Wyszukiwarka
Katedra Biotechnologii Molekularnej i Mikrobiologii
Publikacje
Filtry
wszystkich: 455
Katalog Publikacji
Rok 2002
-
Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences
PublikacjaZaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...
-
Działanie preparatu antyseptycznego Betadine (EGIS Pharmaceutical L.t.d.) na wielooporne szpitalne szczepy bakterii
PublikacjaStwierdzono silne działanie bakteriobójcze preparatu Betadine na wszystkie badane izolaty. Uzyskano redukcję liczby żywych bakterii w zawiesinie o 99,99% co jest zgodne z wymaganiami dla preparatów przeznaczonych do dezynfekcji higienicznej i chirurgicznej.
-
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains
PublikacjaOkreślono molekularne właściwości białek SSB-podobnych z Thermus thermophi-lus i T. aquaticus. Zbadano aktywność białek oraz termostabilność. Ponadto, dowiedziono homodimeryczność obu białek i ustalono minimalną sekwencję wiążącą ssDNA.
-
Identification of anisakid nematodes from the Southern Baltic Sea usingPCR-based methods
PublikacjaZaproponowano metodę identyfikacji nicieni gatunków Anisakis, Hysterothyla-cium, Contracaecum przy użyciu techniki PCR/RFLP.
-
Novel thermostable ssDNA-binding proteins from Thermus thermophilus and T. aquaticus-expression and purification
PublikacjaSklonowano w system ekspresyjny pET-30LIC Escherichia coli gen kodujący białka SSB-podobne Thermus thermophilus i T. aquaticus. Oczyszczono do homogenności białka SSB-podobne, a uzyskane preparaty umożliwiają wykonanie badań strukturalnych w/w białek.
-
Ocena wrażliwości na fluorochinolony drobnoustrojów izolowanych od pacjentów z zakażeniami układu moczowego leczonych w warunkach ambulatoryjnych
PublikacjaWykazano, że drobnoustroje powodujące zakażenia układu moczowego u pacjentów ambulatoryjnych są nadal wrażliwe na fluorochinolony; dotyczy to jednak drobnoustrojów z rodziny Enterobacteriacae. Natomiast w przypadku zakażeń drobnoustrojami Gram-dodatnimi leki te mogą okazać się nieskuteczne. Stwierdzono silne działanie bakteriobójcze preparatu Betadine na wszystkie badane izolaty. Uzyskano redukcję liczby żywych bakterii w zawiesinie...
-
Species - specific detection of the toxic mushrooms Amanita virosa and Amanita verna by PCR amplification of the gpd gene fragment
PublikacjaZaprojektowano dwie pary starterów do reakcji PCR, które umożliwiają gatunkowo specyficzną amplifikację unikalnych fragmentów genów gpd dla dwóch grzybów kapeluszowych: muchomora wiosennego (Amanita verna) i muchomora jadowitego (Amanita virosa).
-
Structure-function analysis of decay-accelerating factor: identification ofresidues important for binding of the Escherichia coli Dr adhesin and complement regulation
PublikacjaZidentyfikowano ważne dla wiązania adhezyny Dr uropatogennych Escherichiacoli reszty aminokwasowe w ludzkim receptorze DAF SCR-3.
Rok 2003
-
Antarctic marine bacterium Pseudoalteromonas sp. 22b as a source of cold adapted á-galaktosidase.
PublikacjaAntarktyczny morski szczep Pseudoalteromonas sp. 22b. jest źródłem wewnątrzkomórkowej beta-galaktozy. Enzym ten wykazuje wysoką aktywność hydrolizy laktozy w zakresie temperatur od 0 do 20 st. C oraz pH 6,0-8,0. W niniejszej pracy opisano metodykę uzyskania homogennego preparatu tego enzymu, oraz pełną charakterystykę jego własności enzymatycznych i kinetycznych.
-
Chimeric Dr fimbriae with a Herpes Simplex virus type 1 epitope as a model for a recombinant vaccine.
PublikacjaBiałko adhezyny DraE uropatogennych szczepów E. coli Dr+ zostało wykorzystane jako nośnik 11a a determinanty antygenowej glikoproteiny D wirusa HSV ty-pu 1. Sekwencja kodująca epitop HSV została wklonowana do genu draE w obrębie regionu N- terminalnego eksponowanej powierzchniowo domeny 2. Ekspresjachimerycznych białek DraE-HSV została potwierdzona za pomocą mikroskopii immunofluorescencyjnej i elektronowej.
-
Construction and purification of his6-Thermus thermophilus MutS protein.
PublikacjaGen mutS z termofilnej bakterii Thermus thermophilus zamplifikowano przy użyciu PCR, sklonowano i przeprowadzono jego ekspresję w E. coli. Rekombinantowe białko MutS zawierające oligohistydynową domenę na N-końcu oczyszczono w jednoetapowej procedurze przy wykorzystaniu chromatografii powinowactwaNi(2+). Zdolność do rozpoznania niekomplementarności białka his(6)-MutS potwierdzono w eksperymentach ochrony DNA przed trawieniem...
-
Evaluation and comparison of random amplification of polymorphic DNA, pulsed field gel electrophoresis and ADSRRS-fingerprinting for typing Serratiamarcescens outbreaks.
