Search
Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry
Publications
Filters
total: 68
Catalog Publications
Year 2005
-
Thermodynamic and electrostatic properties of ternary Oxytricha nova TEBP-DNA complex
PublicationZa pomocą metod chemi obliczeniowej badano właściwości molekularne kompleksu telomerowego białka TEBP z Oxytricha nova w kompleksie trójskkładnikowym z DNA o sekwencji telomerowej. Wyliczone wartości energii kompleksowania wskazują specyficznie na jedną z dróg tworzenia kompleksu, gdzie wpierw podjednostka alfa łaczy się z DNA a następnie podjednostka beta dołącza się do takiego dwuskładnikowego kompleksu. Policzone rozkłady molekularnego...
Year 2004
-
Allosteric control of Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase.
PublicationPrzedstawiono wyniki badań spektrofluorymetrycznych syntazy GlcN-6-P z Candida albicans oraz enzymu zmutowanego, w którym reszty Trp388 i 690 zostały zamienione na drodze ukierunkowanej mutagenezy na reszty Phe. Metodą spektrofluorymetryczną badano wpływ ligandów: Fru-6-P (substrat), Gln (substrat), UDP-GlcNAc (inhibitor), Glc-6-P (aktywator), DON (analog glutaminy) w odpowiednio dobranych stężeniach. Obecność większości efektorów...
-
Cloning of the thermostable alpha-amylase gene from Pyrococcus woesei in Escherichia coli.
PublicationGen kodujący alfa-amylazę z Pyrococcus woesei klonowano do plazmidów pET21d(+)lub pYTB2, którymi transformowano komórki Escherichia coli. Otrzymana rekombinantowa alfa amylaza wykazuje maksymalną aktywność przy pH 5.6 w temperaturze 95 stC i przejawia około 24 % początkowej aktywności nawet po 2 godz. inkubacji w 120 stC. Duża termostabilność otrzymanego preparatu świadczy o jego przydatności do enzymatycznego upłynniania skrobi.
-
Functional domains of Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase.
PublicationSkonstruowano oddzielnie dwie domeny syntazy GlcN-6-P z Candida albicans jako białka fuzyjne, tj. domenę glutaminazową oraz domenę izomerazową, zawierające sekwencje poliHis, odpowiednio na C- i N-końcu. Zoptymalizowano warunki nadekspresji domen w komórkach Escherichia coli. Oba białka oczyszczono do homogenności przy zastosowaniu chromatografii metalopowinowactwa oraz zbadano ich podstawowe właściwości. Wyznaczono parametry kinetyczne...
-
Induction of apoptosis by triazoloacridinone derivative - C-1533 in HL60 and MOLT4 human leukemia cells.
PublicationPrzeprowadzone badania miały na celu określenie zdolności triazoloakrydonu C-1533 do indukcji śmierci komórek nowotworowych MOLT4 i HL60 na drodze apoptozy. Badanie zjawiska apoptozy przeprowadzono z wykorzystaniem techniki cytofluorymetrii przepływowej, mikroskopii fluorescencyjnej i elektroforezy agarozowej. Badania wykazały, że zarówno w komórkach MOLT4 jak i HL60, spadek mitochondrialnego potencjału błonowego oraz translokacja...
-
Inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase as potential antifungal drugs.
PublicationPrzedstawiono stan obecny i perspektywy zastosowania inhibitorów enzymu syntazy GlcN-6-P jako leków skutecznych w leczeniu grzybic układowych. Używając metod modelowania molekularnego zaprojektowano struktury inhibitorów enzymu należących do dwóch grup strukturalnych: analogów glutaminy oraz analogów stanu przejściowego reakcji katalizowanej przez enzym. Opracowano metody syntezy pochodnych zoptymalizowanych inhibitorów, wykazujących...
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Molecular aspects of the interaction between amphotericin B and a phospholipid bilayer: molecular dynamics studies.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem z grupy polienów makrolidowych. Stosowany jest on w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Wiadomo że związek ten oddziałuje ze składnikami błon lipidowych i tworzy kanały. W przedstawianej pracy prezentowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną układu składającego się z 200 cząsteczek lipidów DMPC i jednej cząsteczki amfoterycyny ułożonej na powierzchni błony. Z przeprowadzonej...
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublicationStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
N-Alkylation of D-glucosamine and 2-amino-2-deoxy-D-glucitol-6-phosphate
PublicationTematem pracy była synteza N-alkilowych pochodnych D-glukosaminy i 2-amino-2-deoxy-D-glukitolo-6-fosforanu
-
Phosphorylation of glucosamine-6-phosphate synthase is important but not essential for germination and mycelial growth of Candida albicans.
PublicationStosując mutagenezę ukierunkowaną dla genu gfa1 kodującego syntazę glukozamino-6-fosforanu Candida albicans otrzymano zmutowaną wersję GFA1S208A. Produkt zmutowanego genu, który utracił miejsce fosforylacji dla kinazy A, wykazywał wszystkie właściwości identyczne do dzikiego enzymu, jednakże nie był substratem dla kinazy. Brak fosforylacji syntazy glukozamino-6-fosforanu przez kinazęA prowadził do redukcji lecz nie eliminował...
