Search
Search results for: izolacja i hodowla szczepów
-
Izolacja i identyfikacja psychrotolerancyjnych szczepów drożdży z torfowiska Rucianka zdolnych do efektywnej biodegradacji fenolu w obecności tlenu oraz identyfikacja szlaku metabolicznego zaangażowanego w tym procesie w celu oceny potencjału biotechnologicznego badanych szczepów drożdży
PublicationFenole to grupa toksycznych węglowodorów aromatycznych, a do głównych źródeł ich emisji do środowiska można zaliczyć przemysł chemiczny, procesy przeróbki węgla kamiennego i przemysł tekstylny. Pośród nich, fenol stanowi główne zanieczyszczenie gleb i wód spowodowane związkami fenolowymi. W wyniku realizacji badań prowadzonych w ramach mojej rozprawy doktorskiej wykazałam, że torfowiska mogą stanowić miejsce izolacji mikroorganizmów...
-
Józef Kur prof. dr hab.
People -
Obrony prac doktorskich na Wydziale Chemicznym
EventsDn. 29.03.2022 r. o godz. 14.15 w Audytorium 1.4 Wydziału Chemicznego PG (budynek nr 5) odbędzie się w trybie hybrydowym publiczna obrona pracy doktorskiej mgr inż. Natalii Filipowicz.
-
Roman Kotlowski dr hab. inż.
People -
Biotechnologia Leków
e-Learning Courses1. Biotechnologia farmaceutyczna rys historyczny, zakres działania, uwarunkowania prawne, problemy etyczne, odbiór społeczny.2. Drobnoustroje jako źródło nowych substancji biologicznie czynnych i przesiewowe techniki poszukiwania tych substancji3. Badania przedkliniczne i kliniczne nowych potencjalnych leków4. Znajomość metabolizmu drobnoustrojów podstawą planowania procesów biotechnologicznych.5. Peryferyjne szlaki metaboliczne...
-
Izolacja studzienki
PublicationProblem izolowania dodatkowego betonowej kanalizacyjnej studzienki rewizyjnej. Wykazano, że dla studzienki spełniającej wymagania norm jest to bezsensowne. Występuje tylko sbędne przedrożenie obiektu.
-
Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP
PublicationOmówiono etapy tworzenia zestawu diagnostycznego przeznaczonego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych wykorzystującego procedurę PCR MP (PCR Melting Profiles). Dokonano optymalizacji warunków i walidacji metody w celu przystosowania jej do potrzeb epidemiologicznej oceny zakażeń szpitalnych. Opracowany zestaw stwarza możliwości zastosowania go w laboratoriach prowadzących rutynowo badania diagnostyczne.
-
Beata Krawczyk dr hab.
PeopleBeata Krawczyk, PhD, Professor Academic degrees, education, qualifications: B. Krawczyk earned his master degree in Biology at the University of Gdansk, Biology Faculty, in 1986, and her PhD in Molecular Biology at the University of Gdansk, Biology Faculty, in 1996. Postdoctoral degree (habilitation) in biological sciences in the discipline biology, Faculty of Natural Sciences, University of Szczecin, Szczecin, in 2009. In 2012...
-
Molekularny mechanizm biogenezy fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli.
Publication.
-
Izolacja i identyfikacja naturalnych substancji barwiących obecnych w tkaninach grobowych
Publication.
-
Molecular characterization of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Poland by use of multiple genetic markers
PublicationW pracy przedstawiono wyniki genotypowania wielolekoopornych szczepów Mycobacterium tuberculosis, izolowanych od pacjentów z Polski.
-
Charakterystyka genetyczna szczepów Klebsiella pneumoniae izolowanych od pacjentów po przeszczepieniu nerki oraz badanie wpływu leków immunosupresyjnych na ekspresję genów bakteryjnych
PublicationBakterie z gatunku Klebsiella pneumoniae należą do oportunistycznych patogenów odpowiedzialnych za zakażenia szpitalne. Drobnoustroje te wykazują skłonność do oporności wielolekowej i wysokiej wirulencji, co stanowi poważne zagrożenie dla pacjentów nieimmunokompetentnych. Wśród pacjentów po transplantacji nerki zakażenia układu moczowego (ZUM) stanowią najczęstszą przyczynę powikłań infekcyjnych. Mechanizmy molekularne leżące u...
