Search
Filters
total: 2239
filtered: 1665
-
Catalog
- Publications 1665 available results
- Journals 22 available results
- Conferences 2 available results
- Publishing Houses 1 available results
- People 295 available results
- Inventions 9 available results
- Projects 7 available results
- Laboratories 2 available results
- Research Teams 1 available results
- Research Equipment 6 available results
- e-Learning Courses 29 available results
- Events 40 available results
- Open Research Data 160 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: DSB PROTEINS
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pastuerianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Novel primosomal protein B from Clostridium pasteurianum
PublicationPriB is a primosomal protein that catalyzes DNA replication in Procaryota. The replication pathway starts with PriA protein - the initiator protein that binds to a DNA replication fork, unwinds double-stranded DNA and role of PriB is to stabilize PriA on the DNA. However there are many biochemical differences in replication mechanism in bacteria and only some of them use PriB proteins. A few of PriB proteins were published and...
-
Pea Protein for Hempseed Oil Nanoemulsion Stabilization
Publication -
Polysaccharide–Protein Complexes in a Coarse-Grained Model
Publication -
Some applications of thermophiles and their enzymes for protein processing
PublicationPrzedstawiono charakterystykę, właściwości oraz możliwości zastosowań enzymów proteolitycznych wytwarzanych przez termofile. Zaletą tych biokatalizatorów jest między innymi duża odporność na działanie rozpuszczalników organicznych, detergentów i innych czynników denaturujących białka oraz mała wrażliwość na zmiany pH. Dokonano też przeglądu czynników powodujących dużą stabilność proteaz z termofili.
-
Apple pectin complexes with whey protein isolate
Publication -
The investigation of the effects of counterions in protein dynamics simulations
Publication -
Taurine as a water structure breaker and protein stabilizer
PublicationThe enhancing effect on the water structure has been confirmed for most of the osmolytes exhibiting both stabilizing and destabilizing properties in regard to proteins. The presented work concerns osmolytes, which should be classified as “structure breaking” solutes: taurine and N,N,N-trimethyltaurine (TMT). Here, we combine FTIR spectroscopy, DSC calorimetry and DFT calculations to gain an insight into the interactions between...
-
ANALYSIS OF THE p53 PROTEIN GENE EXPRESSION MODEL
PublicationWe study the asymptotic behaviour of the solutions of the p53-Mdm2 model proposed by Monk (2003). The p53 gene is crucial for cellular inhibition of the angiogenesis process, while Mdm2 is a negative regulator of the p53 tumor-suppressor. We investigate the stability of the positive steady state and perform some numerical experiments.
-
Protein thermal stabilization in aqueous solutions of osmolytes
PublicationProteins’ thermal stabilization is a significant problem in various biomedical, biotechnological, and technological applications. We investigated thermal stability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions of the following stabilizing osmolytes: Glycine (GLY), N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), N,N,N-trimethylglycine (TMG), and trimethyl-N-oxide (TMAO). Results of CD-UV spectroscopic investigation were compared...
-
Modelling gene expression of a self-regulating protein
PublicationWe analyze a model of gene transcription and protein synthesis. We take into account the number of sites on the protein’s promoter at which the protein’s dimers can bind blocking transcription of protein mRNA.
-
Identification and characterization of single-stranded DNA-binding protein from the facultative psychrophilic bacteria Pseudoalteromonas haloplanktis
PublicationSingle-stranded DNA-binding protein (SSB) plays an important role in DNA metabolism such as DNAreplication, repair, and recombination, and is essential for cell survival. This study reports on the ssb-likegene cloning, gene expression and characterization of a single-stranded DNA-binding protein of Pseudoal-teromonas haloplanktis (PhaSSB) and is the first report of such a protein from psychrophilic microorganism.PhaSSB possesses...
-
Cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates: Structural and spectroscopic models of metal sites in proteins
Publication -
Cadmium tri-tert-butoxysilanethiolates. Structural and spectroscopic models of metal sites in proteins.
PublicationW publikacji opisano syntezy i struktury dla dwóch heteroleptycznych kompleksów kadmu z rdzeniem CdS2NO2 i CdS2N2. Bis(tri-tert-butoksysilanotiolato)(1-metyloimidazol)kadmu(II) oraz bis(tri-tert-butoksysilanotiolato)bis(1-metyloimidazol)kadmu(II) współistnieją w roztworze chloroformu przy różnych stężeniach Bis(tri-tert-butoksysilanotiolanu) kadmu(II) i 1 metyloimidazolu. Rotzwór ten został scharakteryzowany za pomocą analizy spektralnej...
-
Crystal structures of the Bacillus subtilis prophage lytic cassette proteins XepA and YomS
Publication -
Proteins Structure Models in the Evaluation of Novel Variant (C.472_477del) in the MOCS2 Gene
Publication -
Extension of the UNRES Coarse-Grained Force Field to Membrane Proteins in the Lipid Bilayer
Publication -
Water-mediated long-range interactions between the internal vibrations of remote proteins
PublicationIt is generally acknowledged that the mobility of protein atoms and the mobility of water molecules in the solvation layer are connected. In this article, we answer the question whether a similar interdependence exists between the motions of atoms of proteins separated by the hydration layers of variable thickness. The system consisted of a kinesin catalytic domain and a tubulin dimer. It was studied using molecular dynamics simulations....
