ISSN:
eISSN:
Dyscypliny:
- informatyka techniczna i telekomunikacja (Dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych)
- inżynieria biomedyczna (Dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych)
- inżynieria chemiczna (Dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych)
- inżynieria materiałowa (Dziedzina nauk inżynieryjno-technicznych)
- nauki farmaceutyczne (Dziedzina nauk medycznych i nauk o zdrowiu)
- nauki leśne (Dziedzina nauk rolniczych)
- rolnictwo i ogrodnictwo (Dziedzina nauk rolniczych)
- nauki chemiczne (Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych)
- nauki fizyczne (Dziedzina nauk ścisłych i przyrodniczych)
Punkty Ministerialne: Pomoc
Rok | Punkty | Lista |
---|---|---|
Rok 2024 | 140 | Ministerialna lista czasopism punktowanych 2024 |
Rok | Punkty | Lista |
---|---|---|
2024 | 140 | Ministerialna lista czasopism punktowanych 2024 |
2023 | 140 | Lista ministerialna czasopism punktowanych 2023 |
2022 | 140 | Lista ministerialna czasopism punktowanych (2019-2022) |
2021 | 140 | Lista ministerialna czasopism punktowanych (2019-2022) |
2020 | 140 | Lista ministerialna czasopism punktowanych (2019-2022) |
2019 | 140 | Lista ministerialna czasopism punktowanych (2019-2022) |
2018 | 30 | A |
2017 | 30 | A |
2016 | 30 | A |
2015 | 30 | A |
2014 | 30 | A |
2013 | 30 | A |
2012 | 35 | A |
2011 | 35 | A |
2010 | 32 | A |
Model czasopisma:
Punkty CiteScore:
Rok | Punkty |
---|---|
Rok 2022 | 5.6 |
Rok | Punkty |
---|---|
2022 | 5.6 |
2021 | 5.3 |
2020 | 5.1 |
2019 | 5.2 |
2018 | 5.8 |
2017 | 6 |
2016 | 6.1 |
2015 | 5.9 |
2014 | 5.9 |
2013 | 6.3 |
2012 | 6.7 |
2011 | 6.3 |
Impact Factor:
Sherpa Romeo:
Prace opublikowane w tym czasopiśmie
Filtry
wszystkich: 71
Katalog Czasopism
Rok 1998
Rok 1999
Rok 2000
-
Reply to “Comment on ‘Crystal Structure Prediction by Global Optimization as a Tool for Evaluating Potentials: Role of the Dipole Moment Correction Term in Successful Predictions'” by B. P. van Eijck and J. Kroon
Publikacja -
ID and 2D Electron Spin Resonance Imaging (ESRI) of Nitroxide Radicals in Stabilized Poly(acrylonitrile−butadiene−styrene) (ABS): UV vs Thermal Degradation
Publikacja
Rok 2001
-
Optimization of Parameters in Macromolecular Potential Energy Functions by Conformational Space Annealing
Publikacja -
Development of Physics-Based Energy Functions that Predict Medium-Resolution Structures for Proteins of the α, β, and α/β Structural Classes
Publikacja
Rok 2002
-
Solvation of N-methylformamide by ethanol: a comparison of molecular dynamics calculations with the experimental data
PublikacjaWykonano obliczenia metodami dynamiki molekularnej dla tytułowego układu. Rezultaty porównano z uzyskanymi wcześniej wynikami pomiarów termodynamicznych oraz wnioskami z nich wyciągniętymi.
