Search results for: SEKWENCJE DNA

• Artificial DNA: PNA and XNA

  Journals

  ISSN: 1949-095X

• Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań

  Publication

  • Ł. Wrona
  • K. Woźniak

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2006

  Biologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...

  Full text to download in external service

• Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu

  Publication

  • Ł. Wrona
  • K. Woźniak

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2006

  Moduł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...

  Full text to download in external service

• przyrostowa metoda budowy hierarchicznej sieci neuronowej dla przewidywania sekwencji znakowych

  Publication

  • M. Michalski

  - Year 2010

  Zaprezentowano sposób wykorzystania hierarchicznej, opartej na przewidywaniu sieci neuronowej do nauki (bez nadzoru) oraz rozpoznawania sekwencji znaków w wejściowym strumieniu tekstu. Dla powyższej struktury zaproponowano algorytm jej przyrostowej rozbudowy w miarę zapamiętywania sekwencji pozwalający na optymalizację procesu uczenia oraz ograniczenie wymagań pamięciowych prezentowanego rozwiązania. Wskazano również jej możliwe...

• Identyfikacja sekwencji markerowych w mikologicznej diagnostyce molekularnej

  Publication

  • M. Kordalewska
  • K. Szemiako

  - Year 2013

  Procedury diagnostyki mikologicznej coraz częściej wykorzystują metody molekularne, oparte na analizie kwasów nukleinowych. Pozwala to na skrócenie czasu analizy oraz polepszenie wielu innych, istotnych dla procesu diagnostycznego parametrów takich jak: czułość, powtarzalność, specyficzność oraz potencjał różnicujący. Istotnym etapem przy projektowaniu układów do diagnostyki molekularnej grzybów jest wybór celu molekularnego. Powszechnie...

• Wpływ sekwencji złóż na efektywność usuwania zanieczyszczeń w hybrydowych systemach hydrofitowych

  Publication

  • H. Obarska-Pempkowiak
  • M. Gajewska
  • A. Lang

  - Year 2005

  Hybrydowe Systemy Hydrofitowe (HSH) to obiekty złożone z co najmniej dwóch złóż o zmiennym pionowym i poziomym przepływie ścieków. Dotychczas stosowano dwa rodzaje konfiguracji hybrydowych systemów hydrofitowych: z poziomym względnie pionowym złożem usytuowanym na początku biologicznego oczyszczania. W Polsce eksploatowane są tylko systemy HSH ze złożem poziomym na początku a potem ze złożem pionowym. W Europie również są popularne...

• Analiza dokładności pomiarów pulsu na podstawie zarejestrowanej sekwencji wideo obszaru twarzy

  Publication

  • M. Madej
  • J. Rumiński

  - Year 2013

  Za pomocą prostej kamery internetowej zarejestrowano sekwencje wideo obszaru twarzy, równolegle wykonując pomiar EKG. Sekwencje wideo poszczególnych składowych (R,G,B) uśredniono w następujących obszarach: całej twarzy, czoła oraz policzków uzyskując w ten sposób dla każdego z kanałów RGB serie czasowe odpowiadające wybranym obszarom twarzy. Aby usunąć zakłócenia związane m.in. z oddechem i ruchem zastosowano filtr pasmowy (FIR)....

• Dopasowanie obrazów podczerwieni przy pomocy sekwencji obrazów widzialnych

  Publication

  • M. Suchowirski
  • A. Z. Nowakowski

  - Year 2009

• Sekwencyjne algorytmy antypodalnego kolorowania radiowego grafów.

  Publication

  • A. Kosowski

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2003

  Praca zawiera charakterystykę suboptymalnych algorytmów antypodalnego kolorowania grafów, stanowiących adaptację algorytmów sekwencyjnych S, SL, LF stosowanych przy klasycznym kolorowaniu grafów. Dla tych algorytmów wskazano grafy dość trudne i trudne do pokolorowania (HC i SHC). Porównano ich funkcję dobroci i rozpiętości uzyskiwanych pokolorowań dla grafów o różnej gęstości krawędziowej.

• DNA REPAIR

  Journals

  ISSN: 1568-7864 , eISSN: 1568-7856

• Mobile DNA

  Journals

  ISSN: 1759-8753

• DNA SEQUENCE

  Journals

  ISSN: 1042-5179

• DNA Reporter

  Journals

  ISSN: 0418-5412

• Environmental DNA

  Journals

  eISSN: 2637-4943

• Mitochondrial DNA

  Journals

  ISSN: 1940-1736

• Analiza PCA sekwencji aktywnej termografii dynamicznej w diagnostyce oparzeń

  Publication

  • M. Kaczmarek
  • A. Zajączkowska

  - Year 2009

  Celem niniejszej pracy jest analiza metod przetwarzania obrazów opartych na analizie składowychgłównych oraz analizie składowych niezależnych, które pozwola na uzyskanie nowych informacji obadanym obiekcie. W ramach pracy powstało oprogramowanie, które pozwala na analizezarejestrowanych sekwencji termograficznych metoda składowych głównych - Principal ComponentAnalysis - PCA. Została przeprowadzona weryfikacja działania powyższych...

