was designed for rapid testing DNA-binding activity of proteins. The principle of the assay involves binding of tested DNA by his-tagged protein immobilized on a nickel-coated ELISA plate, following colorimetric detection of biotinylated DNA with avidin conjugated to horseradish peroxidase. The method was used to compare DNA mismatch binding activities of MutS proteins from three bacterial species. The...
-
Methods for Elucidation of DNA-Anticancer Drug Interactions and Their Applications in the Development of New Drugs
PublicationDNA damaging agents including anthracyclines, camptothecins and platinum drugs are among most frequently used drugs in the chemotherapeutic routine. Due to their relatively low selectivity for cancer cells, administration is associated with adverse side effects, whereas the inherent genotoxicity of these drugs is associated with risk of developing secondary cancers. Development of new drugs, which could be spared of these drawbacks...
-
Diet is Not Responsible for the Presence of Several Oxidatively Damaged DNA Lesions in Mouse Urine
Publication -
Selenium Supplementation Reduced Oxidative DNA Damage in Adnexectomized BRCA1 Mutations Carriers
Publication -
Comparison of Oxidative Stress/DNA Damage in Semen and Blood of Fertile and Infertile Men
Publication -
The influence of the substrate temperature on the preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublicationExperiments were carried out to determine the dependence of the physical form of supercoiled DNA films on the initial temperature of the substrate. Such films are often used in irradiation experiments involving low energy particles, like electrons or photons. In order to obtain absolute values for cross sections for such experiments, the spatial distribution of the sample in the film has to be well estimated. These investigations...
-
Comparative Analysis of CpG Sites and Islands Distributed in Mitochondrial DNA of Model Organisms
Publication -
The influence of the substrate temperature on the preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublicationPrzeanalizowano wpływ temperatury na formowanie warstw DNA. Sprawdzono wpływ stabilizatorów na jakość otrzymanych próbek. Stwierdzono, że optymalnymi warunkami przygotowywania filmów do badań w warunkach próżniowych jest - 10 st. C przy minimalnej zawartości NaOH.
-
B26 Differential mitochondrial DNA levels in HD patients depending on the cell type
Publication -
Decisional DNA with embedded Relief-F linear regression for knowledge and experience management
PublicationOmowiono zastowania Decyzyjnego DNA, regresji liniowej oraz funkcji RELIEF-F w procesach formalnego modelowania i wspomagania zarzadzania wiedza oraz zarzadzania doswiadczeniem.
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublicationZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Confirmative electric DNA array-based test for food poisoning Bacillus cereus
Publication -
Theoretical Study of Damage to DNA by 0.2−1.5 eV Electrons Attached to Cytosine
Publication -
Ancient mitochondrial DNA and the genetic history of Eurasian beaver (Castor fiber) in Europe
Publication -
Genome-Wide DNA Methylation and Gene Expression in Patients with Indolent Systemic Mastocytosis
PublicationMastocytosis is a clinically heterogenous, usually acquired disease of the mast cells with a survival time that depends on the time of onset. It ranges from skin-limited to systemic disease, including indolent and more aggressive variants. The presence of the oncogenic KIT p. D816V gene somatic mutation is a crucial element in the pathogenesis. However, further epigenetic regulation may also affect the expression of genes that...
-
Isolation and structure of a covalent cross-link adduct between mitomycin C and DNA
PublicationA DNA cross-link adduct of the antitumor agent mitomycin C (MC) to DNA has been isolated and characterized; the results provide direct proof for bifunctional alkylation of DNA by MC. Exposure of MC to Micrococcus luteus DNA under reductive conditions and subsequent nuclease digestion yielded adducts formed between MC and deoxyguanosine residues. In addition to the two known monoadducts, a bisadduct was obtained. Reductive MC activation...
-
Photostability pf Cy3 and Cy5-labeled DNA in the presence of metallic silver particles
PublicationZbadano wpływ cząstek metalicznego srebra na fotostabilność oligomerów DNA kowalencyjnie związanych z Cy3 lub Cy5. Zbliżenie fluoroforów do cząstek srebra powodowało zwiększenie intensywności fluorescencji i pojawienie się frakcji emisji bardziej odpornej na wybielanie.
-
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) - sources and applicationsin molecular biology
PublicationBiałka wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB) odgrywają ważną rolę w replikacji, rekombinacji i naprawie DNA u bakterii, archea i eukariota. Ostatnio wzrosło zainteresowanie białkami SSB jako przydatnymi narzędziami w metodach badawczych biologii molekularnej, analitycznych i diagnostycznych. Większość znanych prokariotycznych białek SSB zbudowanych jest z czterech podjednostek (homotetramer) z jedną domeną wiążąca (OB) jednoniciowe...