-
Differentially expressed proteins in the blood serum of piglets in response to a diet supplemented with inulin
Publication -
FT-Raman Spectroscopy as a Tool to Study the Secondary Structures of Wheat Gliadin Proteins
Publication -
Does Nitrogen Fertilization Affect the Secondary Structures of Gliadin Proteins in Hypoallergenic Wheat?
Publication -
Why the Solvation Water around Proteins Is More Dense than Bulk Water
PublicationThe main aim of this work is to propose a rational explanation of the commonly observed phenomenon of increasing water density within solvation shell of proteins. We have observed that the geometry of the water–water hydrogen bond network within solvation layer differs from the one in bulk water, and it is the result of interactions of water molecules with protein surface. Altered geometry of the network reflects changes in the...
-
Role of the Solvation Water in Remote Interactions of Hyperactive Antifreeze Proteins with the Surface of Ice
PublicationMost protein molecules do not adsorb onto ice, one of the exceptions being so-called antifreeze proteins. In this paper, we describe that there is a force pushing an antifreeze protein molecule away from the ice surface when it is not oriented with its ice-binding plane toward the ice and that this pushing force may be also present even when the protein is oriented with its ice-binding plane toward the ice. This force is absent...
-
Why the solvation water around proteins is more dense than bulk water
PublicationThe main aim of this work is to propose a rational explanation of commonly observed phenomenon of increasing water density within solvation shell of proteins. We have observed that geometry of the water-water hydrogen bond network within solvation layer differs from the one in bulk water and it is the effect of interactions of water molecules with protein surface. Altered geometry of the network reflects changes in the structure...
-
Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) - sources and applicationsin molecular biology
PublicationBiałka wiążące się do jednoniciowego DNA (SSB) odgrywają ważną rolę w replikacji, rekombinacji i naprawie DNA u bakterii, archea i eukariota. Ostatnio wzrosło zainteresowanie białkami SSB jako przydatnymi narzędziami w metodach badawczych biologii molekularnej, analitycznych i diagnostycznych. Większość znanych prokariotycznych białek SSB zbudowanych jest z czterech podjednostek (homotetramer) z jedną domeną wiążąca (OB) jednoniciowe...
-
Biblioteka PG w strukturach ogólnokrajowej sieci bibliotecznej (OSB)
PublicationBiblioteka Politechniki Gdańskiej została włączona do ogólnokrajowej sieci bibliotecznej (OSB). Proces rozbudowy OSB opiera się na wdrażaniu działającego w chmurze (cloud computing) systemu bibliotecznego Alma (z wyszukiwarką Primo), używanego przez ponad 3 tysiące bibliotek na świecie. Jest to system biblioteczny nowej generacji działający w oparciu o usługę chmurową typu Multitenant SaaS. Oznacza to, że system biblioteczny...
-
Analysis of structure and properties of DVB–GMA based porous polymers
Publication -
Badanie efektywności kodeków źródłowych w radiofonii cyfrowej DAB+
PublicationW Polsce radiofonia cyfrowa jest dostępna dla słuchaczy już od 2013 roku. Jednakże brakuje ogólnodostępnych publikacji naukowych lub też raportów badawczych uzasadniających przyjęte przepływności dla strumieni audio. W artykule przedstawiono badania sprawności kodowania oraz subiektywnej oceny jakości kodeka MPEG-4 HE-AAC v2, wykorzystywanego w standardzie DAB+. Testy prze-prowadzono wg. techniki porównawczej MUSHRA na dwóch grupach,...
-
Funkcjonalność systemu operacyjnego Linux uruchamianego z pamięci USB
PublicationSystem operacyjny Linux z uwagi na swoją funkcjonalność, użyteczność oraz warunki licencyjne jest coraz powszechniej wykorzystywany. Wśród licznych dystrybucji tego systemu można wyróżnić takie, które są uruchamiane bezpośrednio z pamięci półprzewodnikowych USB. W artykule zostanie przedstawiona funkcjonalność i parametry użytkowe opracowanej dystrybucji cdlinux.pl uruchamianej z pamięci USB. Dystrybucja charakteryzuje się bezpieczeństwem...
-
TRANSMISJA GŁOSOWYCH KOMUNIKATÓW DROGOWYCH W RADIOFONII CYFROWEJ DAB+
PublicationProces cyfryzacji radia jest nowym rozdziałem w historii radiofonii. Wiele rekomendacji i badań naukowych wskazuje na standard DAB+ (Digital Audio Broadcasting plus), który w niedalekiej przyszłości ma zastąpić analogową radiofonię FM. Ten system cyfrowy wprowadza wiele zmian, oferując przy tym lepszą jakość dźwięku oraz szereg usług dodatkowych. W pracy postanowiono zbadać minimalną wymaganą przepływność bitową potrzebną do transmisji...