• Analiza PCA sekwencji aktywnej termografii dynamicznej w diagnostyce oparzeń

  Publication

  • M. Kaczmarek
  • A. Zajączkowska

  - Year 2009

• Pakiet oprogramowania do obróbki sekwencji termograficznych w aktywnej termografii dynamicznej

  Publication

  • J. Macyński
  • M. Kaczmarek

  - Year 2006

  .

• Wpływ wyboru elementu strukturalnego użytego w przetwarzaniu morfologicznym na skuteczność nowej metody usuwania tła z sekwencji MRI

  Publication

  • R. Kalicka
  • A. Pietrenko-Dąbrowska
  • S. Lipiński

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2008

  Zaprezentowano nową metodę usuwania zaszumionego tła z sekwencji skanów MRI. Na każdy skan składają się dwa obszary: przekrój mózgu i tło, oba zawierające szum. Tło powinno być odseparowane i wykluczone z dalszej analizy. Cel ten został osiągnięty dzięki zastosowaniu opisanego algorytmu, aplikującego podstawowe operacje morfologiczne: dylację, erozję, otwarcie i zamknięcie do uprzednio zbinaryzowanych zbiorów MRI. Pokazano rezultaty...

• Mitochondrial DNA Part A

  Journals

  ISSN: 2470-1394 , eISSN: 2470-1408

• Dlaczego subwencje nie są rozwojowe? Próba identyfikacji przyczyn braku wpływu subwencji na wydatki inwestycyjne

  Publication

  • A. Sekuła
  • B. Basińska

  - PRACE NAUKOWE UNIWERSYTETU EKONOMICZNEGO WE WROCŁAWIU - Year 2014

  Artykuł skupia się na poszukiwaniu przyczyn braku wpływu subwencji ogólnej na wydatki inwestycyjne jednostek samorządu terytorialnego. Na podstawie wyników badań statystycznych oraz porównania wpływów z części oświatowej subwencji ogólnej oraz jej całkowitej wielkości w stosunku do wydatków oświatowych jako najbardziej prawdopodobne wytłumaczenie przyjęto wysokość tych ostatnich, które nierzadko przekraczają wpływy z całej subwencji...

  Full text available to download

• Projektowanie strategii frezowania złożonych kieszeni w komponentach mechanicznych

  Publication

  • T. Bocheński
  • M. Deja
  • M. Siemiątkowski

  - Mechanik - Year 2016

  Przedstawiono metody wyznaczania optymalnych sekwencji narzędziowych w projektowaniu strategii frezowania złożonych kieszeni przy wykorzystaniu określonego zestawu narzędziowego. W doborze sekwencji dopuszczalnych uwzględniano eliminację sekwencji nieefektywnych. Alternatywne sekwencje narzędziowe modelowano w postaci ważonych grafów acyklicznych dla generowanych wariantów ścieżek kolejnych narzędzi, dokonując ich oceny kosztowej.

  Full text available to download

• Port knocking - alternatywne rozwiązania

  Publication

  • K. Nowicki
  • P. Sojka

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2007

  Omówiono techniki pukania w porty (ang. Port Knocking). Zaproponowano nowe wersje mechanizmu oparte o wykonanie sekwencji puknięć wieloma pakietami w jeden port: pukanie pakietami o różnej długości, przy czym długości te stanowiłyby sekwencję kodową, oraz pukanie, w którym sekwencją kodową są odcinki czasu pomiędzy pojawianiem się na porcie kolejnych pakietów. Rozważono możliwości zastosowania tego typu port knockingu i zaproponowano...

• DNA AND CELL BIOLOGY

  Journals

  ISSN: 1044-5498 , eISSN: 1557-7430

• Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences

  Publication

  • B. Krawczyk
  • K. Lewandowski
  • J. Kur

  - MOLECULAR AND CELLULAR PROBES - Year 2002

  Zaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...

• RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY

  Journals

  ISSN: 1355-8382 , eISSN: 1469-9001

• Mitochondrial DNA Part B-Resources

  Journals

  ISSN: 2380-2359

• Recent Advances in DNA and Gene Sequences

  Journals

  ISSN: 2352-0922

• Elektronika dla wszystkich

  Journals

  ISSN: 1425-1698

• Glyceraldehyde - 3 - phosphate dehydrogenase gen from Amanita citrina. Ac-cession AJ532582, 2002 GenBank NCBI [on line].**2002 [cytowany 07.01.03]. Dostępny: http://www.ncbi.nml.nih.gov Sekwencja genu kodującego dehydrogenzę aldehydu - 3 - fsfoglicerynowego dla muchomora cytrynowego (Amanita citrina).