-
Enhanced susceptibility to antifungal oligopeptides in yeast strains overexpressing ABC multidrug efflux pumps
PublicationPorównano podatność na działanie związków przeciwgrzybowych o strukturze oligopeptydowej oraz aminokwasowej szczepów Saccharomyces cerevisiae z usuniętymi genami kodującymi białka oporności wielolekowej oraz transformantów tych szczepów, zawierających geny CDR1, CDR2 lub MDR1, kodujące główne pompy wielolekowe Candida albicans. Rekombinowane szczepy nadprodukujące białka Cdr1p i Cdr2p wykazywały zwiększoną wrażliwość na wszystkie...
-
Evaluation of multiple genetic markers for typing drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains from Poland
PublicationW publikacji przedstawiono wyniki genotypowania wielolekoopornych szczepów Mycobacterium tuberculosis izolowanych od pacjentów z Polski.
-
Ewaluation of a PCR Melting Profile technique for bacterial strain differentiation
PublicationBadano przydatność techniki PCR MP w efektywnym typowaniu szczepów w badaniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych. Technika oparta jest na użyciu niskiej temperatury denaturacji podczas LM PCR. Badaniu zostały poddane izolaty Escherichia coli pochodzące od pacjentów Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że technika jest szybka, o wysokim potencjale różnicującym i bardzo dobrej powtarzalności i może być zastosowana w badaniach...
-
IZOLACJA I IDENTYFIKACJA NATURALNYCH SUBSTANCJI BARWIĄCYCH OBECNYCH W PRÓBKACH FARB ARTYSTYCZNYCH I TKANINACH POCHODZENIA HISTORYCZNEGO
PublicationNatural organic dyes are group of substances that belong to various types of chemical compounds. The most commonly used in paintings and dyeing textiles were naturally occurring dyestuffs from group of anthraquinones, flavones and indigoid dyes. Identification of coloring substances present in historical artistic paints provides relevant information for a wide range of specialists dealing with works of art and in the field of conservation science....
-
Izolacja drożdży psychrotolerancyjnych oraz ocena ich zdolności do wykorzystania N-fosfonometyloglicyny jako źródła pierwiastków biogennych
PublicationN-fosfonometyloglicyna (PMG, glifosat) jest substancją aktywną herbicydu Roundup o szerokim spektrum aktywności biologicznej. Mechanizm jego działania opiera się na inhibicji aktywności syntazy 5-enolopirogroniano-szikimowo-3-fosforanowej (EPSP), przez co hamowana jest biosynteza aminokwasów aromatycznych u roślin. Glifosat jest związkiem fosforoorganicznym, w którego budowie wyróżnia się trwałe wiązanie C-P. Szybkość rozkładu...
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublicationWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
Molecular typing of Staphylococcus aureus isolated from cows with mastitis in the east of Poland on the basis of polymorphism of genes coding protein A and coagulase
PublicationPolimorfizm genów kodujących białko A i koagulazę wykorzystano do badania zmienności genetycznej bakterii Staphylococcus aureus wyizolowanych z gruczołów mlekowych krów u których stwierdzono stan zapalny. W badanej grupie 82 szczepów wyróżniono 24 genotypy.
-
Pochodne amfoterycyny B z zawadą przestrzenną - nowa grupa antymykotyków o niskiej toksyczności i aktywnych względem szczepów z opornością wielolekową. Badanie natury i mechanizmów ich właściwości fizykochemicznych i biologicznych
PublicationBadania prezentowane w ramach niniejszej rozprawy koncentrują się na poznaniu i wyjaśnieniu molekularnych mechanizmów leżących u podstaw poprawy selektywnej toksyczności pochodnych amfoterycyny B z zawadą przestrzenną jak również ich aktywności względem opornych szczepów grzybowych. Kluczowe wnioski wynikające z pracy są następujące: i) mutanty drożdżaków z defektem biosyntezy ergosterolu zachowują wrażliwość na badane związki...
