Wyniki wyszukiwania dla: microbiology
-
The DraC usher in Dr fimbriae biogenesis of uropathogenic E. coli Dr+ strains
PublikacjaBiogeneza fimbrii Dr kodowanych przez operon dra uropatogennych szczepów Escherichia coli (infekcje górnych dróg moczowych) odbywa się na bazie zakonserwowanego systemu sekrecji typu chaperone-usher. Funkcjonowanie powyższego systemu sekrecji opiera się na dwóch komponentach białkowych, periplazmatycznym chaperonie DraB i zewnątrzbłonowym kanale DraC. Białko DraB kontroluje proces składania podjednostek fimbrialnych DraE, natomiast...
-
Gamma rays-assisted bacterial synthesis of bimetallic silver-selenium nanoparticles: powerful antimicrobial, antibiofilm, antioxidant, and photocatalytic activities
Publikacja -
Mixed growth of Salix species can promote phosphate-solubilizing bacteria in the roots and rhizosphere
Publikacja -
How Does Salinity Shape Bacterial and Fungal Microbiomes of Alnus glutinosa Roots?
Publikacja -
Soil chemical properties affect the reaction of forest soil bacteria to drought and rewetting stress
Publikacja -
Assessment of antibiotic resistance and biofilm formation of Enterococcus species isolated from different pig farm environments in Poland
Publikacja -
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublikacjaW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
A cold-adapted esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. strain 643A
PublikacjaDzięki zastosowaniu lipaz możliwa jest biotechnologiczna produkcja m.in. biodegradowalnych biopolimerów, biopaliw (tzw. biodiesel), wielu terapeutyków, herbicydów, pestycydów, kosmetyków, substancji smakowych, serów i in. Szczególnie interesującą grupę stanowią enzymy lipolityczne, pochodzące z organizmów psychrofilnych i psychrotrofowych, ze względu na zdolność do wydajnego katalizowania reakcji w temperaturach rzędu 10-20 ºC....
-
DAF - and collagen-binding properties of chimeric Dr fimbriae
PublikacjaEkspozycja białek heterologicznych na powierzchni mikroorganizmów jest jedną z nowych strategii stosowanych w mikrobiologii, biotechnologii oraz projektowaniu nowoczesnych szczepionek. W niniejszej pracy zbadano możliwość wykorzystania białka podjednostkowego DraE fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jako nośnika heterologicznych sekwencji. W rejon odpowiadający N-terminalnej domenie 2 białka DraE wprowadzono epitopową...
-
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains
PublikacjaOkreślono molekularne właściwości białek SSB-podobnych z Thermus thermophi-lus i T. aquaticus. Zbadano aktywność białek oraz termostabilność. Ponadto, dowiedziono homodimeryczność obu białek i ustalono minimalną sekwencję wiążącą ssDNA.
-
Postbiotics in oncology: science or science fiction?
PublikacjaThe gut microbiome has been increasingly understood to play a critical role in carcinogenesis and cancer disease progression. The most recent research advancements have shown that different tools of microbiota manipulation contribute to gut microbiome–immune–oncology axis modulation, offering exciting opportunities for targeted interventions aimed at improving the efficacy of established anti-cancer therapy. Postbiotics are a new...
-
Insights in microbiotechnology: 2022.Editorial
PublikacjaThis Research Topic serves as an invaluable resource for readers interested in staying updated with the latest progress and developments in the field of microbiotechnology. It spotlights the innovative research conducted by up-and-coming experts in the field, specifically emphasizing the transforming abilities of microorganisms that greatly influence the scientific community. The advent of multi-omic technologies has revolutionized microbiotechnology,...
-
Transport deficiency is the molecular basis of Candida albicans resistance to antifungal oligopeptides
Publikacja(FMDP), an inhibitor of glucosamine-6-phosphate synthase, exhibited growth inhibitory activity against Candida albicans, with minimal inhibitory concentration values in the 0.05–50 mg/L range. Uptake by the peptide permeases was found to be the main factor limiting an anticandidal activity of these compounds. Di- and tripeptide containing FMDP (F2 and F3) were transported by Ptr2p/Ptr22p peptide transporters (PTR) and FMDP-containing...