-
Solid Phase Photocatalytic Reaction on the Soot/TiO2 Interface: The Role of Migrating OH Radicals
Publikacja -
Mechanism for Damage to DNA by Low-Energy Electrons
Publikacja
Rok 2003
-
Molecular Simulation Study of the Potentials of Mean Force for the Interactions between Models of Like-Charged and between Charged and Nonpolar Amino Acid Side Chains in Water
Publikacja -
Global Optimization-Based Method for Deriving Intermolecular Potential Parameters for Crystals
Publikacja
Rok 2004
-
Parametrization of Backbone−Electrostatic and Multibody Contributions to the UNRES Force Field for Protein-Structure Prediction from Ab Initio Energy Surfaces of Model Systems
Publikacja -
Optimization of the UNRES Force Field by Hierarchical Design of the Potential-Energy Landscape. 3. Use of Many Proteins in Optimization
Publikacja -
Optimization of the UNRES Force Field by Hierarchical Design of the Potential-Energy Landscape. 2. Off-Lattice Tests of the Method with Single Proteins
Publikacja -
Optimization of the UNRES Force Field by Hierarchical Design of the Potential-Energy Landscape. 1. Tests of the Approach Using Simple Lattice Protein Models
Publikacja -
Anomalous Thermal Behavior of Salicylsalicylic Acid and Evidence for a Monotropic Transition to a Nematic Phase
Publikacja
Rok 2005
-
Reply to “Comment on ‘Molecular Origin of Anticooperativity in Hydrophobic Association'”
Publikacja -
Molecular Origin of Anticooperativity in Hydrophobic Association
Publikacja -
Comment on “Molecular Origin of Anticooperativity in Hydrophobic Association”
Publikacja
Rok 2006
-
A new Apporoach to the Spectral Analysis of Liquid Membrane Oscillators by Gabor Transformation
PublikacjaOcylatory z membrana ciekłą charakteryzują się nieregularnymi oscylacjami. Widma mocy nie mogą być ustalone za pomocą transformacji Fourier'a do oscylacji niestacjonarnej. Zaprezentowano nowe podejście pozwalające tych przypadkach otrzymać widma mocy. Analizę tę zastosowano do oscylatorów z membraną ciekłą, zawierających kationowy surfaktant. Stwierdzono, że obecnośc róznych dodanych substancji do wodnej fazy akceptorowej wpływa...
Rok 2007
-
Theoretical study of the energetics of the reactions of triplet dioxygen with hydroquinone, semiquinone, and their protonated forms: relation to the mechanism of superoxide generation in the respiratory chain = Badanie teoretyczne energii z energii reakcji dioksygenu potrójnego z wodorem, półkiną i ich formami protony: relacja z mechanizmem wytwarzania supertlenku w łańcuchu oddechowym
PublikacjaW pracy prezentujemy wyniki obliczeń kwantowych ab initio i półempirycznych energetyki reakcji redukcji jednoelektronowej tlenu trypletowego. Zaproponowaliśmy cztery możliwe mechanizmy redukcji i przeprowadziliśmy obliczenia kwantowe. Z obliczeń wynika, że najprawdopodobniejszy mechanizm reakcji wiedzie poprzez przeniesienie elektronu z anionu hydrochinonu po deprotonacji lub też z rodnika semichinonowego na tlen cząsteczkowy,...
-
Simple Physics-Based Analytical Formulas for the Potentials of Mean Force for the Interaction of Amino Acid Side Chains in Water. 3. Calculation and Parameterization of the Potentials of Mean Force of Pairs of Identical Hydrophobic Side Chains
Publikacja -
Potential of Mean Force of Hydrophobic Association: Dependence on Solute Size
Publikacja -
Modification and Optimization of the United-Residue (UNRES) Potential Energy Function for Canonical Simulations. I. Temperature Dependence of the Effective Energy Function and Tests of the Optimization Method with Single Training Proteins
Publikacja
Rok 2008
-
Visualizing the Dose Distribution and Linear Energy Transfer by 1D and 2D ESR Imaging: A Potassium Dithionate Dosimeter Irradiated with C6+ and N7+ Ions
Publikacja -
Two-particle entropy and structural ordering in liquid water
PublikacjaEntropies of simple point charge (SPC) water were calculated over the temperature range 278-363 K using the two-particle correlation function approximation. Then, the total two-particle contribution to the entropy of the system was divided into three parts, which we call translational, configurational, and orientational. The configurational term describes the contribution to entropy, which originates from spatial distribution of...