-
Biofilm bakteryjny uropatogennych szczepów E. coli Dr+ jako czynnik indukujący przewlekłość zakażeń dróg moczowych ograniczający ich leczenie
PublicationZakażenia dróg moczowych (ZUM) stanowią jedne z najczęściej występujących infekcji bakteryjnych, dotykających każdego roku miliony osób na świecie. Problematyka tych zakażeń wynika z ich przewlekłości i nawrotów, pomimo stosowania terapii antybiotykowej oraz ciągle wzrastającej lekooporności uropatogenów je wywołujących. Dominującym czynnikiem etiologicznym ZUM są uropatogenne szczepy E. coli (UPECs), wykazujące zdolność do adhezji,...
-
Bacterial SSB-like proteins of family Deinococcaceae - indentification, isolation, obtaining, purification and molecular characteristic
PublicationWiększość poznanych białek SSB jest aktywna w formie homotetramerycznej. Od 2002 roku znane są białka organizmów ekstremofilnych. Scharakteryzowano białka mikroorganizmów rodziny Deinococaceae. Uzyskane termostabilne białka stanowią atrakcyjną alternatywę w stosunku do znanych białek SSB w metodach diagnostyki molekularnej, technikach biologii molekularnej i analityce.
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublicationW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
Izolacja lotnych związków organicznych z próbek wody. Metody i aparatura. Analysis of volatile organic compounds (VOCs) in water samples. Methods and apparatus.
PublicationOmówiono techniki wykorzystywane do przygotowania próbek wody do oznaczeń analitów z grupy lotnych związków organicznych (VOCs) za pomocą chromatografii gazowej. Opisano wady i zalety takich technik jak: bezpośrednie dozowanie próbki wody do kolumny chromatograficznej, ekstrakcja rozpuszczalnikiem, ekstrakcja do fazy stałej lub stacjonarnej, ekstrakcja membranowa oraz analiza fazy nadpowierzchniowej. Omówiono także nowe rozwiązania...
-
Białko DraD uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - mechanizm transportu na powierzchnię komórki i rola w procesie polimeryzacji struktur fimbrialnych
Publication -
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublicationPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
Identyfikacja i izolacja genu kodującego zaadaptowaną do zimna β-galaktozydazę Paracoccus sp. = Identification and izolation of the gene encoding cold-active β-galactosidase from paracoccus sp.
PublicationZaprezentowane badania były prowadzone u eehi wyizolowania ze środo¬wiska organizmu psychrofilnego, zdolnego do hydrolizy laktozy w niskiej tempe¬raturze, oraz zidentyfikowania genu kodującego (i-galaktozydazę zaadaptowaną do zimna.Poszukiwan gen został w izolowany z psychrofilnego szczepu autarkicz¬nego Paracoccus sp. 321). Na podstawie sekwencji nukleotydowej genu kodują¬cego fS-galaktozdaze ustalono skład aminokwasów),...
-
Zeszyty Naukowe Uniwersytetu Przyrodniczego we Wrocławiu, Biologia i Hodowla Zwierząt
Journals -
Phylogenetic relationship and antimicrobial resistance in Escherichia coli isolated from the Reda River and the Oliwski Stream, Northern Poland = Lekooporność i przynależność filogenetyczna szczepów Escherichia Coli izolowanych z rzeki Redy i Potoku Oliwskiego
PublicationThe high abundance of fecal bacteria in surface water is usually related to poor agricultural practice, pollution caused by domesticated and wild animals as well as with septic tank failures. Identification of fecal contamination sources seems to be crucial in order to effectively estimate the inherent risk. In this study, the phylogenetic relationship of 30 isolates of E. coli, originated from surface water, was estimated by employing...
-
Tetracycline and ampicillin resistance of Escherichia coli strains of surface water origin: the potential for horizontal transfer of resistance genes = Oporność na tetracyklinę i ampicylinę szczepów Escherichia Coli wyizolowanych z wody powierzchniowej : możliwość horyzontalnego przenoszenia genów oporności
PublicationThe aim of this preliminary study was to assess the occurrence and molecular diversity of tetracycline and ampicillin resistance genes carried by Escherichia coli present in surface water. Bacterial strains were isolated from two watercourses (the Reda River and the Oliwski Stream) that influence the quality of coastal waters in the Gdańsk Bay (Northern Poland) by direct discharge. The bacterial drug susceptibility, tested against...