-
Chemosensitization of multidrug resistant Candida albicans by the oxathiolone fused chalcone derivatives
PublikacjaThree structurally related oxathiolone fused chalcone derivatives appeared effective chemosensitizers, able to restore in part sensitivity to fluconazole of multidrug-resistant C.albicans strains. Compound 21 effectively chemosensitized cells resistant due to the overexpression of the MDR1 gene, compound 6 reduced resistance of cells overexpressing the ABC-type drug transporters CDR1/CDR2 and derivative 18 partially reversed fluconazole...
-
Drug-resistant and hospital-associated Enterococcus faecium from wastewater, riverine estuary and anthropogenically impacted marine catchment basin.
PublikacjaEnterococci, ubiquitous colonizers of humans and other animals, play an increasingly important role in health-care associated infections (HAIs). Acquisition of resistance determinants not only seriously limits available therapeutic options but also increases available gene pool for other species. It is believed that the recent evolution of two clinically relevant species, Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium occurred...
-
Identification of antigen Ag43 in uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains and defining its role in the pathogenesis of urinary tract infections
PublikacjaUrinary tract infections (UTIs) caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC) are among the most common bacterial infectious diseases in the developed world. The urovirulence of UPEC is mainly associated with the surface-exposed fimbrial adhesins and adhesins of the autotransporter (AT) family. The best studied of theses proteins is antigen 43 (Ag43) mediating cell aggregation, adhesion and biofilm development as the causes of...
-
Characterization of exceptionally thermostable single-stranded DNA-binding proteins from Thermotoga maritima and Thermotoga neapolitana
PublikacjaBACKGROUND: In recent years, there has been an increasing interest in SSBs because they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods.RESULTS: We report the characterization of single-stranded DNA binding proteins (SSBs) from the thermophilic bacteria Thermotoga maritima (TmaSSB) and Thermotoga neapolitana (TneSSB). They are the smallest known bacterial SSB proteins, consisting of 141 and 142 amino...
-
Ribosomal intergenic spacer analysis as a tool for monitoring methanogenic archaea changes in an anaerobic digester
PublikacjaThe applicability of a newly-designed PCR primer pair in examination of methanogenic Archaea in a digester treating plant biomass was evaluated by Ribosmal Intergenic Spacer Analysis (RISA). To find a suitable approach, three variants of RISA were tested: (1) standard, polyacrylamide gel-based, (2) automated, utilized capillary electrophoresis (GA-ARISA), and (3) automated microfluidics-based (MF-ARISA). All three techniques yielded...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria Desulfotalea psychrophila, Flavobacterium psychrophilum, Psychrobacter arcticus, Psychrobacter cryohalolentis, Psychromonas ingrahamii, Psychroflexus torquis, and Photobacterium profundum
PublikacjaBackground: Single-stranded DNA-binding proteins (SSBs) play essential roles in DNA replication, recombination and repair in Bacteria, Archaea and Eukarya. In recent years, there has been an increasing interest in SSBs, since they find numerous applications in diverse molecular biology and analytical methods. Results: We report the characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria Desulfotalea...
-
Two small RNAs conserved in Enterobacteriaceae provide intrinsic resistance to antibiotics targeting the cell wall biosynthesis enzyme glucosamine-6-phosphate synthase
PublikacjaFormation of glucosamine-6-phosphate GlcN6P) by enzyme GlcN6P synthase (GlmS) represents the first step in bacterial cell envelope synthesis. In Escherichia coli, expression of glmS is controlled by small RNAs (sRNAs) GlmY and GlmZ. GlmZ activates the glmS mRNA by base-pairing. When not required, GlmZ is bound by adapter protein RapZ and recruited to cleavage by RNase E inactivating the sRNA. The homologous sRNA GlmY activates...
-
Phosphorylation‐mediated regulation of heat shock response in Escherichia coli
PublikacjaEscherichia coli has two heat shock regulons under the transcriptional control of Esigma(32) and Esigma(E) RNA polymerases. These polymerases control the expression of genes, the products of which are needed for correct folding of proteins in the cytoplasm and the extracytoplasm respectively. In this study, we report that mutations in a tyrosine phosphatase-encoding gene led to decreased activity of these heat shock regulons. The...
-
A Novel Cryptic Clostridial Peptide That Kills Bacteria by a Cell Membrane Permeabilization Mechanism
PublikacjaThis work reports detailed characteristics of the antimicrobial peptide Intestinalin (P30), which is derived from the LysC enzyme of Clostridium intestinale strain URNW. The peptide shows a broader antibacterial spectrum than the parental enzyme, showing potent antimicrobial activity against clinical strains of Gram-positive staphylococci and Gram-negative pathogens and causing between 3.04 ± 0.12 log kill for Pseudomonas aeruginosa...
