Wyszukiwarka
Wyniki wyszukiwania dla: bioinformatyka
-
Bioinformatyka
Kursy OnlineKurs dotyczy bioinformatyki. Bioinformatyka jest dziedziną nauki, w której biologia, informatyka oraz technologie informacyjne zlewają się w jedną dyscyplinę.
-
Bioinformatyka - 2022
Kursy OnlinePodstawowy kurs Bioinformatyki dla studentów 5 semestru Biotechnologii
-
Bioinformatyka 2
Kursy Online -
Bioinformatyka II - 2022
Kursy Online -
Współpraca nauki i biznesu w obszarze projektów medycznych
WydarzeniaZapraszamy do rejestracji na kolejne webinarium związane z odkrywaniem, rozwojem i komercjalizacją wynalazków medycznych. Swoim doświadczeniem podzieli się z nami tym razem dr Rafał Kamiński z firmy OncoArendi.
-
Konrad Stawiski dr n. med.
Osoby -
Marek Wojciechowski dr hab. inż.
Osoby -
Metoda porównywania drzew filogenetycznych wykorzystująca najlżejsze doskonałe skojarzenie w grafach dwudzielnych
PublikacjaDrzewa filogenetyczne przedstawiają historyczne, ewolucyjne związki pokrewieństwa między różnymi gatunkami lub różnymi osobnikami w ramach jednego gatunku. Istnieje wiele metod rekonstruowania drzew filogenetycznych. Wykorzystywanie różnych metod na tym samym zbiorze danych zazwyczaj owocuje powstaniem różnych drzew. Pojawia się zatem pytanie: jak bardzo dwa dane drzewa różnią się od siebie. W niniejszej pracy prezentujemy nową...
-
Porównywanie topologii drzew i sieci filogenetycznych z wykorzystaniem metryki błędu
PublikacjaPodstawowymi modelami historii ewolucji organizmów są drzewa i sieci filogenetyczne. Ponieważ algorytmy konstrukcji filogenów zwracają różne wyniki dla tych samych danych wejściowych, powstaje problem oceny, który filogen najlepiej reprezentuje historię ewolucji dla zadanego zbioru gatunków. W pracy podano definicję metryki dla przestrzeni drzew o n liściach, zwanej metryką błędu. Dokonano przeglądu miar odległości na przestrzeni...
-
Algorytm budowy reprezentacji przedziałowej grafu jako heurystyka dla problemu mapowania DNA
PublikacjaW pracy dokonano analizy przydatności algorytmu Corneil'a budowy reprezentacji przedziałowej grafu jako heurystyki dla problemu tworzenia map fizycznych DNA. Prezentowana analiza dotyczy dwóch osobno rozpatrywanych przypadków, w których do danych wzorcowych wprowadzamy odpowiednio błędy negatywne (reprezentujące niedobór informacji) oraz błędy pozytywne (reprezentujące fałszywe informacje). Rozpatrywany algorytm zachowuje się znacznie...
-
Comparing phylogenetic trees using a minimum weight perfect matching
PublikacjaA phylogenetic tree represents historical evolutionary relationshipbetween different species or organisms. There are various methods for reconstructing phylogenetic trees.Applying those techniques usually results in different treesfor the same input data. An important problem is to determinehow distant two trees reconstructed in such a wayare from each other. Comparing phylogenetic trees is alsouseful in mining phylogenetic information...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu
PublikacjaModuł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublikacjaBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Grafowy model macierzy ultrametrycznej i jego zastosowania w filogenezie i t-kolorowaniu
PublikacjaW pracy podano definicję macierzy ultrametrycznej i jej reprezentację grafową. Macierz ta jest wykorzystywana głównie w filogenezie, do budowy drzew ultrametrycznych. W pracy opisano jeden z algorytmów słuzący do konstrukcji takich drzew. Ponadto, omówiono inne możliwe zastosowania modelu grafowego macierzy, tym razem dla problemu przydziału częstotliwości dla nadajników. Zaproponowano również rozwiązanie tego problemu w szczególnym...
-
Construction of phylogenetic trees with topological constraints
PublikacjaThis paper proposes a method of reconstruction of phylogenetic trees based on heuristic search with topological constraints. Using topological constraints it is possible to reduce the set of solutions as well as to enforce that the result is consistent with a given hypothesis about the evolution process within some group of species. Along with this work a number of algorithms used for phylogenetic analysis were implemented. Those...
-
Anna Toruńska-Sitarz
OsobyToruńska-Sitarz Anna, dr (anna.torunska@ug.edu.pl, https://www.researchgate.net/profile/Anna_Torunska-Sitarz) – absolwentka Oceanografii na Uniwersytecie Gdańskim, adiunkt w Zakładzie Biotechnologii Morskiej na Wydziale Oceanografii i Geografii UG. Autorka kilkunastu publikacji naukowych, wykonawca w projektach krajowych i międzynarodowych finansowanych przez m.in. NCN, 7PR UE, COST, Interreg. Jej zainteresowania badawcze dotyczą...
-
Filip Anaszewicz mgr inż.
Osoby