Search
Search results for: KASKADA ZAPALNO-GENETYCZNA
-
Migotanie przedsionków - kaskada zapalno-genetyczna. Rola procesu zapalnego w migotaniu przedsionków
PublicationRola procesu zapalnego, wskaźniki zapalne, czynniki predysponujące wystąpienie migotania przedsionków po zabiegu operacyjnym, czynniki wyzwalające napad pooperacyjnego migotania przedsionków, działanie interleukiny.
-
Protokoły łączności do transmisji strumieni multimedialnych na platformie KASKADA
PublicationPlatforma KASKADA rozumiana jako system przetwarzania strumieni multimedialnych dostarcza szeregu usług wspomagających zapewnienie bezpieczeństwa publicznego oraz ocenę badań medycznych. Wydajność platformy KASKADA w znaczącym stopniu uzależniona jest od efektywności metod komunikacji, w tym wymiany danych multimedialnych, które stanowią podstawę przetwarzania. Celem prowadzonych prac było zaprojektowanie podsystemu komunikacji...
-
KASKADA Platform in Cloud Environment
PublicationKASKADA is a computing platform for developing and running services and applications oriented to multimedia processing and data streaming. A solution for serving the platform in the PaaS model is presented. The paper briefly describes the software for creating the private cloud environment based on the OpenStack software. The coud has been deployed to a supercomputer working in C2 NIWA at the Gdansk University of technology. This...
-
Funkcjonalność platformy KASKADA
PublicationPrzedstawiono opis funkcjonalności platformy KASKADA, a w szczególności jej architektury oprogramowania, mechanizmów zarządzania oraz biblioteki usług aplikacyjnych. Zaprezentowano poszczególne komponenty platformy, opisano ich budowę i implementację podstawowych funkcji, jak również zasygnalizowano problemy jakie wystąpiły podczas jej implementacji.
-
Zarządzanie zdarzeniami na platformie KASKADA
PublicationZdefiniowano pojęcie zdarzenia i opisano proces obsługi zdarzeń w ramach platformy KASKADA, wprowadzając pojęcia strumieni zdarzeń, filtrów zdarzeń i kanałów zdarzeń typu e-mail i JMS. Przedstawiono sposób monitorowania zdarzeń bieżących i przeszłych. Wyszczególniono rozwiązania implementacyjne procesu przetwarzania zdarzeń uwzględniające komponentową architekturę platformy KASKADA, uwypuklając ich elastyczność w przypadku rozwoju...
-
Metody testowania platformy KASKADA
PublicationW rozdziale przedstawiono wykorzystywany iteracyjny i inkrementalny proces wytwarzania oprogramowania, ze szczególnym uwzględnieniem planowania, wykonywania i śledzenia testów oprogramowania platformy KASKADA. Zaprezentowano model V i przykłady testów jednostkowych, systemowych, wydajnościowych i wiarygodnościowych. Przedstawiono wybrane wyniki testów oraz ich wpływ na konstrukcję platformy.
-
Użyteczność platformy KASKADA (rozdział 6)
PublicationZadania wykonane w ramach projektu MAYDAY EURO 2012 w temacie można podzielić na dwie główne kategorie: prace implementacyjne, obejmujące zarówno implementację rozwiązań ekstrakcji cech twarzy jak i systemów rozpoznawania i typowania osób na platformach WINDOWS i KASKADA, prace badawcze, obejmujące z kolei badania związane ze skutecznością typowania i rozpozna-wania osób oraz możliwości zrównoleglania opracowanych rozwiązań na...
-
Systemy monitorowania na platformie KASKADA
PublicationW artykule znajduje się opis projektu pt. „MAYDAY EURO 2012” Superkomputerowa platforma kontekstowej analizy strumieni danych multimedialnych do identyfikacji wyspecyfikowanych obiektów lub niebezpiecznych zdarzeń. Projekt jest współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego i Budżetu Państwa w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka. KASKADA jest platformą na klastrze komputerowym (superkomputer Galera)...
-
Kaskada - scenariusze analizy strumieni multimedialnych
PublicationZaprezentowano podstawowe mechanizmy działania platformy KASKADA ze względu na wykonywanie usług prostych związanych z realizacją algorytmów analizy strumieni multimedialnych, jak również usług złożonych dotyczących wykonywania bardziej skomplikowanych scenariuszy. Rozpatrzono problemy implementacyjne na przykładzie scenariusza analizy strumieni z kamer wideo.