-
Divulging the anti-acetylcholinesterase activity of Colletotrichum lentis strain KU1 extract as sustainable AChE active site inhibitors
PublikacjaAlzheimer’s disease (AD), also called senile dementia is a neurodegenerative disease seen commonly in the elderly and is characterised by the formation of β-amyloid plaques and neurofbrillary tangles (NFT). Though a complete understanding of the disease is lacking, recent studies showed the role of the enzyme acetylcholinesterase (AChE) in pathogenesis. Finding new lead compounds from natural sources has always been a quest for...
-
A new assay for the simultaneous identification and differentiation of Klebsiella oxytoca strains.
PublikacjaKlebsiella oxytoca is the second most frequently identified species of Klebsiella isolated from hospitalized patients. Klebsiella spp. is difficult to identify using conventional methods and is often misclassified in clinical microbiology laboratories. K. oxytoca is responsible for an increasing number of multi-resistant infections in hospitals because of insufficient detection and identification. In this study, we propose a new...
-
Mycobacterium tuberculosis Complex and Mycobacterial Heat Shock Proteins in Lymph Node Tissue from Patients with Pulmonary Sarcoidosis
Publikacja -
The development and evaluation of cross-priming amplification for the detection of avian reovirus
Publikacja -
Prevalence of Closely Related Candida albicans Species among Patients with Vulvovaginal Candidiasis in Southern Poland Based on the hwp1 Gene Amplification
Publikacja -
Hyperosmolarity adversely impacts recombinant protein synthesis by Yarrowia lipolytica—molecular background revealed by quantitative proteomics
Publikacja -
An MTA-phosphorylase gene discovered in the metagenomic library derived from Antarctic top soil during screening for lipolytic active clones confers strong pink fluorescence in the presence of rhodamine B.
PublikacjaIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichiacoli using the pUC19 vector and environmental DNA directly isolated fromAntarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. Unexpectedly, the screeningon agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one unusual pinkfluorescent clone (PINKuv) out of 85 000 clones. This clone harbored a plasmid,pPINKuv, which has an insert of 8317 bp that...
-
Effect of lysozyme or nisin on survival of some bacteria treated with high pressure at subzero temperature
PublikacjaCelem pracy było określenie wrażliwości gramujemnych i gramdodatnich bakterii na działanie ciśnienia 193MPa w temp. -20°C w obecności lizozymu lub nizyny. Stwierdzono, że połączone działanie ciśnienia i badanych substancji przeciwdrobnoustrojowych na zawiesiny bakterii Escherichia coli i Staphylococcus aureus powodowało większy stopień inaktywacji komórek niż suma efektów wywieranych przez pojedyncze czynniki.
-
Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library.
PublikacjaIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichia coli using pUC19 vector and environmental DNA directly isolated from Antarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. The screening on agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one clone with lipolytic activity (Lip1) out of 11,000 E. coli clones. This clone harbored a plasmid, pLip1, which has an insert of 4722 bp that has been...
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublikacjaOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
-
Purification and biochemical characteristic of a cold-active recombinant esterase from Pseudoalteromonas sp. 643A under denaturing conditions.
PublikacjaIn this paper production of a cold-active esterase EstA from the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A in E. coli expression system was described. The purification and biochemical characteristic of EstA were performed in the presence of urea and then compared with results obtained for the esterase with no addition of urea and isolated from the native source. In both cases the cold-active enzyme displayed similar properties....
-
Biofilm formation as a virulence determinant of uropathogenic Escherichia coli Dr+ strains
PublikacjaInfekcje dróg moczowych stanowią największy problem zdrowotny dotykający miliony osób populacji ludzkiej każdego roku. Uropatogenne szczepy Escherichia coli są najczęstszym czynnikiem etiologicznym odpowiedzialnym za wywoływanie górnych i dolnych dróg moczowych. Powyższe szczepy bakteryjne produkują szereg czynników wirulentnych pośród, których wyróżnić można eksponowane powierzchniowo polimeryczne struktury adhezyjne (fimbrie/pile)...