-
Structural and Dynamic Properties of Water within the Solvation Layer around Various Conformations of the Glycine-based Polypeptide
PublikacjaSeveral conformations of the solvated glycine-based polypeptides were investigated using molecular dynamics simulations. Some properties of water in the neighboring space around these molecules were investigated. It was found that water forms a well-defined layer—the first solvation shell—around the peptide molecule, and thickness of this layer is independent of the peptide structure and is equal to approximately 0.28 nm. Within...
-
Structural and dynamic properties of water within the solvation layer around various conformations of the glycine-based polypeptide
PublikacjaSeveral conformations of the solvated glycine-based polypeptides were investigated using molecular dynamics simulations. Some properties of water in the neighbouring space around these molecules were investigated. It was found, that water forms a well-defined layer - the first solvation shell - around the peptide molecule, and thickness of this layer is independent of the peptide structure, and it equals to approximately 0.28 nm....
-
Simple Physics-Based Analytical Formulas for the Potentials of Mean Force for the Interaction of Amino Acid Side Chains in Water. IV. Pairs of Different Hydrophobic Side Chains
Publikacja -
Programmed metalloporphyrins for self-assembly within light-harvesting stacks: 5,15-dicyano-10,20-bis(3,5-di-tert-butylphenyl)-porphyrinato zinc(II) and its push-pull 15-N,N-dialkylamino-5-cyano congeners obtained by a facile direct amination.
PublikacjaThe title dicyano compound was synthesized via cyanation and it self-assembles in nonpolar solvents giving red-shifted and broad absorption maxima just as the bacteriochlorophylls which are encountered in the light-harvesting organelles of early photosynthetic bacteria. In the crystal, stacks are formed through a hierarchic combination of π-stacking and a CNZn electrostatic interaction. Push−pull 15-N,N-dialkylamino-5-cyano congeners...
-
Molar volumes and heat capacities of electrolytes and iIons in N,N-dimethylformamide
PublikacjaZmierzono gęstości i molowe pojemności elektrolitów typu 1:1 oraz o soli o wyższych liczbach ładunkowych jonów w roztworach w N,N-dimetyloformamidzie w temperaturze 25 stopni Celsjusza. W oparciu o te pomiary wyznaczono standardowe objętości molowe oraz standardowe wartości izobarycznych ciepeł molowych. Uzyskane wartości podzielono na udziały jonowe wykorzystując tetrafenyloboran tetrafenylofosfoniowy (TPTB) jako elektrolit odniesienia....
-
Hydration of simple amides. FTIR spectra of HDO and theoretical studies
PublikacjaZastosowano metodę ważonych widm różnicowych do opisu hydratacji amidów w roztworach wodnych: formamidu, N-metyloformamidu, N,N-dimetyloformaidu, acetamidu, N-metyloacetamidu, N,N-dimetyloacetamidu. Narzędziem wspomagającym interpretację wyników eksperymentalnych są struktury agregatów solwatacyjnych wokół cząsteczki substancji rozpuszczonej uzyskane na podstawie obliczeń teoretycznych metodą ab initio z korelacją elektronową...
Rok 2009
-
Systematic Study of Hydration Patterns of Phosphoric(V) Acid and Its Mono-, Di-, and Tripotassium Salts in Aqueous Solution
PublikacjaSpektroskopia oscylacyjna FTIR w zakresie drgania OD cząsteczki HDO została zastosowana do zbadania różnych form fosforanów w kolejności malejącego stopnia protonacji: H3PO4, KH2PO4, K2HPO4, K3PO4. HDO rozcieńczona izotopowo w H2O została otrzymana przez dodanie odpowiednich ilości wody ciężkiej (D2O) do roztworów w wodzie zwykłej. Do wyizolowania widm HDO zaburzonej przez substancję rozpuszczoną zastosowano metodę widm różnicowych....
-
On the Possibility of the Amphotericin B-Sterol Complex Formation in Cholesterol- and Ergosterol-Containing Lipid Bilayers: A Molecular Dynamics Study
PublikacjaAmphotericin B (AmB) is a well-known membrane-active antibiotic that has been used to treat systemicfungal infections for more than 45 years. Therapeutic application of AmB is based on the fact that it is moreactive against ergosterol-containing membranes of fungal cells than against mammalian membranes withcholesterol. In this paper, we examine the hypothesis according to which the selectivity of the AmB's membraneaction originates...