-
Parallelization of video stream algorithms in kaskada platform
PublicationThe purpose of this work is to present different techniques of video stream algorithms parallelization provided by the Kaskada platform - a novel system working in a supercomputer environment designated for multimedia streams processing. Considered parallelization methods include frame-level concurrency, multithreading and pipeline processing. Execution performance was measured on four time-consuming image recognition algorithms,...
-
The task graph assignment for KASKADA platform
PublicationArtykuł opisuje model obliczeniowy wykorzystany w platformie KASKADA. Opiera się on na dwóch podstawowych elementach: węzłach klastra obliczeniowego oraz grafie zadań. Przeanalizowane zostały algorytmy przydzielania węzłów obliczeniowych dla zadań w zależności od kryteriów: minimalizacja fragmentacji klastra i minimalizacja opóźnienia przetwarzania danych. Zostały przedstawione wyniki symulacji opisanych algorytmów oraz ich...
-
Platforma KASKADA - proces wytwarzania oprogramowania
PublicationZostał przedstawiony proces wytworzenia Platformy KASKADA służącej do przetwarzania strumieni multimedialnych w rozproszonym środowisku superkom-putera. Przedstawiono wymagania dotyczące Platformy, a następnie opisano przyjętą metodykę wytwarzania. Opi-sano przebieg poszczególnych iteracji procesu. Przedsta-wiono proces wytwarzania usług, od implementacji algo-rytmu, przez wdrożenie na Platformę, aż po akceptację i udostępnienie...
-
KASKADA - multimedia processing platform architecture
PublicationPrzedstawiono architekturę platformy KASKADA (skrót od: Kontekstowa Analiza Strumieni Danych z Kamer do Aplikacji Definiujących Alarmy), będącą częścią projektu MAYDAY EURO 2012. Opisano nowy wielowarstwowy model przetwarzania strumieni multimedialnych. Zaproponowano następujące warstwy: usług - prostych i złożonych, zadań obliczeniowych i procesów. Przedstawiono przykładowy scenariusz wraz ze szczegółami jego wykonania, jak również...
-
Dystrybucja, archiwizacja i przetwarzanie strumieni multimedialnych na platformie KASKADA
PublicationZaprezentowano metody przetwarzania strumieni multimedialnych na platformie KASKADA. Przedstawiono koncepcję dystrybucji strumieni do zadań obliczeniowych wykonywanych na poszczególnych węzłach klastra komputerowego. Zaprezentowano w jaki sposób dane strumieni są konwertowane i dostosowywane do wykorzystywania przez algorytmy obudowane w tzw. Ramkę KASKADA. Przedstawiono projekt i implementację archiwum strumieni multimedialnych...
-
Platforma KASKADA jako system zapewniania bezpieczeństwa poprzez masową analizę strumieni multimedialnych w czasie rzeczywistym
PublicationW artykule przedstawiono Platformę KASKADA rozumianą jako system przetwarzania danych cyfrowych i strumieni multimedialnych oraz stanowiącą ofertę usług wspomagających zapewnienie bezpieczeństwa publicznego, ocenę badań medycznych i ochronę własności intelektualnej. celem prowadzonych prac było stworzenie innowacyjnego systemu umozliwiajacego wydajną i masową analizę dokumentów cyfrowych i strumieni multimedialnych w czasie rzeczywistym...
-
Integracja usług multimedialnych na przykładzie platformy KASKADA
PublicationOpisano metody integracji wykorzystywane podczas tworzenia aplikacji na platformie KASKADA. Przedstawiono trzy podstawowe elementy podlegające integracji: aplikacje, usługi i urządzenia zewnętrzne. Zaproponowano metody współpracy między nimi, jak również przedstawiono szczegóły techniczne komunikacji: usługi sieciowe dla synchronicznego wykonywania usług, system kolejkowy dla asynchronicznej wymiany wiadomości oraz specjalnie zaprojektowany...
-
Monitorowanie usług i zadań na platformie KASKADA
PublicationPrzedstawiono monitor usług na platformie KASKADA. Zaprezentowano trzy sposoby monitorowania usług (1) przez mechanizmy wewnętrzne platformy, (2) na bieżąco przez użytkownika (3) przez użytkownika po zakończeniu działania usługi. Zawarto szczegółowy opis cyklu życia usługi i związanych z nią zadań obliczeniowych wraz z wymianą informacji pomiędzy elementami podlegającymi monitorowaniu oraz hierarchią i porządkiem uzupełniania plików...