PublikacjaADSRRS-fingerprinting, nowa metoda genotypowania oparta na supresji reakcji PCR została zastosowana do badań epidemiologicznych izolatów S. marcescens,pochodzących z trzech różnych epidemii Szpitala Publicznego w Gdańsku. Wyniki uzyskane metodą ADSRRS-fingerprinting porównano z wynikami uzyskanymi technikami RAPD-fingerprinting i PFGE.
-
Evaluation of a novel method based on amplification of DNA fragments surrounding rare restriction sites (ADSRRS-figerprinting) for typing strains of vancomycin resistant Enterococcus faecium.
PublikacjaBadania objęły wankomycyno oporne szczepy Enterococcus faecium izolowane od pacjentów oddziału Hematologii Szpitala Klinicznego w Gdańsku. Wykazano, że ADSRRS-fingerprinting jest metodą szybką o dużym potencjale różnicującym i dużej powtarzalności w badaniach epidemiologicznych.
-
High level expression, secretion and purification of the termostable aqualysin I from Thermus aquaticus YT-1 in Pichia pastoris.
PublikacjaOtrzymano aktywną proteazę serynową Thermus aquaticus z systemu nadprodukcji Escherichia coli. Oczyszczono enzym przy zastosowaniu chromatografii metalo-powinowactwa.
-
High yield expression and single step purification of Toxoplasma gondii SAG1, GRA1, GRA7 antigens in Escherichia coli.
PublikacjaPraca przedstawia metodę uzyskiwania antygenów rekombinowanych Toxoplasmagondii o wysokiej czystości, które można zastosować w immunodiagnostyce. Antygeny T. gondii eksprymowane w komórkach E. coli zawierały polihistydynowedomeny fuzyjne na końcu N i C białka. Pozwalało to na jednoetapowe oczyszczanie białek metodą chromatografii metalopowinowactwa na złożu Ni2+ -IDA-Sepharose. Immunoreaktywność antygenów rekombinowanych...
Rok 2004
-
Molecular epidemiology of Serratia marcescens in two hospitals in Danzig, Poland, over a 5-year period.Molecular epidemiology of Serratia marcescens in two hospitals in Gdańsk, Poland, over a 5-year period.
PublikacjaW pracy badano zmiany populacji Serratia marcescens w ciągu 5 lat w dwóch szpitalach klinicznych Gdańska. Posłużono się wartościami MIC, wynikami typowania genetycznego RAPD-PCR, PFGE i nową metodą ADSRRS-fingerprinting oraz analizą beta-laktamaz o rozszerzonym spektrum substratowym (ESBL). Dzięki określeniu lekowrażliwości na najnowsze antybiotyki beta-laktamowe wykryto fenotypy wykazujące derepresję cefalosporynazy AmpC u 23%...
-
Usefulness of the PCR technique for bacterial DNA detection in blood of the patients after ''oppened heart'' operations.
PublikacjaOperacje kardiochirurgiczne w krążeniu pozaustrojowym (KPU) poprzez ogromny uraz, powodowanie występowania zaburzeń odporności oraz uszkodzenie barier anatomicznych stwarzają sytuację wybitnie sprzyjającą rozwojowi powikłań infekcyjnych u tych chorych. Prowadzenie terapii antybiotykowej profilaktycznej i leczniczej, a także selektywna dekontaminacja przewodu pokarmowego może utrudniać i przedłużać czas rozpoznania obecności bakterii...
Rok 2006
-
A highly thermostable, homodimeric single-stranded DNA-binding protein from Deinococcus radiopugnans
PublikacjaWe report the identification and characterization of the single-stranded DNA-binding protein (SSB) from the mesophile and highly radiation-resistant Deinococcus radiopugnans (DrpSSB). PCR-derived DNA fragment containing the complete structural gene for DrpSSB protein was cloned and expressed in Escherichia coli. The gene consisting of an open reading frame of 900 nucleotides encodes a protein of 300 amino acids with a calculated...
-
Detection of Blastocystis hominis in unpreserved stool specimens byusing polymerase chain reaction
PublikacjaBlastocystis hominis jest pasożytem występującym na całym świecie. Patogenność tego pasożyta nie jest jeszcze w pełni udowodniona, aczkolwiek opisanych jest wiele przypadków, sugerujących, że B. hominis może wywoływać objawy żołądkowo-jelitowe. Wykrywanie tego pasożyta opiera się na bezpośredniej obserwacji mikroskopowej rozmazów i zagęszczonych próbek kału lub rozmazów utrwalonych, jednakże w pewnych przypadkach nie jest to możliwe.Celem...
-
Escherichia coli - zapomniany patogen posocznic
PublikacjaPrzedstawiono próbę retrospektywnej analizy częstości występowania bakteriemii Gram-ujemnych, wywołanych przez E. coli u chorych hospitalizowanych w ośmiu grupach oddziałów klinicznych SPSK1 ACK AM w Gdańsku w latach 2002-2004. Dokonano oceny częstości występowania bakteriemii o etologii E. coli, liczby zgonów związanych bezpośrednio z posocznicą, analizy potencjalnych wrót zakażenia oraz analizy lekowrażliwości szczepów E. coli...