-
Professor Edward Borowski and molecular aspects of chemotherapy.
PublicationPrzedstawiono sylwetkę naukową i krótkie podsumowanie najważniejszych osiągnięć badawczych profesora Edwarda Borowskiego. Profesor Borowski jest autorem lub współautorem około 800 publikacji naukowych oraz 70 patentów, a jego prace były cytowane ponad 1100 razy. Do najważniejszych osiągnięć prof. Borowskiego i Jego zespołu naukowego należy zaliczyć: izolację i charakterystykę antybiotyków peptydowych, tetainy i edeiny oraz antybiotyków...
-
The influence of 4-substituted and unsubstituted derivatives of 1-nitroacridine on the cell cycle and induction of apoptosis in human cancer HT29 and HeLa S3.
PublicationZbadano wpływ pochodnych 1-nitroakrydyny C-1748 i C-857, w stężeniach biologicznie istotnych, na cykl życiowy oraz indukcję apoptozy komórek raka jelita grubego HT29 oraz raka szyjki macicy HeLa S3. Metodą cytometrii przepływowej wykazano, że 4-metylo-1-nitroakrydyna C-1748 powoduje akumulację komórek HT29 w fazie S i komórek HeLa S3 w fazie G2 cyklu komórkowego zaś związek C-857 indukuje akumulację komórek HT29 i HeLa S3 w fazie...
-
The synthesis of 1,4,7,10-tetraazacyclododecanes with acetylsalicylic side arm as potential cobalt(II) fluorophores.
PublicationMonoacylowe pochodne 1,4,7,10-tetraazacyklododekanu otrzymano w bezpośredniej reakcji cyklenu z chlorkiem kwasu salicylowego, jak również przy użyciu trichronionego cyklenu. Monoacylową pochodną wykorzystano następnie w reakcji z fosforynem etylu otrzymując difunkcyjny związek. Otrzymane ligandy zbadano spektrofotometrycznie. Obydwa ligandy oddziaływują selektywnie z jonami Co(II), tworząc kompleksy o stechiometrii 2:1 i 1:1 (ligand:metal).
-
What about the multidrug resistance in fungi? - comparison of voriconazole and ''old'' azoles.
PublicationPorównano wyniki oznaczeń aktywności przeciwgrzybowej voriconazolu- nowego leku przeciwgrzybowego z pierścieniem azolowym, z lekami poprzedniej generacji. Zaobserwowano znaczny spadek aktywności biologicznej voriconazolu (podobnie jak starszych leków, takich jak fluconazol czy ketoconazol) względem komórek wielolekoopornych, co stanowi przesłankę, że nowy lek jest substratem dla głównych pomp kształtujących zjawisko wielolekooporności...
Year 2002
-
Glyceraldehyde - 3 - phosphate dehydrogenase gen from Amanita citrina. Ac-cession AJ532582, 2002 GenBank NCBI [on line].**2002 [cytowany 07.01.03]. Dostępny: http://www.ncbi.nml.nih.gov Sekwencja genu kodującego dehydrogenzę aldehydu - 3 - fsfoglicerynowego dla muchomora cytrynowego (Amanita citrina).
PublicationPo raz pierwszy ustalono sekwencję nukleotydową fragmentu genu gpd (dehydro-genazy aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego) dla muchomora cytrynowego (Amanitacitrina), pozwoli to na ustalenie sekwencji starterów umożliwiających wykry-wanie grzybów tego gatunku za pomocą techniki PCR.
-
Glyceraldehyde - 3 - phosphate dehydrogenase gene from Coprinus atramenta-rius. Accession AJ532581, 2002 GenBank NCBI [on line].**2002 [cytowany 07.01.03]. Dostępny: http://www.ncbi.nlm.nih.gov Sekwencja genu kodujacego dehydrogenazę aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego dla czernidłaka pospolitego (Coprinus atramentarius).
PublicationPo raz pierwszy ustalono sekwencję nukleotydową fragmentu genu gpd (dehydro-genazy aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego)dla gatunku Coprinus atramentarius,pozwoli to na zaprojektowanie pary starterów umożliwiających wykrywaniegrzybów tego gatunku za pomocą reakcji PCR.
-
Skorygowana nomenklatura rodników, jonów, jonorodników i podobnych indywi-duów chemicznych. (Zalecenia IUPAC 1993). Z ang. przełożyli: M. Hoffmann, S. Milewski, W. Przychodzeń, T. Sokołowska, D. Witt. Red. nauk. T. Sokołow- ska, A. Wiśniewski. Wrocław: Uniw. Wroc.**2001, 123 s. 4 tab. bibliogr. 21 poz. Biblioteka Wiadomości Chemiczne. Org.: W. H. Powell. Revised nomenclature for radicals, ions, radical ions and related species (IUPAC recommendations 1993). Pure Appl. Chem. vol. 65.
PublicationDokument zawiera reguły tworzenia nazw systematycznych cząstek wymienionychw tytule. Reguł jest 110. Numerowane są od RC-80 do RC-85, z podpunktami.Zastępują one Reguły C-80 do C-85 Nomenklatury Związków Organicznych IUPAC zroku 1979. Reguły są ilustrowane wzorami (ok. 600), którym przypisano nazwęlub nazwy systematyczne.