-
Inżynieria genetyczna w świetle dialektyki oświecenia
Publication -
KASKADA - środowisko do wytwarzania i uruchamiania multimedialnych aplikacji równoległych
PublicationOpisano podstawowe cechy platformy KASKADA jako środowiska do tworzenia i uruchamiania multimedialnych aplikacji rozproszonych. Przedstawiono funkcjonalność wspierającą konstrukcję algorytmów, zaimplementowanych jako zadania obliczeniowe wykonujące analizę danych wejściowych, usług prostych umożliwiających uruchamianie zadań obliczeniowych oraz usług złożonych agregujących usługi proste za pomocą scenariuszy wykonania. Zaprezentowano...
-
Klasyfikacja usług i ich wykorzystanie do wytwarzania aplikacji na platformie Kaskada
PublicationPrzedstawiono metodologię komponentowego wytwarzania aplikacji bazujących na strumieniowym przetwarzaniu danych. Scharakteryzowano proces wytwarzania oparty o nowo utworzoną platformę Kaskada, ulokowaną w środowisku superkomputera Galera. Przedstawiono gotową listę usług dostępnych na tej platformie. Podano przykładowy scenariusz orkiestracji usług z różnych kategorii, pozwalającym na skrócenie czasu wytwarzania gotowej aplikacji.
-
Zespół Imerslund-Gräsbecka - rzadka choroba genetyczna różnych ras psów
Publication -
Inżynieria genetyczna wykład 9.06.2020
e-Learning CoursesKolejny wyklad zdalny z inżynierii genetycznej w postaci webinarium.
-
Inżynieria genetyczna wykład 2.06.2020
e-Learning CoursesKolejny wyklad zdalny z inżynierii genetycznej w postaci webinarium.
-
Charakterystyka genetyczna szczepów Klebsiella pneumoniae izolowanych od pacjentów po przeszczepieniu nerki oraz badanie wpływu leków immunosupresyjnych na ekspresję genów bakteryjnych
PublicationBakterie z gatunku Klebsiella pneumoniae należą do oportunistycznych patogenów odpowiedzialnych za zakażenia szpitalne. Drobnoustroje te wykazują skłonność do oporności wielolekowej i wysokiej wirulencji, co stanowi poważne zagrożenie dla pacjentów nieimmunokompetentnych. Wśród pacjentów po transplantacji nerki zakażenia układu moczowego (ZUM) stanowią najczęstszą przyczynę powikłań infekcyjnych. Mechanizmy molekularne leżące u...
-
System wspomagający diagnozowanie chorób na obrazach endoskopowych przy użyciu nowoczesnych algorytmów działających na platformie Kaskada
PublicationPraca ma na celu opisanie działania systemu, stworzonego w ramach projektu Mayday 2012 prowadzonego przez Politechnikę Gdańską, mającego na celu wspomaganie lekarza w badaniach endoskopowych. W pracy przedstawiono poszczególne komponenty, z których składa się system, ich wzajemne powiązania oraz sposób integracji ze środowiskiem równoległego przetwarzania KASKADA (Kontekstowa Analiza Strumieni danych z Kamer dla Aplikacji Definiujących...
-
Inżynieria Tkankowa i Genetyczna - Nowy
e-Learning Courses -
Inżynieria genetyczna wykład 5.05.2020 15.15
e-Learning CoursesKolejny wykład z inżynierii genetycznej
-
Inżynieria genetyczna - wykład 12.05.2020 12.15
e-Learning CoursesKolejny wykład z inżynierii genetycznej
-
Inżynieria genetyczna wykład 19.05.2020 12.15
e-Learning CoursesKolejny wykład z inżynierii genetycznej.
-
Real-Time connection Between Immerse 3D Vizualization Laboratory and Kaskada Platform
PublicationMultimedia stream processing into two cooperative different systems (cluster platform and virtual lab) is considered. The considered selected information about the systems is presented and the idea of its communication when executing the distributed application is proposed. A general schema of the communication architecture is given. Tests of data transmission quality are considered and their results are presented.
