Publikacje
Filtry
wszystkich: 42
Katalog Publikacji
-
Influence of a lipid bilayer on the conformational behavior of amphotericin B derivatives - A molecular dynamics study.
PublikacjaAmphotericin B (AmB) is an effective but very toxic antifungal antibiotic. In our laboratory a series of AmB derivatives of improved selectivity of action was synthesized and tested. To understand molecular basis of this improvement, comparative conformational studies of amphotericin B and its two more selectivederivatives were carried out in an aqueous solution and in a lipid membrane. These molecular simulation studies revealed...
-
Modeling of the alcohol dehydrogenase active site. Two different modes of alcohol binding in crystals of zinc and cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates evidenced by X-ray diffraction and solid state vibrational spectroscopy
PublikacjaOpisano syntezę, struktury cząsteczkowe oraz widma FT-IR, 1H. 13C, 29Si, 113Cd NMR dziesięciu nowych, mieszanoligandowych kompleksów cynku i kadmu z ligandem tri-tert-butoksysilanotiolanowym i pochodnymi imidazolu. Za pomocą rentgenowskiej analizy strukturalnej i spektroskopii w podczerwieni udokumentowano dwa różne sposoby wiązania etanolu i metanolu w kryształach tych związków. Opisane kompleksy stanowią modele miejsca aktywnego...
-
Molecular Determinants of Proton Transfer in ATP Synthase FO Complex
Publikacja -
Amphotericin B and Its New Derivatives - Mode of Action
PublikacjaAmphotericin B (AmB) is a well known antifungal and antiprotozoal antibiotic used in the clinic for several decades. Clinicalapplications of AmB, however, are limited by its nephrotoxicity and many other acute side effects which are not acceptable by patientswhen their life is not threaten. In order to improve the therapeutic index of this drug, lipid formulations have been introduced and manyefforts have been made to obtain less...
-
How do sterols determine the antufungal activitiy of amphotericin B? Free energy of binding between the drug and its membrane targets.
PublikacjaAmphotericin B (AmB) is a well-known polyene antibiotic used to treat systemic fungal infections. It is commonly accepted that the presence of sterols in the membrane is essential for the AmB biological activity, that is, for the formation of transmembrane ion channels. The selective toxicity of AmB for fungal cells is attributed to the fact that it is more potent against fungal cell membranes containing ergosterol than against...
-
Interactions of amphotericin B derivatives with lipid membranes - a molecular dynamics study
PublikacjaW pracy analizowano oddziaływanie dwóch nisko-toksycznych pochodnych amfoterycyny B (związki SAmE i PAmE) z modelami błon lipidowych. Badania wykonane zostały za pomocą dynamiki molekularnej. Modele błon oprócz fosfolipidów DMPC zawierały odpowiednio cholesterol (model błony zwierzęcej) lub ertosterol (model błony grzybowej). Analiza wyników wykazała, że obie pochodne amfoterycyny B zachowują się inaczej w błonie cholesterolowej...
-
Partition coefficients of selected environmentally important volatile organic compounds determined by gas - liquid chromatography with polydimethylsiloxane stationary phase
PublikacjaPrzedstawiono wartości współczynników podziału (stałych podziału) 14 lotnych związków organicznych istotnych dla stanu środowiska (często oznaczanych w powietrzu w pomieszczeniach zamkniętych) między fazą gazową (N2) a ciekłą (PDMS). Wyznaczano je dwiema technikami (izotermiczną i z liniowo programowanym wzrostem temperatury). Dowiedziono, że istnieje możliwość wyznaczania współczynników podziału techniką LTPRI w oparciu o skalę...
-
Thick film traps with an irregular film. Preparation and evaluation.
PublikacjaOpisano nową metodę wytwarzania otwartych pułapek kapilarnych do wzbogacania lotnych związków organicznych z próbek gazowych. Badanie właściwości tego typu pułapek wykazało, że spadek ich sprawności chromatograficznej w porównaniu z pułapkami z filmem regularnym, jest rzędu 20-30%. Opracowana technologia jest bardzo prosta i pozwala na szybkie i tanie wytwarzanie dużych ilości pułapek z grubymi filmami również przez niewyspecjalizowane...
-
Automated high-capacity sorption probe for extraction of organic compounds in aqueous samples followed by gas chromatographic analysis.
PublikacjaOpracowano zautomatyzowany zestaw wyposażony w próbnik o dużej pojemności sorpcyjnej do oznaczania związków śladowych z zastosowaniem chromatografii gazowej. Zestaw łączy prostotę SPME z wysoką wydajnością techniki ekstrakcji z zastosowaniem ruchomego elementu sorpcyjnego (SBSE). Procedura pobierania próbek była przeprowadzana z zastosowaniem podajnika automatycznego. Ze względu na pełną automatyzację zestawu, możliwa jest bezobsługowa...
-
Solvation and partial molar volumes of some transition metal cations in N,N-dimethylacetamide, triethylphosphate and acetonitrile.
PublikacjaW oparciu o precyzyjne pomiary gęstości roztworów nadchloranów metali przejściowych szeregu Mn(II)-Zn(II) w DMA, TEP i AN wyznaczono pozorne molowe oraz graniczne wartości cząstkowych molowych objętości sole w temperaturach 293, 298 i 303,15 K. Wyznaczone wartości rozdzielono na udziały jonowe. Przeanalizowano czynniki decydujące o wielkości cząstkowych molowych objętości solwatowanych kationów.