-
Justyna Kobos dr
People -
Czynniki adhezyjne i inwazyjne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - badania podstawowe i aplikacyjne.**2003, 240 s. 80 rys. 13 tab. bibliogr. 107 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /22.12.2003/Międzyucz. Wydz. Biotechnol.UG i AM Promotor: prof. dr. hab. Józef Kur
Publication.
-
Lekooporność bakterii występujących w sieci wodociągowej rejonu Gdyni.
PublicationW pracy przedstawiono wyniki badań wrażliwości 120 szczepów bakterii wyizolowanych z surowej wody podziemnej i wodociągowej na 15 wybranych antybiotyków. Wykazano, że szczepy pochodzące z wody wodociągowej są bardziej oporne na wybrane antybiotyki II i III generacji. 40% szczepów z surowej wody oraz 87% szczepów z wody wodociągowej było opornych na więcej niż jeden antybiotyk.
-
Evaluation of a novel method based on amplification of DNA fragments surrounding rare restriction sites (ADSRRS-figerprinting) for typing strains of vancomycin resistant Enterococcus faecium.
PublicationBadania objęły wankomycyno oporne szczepy Enterococcus faecium izolowane od pacjentów oddziału Hematologii Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że ADSRRS-fingerprinting jest metodą szybką o dużym potencjale różnicującym i dużej powtarzalności w badaniach epidemiologicznych.
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublicationOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
-
Antifungal activity of thionated analogues of nva-fmdp and lys-nva-fmdp
Publicationotrzymano dwa peptydy w których wiązanie amidowe łączące aminokwasy zamieniono na tioamidowe w wyniku kilkunastoetapowej syntezy chemicznej. do reakcji tionowania zastosowano odczynnik lawessona. otrzymane związki poddano badaniom aktywności z wykorzystaniem pięciu szczepów candida , w tym szczepów opornych na flukonazol. stwierdzono, ze obecniość wiązania tioamidowego znacznie obniża aktywność przeciwgrzybową testowanych związków...
-
Charakterystyka oporności Klebsiella pneumoniae New Delhi na karbapenemy
PublicationBakterie Klebsiella pneumoniae New Delhi, posiadające gen oporności na karbapenemy (blaNDM) zostały po raz pierwszy wyizolowane w 2008 roku w Szwecji od pacjenta wcześniej hospitalizowanego w Indiach. Bakterie te szybko rozprzestrzeniają się po całym świecie, a od 2011 roku występują również w Polsce. Stanowią one wysokie ryzyko epidemiologiczne, ponieważ gen oporności na karbapenemy przekazywany jest pomiędzy bakteriami poprzez...
-
Projektowanie wodnych instalacji c.o. Nowa norma PN-EN 12828
PublicationPrzedstawiono wymagania dla projektowanej instalacji centralnego ogrzewania wg nowej normy PN-EN 12828 z podziałem na następujące elementy: dostawa ciepła, rozdział ciepła w instalacji c.o, grzejniki, regulacja (centralna, strefowa, miejscowa, programowana) i urządzenia zabezpieczające (instalacje zamknięte, naczynia wzbiorcze, wymagania dla instalacji otwartych, izolacja cieplna).
-
Możliwości i ograniczenia metod oznaczania lotnych i średniolotnych związków organicznych w wodach
PublicationW pracy przedstawiono i omówiono krytycznie metodyki analityczne wykorzystywane do oznaczania szerokiego spektrum analitów (z grupy lotnych i średniolotnych związków organicznych) w próbkach wody. Szczególną uwagę zwrócono na operacje związane z takimi etapami odpowiednich procedur analitycznych jak: pobieranie próbek, izolacja i/lub wzbogacanie analitów przed etapem oznaczeń końcowych.
-
Voriconazole and multidrug resistance in Candida albicans
PublicationPorównano aktywność grzybostatyczną in vitro worikonazolu, flukonazolu, ketokonazolu i klotrimazolu wobec opornych na flukonazol szczepów klinicznych Candida albicans oraz rekombinowanych szczepów Saccharomyces cerevisiae eksprymujących jeden z genów kodujących białka oporności wielolekowej (MDR) C. albicans: Cdr1p. Cdr2p lub CaMdr1p. Stwierdzono, że nadekspresja genów MDR czyni komórki drożdżaków mniej wrażliwymi na działanie...
