dr hab. inż. Piotr Bruździak
Zatrudnienie
- Profesor uczelni w Katedra Chemii Fizycznej
Publikacje
Filtry
wszystkich: 42
Katalog Publikacji
Rok 2008
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublikacjaWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
Rok 2009
-
Effects of Urea and Trimethylamine-N-oxide on the Properties of Water and the Secondary Structure of Hen Egg White Lysozyme
PublikacjaW celu określenia sposobu hydratacji mocznika i N-tlenku trimetyloaminy, wykorzystano spektroskopię oscylacyjną FTIR. Dane eksperymentalne, otrzymane z pomiarów widm oscylacyjnych wody półciężkiej (HDO) rozcieńczonej izotopowo w wodnych roztworach badanych związków, analizowane były za pomocą "metody widm różnicowych". Strukturalno-energetyczna charakterystyka wody zaburzonej przez cząsteczki osmolitów wskazuje, że woda zaburzona...
-
Preclusion of irreversible destruction of Dr adhesin structures by a high activation barrier for the unfolding stage of the fimbrial DraE subunit
PublikacjaFimbrie Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli stanowią przykład eksponowanych powierzchniowo struktur adhezyjnych podlegających biogenezie według zakonserwowanego, pośród bakterii Gram-ujemnych, systemu "chaperone-usher" ("białko opiekuńcze-zewnątrzbłonowe białko kanałowe"). Powyższe struktury adhezyjne są niezbędne w procesie specyficznej adhezji bakterii do receptorów zlokalizowanych na powierzchni docelowych komórek gospodarza....
-
Purification and biochemical characteristic of a cold-active recombinant esterase from Pseudoalteromonas sp. 643A under denaturing conditions.
PublikacjaIn this paper production of a cold-active esterase EstA from the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A in E. coli expression system was described. The purification and biochemical characteristic of EstA were performed in the presence of urea and then compared with results obtained for the esterase with no addition of urea and isolated from the native source. In both cases the cold-active enzyme displayed similar properties....
Rok 2010
-
Chemometric determination of solute-affected solvent vibrational spectra as a superior way of information extraction on solute solvation phenomena
PublikacjaW pracy zaprezentowano dwie chemometryczne metody wyznaczania widm zaburzonych rozpuszczalnika oraz liczby cząsteczek zaburzonych, na podstawie zmierzonych serii wibracyjnych widm FT-IR roztworów substancji. Pierwsza z metod została stworzona na podstawie Namiarowej Analizy Faktorowej (ang. Target Factor Analysis). Druga z nich wykorzystuje algorytm izolacji widm czystych składników z serii widm mieszanin. Działanie obu metod zostało...
-
Synthesis and structural characterization of novel 2-benzimidazolylthioureas: adducts of natural isothiocyanatesand 2-amino-1-methylbenzimidazole
PublikacjaNa drodze syntezy chemicznej uzyskano addukty naturalnych izotiocyjanianów - alilu, benzylu i fenyloetylu i 2-amino-1-metylobenzoimidazolu. W następstwie optymalizacji warunków reakcji, poszczególne 2-benzimidazolilotiomoczniki otrzymano produkty z umiarkowanymi wydajnościami. Strukturę molekularną i krystaliczną produktów scharakteryzowano przy użyciu metod spektroskopowych i X-ray. Analiza uzyskanych widm pozwoliła stwierdzić,...
-
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublikacjaAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
Rok 2011
-
Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits
PublikacjaInwazyna DraD kodowana przez operon dra posiada strukturę charakterystyczną dla białek podjednostkowych fimbrii typu chaperone-usher. Fold-Ig białka DraD posiada dwie charakterystyczne cechy wyróżniające je z pośród rodziny fimbrialnych białek podjednostkowych: 1) zaburzenie struktury beta-beczki w rejonie szczeliny akceptorowej objawiające się układem wiązań wodorowych głównego łańcucha polipeptydowego oraz 2) nietypowo usytuowany...
-
Stabilizing agents and protein stability
PublikacjaBiałka są kluczowymi elementami żywych organizmów, jak również efektywnymi katalizatorami w biotechnologii i medycynie. Szybki rozwój wielu gałęzi biotechnologii wiąże się z coraz większym zapotrzebowaniem na produkty białkowe charakteryzujące się wysoką stabilnością. Jednym ze sposobów osiągnięcia większej stabilności białek jest wykorzystanie małych związków organicznych, tzw. osmolitów. Do tej grupy związków należą aminokwasy,...
Rok 2012
-
Characteristics of hydration water around hen egg lysozyme as the protein model in aqueous solution. FTIR spectroscopy and molecular dynamics simulation
PublikacjaW niniejszej pracy przedstawiono wyniki badań dotyczące hydratacji białka modelowego - lizozymu z jaja kurzego w roztworze wodnym. Wiodącą techniką stosowaną w badaniach była spektroskopia oscylacyjna FTIR z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego wody półciężkiej HDO w roztworze wody zwykłej. Analiza widma HDO przy pomocy "metody widm zaburzonych" pozwoliła na wyizolowanie widma wody zaburzonej przez lizozym, a tym samym...
