Search
Search results for: LIPOZYME RM
-
The Polish perspective on adopting EU standards nitrogen removal at large WWTPs - case studies
PublicationW związku z przyjęciem nowych regulacji prawnych w zakresie usuwania azotu w dużych oczyszczalniach ścieków (>100 000 RM), potrzebne są wiarygodne i dokładne informacje na temat wymiarowania stref anoksycznych w komorach osadu czynnego. Badania zostały przeprowadzone w oczyszczalniach Gdańsk-Wschód oraz Gdynia-Dębogórze. Ich celem było porównanie szybkości denitryfikacji określonej w warunkach laboratoryjnych oraz obliczonej na...
-
Influence of Osmolytes on Protein and Water Structure: A Step To Understanding the Mechanism of Protein Stabilization
PublicationResults concerning the thermostability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions with stabilizing osmolytes, trimethylamine-N-oxide (TMAO), glycine (Gly), and its N-methyl derivatives, N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), and N,N,N-trimethylglycine (betaine, TMG), have been presented. The combination of spectroscopic (IR) and calorimetric (DSC) data allowed us to establish a link between osmolytes’ influence on...
-
Influence of Urea and Dimethyl Sulfoxide on K-Peptide Fibrillation
PublicationProtein fibrillation leads to formation of amyloids—linear aggregates that are hallmarks of many serious diseases, including Alzheimer’s and Parkinson’s diseases. In this work, we investigate the fibrillation of a short peptide (K-peptide) from the amyloidogenic core of hen egg white lysozyme in the presence of dimethyl sulfoxide or urea. During the studies, a variety of spectroscopic methods were used: fluorescence spectroscopy...
-
Stabilizing agents and protein stability
PublicationBiałka są kluczowymi elementami żywych organizmów, jak również efektywnymi katalizatorami w biotechnologii i medycynie. Szybki rozwój wielu gałęzi biotechnologii wiąże się z coraz większym zapotrzebowaniem na produkty białkowe charakteryzujące się wysoką stabilnością. Jednym ze sposobów osiągnięcia większej stabilności białek jest wykorzystanie małych związków organicznych, tzw. osmolitów. Do tej grupy związków należą aminokwasy,...
-
Marta Wanarska dr hab. inż.
People -
Nutrients and Bioactive Components of Human Milk After one Year of Lactation. Implication for Human Milk Banks
PublicationObjective: Specifying the nutrient content and bioactive compounds in milk from long-term lactation for the purpose of finding additional sources of donors’ milk for HMBs. Method: Human milk samples were collected from 43 mothers of term infants (term infant human milk, TIHM) (3–6 weeks of lactation) and 50 mothers who have breastfed for over a year (long-nursing human milk, LNHM). The milk collection time was 24 hours. The analyses...
-
Correlation–polarization effects in electron/positron scattering from acetylene: A comparison of computational models
PublicationDifferent computational methods are employed to evaluate elastic (rotationally summed) integral and differential cross sections for low energy (below about 10 eV) positron scattering off gas-phase C2H2 molecules. The computations are carried out at the static and static-plus-polarization levels for describing the interaction forces and the correlation–polarization contributions are found to be an essential component for the correct...
-
Density, sound velocity, viscosity, and refractive index of new morpholinium ionic liquids with amino acid-based anions: Effect of temperature, alkyl chain length, and anion
PublicationIn this work, room temperature synthesis of twenty new ionic liquids (ILs) based on the N-alkyl-N-methylmorpholinium ([Mor1,R], R = 2, 3, 4, 6, 8) cation and N-acetyl-L-amino acid anions (L-alaninate, L-valinate, L-leucinate, L-isoleucinate) was described. The synthesized ILs were characterized by various spectroscopic techniques and high-resolution mass spectrometry. Furthermore, density (ρ), sound velocity (v), viscosity (η)...
-
Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studies
PublicationInteractions between osmolytes and hen egg white lysozyme in aqueous solutions were studied by means of FTIR spectroscopy and molecular dynamics. A combination of difference spectra method and chemometric analysis of spectroscopic data was used to determine the number of osmolyte molecules interacting with the protein, and the preferential interaction coefficient in presented systems. Both osmolytes – L-proline and trimethylamine-N-oxide...