-
Detection of the Incoming Sound Direction Employing MEMS Microphones and the DSP
PublicationA 3D acoustic vector sensor based on MEMS microphones and its application to road traffic monitoring is presented in the paper. The sensor is constructed from three pairs of digital MEMS microphones, mounted on the orthogonal axes. Signals obtained from the microphones are used to compute sound intensity vectors in each direction. With this data, it is possible to compute the horizontal and vertical angle of an incoming sound....
-
Adaptive Multiplex Resource Allocation Method for DAB+ Broadcast System
PublicationIn this paper an adaptive multiplex resource allocation method for the DAB+ broadcast system is presented. An analysis of content transmitted over different radio programs with respect to their profile is discussed. Simulation results of an adaptive multiplexer, as well as the technological demonstrator, fully compatible with the DAB+ standard, are described. The concept is verified by a subjective quality assessment study of real-time...
-
Zastosowanie addytywów w separacji pianowej białek serwatkowych i białek mlecznych
PublicationZaproponowano proces separacji pianowej do wydzielania białek ze strumieni poprodukcyjnych przemysłu mleczarskiego Ponadto zaproponowano zastosowanie w separacji pianowej białek serwatkowych i mlecznych addytywów dopuszczonych ustawą do stosowania w żywności. Jako cel pracy przyjęto uzyskanie wyników uzasadniających wybór takich addytywów, które intensyfikują przebieg i polepszają wynik procesu separacji pianowej białek. W części...
-
Proteinase 3 phosphonic inhibitors
Publication -
Novel primosomal protein B from thermophilic bacterium Thermoanerobacter tengcongensis
PublicationWe report the identification and characterization of theprimosomal protein B (PriB) from thermophilic bacteriumThermoanerobacter tengcongensis (TtePriB). It is the largestknown bacterial PriB protein consisting 216 amino acidresidues with a calculated molecular mass of 25 kDa. Surprisingly,it is functional as monomer containing two single-stranded DNA binding domain (OB-fold) and it is thecompletely new kind structure of SSB protein....
-
MUTL PROTEIN AS A COMMON CONSTITUENT OF VSP, BER, NER AND MMR REPAIR SYSTEMS
PublicationMutS and MutL proteins are renowned mostly for their functions in well-characterized, post-DNA replication mismatch repair system (MMR). However, there is growing evidence that MMR system is not the only field of action of these proteins. Moreover, involvement in MMR does not even have to be their primary function. There are some reports indicating involvement of MutL in BER, NER and VSP (very short patch repair). MutL protein...
-
Eine Eeue Technik zur Präzisen Rissfortschrittsmessung im DCB oder im Keilversuch = A novel technique for precise crack length measurement in the DCB or wedge test
PublicationDiverse methods have been tried to study crack length, most basic relying on direct, or microscopic, observation of the crack tip position. Optical correlation, both lasermoiré and speckle interferometry, a single strain gauge and displacement sensorshave also been employed. Crack length measurement is, however, delicate. We present a novel method making use of strain gauges attached to one of the adherends.
-
Effect of increased protein intake on the risk of female infertility
Publication -
The SERRATE protein is involved in alternative splicing in Arabidopsis thaliana
Publication -
The SERRATE protein is involved in alternative splicing in Arabidopsis thaliana
Publication -
Role of Oligosaccharide Chain Polarity in Protein–Glycosaminoglycan Interactions
Publication -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublicationPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
Electrosynthesis of potato starch–whey protein isolate complexes
Publication -
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein
Publication -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactosidase
Publication -
The protein folding problem: global optimization of force fields
Publication -
Lipid-protein interactions in membranes: a molecular modelling study
Publication -
Copper containing protein sites - structure, properties and models
PublicationEnzymy organizmów żywych katalizują wiele reakcji stosowanych w przemyśle chemicznym. Przykładem potencjalnego zastosowania enzymu w produkcji jest synteza L-Dopy przy udziale tyrozynazy. Ze względu na możliwe praktyczne zastosowanie w katalizie, otrzymano i opisano wiele prostych modeli miejsc aktywnych enzymów. W artykule opisano niektóre modele białek zawierających miedź.
-
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein.
PublicationGen mutS z termofilnej bakterii Thermus thermophilus zamplifikowano przy użyciu PCR, sklonowano i przeprowadzono jego ekspresję w E. coli. Rekombinantowe białko MutS zawierające oligohistydynową domenę na N-końcu oczyszczono w jednoetapowej procedurze przy wykorzystaniu chromatografii powinowactwaNi(2+). Zdolność do rozpoznania niekomplementarności białka his(6)-MutS potwierdzono w eksperymentach ochrony DNA przed trawieniem...
-
<title>Modular version of SIMCON, FPGA based, DSP integrated, LLRF control system for TESLA FEL part II: measurement of SIMCON 3.0 DSP daughterboard</title>
Publication