Symulacje biomolekularne jako narzędzie do badania mechanizmów rozpoznania i wiązania pomiędzy białkami - Publikacja - MOST Wiedzy

Wyszukiwarka

Symulacje biomolekularne jako narzędzie do badania mechanizmów rozpoznania i wiązania pomiędzy białkami

Abstrakt

Białka pełnią wielorakie funkcje w organizmach żywych, jednak rzadko działają samodzielnie. W zdecydowanej większości przypadków współpracują one między sobą tworząc makrokompleksy o precyzyjnie zorientowanych podjednostkach. Oddziaływania międzybiałkowe wzbudzają więc duże zainteresowanie, jako że w istotny sposób odpowiadają za aktywność biologiczną białek. Choć do tej pory opracowano wiele metod doświadczalnych badania oddziaływań białko-białko, to często są one kosztowne oraz rzadko kiedy pozwalają na scharakteryzowanie w bezpośredni sposób molekularnych szczegółów mechanizmów wiązania białek między sobą. Dlatego też istnieje zapotrzebowanie na metody, które mogłyby pokierować badaniami eksperymentalnymi. W niniejszej pracy pokazuję, że nowoczesne metody komputerowe umożliwiają zarówno precyzyjne przewidywanie struktur kompleksów białkowych, jak również scharakteryzowanie sił napędowych leżących u podstaw ich tworzenia. By zbadać zakres stosowalności tych metod, w swojej pracy badałem trzy różnorodne systemy: i) tworzenie kompleksu przez białka Hsp70 z ich partnerami pomocniczymi, ii) wewnątrzdomenowe oddziaływania w ramach domeny 4HB białka zuotyny iii) wiązanie substratów przez y-sekretazę. Otrzymane wyniki pokazują, że symulacje dynamiki molekularnej ułatwiają interpretację otrzymywanych wyników doświadczalnych, i dostarczają hipotez, które pomagają w projektowaniu badań.

Cytuj jako

Pełna treść

pobierz publikację
pobrano 63 razy
Wersja publikacji
Accepted albo Published Version
Licencja
Copyright (Author(s))

Słowa kluczowe

Informacje szczegółowe

Kategoria:
Doktoraty, rozprawy habilitacyjne, nostryfikacje
Typ:
praca doktorska pracowników zatrudnionych w PG oraz studentów studium doktoranckiego
Język:
polski
Rok wydania:
2019
Weryfikacja:
Politechnika Gdańska

wyświetlono 44 razy

Publikacje, które mogą cię zainteresować

Meta Tagi