Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 215
Wyniki wyszukiwania dla: 16SRRNA PCR-DGGE
-
PCR-RFLP assays for species-specific identification of fungi belonging to Scopulariopsis and related genera
PublikacjaFungi of the Scopulariopsis genus, commonly found in the environment, are opportunistic pathogens that can cause various types of human infections. So far, no efficient molecular method has been developed for species differentiation among Scopulariopsis and related genera. In order to advance this field, we have evaluated performance of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assays, based...
-
Species - specific detection of the toxic mushrooms Amanita virosa and Amanita verna by PCR amplification of the gpd gene fragment
PublikacjaZaprojektowano dwie pary starterów do reakcji PCR, które umożliwiają gatunkowo specyficzną amplifikację unikalnych fragmentów genów gpd dla dwóch grzybów kapeluszowych: muchomora wiosennego (Amanita verna) i muchomora jadowitego (Amanita virosa).
-
System do diagnostyki dermatofitowych zakażeń powierzchniowych oparty na technice Real-Time PCR
PublikacjaDermatofity należą do blisko spokrewnionej grupy grzybów, które wykazują wysokie powinowactwo do skeratynizowanych tkanek. Cecha ta czyni je odpowiedzialnymi za powierzchniowe grzybice skóry, paznokci oraz włosów. Szacuje się, iż nawet do 20% ludzi na całym świecie dotkniętych jest infekcjami powodowanymi przez dermatofity. Ich leczenie wymaga długotrwałego zastosowania leków przeciwgrzybiczych. W celu dobrania odpowiedniego leczenia...
-
The use of a one-step PCR method for the identification of Microsporum canis and Trichophyton mentagrophytes infection of pets
PublikacjaIntroduction: Dermatophytes are a closely related group of keratinophilic fungi. They encompass important etiological agents of superficial fungal infections. These fungi are able to invade keratinized tissues of humans and animals, causing dermatophytosis (ringworm) of hair, nails or skin. The aim: Traditional diagnostics of ringworm is based on morphological identification of cultured fungi and is time-consuming. Materials and methods:...
-
Isolation of Human Progenitor Epidermal Cells on Collagen Type IV and Analysis of Their Markers with Flow Cytometry and PCR Methods
PublikacjaEpidermal stem cells, located in the skin, together with keratinocytes are transplanted in regenerative therapies, e.g., for the treatment of burns or other wounds. Here, we describe the protocol of their enzymatic isolation from human skin. It includes separation of the epidermis form the dermis by incubation with dispase followed by cell isolation for epidermis by digestion with trypsin. Cell isolated with this method can be...
-
PCR-Based Genotyping of Mycobacterium tuberculosis with New GC-Rich Repeated Sequences and IS6110 Inverted Repeats Used as Primers.
PublikacjaW pracy przedstawiono nową metodę genotypowania Mycobacterium tuberculosis. Zastosowanie oligonukleotydu Mtb1 5'-CCG-GCG-GGG-CCG-GCG-G lub Mtb2 5'-CGG-CGG-CAA-CGG-CGG-C wraz z oligonukleotydami specyficznymi do terminalnych sekwencji elementu insercyjnego IS6110 pozwala na różnicowanie szczepów Mycobacterium tuberculosis w metodzie PCR. Opracowana metoda może być wykorzystana w badaniach epidemiologicznych gruźlicy.
-
Różnicowanie C. albicans i C. dubliniensis w oparciu o polimorfizm genu syntazy homocytrynianowej z wykorzystaniem metody PCR RFLP
PublikacjaNajczęstszym czynnikiem etiologicznym zakażeń wywołanych przez drożdżaki z rodzaju Candida jest C. albicans. Gatunek ten posiada bardzo zbliżone cechy fenotypowe do C. dubliniensis co często wiąże się z błędną identyfikacją. Skutkuje to wtórnym zakażeniem wywołanym przez współwystepujący gatunek C. dubliniensis, który nabywa oporność na flikonazol stosowany w terapii C. albicans. Celem badań była konstrukcja układu diagnostycznego...
