Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits
Abstrakt
Inwazyna DraD kodowana przez operon dra posiada strukturę charakterystyczną dla białek podjednostkowych fimbrii typu chaperone-usher. Fold-Ig białka DraD posiada dwie charakterystyczne cechy wyróżniające je z pośród rodziny fimbrialnych białek podjednostkowych: 1) zaburzenie struktury beta-beczki w rejonie szczeliny akceptorowej objawiające się układem wiązań wodorowych głównego łańcucha polipeptydowego oraz 2) nietypowo usytuowany mostek disiarczkowy, który łączy beta nici B I F - lokalizacja obserwowana tylko w podrodzinie DraD-podobnych inwazyn. W celu określenia wpływu unikalnych cech strukturalnych białka DraD na jego stabilność oraz mechanizm denaturacji termicznej przeprowadzone zostały badania DSC oraz FT-IR, które dały następujące wyniki: 1) Białko DraD charakteryzuje się niską stabilnością (standardowa energia Gibbsa 18.4 +/- 1.4 kJ/mol, entalpia denaturacji 131 +/- 25 kJ/mol), która kontrastuje z prawie nieskończoną stabilnością wcześniej opisanego białka fimbrialnego DraE-sc. 2) Białko DraD denaturuje termalnie zgodnie z modelem równowagowym, dwu-stanowym w przeciwieństwie do nieodwracalnej, kontrolowanej kinetycznie denaturacji białka DraE-sc. 3) Specyficzny dla białka DraD mostek disiarczkowy pełni istotną rolę na etapie fałdowania białka, jego efekt stabilizacyjny w dojrzałym białku jest niewielki. Dane opublikowane dotychczas podkreślają unikalne własności biologiczne inwazyny DraD jako fimbrialnego białka podjednostkowego: niezależny od białka chaperone proces fałdowania, niezależny od białka usher transport na powierzchnię komórki oraz możliwość występowania w dwóch formach - jako niezwiązana podjednostka oraz luźno związana podjednostka szczytowa fimbrii. Przedstawiona kalorymetryczna oraz FT-IR analiza stabilności białka DraD w połączeniu z danymi strukturalnymi wskazują, iż białko to charakteryzuje się również unikalnymi własnościami fizykochemicznymi oraz strukturalnymi w kontekście jego przynależności do rodziny białek podjednostkowych układów fimbrialnych.
Cytowania
-
2
CrossRef
-
0
Web of Science
-
2
Scopus
Autorzy (6)
Cytuj jako
Pełna treść
- Wersja publikacji
- Accepted albo Published Version
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1186/1472-6807-11-25
- Licencja
- otwiera się w nowej karcie
Słowa kluczowe
Informacje szczegółowe
- Kategoria:
- Publikacja w czasopiśmie
- Typ:
- artykuł w czasopiśmie wyróżnionym w JCR
- Opublikowano w:
-
BMC STRUCTURAL BIOLOGY
nr 11,
ISSN: 1471-2237 - Język:
- angielski
- Rok wydania:
- 2011
- Opis bibliograficzny:
- Piątek R., Bruździak P., Zalewska-Piatek B., Wojciechowski M., Namieśnik J., Kur J.: Analysis of the unique structural and physicochemical properties of the DraD/AfaD invasin in the context of its belonging to the family of chaperone/usher type fimbrial subunits// BMC STRUCTURAL BIOLOGY. -Vol. 11, (2011), s.25-
- DOI:
- Cyfrowy identyfikator dokumentu elektronicznego (otwiera się w nowej karcie) 10.1186/1472-6807-11-25
- Weryfikacja:
- Politechnika Gdańska
wyświetlono 134 razy
Publikacje, które mogą cię zainteresować
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
- B. Zalewska-Piątek,
- M. Kur,
- S. Wilkanowicz
- + 2 autorów
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
- B. M. Zalewska-Piątek,
- S. I. Wilkanowicz,
- R. Piątek
- + 1 autorów