-
Ultra thick open tubular traps with an increased inner diameter.
PublikacjaPrzeanalizowano zagadnienia związane z zastosowaniem otwartych pułapek kapilarnych z grubym nieregularnym filmem polidimetylosiloksanu do wzbogacania lotnych związków organicznych. Przeprowadzone rozważania teoretyczne oraz prace eksperymentalne wykazały, że zwiększenie średnicy wewnętrznej pułapek może znacząco polepszyć ich właściwości. Dla danego natężenia przepływu próbki oraz danego stosunku objętości faz w pułapce, liczba...
-
Apparent molar volumes of divalent transition metal perchlorates and chlorides in N,N-dimethylacetamide.
PublikacjaZmierzono gęstości roztworów nadchloranów i chlorków manganu(II), kobaltu(II), niklu(II), miedzi(II) i cynku(II) w temperaturach 10, 20,25, 30, 40, 50 i 60(o)C. Obliczono pozorne objętości molowe. Wyznaczono graniczne wartości cząstkowych molowych objętości tych soli oraz odpowiednie rozszerzalności. Przeanalizowano i wyjaśniono różnice we właściwościach wolumetrycznych roztworów nadchloranów i chlorków.
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublikacjaAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Ionic hydration in LiPF6, NaPF6, and KPF6 aqueous solutions derived from infrared HDO spectra.
PublikacjaZbadano hydratację LiPF6, NaPF6 oraz KPF6 przy pomocy metody FTIR, z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego HDO w H2O. Dane widmowe poddano analizie metodą ważonych widm różnicowych. Główne wnioski pracy stanowią uzupełnienie i rozszerzenie pasmowego modelu hydratacji kationów, wcześniej postulowanego na podstawie widm w podczerwieni HDO wodnych roztworów różnych elektrolitów.
-
Molecular aspects of the interaction between amphotericin B and a phospholipid bilayer: molecular dynamics studies.
PublikacjaAmfoterycyna B jest antybiotykiem z grupy polienów makrolidowych. Stosowany jest on w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Wiadomo że związek ten oddziałuje ze składnikami błon lipidowych i tworzy kanały. W przedstawianej pracy prezentowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną układu składającego się z 200 cząsteczek lipidów DMPC i jednej cząsteczki amfoterycyny ułożonej na powierzchni błony. Z przeprowadzonej...
-
Thermodynamic properties of inorganic salts in nonaqueous solvents. I. Apparent molar volumes and compressibilities of divalent transition-metal perchlorates in N,N-dimethylformamide.
PublikacjaZmierzono gęstości i szybkość dźwięku dla roztworów nadchloranów dwuwartościowych metali przejściowych w N,N-dimetyloformamidzie. W oparciu o uzyskane wyniki wyznaczono pozorne objętości molowe, cząstkowe objętości molowe, rozszerzalności izobaryczne oraz ściśliwości adiabatyczne. Dokonano analizy oraz zbadano wpływ rodzaju kationu metalu.
-
Wykorzystanie zjawiska sorpcji w opracowaniu nowych technik izolacji analitów organicznych z mediów gazowych oraz ciekłych z zastosowaniem polidimetylosiloksanu.
Publikacja.
-
Nowoczesne techniki przygotowania próbki do oznaczania analitów organicznych z zastosowaniem chromatografii gazowej. Część II. Aparatura. Modern techniques of preparation of samples for determining organic analytes by gas chromatography. Part II. Instrumentation.
PublikacjaW pracy dokonano przeglądu szerokiego spektrum technik przygotowania próbki ze szczególnym uwzględnieniem technik o charakterze prośrodowiskowym. Opisu technik dokonano pod kątem wykorzystywanych mechanizmów izolacji analitów oraz stosowanych rozwiązań aparaturowych.
-
Nowoczesne techniki przygotowania próbki do oznaczania analitów organicznych z zastosowaniem chromatografii gazowej. Część I. Podstawy teoretyczne ekstrakcji. Modern techniques of preparation of samples for determining organic analytes by gas chromatography. Part I. Theoretical principles of extraction.
PublikacjaPrzedstawiono podstawy teoretyczne technik izolacji i wzbogacania analitów organicznych z próbek gazowych oraz ciekłych. Już pobieżna analiza literatury dotyczącej omawianych zagadnień, pokazuje jak różnorodne i bogate spektrum technik jest stosowane na etapie przygotowania próbki. Z drugiej strony, z punktu widzenia podstaw fizykochemicznych, większość technik opiera się na dwóch zjawiskach: adsorpcji analitów na medium zatrzymującym...
-
The common effect of hydrophobic and electrophilic types of hydration dependent on protonation in the sec-butyloamine/HCl/H2O system studied by FTIR spectroscopy
PublikacjaZbadano hydratację sec-butyloaminy w zależności od pH roztworów wodnych przy pomocy spektoskopii FTIR, z zastosowaniem techniki rozcieńczenia izotopowego HDO w H2O. Dane widmowe poddano analizie przy pomocy ilościowej metody widm różnicowych. Stwierdzono, iż wiązania wodorowe cząsteczek wody tworzących klatratopodobną otoczkę hydratacyjną wokół aminy ulegają wzmocnieniu na skutek oddziaływania z grupą elektrofilową aminy.