-
Mollecular mechanism and chemicl kinetic description of nitrobenzene liquid membrane oscillator containing benzyldimethyltetradecylammonium chloride surfactant
PublikacjaBadano oscylacje róznicy potencjału między fazami wodnymi oscylatora z nitrobenzenową membraną ciekłą zawierającego chlorek benzylodimetylotetradecyloamoniowy. Opisano chemię fizyczną tego oscylatora oraz omówiono rolę efektów hydrodynamicznych w powstawaniu oscylacji. Zaproponowano nowy mechanizm oparty na transferze masy par jonowych. Oscylacje są generowane na granicy faza akceptowa/ membrana ciekła i są spowodowane autokatalityczną...
-
Hydration of Carboxylate Anions: Infrared Spectroscopy of Aqueous Solutions
PublikacjaHydratacja anionów karboksylanowych w roztworach wodnych ich soli sodowych została zbadana przy wykorzystaniu spektroskopii FTIR z zastosowaniem cząsteczki HDO jako sondy molekularnej. Do wyznaczenia widm wody zaburzonej przez rozpuszczalnik wykorzystano ilościową wersję metody widm różnicowych. Widma te wykazują dwa pasma składowe przy ok. 2550 i ok. 2420 cm-1. Pasma te przypisano grupie -COO- anionu R-COO- (R = H, CH3, C2H5),...
-
Effects of Urea and Trimethylamine-N-oxide on the Properties of Water and the Secondary Structure of Hen Egg White Lysozyme
PublikacjaW celu określenia sposobu hydratacji mocznika i N-tlenku trimetyloaminy, wykorzystano spektroskopię oscylacyjną FTIR. Dane eksperymentalne, otrzymane z pomiarów widm oscylacyjnych wody półciężkiej (HDO) rozcieńczonej izotopowo w wodnych roztworach badanych związków, analizowane były za pomocą "metody widm różnicowych". Strukturalno-energetyczna charakterystyka wody zaburzonej przez cząsteczki osmolitów wskazuje, że woda zaburzona...
Rok 2010
-
Structural properties of hydration shell around various conformations of simple polypeptides
PublikacjaIn this paper we investigate structural properties of water within the solvation shell around the peptide core created by a well-defined conformation of polypeptide chain. The following secondary structures are investigated: linear (straight chain), and three helices PII (polyproline-like), 310, and α. We propose using the two-particle contribution to entropy as a rational measure of the water structural ordering within the solvation...
-
Potential of Mean Force of Association of Large Hydrophobic Particles: Toward the Nanoscale Limit
Publikacja -
An effective method for studying intermolecular interactions in binary liquids with hydrogen bonds: FTIR spectra and ab initio calculations in the N-methylformamide - methanol system
PublikacjaMolecular complexes in methanol (MeOH)−N-methylformamide (NMF) mixtures were studied based on their FTIR-ATR spectra, to which two methods of analysis were applied: factor analysis and a quantitative version of the difference-spectra method. The mean composition of a complex between NMF and MeOH molecules over the whole range of mixture compositions was determined. Absorbing species differentiated with regard to the interaction...
Rok 2011
-
Long-Distance FRET Analysis: A Monte Carlo Simulation Study
PublikacjaZaproponowano nową metodę na rozszerzenie zakresu stosowalności rezonansowego transferu energii (FRET) przetestowaną przy pomocy metody Monte Carlo. Otrzymane rezultaty dowodzą, że wydajność procesu FRET może być znacząco zwiększona w porównaniu z wydajnością pojedynczego akceptora, gdy dla ustalonej od donora umieścimy układ blisko siebie położonych akceptorów na makromolekule. Z drugiej strony metoda ta umożliwia zwiększenie...