-
Genetic inactivation and chemical inhibition of PARP-1 lead to increased cytotoxicity to antitumor triazoloacridone C-1305
PublicationOkreśliliśmy aktywność cytotoksyczną związku C-1305 wobec komórek z obniżoną aktywnością PARP-1 w wyniku działania inhibitora tego enzymu związku NU1025. Dane wskazują, że w zależności od rodzaju inhibitora topoizomerazy II obniżenie aktywności PARP-1 przez związek NU1025 prowadzi do zwiększenia bądź obniżenia cytotoksyczności tych leków. Działanie NU1025 prowadzi również do re-aktywacji szlaku p53 w komórkach HeLa, czego jak dotąd...
-
Inżynieria Tkankowa i Genetyczna - wstęp do laboratorium - Nowy (Archiwizowany 2021-10-29) - Nowy
e-Learning Courses -
Rodzinny katecholaminergiczny częstoskórcz komorowy = Familial catecholaminergic Polymorphic Ventricular Tachycardia
PublicationCelem pracy jest przedstawienie katecholaminergicznego wielokształtnego częstoskurczu komorowego. Wielokształtny rodzinny katecholaminozależny częstoskórcz komorowy jest sporadycznie występującą arytmią komorową. W rodzinnej postaci PVT wskazana jest implantacja kardiowertera-defibrylatora celem prewencji nagłej śmierci sercowej oraz rozszerzona diagnostyka genetyczna.
-
Henryk Krawczyk prof. dr hab. inż.
PeopleDyscyplina naukowa: informatyka Sprawował urząd rektora od 2008 do 2016. Urodził się 20 maja 1946 r. w Dybowie. Studia wyższe ukończył w 1969 r. na Wydziale Elektroniki Politechniki Gdańskiej, uzyskując tytuł magistra inżyniera w zakresie informatyki. W latach 1969–1972 pracował w Przemysłowym Instytucie Telekomunikacji. W 1972 r. rozpoczął pracę na Wydziale Elektroniki Politechniki Gdańskiej, gdzie w 1976 r. uzyskał doktorat,...
-
System sterowania zamknięcia segmentowego z przeciwwagą na stopniu wodnym Łapino na rzece Raduni
PublicationKaskada Raduni jest cennym zabytkiem budownictwa wodnego, na której można spotkać bardzo rozmaite konstrukcje hydrotechniczne. Przedstawiono oryginalną konstrukcję zamknięcia segmentowego z przeciwwaga i sposobu jego sterowania.
-
Real-Time Multimedia Stream data Processing in a Supercomputer Environment
PublicationRozdział opisuje doświadczenia uzyskane przez autorów podczas pracy w projekcie MAYDAY EURO 2012. Przedstawiono główny cel projektu - stworzenie systemu umożliwiającego rozwijanie i równolegle wykonywanie usług multimedialnych w środowisku klastra obliczeniowego dużej mocy. opisano tematykę przetwarzania dużej liczby strumieni multimedialnych na komputerach dużej mocy. Następnie zaprezentowano możliwości platformy KASKADA: tworzenie...
-
Józef Kur prof. dr hab.
People -
Beata Krawczyk dr hab.
PeopleBeata Krawczyk, PhD, Professor Academic degrees, education, qualifications: B. Krawczyk earned his master degree in Biology at the University of Gdansk, Biology Faculty, in 1986, and her PhD in Molecular Biology at the University of Gdansk, Biology Faculty, in 1996. Postdoctoral degree (habilitation) in biological sciences in the discipline biology, Faculty of Natural Sciences, University of Szczecin, Szczecin, in 2009. In 2012...
-
Human Tracking in Multi-camera Visual Surveillance System
PublicationArtykuł prezentuje krótkie podsumowanie wykorzystywanych technologii z dziedziny śledzenia osób z wykorzystaniem inteligentnych systemów bezpieczeństwa. Opisane w niniejszym opracowaniu systemy rozpoznawania twarzy, w połączeniu ze śledzeniem osób, nie mają na celu rozpoznawania tożsamości osób. Nie powstaje żadna baza danych łącząca cechy biometryczne z konkretnymi osobami, co sprawia że przestrzegane jest prawo w zakresie ochrony...
-
Platforma i aplikacje przetwarzania strumieni danych
PublicationPrzedstawiono uogólniony schemat uzgadniania wymagań dotyczących bezpieczeństwa publicznego i na tej podstawie zaprezentowano koncepcję platformy KASKADA przeznaczonej do analizy strumieni multimedialnych. Opisano metodę wytwarzania i testowania takiej platformy oraz różne możliwości jej wykorzystania. Podano przykłady aplikacji zrealizowanych i wykonywanych na tej platformie.