-
Scheduling on Uniform and Unrelated Machines with Bipartite Incompatibility Graphs
PublicationThe problem of scheduling jobs on parallel machines under an incompatibility relation is considered in this paper. In this model, a binary relation between jobs is given and no two jobs that are in the relation can be scheduled on the same machine. We consider job scheduling under the incompatibility relation modeled by a bipartite graph, under the makespan optimality criterion, on uniform and unrelated machines. Unrelated machines...
-
Amyloid fibril formation in the presence of water structure-affecting solutes
PublicationThe impact of the differently hydrated non-electrolytes (protein structure destabilizers) on the fibrillation of hen egg white lysozyme (HEWL) was investigated. Two isomeric urea derivatives i.e. butylurea (BU) and N,N,N′,N′-tetramethylurea (TMU) were chosen as a tested compounds. The obtained results show that butylurea exerts greater impact on HEWL and its fibrillation than tetramethylurea. Both substances decrease the time of...
-
Protein thermal stabilization in aqueous solutions of osmolytes
PublicationProteins’ thermal stabilization is a significant problem in various biomedical, biotechnological, and technological applications. We investigated thermal stability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions of the following stabilizing osmolytes: Glycine (GLY), N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), N,N,N-trimethylglycine (TMG), and trimethyl-N-oxide (TMAO). Results of CD-UV spectroscopic investigation were compared...
-
Wpływ połączonego działania wysokiego ciśnienia i innych czynników na mikroorganizmy
PublicationWysokie ciśnienie wzmaga bakteriobójcze działanie bakteriocyn i lizozymu w stosunku do różnych gramdodatnich i gramujemnych bakterii i odwrotnie, bakteriocyny powodują wzrost wrażliwości mikroorganizmów na działanie wysokiego ciśnienia. Do inaktywacji bakterii i grzybów oraz do zwiększania stopnia zniszczenia przetrwalników można stosować podwyższone ciśnienie w atmosferze dwutlenku węgla. Wzrost ciśnienia i temperatury zwiększa...
-
Effect of convection and microwave heating on the retention of bioactive components in human milk
PublicationBioactive substances are very important components of human milk (HM), especially for premature newborns. The effects of convection (CH) and microwave heating (MWH) at 62.5 and 66 °C, on the level of selected bioactive components of HM: lysozyme (LZ), lactoferrin (LF), secretory immunoglobulin A (sIgA), basal lipase (BL), cytokine TGF-2, vitamin C and total antioxidant capacity (TAC) was compared. Regardless of the used heating methods...
-
Mechanism of Osmolyte Stabilization–Destabilization of Proteins: Experimental Evidence
PublicationIn this work, we investigated the influence of stabilizing (N,N,N-trimethylglycine) and destabilizing (urea) osmolytes on the hydration spheres of biomacromolecules in folded forms (trpzip-1 peptide and hen egg white lysozyme─hewl) and unfolded protein models (glycine─GLY and N-methylglycine─NMG) by means of infrared spectroscopy. GLY and NMG were clearly limited as minimal models for unfolded proteins and should be treated with...
-
The correlation between impact energy and the meters of hardening of extra high strength steels for ship and offshore welded structures.
PublicationUdowodniono tezę, że można wyznaczyć wystarczająco dokładne dla praktyki projektowania i budowy konstrukcji okrętowych i oceanotechnicznych związki ilościowe odbiorczych właściwości mechanicznych i mikrostruktury blach grubych kategorii 420¸690 oraz ich złączy spawanych. Uzyskane w pracy związki mierników umocnienia (cementytem, roztworowe, wydzieleniowe, wymiarem ziarna ferrytu) z odbiorczymi właściwościami mechanicznymi (Rm,...
-
Triplet–Triplet Annihilation Upconverting Liposomes: Mechanistic Insights into the Role of Membranes in Two-Dimensional TTA-UC
PublicationTriplet−triplet annihilation upconversion (TTA-UC) implemented in nanoparticle assemblies is of emerging interest in biomedical applications, including in drug delivery and imaging. As it is a bimolecular process, ensuring sufficient mobility of the sensitizer and annihilator to facilitate effective collision in the nanoparticle is key. Liposomes can provide the benefits of two-dimensional confinement and condensed concentration...