-
Ionic liquids: predictions of physicochemical properties with experimental and/or DFT-calculated LFER parameters to understand molecular interactions in solution
PublikacjaPublikacja zawiera modele pozwalające na przewidywanie współczynnika podziału oktanol-woda (log P), rozpuszczalności w wodzie oraz krytycznego stężenia micelizacji (CMC) cieczy jonowych oraz współczynników aktywności anionowej i hydrofobowości w wodzie i w mieszaninie oktanolu z wodą. Modele oparte są na liniowych zależnościach energii swobodnej (LFER) i wykorzystują parametry zmierzone i/lub wyliczone na podstawie funkcjonalnej...
-
Hydration of Simple Carboxylic Acids from Infrared Spectra of HDOand Theoretical Calculations
PublikacjaBadanie hydratacji kwasów karboksylowych w rozcieńczonych roztworach wodnych ma duże znaczenie dla zrozumienia ich funkcji biologicznych. Metodą stosowaną w badaniach była spektroskopia oscylacyjna FTIR z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego wody półciężkiej HDO w roztworze wody zwykłej. Do analizy danych widmowych wykorzystano ''metodę widm różnicowych''. Widma HDO zaburzonej przez kwasy: mrówkowy, octowy i propionowy...
Rok 2012
-
Why the Solvation Water around Proteins Is More Dense than Bulk Water
PublikacjaThe main aim of this work is to propose a rational explanation of the commonly observed phenomenon of increasing water density within solvation shell of proteins. We have observed that the geometry of the water–water hydrogen bond network within solvation layer differs from the one in bulk water, and it is the result of interactions of water molecules with protein surface. Altered geometry of the network reflects changes in the...
-
Why the solvation water around proteins is more dense than bulk water
PublikacjaThe main aim of this work is to propose a rational explanation of commonly observed phenomenon of increasing water density within solvation shell of proteins. We have observed that geometry of the water-water hydrogen bond network within solvation layer differs from the one in bulk water and it is the effect of interactions of water molecules with protein surface. Altered geometry of the network reflects changes in the structure...
Rok 2013
-
SOLUBILIZATION OF BENZENE, TOLUENE, AND XYLENE (BTX) IN AQUEOUS MICELLAR SOLUTIONS OF AMPHIPHILIC IMIDAZOLIUM IONIC LIQUIDS
PublikacjaRozpuszczalne w wodzie ciecze jonowe wykazują aktywność powierzchniową oraz zdolność do tworzenia zorganizowanych struktur w roztworach wodnych. W pracy przedstawiono zdolność wodnych układów micelarnych chlorków 1-alkilo-3-metyloimidazoliowych do zwiększania rozpuszczalności węglowodorów aromatycznych – benzenu, toluenu i ksylenu. Zaobserwowano, że po przekroczeniu krytycznego stężenia micelizacji cieczy jonowych w wodzie, następuje...
-
On the Structure and Volumetric Properties of Solvated Lanthanoid(III) Ions in Amide Solutions
PublikacjaThe coordination chemistry and the volumetric properties of three representative lanthanoid(III) ions lanthanum-(III), gadolinium(III), and lutetium(III) have been studied in three amide solvents with gradually increasing spatial demand upon coordination: N,N-dimethylformamide (dmf)
-
Influence of Osmolytes on Protein and Water Structure: A Step To Understanding the Mechanism of Protein Stabilization
PublikacjaResults concerning the thermostability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions with stabilizing osmolytes, trimethylamine-N-oxide (TMAO), glycine (Gly), and its N-methyl derivatives, N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), and N,N,N-trimethylglycine (betaine, TMG), have been presented. The combination of spectroscopic (IR) and calorimetric (DSC) data allowed us to establish a link between osmolytes’ influence on...
Rok 2014
-
Self-Association of Amphotericin B: Spontaneous Formation of Molecular Structures Responsible for the Toxic Side Effects of the Antibiotic
PublikacjaAmphotericin B (AmB) is a lifesaving antibiotic used to treat deep-seated mycotic infections. Both the pharmaceutical activity and highly toxic side effects of the drug rely on its interaction with biomembranes, which is governed by the molecular organization of AmB. In the present work we present detailed analysis of self-assembly of AmB molecules in different environments, interesting from the physiological standpoint, based...
-
Refinements to the Utah–Washington Mechanism of Electron Capture Dissociation
Publikacja
wyświetlono 1724 razy