-
Development of headspace-gas chromatography-flame ionization detection procedure to determine volatile fatty acids in zoo organic waste leachate
PublicationNadrzędnym celem pracy było opracowanie metodyki oznaczania lotnych kwasów tłuszczowych z fazy nadpowierzchniowej opartej na chromatografii gazowej z detektorem płomieniowo-jonizacyjnym oraz sprawdzenie jej przydatności w analizie próbek odcieku ze składowiska odpadów ogrodu zoologicznego. Na podstawie przeprowadzonych badań określono warunki, w jakich przebiegać powinna izolacja lotnych kwasów tłuszczowych, a także określono najlepsze...
-
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
PublicationW pracy pokazano użyteczność dwóch nowych metod do typowania molekularnego Staphylococcus aureus, ADSRRS-fingerprinting (Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites) i PCR MP (PCR melting profile). Przebadano 37 szczepów Staphylococcus aureus izolowanych od pacjentów z czyracznością. Jako metodę referencyjną zastosowano REA-PFGE. Okazało się, że izolaty Staphylococcus aureus z nosa od niektórych pacjentów...
-
Występowanie oraz polimorfizm genów kodujących syntezę autotransporterów proteaz serynowych (SPATE) wśród bakterii Escherichia coli wywołujących biegunki u dzieci w regionie Gdańska
PublicationW grupie 96 szczepów bakterii Escherichia coli wyizolowanych w rejonie Gdańska od dzieci z biegunką zbadano obecność oraz polimorfizm sekwencji genów kodujących grupę białek o wspólnej nazwie: SPATE (Serine Protease Autotransporters of Enterobacteriaceae). Za pomocą analizy restrykcyjnej zidentyfikowano 8 różnych genów kodujących białka z tej grupy. Obecność jednego genu stwierdzono w 39 szczepach, w 15 szczepach występowały dwa,...
-
Marcin Olszewski dr hab. inż.
People -
Metody oznaczania pestycydów w atmosferze w fazie gazowej i w pyle zawieszonym
PublicationW przypadku analizy próbek powietrza konieczne jest zastosowanie aparatury oddzielającej fazę gazową od cząstek stałych. Możliwe jest wtedy oznaczanie pestycydów osobno w obu fazach (w fazie gazowej oraz w pyle zawieszonym). Pierwszym etapem analizy w przypadku oznaczania pestycydów w powietrzu jest izolacja pestycydów z matrycy wraz ze wzbogacaniem analitów, a następnie ekstrakcja i oczyszczanie ekstraktu połączone najczęściej...
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublicationInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Beata Zalewska-Piątek dr hab.
People -
Potassium trimethylsilanolate-mediated conversion of dialkyl phosphonates to their anhydrous potassium monoalkyl phosphonates under mild, non-aqueous conditions
PublicationPrzedstawiona została metoda syntezy bezwodnych soli potasowych fosfonianów monoalkilu z odpowiednich fosfonianów dialkilu w reakcji z trimetylosilanolanem potasu w bezwodnym eterze i chlorku metylenu. Metoda ta może być również stosowana dla makrocyklicznych kaliks[4]arenów z wbudowanymi grupami fosfonowymi na górnej obręczy; preferowanym rozpuszczalnikiem jest w tym przypadku bezwodny THF. Zaletą opisanej metody są łagodne warunki...
-
PCR amplification with primers based on IS2404 and GC-rich repeated sequence reveals polymorphism in Mycobacterium ulcerans
PublicationOpracowano prostą w wykonaniu metodę genotypowania szczepów bakterii z gatunku Mycobacterium ulcerans. Polimorfizm genetyczny 32 badanych izolatów Mycobacterium ulcerans odzwierciedla ich geograficzne pochodzenie z rejonów Afryki Centralnej, Ameryki Południowej i Łacińskiej, Azji Południowo-Wschodniej, Malezji oraz Australii.
-
Anticandiadal properties of N-acylpeptides containing inhibitor of glucosamine-6-phosphate synthase
PublicationOtrzymano serię N-acylopeptydów zawierających inhibitor syntazy glukozamino-6-fosforanu i zbadano ich aktywność w stosunku do szczepów Candida albicans. Aktywność przeciwgrzybową skorelowano z właściwościami lipofilowymi otrzymanych peptydów. Peptydy zawierające resztę kwasu dekanowego wykazywały najwyższą aktywność przeciwgrzybową.