Filters
total: 5735
filtered: 3978
displaying 1000 best results Help
Search results for: PROTEINS, DATA-ASSISTED MODELING, CONFORMATIONAL ENSEMBLES, NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, SMALL-ANGLE X-RAY SCATTERING, CHEMICAL CROSS-LINKING COUPLED WITH MASS SPECTROSCOPY, MOLECULAR DYNAMICS, COARSE GRAINING
-
Molecular dynamics study on the influence of C-terminal sugar substitution on dynamics and conformation of vancomycin derivatives
Publication -
Application of dynamic headspace and gas chromatography coupled to mass spectrometry (DHS-GC-MS) for the determination of oxygenated volatile organic compounds in refinery effluents
PublicationThe paper presents a new procedure for the determination of oxygenated volatile organic compounds (O-VOCs) in postoxidative effluents from the production of petroleum asphalt using dynamic headspace coupled to gas chromatography-mass spectrometry in the selected ion monitoring (SIM) mode (DHSGC-MS). Among the GC capillary columns tested, a polar SLB-IL111 column with the ionic liquid stationary phase was found to be superior due...
-
Total electron-scattering cross section measurements for tetrahydropyran, (CH2)5O, molecules
PublicationZmierzono całkowity przekrój czynny (TCS) na rozproszenie elektronów na drobinach tetrahydropyranu. Pomiary przeprowadzono metodą transmisyjną w zakresie energii zderzenia 1 - 400 eV. Otrzymana zależność energetyczna TCS wskazuje na obecność procesów rezonansowych w zakresie 3 - 15 eV. Wyniki porównano z całkowitymi przekrojami czynnymi dla drobin tetrahydrofuranu i alkoholu alfa-tetrahydrofurfurylowego.
-
Measurements of absolute elastic and vibrational cross sections for electron scattering from tetrahydrofuran
PublicationPrzedstawiono wstępne wyniki pomiaru absolutnych przekrojów czynnych na zderzenie elektronów z drobinami tetrahydrofuranu przy energii 10eV.
-
Electron-scattering total cross sections for complex molecules: group additivity rule
PublicationZaprezentowano całkowite przekroje czynne na rozpraszanie elektronów na dwóch rodzinach drobin: pierwszej - zawierającej azot jako atom centralny [N(CH3)3, NH2CH3, NH3]oraz drugiej - rodzinę eterów cyklicznych [c-(CH2)nO, gdzie n=2-5]. Zostało pokazane, że TCS dla niektórych drobin wieloatomowych można wyznaczyć na podstawie wyników TCS dla drobin o prostszej budowie lub ich fragmentów.
-
Cross sections for electron scattering from sulfuryl chloride fluoride (SO2ClF) molecules
PublicationArtykuł prezentuje zmierzone całkowite przekroje czynne oraz obliczone sprężyste i jonizacyjne przekroje czynne na rozpraszanie elektronów na drobinach SO2ClF dla niskich i średnich energii zderzenia. Wyniki porównano z dostępnymi przekrojami czynnymi dla drobin zawierających siarkę jako atom centralny.
-
Cross section calculations for electron impact ionization and elastic scattering from cisplatin
PublicationCałkowity przekrój czynny na jednokrotną jonizację cisplatyny (H6N2Cl2Pt) w zderzeniach z elektronami został obliczony przy wykorzystaniu modelu BEB (binary-encounter-Bethe) dla energii zderzenia od progu na jonizację do 5 keV. W celu uzyskania danych niezbędnych w modelu BEB, geometryczna i elektronowa struktura cisplatyny została przebadana metodami chemii kwantowej. Obliczono również przekrój czynny na sprężyste rozproszenie...
-
Business competencies and innovation capability in cross-border small regional enterprises
Publication -
Raman spectroscopy analysis of molecular configuration forms of the macular xanthophylls
Publication -
The presence of polycyclic aromatic hydrocarbons in disposable baby diapers: A facile determination method via salting-out assisted liquid-liquid extraction coupled with gas chromatography-mass spectrometry
PublicationIn this paper we demonstrate the development of the extraction procedure of polycyclic aromatic hy- drocarbons from baby diapers along with their quantification by gas chromatography-mass spectrometry. Apart from covering plastic foil, disposable baby diapers contain sorbents intended to absorb urine and feces. A hygroscopic, adsorptive, and tough-to-homogenize fibrous sorbent, represents an analytical chal- lenge to analytical...