-
Data regarding a new, vector-enzymatic DNA fragment amplification-expression technology for the construction of artificial, concatemeric DNA, RNA and proteins, as well as biological effects of selected polypeptides obtained using this method
PublicationApplications of bioactive peptides and polypeptides are emerging in areas such as drug development and drug delivery systems. These compounds are bioactive, biocompatible and represent a wide range of chemical properties, enabling further adjustments of obtained biomaterials. However, delivering large quantities of peptide derivatives is still challenging. Several methods have been developed for the production of concatemers –...
-
Reakcje fosforowych odczynników nukleofilowych ze związkami hiperwalencyj- nego jodu (III).**2003, 114 s. 79 rys. 8 tab. bibliogr. 79 poz. maszyn. Rozprawa doktorska (29.09.2002) Wydz. Chemiczny PG Promotor: prof. dr hab. inż. J. Rachoń
PublicationRozprawa dotyczy reaktywności związków hiperwalencyjnego jodu III takich jak: jodozobenzen, diacetoksyjodobenzen, hydroksy[tosyloksy]jodobenzen z fosfo-rowymi odczynnikami nukleofilowymi takimi jak: enolowe postacie >P(O)H kwa-sów lub związki typu PR3.
-
Molecular Strategy for Survival at a Critical High Temperature in Eschierichia coli
PublicationThe molecular mechanism supporting survival at a critical high temperature (CHT) in Escherichia coli was investigated. Genome-wide screening with a single-gene knockout library provided a list of genes indispensable for growth at 47°C, called thermotolerant genes. Genes for which expression was affected by exposure to CHT were identified by DNA chip analysis. Unexpectedly, the former contents did not overlap with the latter except...
-
K. Grzelec, J. Staszak-Winkler, Changes in urban transport behaviour and preferences of residents in employment - Gdynia case. Transport Development Challenges in the 21st Century. Proceedings of the 2019 TranSopot Conference. Springer International Publishing .1st ed. 2020. ISBN: 978-3-030-50009-2
Publication -
Badania efektywności separacji i wymiany masy we flotowniku cyklonowym zeszczególnym uwzględnieniem rozkładu pęcherzyków gazu.**2002, 120 s. 20 tab. bibliogr. 109 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /16.01.2002/, Wydz. Chem. Promotor: prof. dr hab. inż. J. Hupka.
Publication.
-
Badania nad wykorzystaniem słomy jęczmiennej w ochronie wód powierzchnio- wych.**2002, 154 s. rys. tab. w rozdz. bibliogr. 126 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /29.05.2002/. P. Gdań., Wydz. Chemiczny. Promotor: prof. dr hab. inż. J. Hupka.
Publication.
-
Application of computer assisted modified coupled mode method for the design of polarimetric sensors. Optical Fibres and Their Applications VIII. Białowieża 23-26 stycznia 2002. Ed. J. Dorosz, R.S. Romaniuk. Wykorzystanie zmodyfikowanej metody modów sprzężonych wspomaganej komputerem do projektowania sensorów polarymetrycznych.
PublicationW pracy przedstawiono rozszerzenie zmodyfikowanej metody modów sprzężonych,dzięki, któremu możliwe jest modelowanie szerokiej klasy światłowodów poddanych jednoczesnemu działaniu wielu zaburzeń. W metodzie tej dokonuje się numerycznego rozwiązania równania modów sprzężonych, w wyniku czego możliwa jest analiza przypadków, w których współczynniki sprzężenia modów nie są stałe wzdłuż światłowodu. W wyniku umiejętnej modyfikacji...
-
Nieliniowa analiza konstrukcji powłokowych za pomocą płaskich trójkątnychelementów skończonych.**2003, rys. tab. w rozdz. bibliogr. 182 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /18.12.2003/. P. Gdań, Wydz. Inż. Ląd. Promotor: dr hab. inż. J. Chróścielewski, prof, nadzw. PG.
Publication.
-
Born–Oppenheimer potential energy curves of NaK from the optimised atomic basis sets
PublicationThe article presents adiabatic potential energy curves of the ground and excited electronic states for the diatomic NaK molecule. The calculations were made using the ab initio computational methods to include electron correlation. The studied molecule was calculated as the effective two-electron problem, in which only the valence electrons of the molecule are explicitly taken into account. The remaining electrons with atomic nuclei...