-
Preparation and characterization of genipin cross-linked porous chitosan–collagen–gelatin scaffolds using chitosan–CO2 solution
PublicationNovel porous scaffolds composed of chitosan, collagen and gelatin were prepared by the multistep procedure involving final freeze-drying and characterized. To eliminate the need for residual acid removal from the material after drying, carbon dioxide saturation process was used for chitosan blend formulation. The use of CO2 for chitosan dissolution made the scaffold preparation process more reproducible and economically sustainable....
-
DMSO and TMAO—Differences in Interactions in Aqueous Solutions of the K-Peptide
PublicationInteractions between a solvent and their co-solute molecules in solutions of peptides are crucial for their stability and structure. The K-peptide is a synthetic fragment of a larger hen egg white lysozyme protein that is believed to be able to aggregate into amyloid structures. In this study, a complex experimental and theoretical approach is applied to study systems comprising the peptide, water, and two co-solutes: trimethylamide...
-
Joanna Krakowiak dr hab. inż.
People -
Józef Woźniak prof. dr hab. inż.
PeopleProfessor Józef Woźniak received his M.Sc., Ph.D. and D.Sc. degrees in electronics and telecommunications from the Faculty of Electronics, Gdańsk University of Technology (GUT), Poland, in 1971, 1976 and 1991, respectively. In January 2002 he became a full professor. In 1993 he was elected Associate Dean of the Faculty of Electronics and in 1994 he was he was appointed a Professor at GUT. Simultaneously, from October 1994 till...
-
The Effect of Hyperbaric Storage on the Nutritional Value and Retention of Certain Bioactive Proteins in Human Milk
PublicationHuman milk (HM) contains the essential macronutrients and bioactive compounds necessary for the normal growth and development of newborns. The milk collected by human milk banks is stored frozen and pasteurized, reducing its nutritional and biological value. The purpose of this study was to determine the effect of hyperbaric storage at subzero temperatures (HS-ST) on the macronutrients and bioactive proteins in HM. As control samples,...
-
Oddziaływania międzycząsteczkowe w wybranych układach trójskładnikowych: woda - osmolit - model łańcucha białkowego
PublicationW niniejszej rozprawie przedstawione zostały wyniki moich prac nad oddziaływaniami międzycząsteczkowych w wodnych układach osmolitów i białek. Wykorzystałam równolegle dwa kierunki badań: spektroskopię w podczerwieni (FTIR) oraz badania wolumetryczne i akustyczne. Mając możliwość śledzenia formowania się włókien amyloidowych, postanowiłam zbadać również wpływ wytypowanych osmolitów na proces formowania się włókien białkowych. Najważniejszym...
-
Wpływ różnych metod utrwalania na wartość odżywczą i biologiczną oraz jakość mikrobiologiczną mleka ludzkiego
PublicationTematyka badawcza pracy związana jest z określeniem wpływu ogrzewania konwekcyjnego, ogrzewania polem promieniowania mikrofalowego oraz działania wysokiego ciśnienia w ujemnej temperaturze na jakość mikrobiologiczną jak również wartość odżywczą i biologiczną mleka kobiecego. W przeglądzie literaturowym opisano skład mleka ludzkiego, sposób działania Banków Mleka Kobiecego (BMK) i sposób postępowania z mlekiem ludzkim w BMK. W części...
-
Density functional theory calculations on entire proteins for free energies of binding: Application to a model polar binding site
PublicationIn drug optimization calculations, the molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA) method can be used to compute free energies of binding of ligands to proteins. The method involves the evaluation of the energy of configurations in an implicit solvent model. One source of errors is the force field used, which can potentially lead to large errors due to the restrictions in accuracy imposed by its empirical nature....
-
Taurine as a water structure breaker and protein stabilizer
PublicationThe enhancing effect on the water structure has been confirmed for most of the osmolytes exhibiting both stabilizing and destabilizing properties in regard to proteins. The presented work concerns osmolytes, which should be classified as “structure breaking” solutes: taurine and N,N,N-trimethyltaurine (TMT). Here, we combine FTIR spectroscopy, DSC calorimetry and DFT calculations to gain an insight into the interactions between...
-
Sugar matters: sugar moieties as reactivity-tuning factors in quercetin O-glycosides
PublicationQuercetin, one of the most abundant flavonoids in plant-based foods, commonly occurs in nature in various glycosylated forms. There is still a less explored aspect regarding the cause of its glycosides diversity, depending on the sugars moiety attached. This work focuses on four widespread quercetin glycosides—hyperoside, isoquercitrin, quercitrin and rutin—by testing property-tuning capacity of different sugar moieties and thus...