-
Thermodynamic Studies of Interactions between Sertraline Hydrochloride and Randomly Methylated β-Cyclodextrin Molecules Supported by Circular Dichroism Spectroscopy and Molecular Docking Results
PublicationThe interaction between sertraline hydrochloride (SRT) and randomly methylated β-cyclodextrin (RM β CD) molecules have been investigated at 298.15 K under atmospheric pressure. The method used—Isothermal Titration Calorimetry (ITC) enabled to determine values of the thermodynamic functions like the enthalpy (DH), the entropy (DS) and the Gibbs free energy (DG) of binding for the examined system. Moreover, the stoichiometry coefficient...
-
A TPC Detector for Studying Photo-nuclear Reactions at Astrophysical Energies with Gamma-ray Beams at ELI--NP
Publication -
Fractional neutron point kinetics equations for nuclear reactor dynamics – Numerical solution investigations
PublicationThis paper presents results concerning numerical solutions to a fractional neutron point kinetics model for a nuclear reactor. The paper discusses and expands on results presented in (Espinosa-Paredes et al., 2011). The fractional neutron point kinetics model with six groups of delayed neutron precursors was developed and a numerical solution using the Edwards’ method was proposed (Edwards et al., 2002). The mathematical model...
-
Processing of point cloud data retrieved from terrestrial laser scanning for structural modeling by Finite Element Method
PublicationFinite Element Method is one most popular contemporary method of strength analysis. The method is an advanced method for solving differential equations, based on discretization, which means that area is divided into finite elements. Each finite element has a solution of the equation approximated by specific functions and performing the actual calculations only for nodes of this division. Finite Element Method is widely used in...
-
The use of fast molecular descriptors and artificial neural networks approach in organochlorine compounds electron ionization mass spectra classification
PublicationDeveloping of theoretical tools can be very helpful for supporting new pollutant detection. Nowadays, a combination of mass spectrometry and chromatographic techniques are the most basic environmental monitoring methods. In this paper, two organochlorine compound mass spectra classification systems were proposed. The classification models were developed within the framework of artificial neural networks (ANNs) and fast 1D and...
-
Detection of molecular signatures of oral squamous cell carcinoma and normal epithelium - application of a novel methodology for unsupervised segmentation of imaging mass spectrometry data
Publication -
Scale-consistent approach to the derivation of coarse-grained force fields for simulating structure, dynamics, and thermodynamics of biopolymers
Publication -
Comparative molecular dynamics study of dimeric and monomeric forms of HIV-1 protease in ligand bound and unbound state
PublicationHuman immunodeficiency virus type 1 protease (HIV-1 PR) is a viral-encoded enzyme that forms a homodimer. HIV-1 PR is essential for replication and assembly of the virus and inactivation of HIV-1 PR enzyme causes production of immature, noninfectious viral particles and thus HIV-1 PR is an attractive target in anti-AIDS drug design. In our current work, we performed molecular dynamics (MD) calculations (500 ns) for two different...
-
The Ellenbogen’s “Matter as Software” Concept for Quantum Computer Implementation: IV. The X@C60 Molecular Building Blocks (MBBs) and Computing System Lifetime Estimation
PublicationThe problem of approximate lifetimes of individual X@C60 MBBs and tip-based nanofabricated quantum computing device systems is discussed under the conservative assumption of single-point failure. A single chemical transformation of the C60 cage into high-energy opened o-C60 isomer which forms the communication canal for the low energy transfer of an X atom from X@C60 MBB to the outside environment was studied. According to the...
-
Multi-residue method for the determination of 16 recently used pesticides from various chemical groups in aqueous samples by using DI - SPME coupled with GC-MS
PublicationA simple and solvent-free multi-residue method has been optimized to determine 16 currently used pesticides from different chemical groups in aqueous samples. The extraction of analytes was carried out with direct immersion solid-phase microextraction (DI-SPME) and for the identification and quantitative determination gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC-MS) was applied. Two commonly used adsorbent coatings have...
-
Monitoring the fracture process of concrete during splitting using integrated ultrasonic coda wave interferometry, digital image correlation and X-ray micro-computed tomography
PublicationThe paper deals with the continuous-time monitoring of mechanical degradation in concrete cubes under splitting. A series of experiments performed with integrated coda wave interferometry (CWI) and digital image correlation (DIC), supported with X-ray micro-computed tomography (micro-CT) is reported. DIC and micro-CT techniques were used to characterize the fracture process in detail. CWI method was proved to be effective in the...
