Wyniki wyszukiwania dla: md
-
Brittle fracture of 100-, 110-, 111-oriented Cu crystals: MD vs. TB/MD approach
PublikacjaPrzeprowadzono wieloskalowe symulacje nanoindentacji miedzi nieskończenie twardym narzędziem, przy zastosowaniu metody dynamiki molekularnej, z siłami liczonymi na bieżąco w formalizmie ciasnego wiązania (TB). Przedstawiono wyniki dla trzech orientacji krystalicznych podłoża. Badano efekt dołączenia obliczeń TB na siłę normalną odczuwaną przez narzędzie i na przemieszczenia atomów podłoża, przez porównywanie z symulacją czystą...
-
Final Farewell to Alberto Zanchetti MD
Publikacja -
The structure of liquid lead: EXAFS and MD studies
PublikacjaPraca poświecona jest analizie widm XAFS zmierzonych na krawędzi L3dla ciekłego ołowiu. W analizie strukturalnej EXAFS zastosowano podejście GNXAS. Przetestowano kilka modeli strukturalnych, zarówno numerycznych (MD-DLE, MD-TB), jak i tych otrzymanych doświadczalnie (ND, XRD) i ostatecznie zrekonstruowano pierwszy pik w parowej funkcji rozkładu, g(r). Zweryfikowano wcześniejsze doniesienia o obserwownym za pomocą metody XAFS gwałtownym...
-
Degradation of a nano-cutting tool: an MD simulation
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki symulacji wielokrotnego oddziaływania realistycznie ukształtowanego ostrza tnącego z modelowym, nieskończenie twardym ziarnem, przy zastosowaniu metody dynamiki molekularnej. Ostrze składało się z kilkuset tysięcy atomów metalu fcc, traktowanego za pomocą potencjału Suttona-Chena, przesuwane było ze stałą prędkością 20 m/s. Obserwowane deformacje plastyczne pojawiające się na skutek kontaktu ostrza...
-
Osmotic MD and other membrane distillation variants
Publikacja -
Water demineralisation by NF/MD integrated processes
Publikacja -
Purification of oily wastewater by hybrid UF/MD
Publikacja -
Effect of iron oxides scaling on the MD process performance
Publikacja -
Demineralization of water using a combination of MD and NF(RO)
Publikacja -
NMR and MD Analysis of the Bonding Interaction of Vancomycin with Muramyl Pentapeptide
Publikacja -
Treatment of effluents from the regeneration of ion exchangers using the MD process
Publikacja -
Are stabilizing osmolytes preferentially excluded from the protein surface? FTIR and MD studies
PublikacjaInteractions between osmolytes and hen egg white lysozyme in aqueous solutions were studied by means of FTIR spectroscopy and molecular dynamics. A combination of difference spectra method and chemometric analysis of spectroscopic data was used to determine the number of osmolyte molecules interacting with the protein, and the preferential interaction coefficient in presented systems. Both osmolytes – L-proline and trimethylamine-N-oxide...
-
A Comparison between MD and EXAFS extracted Structural Data for TernaryRbBr(1-x)Ix.
PublikacjaStrukturę trójskładnikowych soli poddano analizie za pomocą metody EXAFS i symulacji M-D. Przedyskutowano przydatność używanego w symulacjach potencjału oddziaływań międzyatomowych.
-
Structure recognition in MD-simulated materials: a case study of boroxyl rings in borate glasses
PublikacjaZanalizowano statystyczne właściwości geometryczne losowo deformowanej jednostki strukturalnej AC_3, gdzie trzy kationyC znajdują się w wierzchołkach trójkąta równobocznego, a anionA - w jego środku. W szczególności opisano rozkłady kątów AAA,ACA i CAA oraz dwóch estymatorów kształtu w funkcji amplitudydeformacji trójkąta. Wyniki analizy stochastycznej zastosowanodo ilościowej oceny stopnia nieuporządkowania w szkle B_2O_3,symulowanym...
-
MD advisor : a journal for New Jersey medical community
Czasopisma -
Structure of partially reduced xPbO (1-x)SiO2 glasses: combined EXAFS and MD study
PublikacjaWykorzystując połączenie metody EXAFS (extended X-ray absorption finestructure) i symulacji MD (molecular dynamics) zbadano strukturęczęściowo zredukowanych szkieł ołowiowo-krzemianowych o różnejstechiometrii wyjściowej. W wyniku analizy uzyskano szczegółowyopis struktury lokalnej wokół atomów ołowiu i jej zmiany w funkcjiskładu szkła i poziomu redukcji. Określono również jaką tendencjędo aglomeracji w metaliczne klastry wykazują...
-
Brownian Motion in Optical Tweezers, a Comparison between MD Simulations and Experimental Data in the Ballistic Regime
PublikacjaThe four most popular water models in molecular dynamics were studied in large-scale simulations of Brownian motion of colloidal particles in optical tweezers and then compared with experimental measurements in the same time scale. We present the most direct comparison of colloidal polystyrene particle diffusion in molecular dynamics simulations and experimental data on the same time scales in the ballistic regime. The four most...
-
UNRES-Dock—protein–protein and peptide–protein docking by coarse-grained replica-exchange MD simulations
Publikacja -
The interactions of monomeric acridines and unsymmetrical bisacridines (UAs) with DNA duplexes: an insight provided by NMR and MD studies
PublikacjaMembers of a novel class of anticancer compounds, exhibiting high antitumor activity, i.e. the unsymmetrical bisacridines (UAs), consist of two heteroaromatic ring systems. One of the ring systems is an imidazoacridinone moiety, with the skeleton identical to the structural base of Symadex. The second one is a 1-nitroacridine moiety, hence it may be regarded as Nitracrine’s structural basis. These monoacridine units are connected...
-
Interaction of cisplatin and two potential antitumoral platinum(ii) complexes with a model lipid membrane: a combined NMR and MD study
PublikacjaIn this study, the interaction of cisplatin (1) and two potential antitumoral Pt(II) complexes (2 and 3) with a model DMPC bilayer was investigated by multinuclear NMR spectroscopy and MD simulations in order to understand its implication for the different antitumoral properties shown by the three complexes. In particular, 31P, 13C and 2H solid state NMR experiments were performed to obtain information on the phase structure, phase...