  Publication

  • P. Szweda
  • N. Malicka
  • W. Krajewski
  • R. Kotlowski

  - Year 2002

  Po raz pierwszy ustalono sekwencję nukleotydową fragmentu genu gpd (dehydro-genazy aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego) dla muchomora cytrynowego (Amanitacitrina), pozwoli to na ustalenie sekwencji starterów umożliwiających wykry-wanie grzybów tego gatunku za pomocą techniki PCR.

• Dwa dni

  Publication

  • K. Wróblewski

  - Year 2022

  Dwa Dni, 1995 r., olej/płótno, 116 x 179 cm (dyptyk), sygnowany, datowany i opisany na odwrocie: KRZYSZTOF WRÓBLEWSKI | olej, płótno | "DWA DNI" | 116 x 179 cm | 1995 | monogram KW | wskazówki montażowe

• Analysis of induction of DNA DSBs on telomeres in A549 cells

  Open Research Data

  open access

  • N. Maciejewska

  - series: Confocal microscopy

  Data consist of an analysis of DNA DSBs on telomeres. A549 were treated with compounds (TXT4, MTX, DMSO) at IC90 concentration for the indicated time. Images were acquired with an LSM 800 inverted laser scanning confocal microscope (Carl Zeiss; Dresden, Germany) equipped with an Airyscan detector using a ×63 1.4 NA Plan Apochromat objective (Carl Zeiss)....

• DYNA-COLOMBIA

  Journals

  ISSN: 0012-7353

• DYNA-BILBAO

  Journals

  ISSN: 0012-7361 , eISSN: 1989-1490

• DNA Computing and Molecular Programming (International Meeting on DNA Computing and Molecular Programming)

  Conferences

• Experience-Based Decisional DNA (DDNA) to Support Product Development

  Publication

  • E. Szczerbicki
  • M. Ahmed
  • C. Sanin

  - CYBERNETICS AND SYSTEMS - Year 2018

  Knowledge and experience are important requirements for product development. The aim of this paper is to propose a systematic approach for industrial product development. This approach uses smart knowledge management system comprising of Set of Experience Knowledge Structure and Decisional DNA (DDNA) along with Virtual Engineering Tools (Virtual engineering object, Virtual engineering process, and Virtual engineering factory)....

  Full text available to download

• Phylogenetic trees of genus Oncidium Sw. based on analysis of DNA sequences

  Open Research Data

  version 1.3 open access

  • P. Krajewski

  - series: Oncidium Sw. taxonomy

  Genus Oncidium Sw. is widely regarded as a polyphiletic, and the taxonomic boundaries between him and such genera as Odontoglossum Kunth. or Miltonia Lindley remain blurred. The goal of the study was to determine the phylogenetic relationships within the genus Oncidium s.lato based on the DNA sequences analysis. The correlation between molecular data...

• Hiperheurystyki w kolorowaniu grafów

  Publication

  • J. Dąbrowski
  • P. Obszarski

  - Zeszyty Naukowe Wydziału ETI Politechniki Gdańskiej. Technologie Informacyjne - Year 2007

  Hiperheurystyki to jeden z nowych trendów w technice obliczeniowej. Można je zdefiniować jako algorytmy, które wykorzystują zdefiniowany zbiór prostych heurystyk do znalezienia przybliżonego rozwiązania. Celem algorytmu jest znalezienie takiej sekwencji uruchamiania tych prostych operacji, która będzie dawała najlepsze rozwiązanie dla danej instancji problemu lub danej klasy instancji problemu. W pracy zdefiniowano heurystyki dla...

• Glyceraldehyde - 3 - phosphate dehydrogenase gene from Coprinus atramenta-rius. Accession AJ532581, 2002 GenBank NCBI [on line].**2002 [cytowany 07.01.03]. Dostępny: http://www.ncbi.nlm.nih.gov Sekwencja genu kodujacego dehydrogenazę aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego dla czernidłaka pospolitego (Coprinus atramentarius).

  Publication

  • P. Szweda
  • N. Malicka
  • W. Krajewski
  • R. Kotlowski

  - Year 2002

  Po raz pierwszy ustalono sekwencję nukleotydową fragmentu genu gpd (dehydro-genazy aldehydu - 3 - fosfoglicerynowego)dla gatunku Coprinus atramentarius,pozwoli to na zaprojektowanie pary starterów umożliwiających wykrywaniegrzybów tego gatunku za pomocą reakcji PCR.