-
Enhancing Luminescence and X-ray Absorption Capacity of Eu3+:LaF3 Nanoparticles by Bi3+ Codoping
Publication -
The K x-ray line structures of the 3d-transition metals in warm dense plasma
Publication -
On the interpretation of high-resolution x-ray spectra from JET with an ITER-like wall
Publication -
The bismuth atom neighbourhood in bismuth-silicate glasses from X-ray absorption experiment
PublicationPraca zawiera wyniki strukturalnej analizy EXAFS lokalnego otoczenia atomów bizmutu w krystalicznym tlenku bizmutu (odmiana alfa) i w szklach bizmutowo-krzemianowych o składzie xBi2O3 (1-x)SiO2,x=0.3, 0.4, 0.5, 0.6. Analizę XA- FS realizowano w oparciu o metodę GNXAS. Otrzymane wyniki porównano z danymi literaturowym.
-
Experimental investigations of fracture process in concrete by means of x-ray micro-computed tomography
PublicationW artykule pokazano doświadczalne wyniki badań procesu pękania w betonie stosując mikro-tomografię. Doświadczenia wykonano dla zginanych belek betonowych. Wyniki doświadczalne modelowano stosując MES na bazie modelu z degradacją sztywności sprężystej z nielokalnym osłabieniem. Beton symulowano jako materiał 4-fazowy. Uzyskano dobra zgodność wyników MES z doświadczeniami.
-
Experimental investigations on water sorptivity in mortars with the use of X-ray micro-CT system.
PublicationW pracy doswiadczalnej zbadano zjawisko sorpcji wody w pryzmatycznych próbkach zapraw, które jest ściśle powiązane z trwałością materiału. Sorpcyjność oceniana na etapie ustalonym w połączeniu z warunkami zewnętrznymi może być wykorzystana do przewidywania okresu użytkowania. Sorpcyjność początkową i wtórną wody w próbkach zapraw nienasyconych zmierzono w badaniach laboratoryjnych zgodnie z normą amerykańską ASTM C 1585–04. Wpływ...
-
Quantum chemical modeling of electrochromism of tungsten oxide films
Publication -
A rapid dispersive liquid–liquid microextraction of antimicrobial onion organosulfur compounds in animal feed coupled to gas chromatography-mass spectrometry
PublicationA rapid analytical procedure is proposed for determining two antimicrobial onion organosulfur compounds, propyl disulfide (PDS) and propyl propane thiosulfonate (PTSO), in animal feed. The use of PTSO as a natural ingredient in animal feed is allowed due to its antimicrobial activity against pathogenic organisms. Two analytical methodologies using gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS) are compared. After the extraction...
-
Nuclear Magnetic Relaxation and d-Wave Pairing in a Model of a Superconductor with Non-Retarded Attraction
Publication -
Nuclear magnetic relaxation and d-wave pairing in an extended Hubbard model with diagonal disorder
Publication -
Optical coherence tomography and magnetic resonance imaging visual pathway evaluation in Wolfram syndrome
Publication -
Numerical Estimate of the Spectral Resonance Structure Frequency Scale of Natural ULF Magnetic Field
Publication -
CMS data processing workflows during an extended cosmic ray run
Publication -
Detection of stress corrosion cracking dynamics by dynamic electrochemical impedance spectroscopy
Publication -
Detection of stress corrosion cracking dynamics by dynamic electrochemical impedance spectroscopy.
PublicationKlasyczne badania korozji naprężeniowej nie dają precyzyjnych informacji o dynamice takiego procesu korozyjnego. Nowa technika dynamicznej elektrochemicznej spektroskopii impedanyjnej, która została opracowana w Katedrze Elektrochemii, Korozji i Inżynierii Materiałowej stwarza takie możliwości. Fakt ten związany z zastosowaną metodologią analizy umożliwiającą selektywną analizą czasowo-częstotliwościową danych pomiarowych.Praca...
-
Molecular dynamics simulations reveal the balance of forces governing the formation of a guanine tetrad—a common structural unit of G-quadruplex DNA
PublicationG-quadruplexes (G4) are nucleic acid conformations of guanine-rich sequences, in which guanines are arranged in the square-planar G-tetrads, stacked on one another. G4 motifs form in vivo and are implicated in regulation of such processes as gene expression and chromosome maintenance. The structure and stability of various G4 topologies were determined experimentally; however, the driving forces for their formation are not fully...