-
Interactions in aqueous solutions of K-peptide and DMSO – spectroscopic and calorimetric studies
PublicationIntroduction K-peptide (GILQINSRW) – short 9 amino acid fragment of the hen egg white lysozyme has the ability to form amyloid structures. Dimethyl sulfoxide (DMSO) is an osmolyte which can alter this ability. Our goal was to get an insight into the mechanism of Kpeptide-DMSO interactions in aqueous solutions. Such a knowledge can be helpful to understand processes leading to various neurodegenerative diseases. Methods ATR-FTIR...
-
Aktywność amylolityczna ciałek inkluzyjnych izolowanych z Escherichia coli BL21(DE3)pLysS transformowanej plazmidem pTYB2alfa-Amyl.
PublicationBadania ekspresji rekombinantowej alfa-amylazy izolowanej z Escherichia coli BL21(DE3)pLysS transformowanej plazmidem pTYB2alfa-Amyl wykazały, że około 49 % wytwarzanego enzymu występuje w postaci ciałek inkluzyjnych. Źródłem genu termostabilnej alfa-amylazy był szczep Pyrococcus woesei (DSM 3773). W celu uzyskania aktywnych białek z ciałek inkluzyjnych odwirowane komórki bakterii inkubowano w roztworze CaCl2 i po trawieniu lizozymem...
-
Wpływ osmolitów na stabilność białek w oparciu o metodę dynamiki molekularnej
PublicationCelem niniejszej pracy było zbadanie molekularnego mechanizmu wpływu biologicznie znaczących związków, tzw. osmolitów na stabilność białek. Aby zweryfikować istniejące hipotezy i dostarczyć spójnego obrazu działania osmolitów na poziomie molekularnym, wykorzystano metodę dynamiki molekularnej do zasymulowania mechanicznej denaturacji modelowych białek – lizozymu i ubikwityny. W tym podejściu odtworzony został efekt stabilizujący...
-
Wykład prof. Krzysztofa Kluszczyńskiego
EventsRektor i Senat Politechniki Gdańskiej w ramach Politechniki Otwartej zapraszają na wykład prof. Krzysztofa Kluszczyńskiego zatytułowany „O sztuce modelowania i twórczej roli intuicji”.
-
Zaawansowane metody wytwarzania – teoria i praktyka [Moduł obowiązkowy, grupy A i B]
e-Learning CoursesProwadzący: dr hab. inż. Mariusz Deja, prof. PG Terminy: 2 kwietnia 08:30-11:30, 23 kwietnia 08:30-11:30, 7 maja 08:30-11:30, 14 maja 08:30-11:30, 21 maja 08:30-11:30 (5 spotkań online x 3 godz.) Tematyka realizowanego przedmiotu obejmuje: Podstawowe koncepcje wytwarzania i nowoczesne centra obróbcze. Właściwości i możliwości współczesnych obrabiarek, nowe materiały narzędziowe (1 W). Trendy w rozwoju wytwarzania ze wspomaganiem...
-
Zaawansowane metody wytwarzania-teoria i praktyka
e-Learning CoursesProwadzący: dr hab. inż. Mariusz Deja, prof. PG Terminy realizacji zajęć: 1 spotkanie: 11.05.2024 - 8.30-11.30- 3h 2 spotkanie: 18.05.2024 - 8.30-11.30- 3h 3 spotkanie: 25.05.2024 - 8.30-11.30-3h 4 spotkanie: 08.06.2024 - 8.30-11.30-3h 5 spotkanie: 09.06.2024 - 8.30-11.30-3h Tematyka realizowanego przedmiotu obejmuje: Podstawowe koncepcje wytwarzania i nowoczesne centra obróbcze. Właściwości i możliwości współczesnych obrabiarek,...
-
Outcomes of gynecologic cancer surgery during the COVID-19 pandemic: an international, multicenter, prospective CovidSurg-Gynecologic Oncology Cancer study
Publication -
Effect of COVID-19 pandemic lockdowns on planned cancer surgery for 15 tumour types in 61 countries: an international, prospective, cohort study
Publication