-
Fusion of DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase with TaqStoffel DNA polymerase as a useful tool in PCR with difficult targets
PublikacjaThe DNA coding sequence of TaqStoffel polymer- ase was fused with the DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase. The resulting novel recombinant gene was cloned and expressed in E. coli. The recombinant enzyme was purified and its enzymatic features were studied. The fusion protein (PfuDBDlig-TaqS) was found to have enhanced processivity as a result of the conversion of the Taq DNA polymerase from a relatively low processive...
-
Recombinant !ermostable AP Exonuclease from Thermoanaerobacter tengcongensis: Cloning, Expression, Purification, Properties and PCR Application
PublikacjaApurinic/apyrimidinic (AP) sites in DNA are considered to be highly mutagenic and must be corrected to preserve genetic integrity, especially at high temperatures. !e gene encoding a homologue of AP exonuclease was cloned from the thermophilic anaerobic bacterium Thermoanaerobacter tengcongensis and transformed into Escherichia coli. The protein product showed high identity (80%) to human Ape1 nuclease, whereas to E. coli exonuclease...
-
Motility activity, slime production, biofilm formation and genetic typing by ERIC-PCR for Pseudomonas aeruginosa strains isolated from bovine and other sources (human and environment)
PublikacjaThe molecular-typing strategy, ERIC-PCR was used in an attempt to determine the genomic relationship of 28 P. aeruginosa strains isolated from faeces of healthy bovine, bovine mastitis and from faeces of hospital patients as well as from environment. ERIC-PCR fingerprinting revealed large molecular differentiation within this group of isolates. Twenty two out of 28 strains tested generated unique patterns of DNA bands and only...
-
Quantification of Plasmid Copy Number with Single Colour Droplet Digital PCR
Publikacja -
BDNF Val66Met Polymorphism, the Allele-Specific Analysis by qRT-PCR - a Novel Protocol
Publikacja -
Nested PCR for the detection of Aspergillus species in maxillary sinus samples of patients with chronic sinusitis
Publikacja -
A NEW IDENTIFICATION METHOD FOR CLARIAS GARIEPINUS, CLARIAS MACROCEPHALUS AND THEIR HYBRIDS USING PCR-RFLP
Publikacja -
Identification of Leaf Rust Resistance Genes in Selected Wheat Cultivars and Development of Multiplex PCR
Publikacja -
Application of PCR-HRM method for microsatellite polymorphism genotyping in the LDHA gene of pigeons (Columba livia)
Publikacja -
PCR amplification with primers based on IS2404 and GC-rich repeated sequence reveals polymorphism in Mycobacterium ulcerans
PublikacjaOpracowano prostą w wykonaniu metodę genotypowania szczepów bakterii z gatunku Mycobacterium ulcerans. Polimorfizm genetyczny 32 badanych izolatów Mycobacterium ulcerans odzwierciedla ich geograficzne pochodzenie z rejonów Afryki Centralnej, Ameryki Południowej i Łacińskiej, Azji Południowo-Wschodniej, Malezji oraz Australii.
-
Highly thermostable RadA protein from the archaeon Pyrococcus woesei enhances specificity of simplex and multiplex PCR assays
Publikacja -
Multiplex PCR assay for the simultaneous identification of race specific and non-specific leaf resistance genes in wheat (Triticum aestivum L.)
Publikacja -
Identification of Powdery Mildew Blumeria graminis f. sp. tritici Resistance Genes in Selected Wheat Varieties and Development of Multiplex PCR
Publikacja -
Enterococci from ready-to-eat food - horizontal gene transfer of antibiotic resistance genes and genotypic characterization by PCR melting profile
Publikacja -
One-tube cell lysis and DNA extraction procedure for PCR based detection of Mycobacterium ulcerans in aquatic insects, molluscs and fish.
PublikacjaMycobacterium ulcerans jest bakterią wywołującą choroby skóry u ludzi i zwierząt. W trakcie prowadzonych badań opracowano prostą w wykonaniu metodę ekstrakcji DNA Mycobacterium ulcerans z próbek środowiskowych oraz klinicznych. Opracowana metoda izolacji DNA może być przydatna w badaniu źródeł infekcji oraz dróg szerzenia się Mycobacterium ulcerans.