-
Determination of MDPBP in postmortem blood samples by gas chromatography coupled with mass spectrometry
PublicationMDPBP (1-(3,4-methylenedioxyphenyl)-2-(1-pyrrolidinyl)-1-butanone) is a new psychoactive substance sold on the black market. It has been a controlled drug of abuse in Poland and China since 2015 as some toxic and fatal cases connected with use of synthetic cathinone derivatives were observed. The fatal case outlined here concerns a 19 year-old man, who was found dead with an envelope containing white powder lying nearby the cadaver....
-
Effect of heat treatment on the diffusion intermixing and structure of the Cu thin film on Si (111) substrate: a molecular dynamics simulation study
PublicationThis work is devoted to the study of the diffusion process at the interface between copper films with a thickness of 2, 3, 4, 7 and 10 atomic monolayers and silicon substrate by molecular dynamics simulation method. For this purpose, the variation of the concentration of copper and silicon along the perpendicular direction to the interface was investigated. An analysis of the density profile along this direction made it possible...
-
Molecular Dynamics of a Vasopressin V2 Receptor in a Phospholipid Bilayer Membrane
Publication -
Molecular-dynamics simulation of clustering processes in sea-ice floes
Publication -
Molecular dynamics-based model of VEGF-A and its heparin interactions
Publication -
The structure of rarefied and densified PbSiO3 glass: a molecular dynamics study.
PublicationArtykuł przedstawia wyniki symulacji dynamiczno-molekularnychstruktury rozrzedzonego i zagęszczonego szkła PbSiO3 (w zakresie gęstości od 3000 kg/m3 do 8000 kg/m3). Otrzymane wyniki dokładnie przedyskutowano pod kątem blisko- i średnio-zasięgowego uporządkowania atomów i porównano ze strukturą szkła PbSiO3 o normalnej gęstości (5970kg/m3) oraz ze strukturą rozrzedzonych i zagęszczonych szkieł PbGeO3.
-
Cation diffusion coefficients in CuAgI via molecular dynamics simulations
PublicationPraca prezentuje wyniki analizy strukturalnej otrzymane poprzez symulacje dynamiczno-molekularne (zespół NpT, dwuciałowy potencjał Vashisty-Rahmana) superjonowego związku o składzie (1-x)Cu-xAg-I, x = 0.0, 0.25, 0.5, 0.75, 1.0). Wyznaczono wartość współczynnika dyfuzji kationów i energii aktywacji w funkcji składu szkła i temperatury. Otrzymane rezultaty porównano z danymi literaturowymi.
-
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) - sources and applicationsin molecular biology
PublicationBiałka wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB) odgrywają ważną rolę w replikacji, rekombinacji i naprawie DNA u bakterii, archea i eukariota. Ostatnio wzrosło zainteresowanie białkami SSB jako przydatnymi narzędziami w metodach badawczych biologii molekularnej, analitycznych i diagnostycznych. Większość znanych prokariotycznych białek SSB zbudowanych jest z czterech podjednostek (homotetramer) z jedną domeną wiążąca (OB) jednoniciowe...
-
Effects of a rotating magnetic field on gas-liquid mass transfer coefficient
Publication -
Multilevel pharmacokinetics-driven modeling of metabolomics data
Publication -
An insight into the mixed quantum mechanical-molecular dynamics simulation of a ZnII-Curcumin complex with a chosen DNA sequence that supports experimental DNA binding investigations
PublicationAn important aspect of research pertaining to Curcumin (HCur) is the need to arrest its degradation in aqueous solution and in biological milieu. This may be achieved through complex formation with metal ions. For this reason, a complex of HCur was prepared with ZnII, that is not likely to be active in redox pathways, minimizing further complications. The complex is monomeric, tetrahedral, with one HCur, an acetate and a molecule...
-
The influence of the choice of the cross linking agent on the electrical properties of polyethyleneimine based humidity sensors. Optoelectronic and Electronic Sensors V.
PublicationW pracy przedstawiono wyniki badań impedancyjnych polimerowych czujników wilgotności.Czujniki zostały wykonane z chemicznie modyfikowane polietylenoiminy. Przedstawiono wpływ środków sieciujących na właściwości czujników.
-
Electron scattering by planar boron-containing molecules BX3(X=F, Cl, CD3)
PublicationPraca prezentuje absolutny całkowity przekrój na rozpraszanie elektronów dla drobiny B(CD3)3 w zakresie niskich i średnich energii, otrzymany liniową metodą transmisyjną. Porównanie wyników dla innych płaskich drobin zawierających bor jako atom centralny - BX3(X=F, Cl) ukazuje rolę atomów zewnętrznych w procesie rozpraszania.