-
Chemometric Method of Spectra Analysis Leading to Isolation of Lysozyme and CtDNA Spectra Affected by Osmolytes
PublikacjaW niniejszej pracy zaprezentowana została chemometryczna metoda analizy danych widmowych, prowadząca do wyizolowania widm FTIR biomakrocząsteczek (lizozymu z białka jaja kurzego i ctDNA) zaburzonych przez wybrane osmolity (TMAO, betainę) w roztworach wodnych. Została ona oparta na metodzie widm różnicowych, wykorzystywanej pierwotnie do określania struktury rozpuszczalnika wokół cząsteczek substancji rozpuszczonej. Cykliczne wykorzystanie...
Rok 2013
-
Biochemical characteristic of biofilm of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains.
PublikacjaUrinary tract infections caused by Escherichia coli are very common health problem in the developed countries. The virulence of the uropathogenic E. coli Dr+ IH11128 is determined by Dr fimbriae, which are homopolymeric structures composed of DraE subunits with the DraD protein capping the fiber. In this study, we have analyzed the structural and biochemical properties of biofilms developed by E. coli strains expressing Dr fimbriae...
-
Influence of Osmolytes on Protein and Water Structure: A Step To Understanding the Mechanism of Protein Stabilization
PublikacjaResults concerning the thermostability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions with stabilizing osmolytes, trimethylamine-N-oxide (TMAO), glycine (Gly), and its N-methyl derivatives, N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), and N,N,N-trimethylglycine (betaine, TMG), have been presented. The combination of spectroscopic (IR) and calorimetric (DSC) data allowed us to establish a link between osmolytes’ influence on...
Rok 2014
-
Cross-linking of epoxy-oligomeric mixtures in the presence of modified phenol-formaldehyde resins
PublikacjaCross-linking of epoxy oligomeric mixtures consisting of industrial epoxy resin ED-20, oligoetheracrylate TGM-3, peroxide derivative of epoxy resin ED-24 and phenol-formaldehyde oligomer with unsaturated methacrylate fragments or peroxide groups was studied in the presence of polyethylenepolyamine at room temperature and heated to 383, 403 or 423 K for 15, 30, 45, 60 and 75 minute. The influence of mixture composition, temperature...
-
Ekspertyza w celu ustalenia utraty właściwości powłoki epoksydowej zastosowanej na konstrukcji stalowej - Raport z badań zleconych - Numer umowy: 031008
Publikacja.
Rok 2015
-
Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studies
PublikacjaInteractions between osmolytes and hen egg white lysozyme in aqueous solutions were studied by means of FTIR spectroscopy and molecular dynamics. A combination of difference spectra method and chemometric analysis of spectroscopic data was used to determine the number of osmolyte molecules interacting with the protein, and the preferential interaction coefficient in presented systems. Both osmolytes – L-proline and trimethylamine-N-oxide...
-
Determination of Hydroxy Groups in the Modified Epoxy Oligomers Using IR-Spectroscopy
PublikacjaThe use of IR-spectroscopy has been proposed to determine the content of hydroxy groups in the modified functional oligomers based on bisphenol A diglycidyl ether. Apart from hydroxy groups the investigated oligomers contain epoxy or peroxy, carboxy or acrylic groups.
Rok 2016
-
General Mechanism of Osmolytes’ Influence on Protein Stability Irrespective of the Type of Osmolyte Cosolvent
PublikacjaThe stability of proteins in an aqueous solution can be modified by the presence of osmolytes. The hydration sphere of stabilizing osmolytes is strikingly similar to the enhanced hydration sphere of a protein. This similarity leads to an increase in the protein stability. Moreover, the hydration sphere of destabilizing osmolytes is significantly different. These solutes generate in their surroundings so-called “structurally different...
-
Protein thermal stabilization in aqueous solutions of osmolytes
PublikacjaProteins’ thermal stabilization is a significant problem in various biomedical, biotechnological, and technological applications. We investigated thermal stability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions of the following stabilizing osmolytes: Glycine (GLY), N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), N,N,N-trimethylglycine (TMG), and trimethyl-N-oxide (TMAO). Results of CD-UV spectroscopic investigation were compared...
-
Synthesis and properties of carboxy derivative of Epidian 6 monomethacrylate (in English)
PublikacjaWe present the synthesis of an oligomer with carboxy and methacrylic groups based on Epidian 6. The effect of the catalyst nature and amount, solvent nature and process temperature on the rate of the reaction between Epidian6 monomethacrylate and adipic acid was examined at 313, 323 and 333 K in the presence of 4-dimethylaminopyridine, 1,4-diazobicyclo[2.2.2]octane, and benzyltriammonium chloride. The synthesized oligomer was characterized...
wyświetlono 2794 razy