-
Antifungal activity of thionated analogues of nva-fmdp and lys-nva-fmdp
Publikacjaotrzymano dwa peptydy w których wiązanie amidowe łączące aminokwasy zamieniono na tioamidowe w wyniku kilkunastoetapowej syntezy chemicznej. do reakcji tionowania zastosowano odczynnik lawessona. otrzymane związki poddano badaniom aktywności z wykorzystaniem pięciu szczepów candida , w tym szczepów opornych na flukonazol. stwierdzono, ze obecniość wiązania tioamidowego znacznie obniża aktywność przeciwgrzybową testowanych związków...
-
Evaluation of a PCR Melting Profile method for intra-species differentiation of Trichophyton rubrum and Trichophyton interdigitale
PublikacjaW celu identyfikacji źródła infekcji spowodowanych przez dermatofity, jak i drogi ich transmisji, istnieje potrzeba szukania nowych metod, które pozwolą na głębokie zróżnicowanie genetyczne szczepów w obrębie rodzaju. W pracy po raz pierwszy pokazano zastosowanie techniki PCR MP opartej o adaptory oligonukleotydowe i różnice w temperaturze topnienia fragmentów restrykcyjnych DNA w reakcji PCR do wewnątrzgatunkowego typowania dermatofitów....
-
Genetic features of clinical Pseudomonas aeruginosa strains
PublikacjaW grupie 62 izolatów klinicznych sprawdzono obecność 6 wybranych czynnikow wirulencji. We wcześniejszych badaniach z wykorzystaniem techniki ERIC - PCR wykazano, że w analizowanej grupie 49 (79%) to szczepy, o dużum podobieństwie genetycznym (ponad 62%), każdy z pozostałych 13 izolatów zaliczono do osobnego genotypu, o zdecydownie niższym stopniu pokrewieństwa. W przypadku wszystkich 49 szczepów z pierwszej grupy stwierdzono obecność...
-
Enzymatic degradation and transport of endothiopeptides into Escherichia coli K12 mutant strains
PublikacjaZbadano transport trzech otrzymanych na drodze syntezy ditiopeptydów do komórek Escherichia coli K12. Ponadto zbadano szybkość hydrolizy tych związków. Wszystkie peptydy są transportowane przez permeazy, natomiast są bardziej oporne na hydrolizę enzymatyczną w stosunku do naturalnych peptydów.
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublikacjaW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
A comparative evaluation of PCR ribotyping and ERIC PCR for determining the diversity of clinical Pseudomonas aeruginosa isolates
PublikacjaW pracy porównano dwie metody stosowane do badania różnorodności genetycznej drobnoustrojów. Modelem do badań była grupa 62 klinicznych izolatów bakterii P. aeruginosa. Zdecydowanie wyższy potencjał różnicujący stwierdzono w przypadku metody ERIC PCR, której zastosowanie pozwoliło na wyodrębnienie 36 różnych genotypów. W przypadku rybotypowania wyróżniono tylko 9 genotypów.
-
Distribution of invasive Cylindrospermopsis raciborskii in the East-Central Europe is driven by climatic and local environmental variables
Publikacja -
Comparative genomics and functional analysis of a highly adhesive dairy Lactobacillus paracasei subsp. paracasei IBB3423 strain
Publikacja -
ClaR—a novel key regulator of cellobiose and lactose metabolism in Lactococcus lactis IL1403
Publikacja -
Alternative Lactose Catabolic Pathway in Lactococcus lactis IL1403
Publikacja -
Novel Highly Thermostable Endolysin from Thermus scotoductus MAT2119 Bacteriophage Ph2119 with Amino Acid Sequence Similarity to Eukaryotic Peptidoglycan Recognition Proteins
Publikacja -
Adhesion of the genome-sequenced Lactococcus lactis subsp. cremoris IBB477 strain is mediated by specific molecular determinants
Publikacja -
Identification, characterization and purification of the lantibiotic staphylococcin T, a natural gallidermin variant
Publikacja -
Antimicrobial photodynamic therapy with fulleropyrrolidine: photoinactivation mechanism of Staphylococcus aureus, in vitro and in vivo studies
Publikacja -
Drastically decreased transcription from CII-activated promoters is responsible for impaired lysogenization of the Escherichia coli rpoA341 mutant by bacteriophage λ
Publikacja -
Fine-tuning recA expression in Staphylococcus aureus for antimicrobial photoinactivation: importance of photo-induced DNA damage in the photoinactivation mechanism
Publikacja