-
Parallel processing of multimedia streams
PublicationRozdział przedstawia platformę KASKADA służącą do przetwarzania strumieni multimedialnych. Został opisany jej projekt: diagramy UML klas i sekwencji obrazujące mechanizmy przetwarzania strumieni, oraz szczegóły komunikacji. Zaprezentowano, również, specjalistyczny framework wspomagający tworzenie i wykonywanie algorytmów, jak również definiowanie scenariuszy usług, wraz z oceną ich użyteczności.
-
Zintegrowany system rejestrowania pozycji pojazdów w oparciu o platformę kaskadę z wykorzystaniem strumieni wideo
PublicationZaproponowno sposób wykorzystania możliwości platformy KASKADA. Opisano metodę pozwalającą na wyodrębnienie ze strumienia wideo pozycji pojazdów. Przedstawiono strukturę podsystemów odpowiedzialnych za monitoring. Opisano metodę filtrowania obrazów i sposób ich przesyłania do systemu. Tworzone rozwiązanie wykorzystując dostępne systemy monitoringu może odnajdować położenie pojazdów na podstawie odczytu numerów rejestracyjnych.
-
Methodology of Selecting the Hadoop Ecosystem Configuration in Order to Improve the Performance of a Plagiarism Detection System
PublicationThe plagiarism detection problem involves finding patterns in unstructured text documents. Similarity of documents in this approach means that the documents contain some identical phrases with defined minimal length. The typical methods used to find similar documents in dig- ital libraries are not suitable for this task (plagiarism detection) because found documents may contain similar content and we have not any war- ranty that...
-
Rozwój repozytorium usług
PublicationW rozdziale zdefiniowano pojęcie usług złożonych realizowanych przez platformę KASKADA, przedstawiono ich konstrukcję wraz ze sposobem zapisu do formatu XML oraz zaprezentowano edytor z graficznym interfejsem użytkownika służący do ich łatwego tworzenia i modyfikowania. Jednocześnie opisano algorytm doboru parametrów usług prostych w celu realizacji usług złożonych na podstawie określonych przez użytkownika kryteriów jakościowych.
-
Dependable Integration of Medical Image Recognition Components
PublicationComputer driven medical image recognition may support medical doctors in the diagnosis process, but requires high dependability considering potential consequences of incorrect results. The paper presentsa system that improves dependability of medical image recognition by integration of results from redundant components. The components implement alternative recognition algorithms of diseases in thefield of gastrointestinal endoscopy....
-
Przetwarzanie strumieni multimedialnych na klastrze komputerowym Galera
PublicationSformułowano problemy przetwarzania strumieni multimedialnych w czasie rzeczywistym. Rozpatrzono różne możliwości realizacji tego typu przetwarzania i na tej podstawie opracowano wymagania na platformę KASKADA ułatwiające wykonanie tego typu zadań na klastrze komputerowym o wysokiej wydajności przetwarzania. Podano architekturę takiej platformy oraz sposób jej implementacji. Dokonano oceny przydatności tej platformy przetwarzania...
-
Roman Kotlowski dr hab. inż.
People -
Recognition of hazardous acoustic events employing parallel processing on a supercomputing cluster . Rozpoznawanie niebezpiecznych zdarzeń dźwiękowych z wykorzystaniem równoległego przetwarzania na klastrze superkomputerowym
PublicationA method for automatic recognition of hazardous acoustic events operating on a super computing cluster is introduced. The methods employed for detecting and classifying the acoustic events are outlined. The evaluation of the recognition engine is provided: both on the training set and using real-life signals. The algorithms yield sufficient performance in practical conditions to be employed in security surveillance systems. The...
-
urosepsa The metabolomic and genetic characteristics of E.coli strains as a trigger of urosepsis
ProjectsProject realized in Department of Microbiology according to UMO-2018/29/B/NZ7/02489 agreement from 2019-02-06
-
Przetwarzanie strumieni multimedialnych z użyciem klastra obliczeniowego
PublicationZaprezentowano docelową funkcjonalność platformy KASKADA oraz sposób konstrukcji kolejnych warstw. Przedstwiono metodę opisu zadań oraz metodę implementacji zadań uzytkowych (framework), których głównym celem jest analiza strumieni multimedialnych dla identyfikacji charakterystycznych obiektów (np. twarzy) oraz niebezpiecznych zdarzeń 9np. bójka0. Zaprezentowano również strategie wykonania tych zadań na komputerze klastrowym w...