-
Discovery and characterization of RecA protein of thermophilic bacterium Thermus thermophilus MAT72 phage Tt72 that increases specificity of a PCR-based DNA amplification
Publikacja -
Use of rapid immunochromatographic tests and PCR for the detection of vaccine viruses (CPV, CDV CAV) in faeces and conjunctival sac swabs of vaccinated dogs
Publikacja -
Validation of Real-time PCR Reference Genes of Muscle Metabolism in Harvested Spiny-Cheek Crayfish (Faxonius limosus) Exposed to Seasonal Variation
Publikacja -
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 65 - Tissue image [6130730026859701]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 65 - Tissue image [613073002685551]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 65 - Tissue image [6130730026859191]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 65 - Tissue image [6130730026858401]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 69 - Tissue image [6130730026856731]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 69 - Tissue image [6130730026856861]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 65 - Tissue image [6130730026853021]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 65 - Tissue image [613073002685331]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 69 - Tissue image [6130730026856261]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Personal history of chemotherapy for neoplastic disease - Female, 69 - Tissue image [6130730026853661]
Dane BadawczeThis is the histopathological image of BREAST tissue sample obtained in Medical University Gdańsk and deposited in ZMDL-GUMED. The sample image was taken using: Pannoramic 1000 slide scanner (20x magnification) and saved to DICOM format.
-
Beata Krawczyk dr hab.
Osobydr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni Stopnie naukowe, wykształcenie, kwalifikacje Beata Krawczyk uzyskała tytuł magistra biologii na Wydziale Biologii (wówczas: Wydział Biologii i Nauk o Ziemi), Uniwersytetu Gdańskiego w 1986 roku, a doktorat z biologii molekularnej na Wydziale Biologii (wówczas: Wydział Biologii, Geografii i Oceanologii) Uniwersytetu Gdańskiego w 1996 roku. Stopień doktora habilitowanego w zakresie nauk biologicznych...
-
Fuzyjne polimerazy DNA – otrzymywanie, charakterystyka i zastosowanie
PublikacjaObecnie reakcje PCR (ang. Polymerase Chain Reaction) wykazują bardzo szerokie zastosowanie w diagnostyce medycznej, biologii molekularnej czy inżynierii genetycznej. Efektywność tych reakcji rozumiana jako wydajność i wierność przeprowadzonej amplifikacji jest nieodłącznie związana ze stosowaną polimerazą DNA i warunkami prowadzenia reakcji PCR. Aby sprostać wymaganiom stawianym przez nowoczesne metody diagnostyczne oraz współczesną...
-
Identification of leaf rust resistance genes Lr34 and Lr46 in common wheat (Triticum aestivum L. ssp. aestivum) lines of different origin using multiplex PCR
Publikacja -
Józef Kur prof. dr hab.
Osoby -
Techniki amplifikacji kwasów nukleinowych -2024-2025 - Nowy
Kursy OnlineSpecjalność: Biotechnologia molekularna (WCh), II stopnia, stacjonarne Prowadzący wykład: dr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni - stacjonarnie na uczelni Prowadzący laboratoria: dr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni - zajęcia stacjonarne na PG, sala 304 WCH B. Kontakt: (58) 347-23-83 Beata Krawczyk (wykłady): e-mail: beata.krawczyk@pg.edu.pl; WCH B; p.217; Konsultacje: stacjonarnie we wtorki o godzinie 13. Opis kursu Kurs...
-
Techniki amplifikacji kwasów nukleinowych -2022-2023
Kursy OnlineSpecjalność: Biotechnologia molekularna (WCh), II stopnia, stacjonarne Prowadzący wykład: dr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni - forma stacjonarna Prowadzący laboratoria: mgr inż. Bartosz Ostrowski - zajęcia stacjonarne na PG, sala 17 WCH C. Kontakt: (58) 347-23-83 Beata Krawczyk (wykłady): e-mail: beata.krawczyk@pg.edu.pl; WCH B; p.218; Bartosz Ostrowski, WCH B, p.218 tel. (58) 347-13-83 Konsultacje: stacjonarnie we wtorki ...