• Novel method of expression and purification of hirudin based on pBAD TOPO, pTYB12 vectors and gene synthesis

  Publication

  • R. Kochanowski
  • R. Kotlowski
  • P. Szweda

  - PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION - Year 2006

  W pracy przedstawiono nową, szybką i tanią metodę otrzymywania, ekspresji i oczyszczania białka hirudyny naturalnie izolowanego z ślinianek pijawki lekarskiej. Hirudyna pełni funkcje bezpośredniego inhibitora trombiny, głównego białka biorącego udział w tworzeniu skrzepów krwi. Właściwości te wykorzystywane są od wielu lat w klinice. Opracowana metoda pozwoliła uzyskać 17 mg/l hodowli E. coli białka o wysokiej czystości i aktywności...

• Cross sections for electron scattering from selected components of DNA and RNA

  Publication

  • P. Możejko
  • L. Sanche

  - Year 2005

  Wykorzystując metodę atomów niezależnych obliczono różniczkowe i całkowite przekroje czynne na sprężyste rozproszenie elektronów na wybranych drobinach, będących analogami składników DNA i RNA. Przekroje te obliczono w zakresie energii zderzenia od 50eV do 200 eV dla następujących drobin: C4H8O, C4H8O2, C5H10O2 oraz H3PO4. Przy użyciu metody BEB (binary-ecounter Bethe method) dla powyższych związków obliczono również przekroje...

• Cross section calculations for electron scattering from DNA and RNA bases.

  Publication

  • P. Możejko
  • L. Sanche

  - RADIATION AND ENVIRONMENTAL BIOPHYSICS - Year 2003

  Policzono różniczkowy i scałkowany przekrój czynny na rozproszenie sprężyste elektronów (w przybliżeniu atomów niezależnych) na uracylu, cytozynie, guaninie, adeninie i tyminie w zakresie energii od 50-4000 eV. W przybliżeniu modelu BEB policzono również przekroje czynne na jonizację tych molekuł.

• Experience Based Decisional DNA (DDNA) to Support Sustainable Product Design

  Publication

  • M. Ahmed
  • C. Sanin
  • E. Szczerbicki

  - Year 2018

  This paper presents the idea of providing engineering design knowledge to designers working on sustainable product design and development process. The new product development process often requires significant amount of design knowledge which can be saved and recalled by designers during the design process. This knowledge is very important for successful sustainable product development as it can include material selection, product...

  Full text to download in external service

• A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins

  Publication

  • M. Kur
  • R. Piątek
  • J. Kur

  - PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION - Year 2007

  Praca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...

• DNA RESEARCH

  Journals

  ISSN: 1340-2838 , eISSN: 1756-1663

• Molecular differences in mitochondrial DNA (mtDNA) genomes of dogs with malignant mammary tumours

  Open Research Data

  open access

  • B. Ślaska
  • K. Kowal
  • A. Tkaczyk-Wlizło
  • M. Pierzchała
  • J. Gawor

  The aim of this study was to determine molecular defects in mitochondrial DNA with the use of large-scale genome analysis in malignant canine mammary gland tumours and indicate whether these changes were linked with the carcinogenesis process. With the use of the NGS technology, we sequenced 27 samples of mtDNA isolated from blood and tumours obtained...

• Molecular characterization of a cryptic plasmid from the psychrotrophic antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A

  Publication

  • H. Cieśliński
  • K. Werbowy
  • J. Kur
  • M. Turkiewicz

  - PLASMID - Year 2008

  W ostatnich latach znacznie wzrosło zainteresowanie organizmami zimnolubnymi, głównie z powodu ich enzymów o biotechnologicznym znaczeniu. Jednak, aby wydajnie produkować takie enzymy w skali przemysłowej użyteczne jest stworzenie rekombinantowych systemów ekspresyjnych, które pozwolą na ich opłacalną produkcję. W osiągnięciu tego celu mogą pomóc odpowiednie wektory, konstruowane na bazie plazmidów pozyskiwanych z bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych....

  Full text to download in external service

• Non-coding RNA

  Journals

  eISSN: 2311-553X

• Journal of RNA and Genomics

  Journals

  ISSN: 2591-7781

• Expression and intein-mediated purification of novel staphylokinase SakSTAR with reduced immunogenicity and antiplatelet and antithrombin activation

  Publication

  • R. Kochanowski
  • R. Kotlowski
  • P. Szweda

  - APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY - Year 2007

  Skonstruowano nową formę stafylokinazy zawierającej na swoim C-końcu domenę pochodzącą z C-konieca ----(KOŃCA)---??? hirudyny. Wprowadzono do sekwencji stafylokinazy sekwencje RGD i DGR, odpowiedzialne za zmniejszenie agregacji płytek krwi (52% do 38%) a tym samym zwiększenie skuteczności działania tego białka jako potencjalnego leku. Otrzymany nowy wariant stafylokinazy posiadał zwiększoną aktywność fibrynolityczną, czego przejawem...