-
Techniki amplifikacji kwasów nukleinowych -2021-2022
Kursy OnlineSpecjalność: Biotechnologia molekularna (WCh), II stopnia, stacjonarne Prowadzący wykład: dr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni - stacjonarnie na uczelni Prowadzący laboratoria: mgr inż. Magdalena Fordon - zajęcia stacjonarne na PG, sala 17 WCH C. Kontakt: (58) 347-23-83 Beata Krawczyk (wykłady): e-mail: beata.krawczyk@pg.edu.pl; WCH B; p.218; Magdalena Fordon (laboratoria): magda.fordon@gmail.com; WCH B; p.218 Konsultacje:...
-
Techniki Amplifikacji Kwasów Nukleinowych -2024-2025
Kursy OnlineSpecjalność: Biotechnologia molekularna (WCh), II stopnia, stacjonarne Prowadzący wykład: dr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni - forma stacjonarna Prowadzący laboratoria: dr hab. Beata Krawczyk, prof. uczelni- zajęcia stacjonarne na PG, sala 304 WCH B (bud.7); III piętro. Kontakt: (58) 347-23-83 Beata Krawczyk (wykłady): e-mail: beata.krawczyk@pg.edu.pl; WCH B; p.217;tel. (58) 347-23-83 Bartosz Ostrowski, WCH B, p.218 tel....
-
Analizator PCR
Aparatura Badawcza -
Roman Kotlowski dr hab. inż.
Osoby -
A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms
PublikacjaABSTRACT Background. As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. Objective. The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic...
-
Identification and cloning of C. albicans SC5314 genes encoding L-methionine biosynthetic pathway enzymes.
Dane BadawczeEnzymes of fungal L-methionine biosynthetic pathway: homoserine O-acetyltransferase (Met2p), O-acetylhomoserine sulfhydrylase (Met15p) and cystathionine-γ-synthase (Str2p) could be exploited as molecular targets for antifungal chemotherapy. The goal of the study was to identify and clone genes encoding mentioned above enzymes. MET2, MET15 and STR2 genes...
-
Paweł Filipkowski dr inż.
Osobymgr inż - Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu, Wydział Nauk o Żywności, Katedra Mikrobiologii Technicznej i Żywnosci, Prof. Maria Wojtatowicz/ Prof. Waldemar Rymowicz, adiunkt - Uniwersytet Ekonomiczny we Wrocławiu, Wydział Inzynieryjno-Ekonomiczny, Katedra Inżynierii Bioprocesowej, Prof. Tadeusz Miśkiewicz/ Prof. Edward Cybis, dr - Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny, Katedra Mikrobiologii, ś.p. Prof. Józef Kur, Staże w...
-
A new assay for the simultaneous identification and differentiation of Klebsiella oxytoca strains.
PublikacjaKlebsiella oxytoca is the second most frequently identified species of Klebsiella isolated from hospitalized patients. Klebsiella spp. is difficult to identify using conventional methods and is often misclassified in clinical microbiology laboratories. K. oxytoca is responsible for an increasing number of multi-resistant infections in hospitals because of insufficient detection and identification. In this study, we propose a new...
-
Five-hour diagnosis of dermatophyte nail infections with specific detection of Trichophyton rubrum
PublikacjaW publikacji przedstawiono szybką dwuetapową metodę oczyszczania DNA oraz opartą na technice multiplex PCR metodę wykrywania grzybów z rodzaju dermatofitów oraz gatunku Trichophyton rubrum z hodowli grzybów oraz bezpośrednio ze zmienionych chorobowo paznokci. Testy stu osiemnastu próbek z użyciem zaprojektowanej reakcji multiplex PCR i dwóch kolejnych (jedna wykrywająca grzyby z rodzaju dermatofitów, druga wykrywająca gatunek T....