Search
Search results for: inihibitory syntazy glcn-6-p
-
Analogi glutaminy jako inhibitory syntazy Glcn-6-P
PublicationArtykuł stanowi przegląd stanu wiedzy z ostatnich trzyciestu lat dotyczący inhibitorów syntazy glukozamino-6-fosforanu będących analogami glutaminy, ze szczególnym naciskiem na właściwości wybranych inhibitorów oraz ich syntezę.
-
Pochodne fosforylowanych cukrów jako inhibitory syntazy glcn-6-p
PublicationW artykule został opisany mechanizm działania syntazy glukozamino-6-fosforanu i syntezy wybranych analogów blokujących domenę wiążących D-fruktozo-6-fosforanu, którym jest cis-enolamina.
-
synth_md_cg Simulation of conformational changes related to the interdomain communication in the eukaryotic GlcN-6-P synthase by means of a large-scale molecular dynamics of the coarse-grained protein model
ProjectsProject realized in Department of Pharmaceutical Technology and Biochemistry from 2014-03-14
-
Molecular modelling of transition state analogue inhibitors of glucosamine-6-P synthase and glucose-6-P isomerase.
PublicationStruktura kompleksu 2-amino-2-deoksy-D-glucitolo-6-P (ADGP) z centrum aktywnym syntazy GlcN-6-P z E. coli została wykorzystAna jako punkt wyjścia do modelowania molekularnego analogów ADGP. Używając programu GROMOS96 wygenerowano konformacje analogów o najniższych energiach wewnętrznych, które następnie ''dokowano'' w centrum aktywnym enzymu. Dokonano syntezy wybranych związków i określono parametry kinetyczne i termodynamiczne...
-
The crystal and solution studies of glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans
PublicationOkreślono strukturę krystaliczną domeny izomerazowej syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans w stanie natywnym, oraz w kompleksie z inhibitorem allosterycznym UDP-GlcNAc, fruktozo-6-P, glukozo-6-P oraz analogiem stanu przejściowego reakcji enzymatycznej - 2-amino-2-deoksy-D-mannitolo-6-P (ADMP). Na podstawie wyników badań metodą niskokątowego rozpraszania promieni X (SAXS) wydedukowano przypuszczalną strukturę kompletnej...
-
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublicationCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
Functional domains of Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase.
PublicationSkonstruowano oddzielnie dwie domeny syntazy GlcN-6-P z Candida albicans jako białka fuzyjne, tj. domenę glutaminazową oraz domenę izomerazową, zawierające sekwencje poliHis, odpowiednio na C- i N-końcu. Zoptymalizowano warunki nadekspresji domen w komórkach Escherichia coli. Oba białka oczyszczono do homogenności przy zastosowaniu chromatografii metalopowinowactwa oraz zbadano ich podstawowe właściwości. Wyznaczono parametry kinetyczne...
-
Allosteric control of Candida albicans glucosamine-6-phosphate synthase.
PublicationPrzedstawiono wyniki badań spektrofluorymetrycznych syntazy GlcN-6-P z Candida albicans oraz enzymu zmutowanego, w którym reszty Trp388 i 690 zostały zamienione na drodze ukierunkowanej mutagenezy na reszty Phe. Metodą spektrofluorymetryczną badano wpływ ligandów: Fru-6-P (substrat), Gln (substrat), UDP-GlcNAc (inhibitor), Glc-6-P (aktywator), DON (analog glutaminy) w odpowiednio dobranych stężeniach. Obecność większości efektorów...
-
Inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase as potential antifungal drugs.
PublicationPrzedstawiono stan obecny i perspektywy zastosowania inhibitorów enzymu syntazy GlcN-6-P jako leków skutecznych w leczeniu grzybic układowych. Używając metod modelowania molekularnego zaprojektowano struktury inhibitorów enzymu należących do dwóch grup strukturalnych: analogów glutaminy oraz analogów stanu przejściowego reakcji katalizowanej przez enzym. Opracowano metody syntezy pochodnych zoptymalizowanych inhibitorów, wykazujących...
-
Sporothrix schenckii: purification and partial biochemical characterisation of glucosamine-6-phosphate synthase, a potential antifungal target
PublicationW artykule opisano izolację i charakterystykę właściwości natywnego enzymu, syntazy GlcN-6-P z komórek dimorficznego grzyba patogennego Sporothrix schenckii. Masę cząsteczkową enzymu natywnego określono na 350 kDa, a enzymu zdenaturowanego na około 79 kDa, co sugeruje homotetrameryczną strukturę białka. Wartość punktu izoelektrycznego wyniosła 6,26; wyznaczono także parametry kinetyczne katalizowanej reakcji. Aktywność enzymu była...
-
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the isomerase domain of glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans
PublicationSyntaza glukozamino-6-fosforanu (EC 2.6.1.16) katalizuje pierwszy, praktycznie nieodwracalny etap w szlaku biosyntezy heksozoamin, którego produktem końcowym jest UDP-GlcNAc, kluczowy substrat dla tworzenia ściany komórkowej drobnoustrojów. Otrzymano kryształy domeny izomerazowej syntazy GlcN-6-P z Candida albicans, składającej się z reszt 346-712 (42 kDa). Analiza rentgenograficzna kryształu wykazała, że należy on do grupy przestrzennej...
-
Aktywność biologiczna koniugatów nanonośników molekularnych z inhibitorami enzymatycznymi
PublicationPrzedmiotem badań były cztery grupy koniugatów nanonośników molekularnych z inhibitorami enzymatycznymi o potencjalnym działaniu przeciwgrzybowym. Pierwszą z tych grup tworzyły koniugaty peptydów penetrujących z inhibitorem gyrazy ciprofloksacyną lub z cząsteczką kwasu N3-(4-metoksyfumaroilo)-L-2,3-diaminopropanowego (FMDP), inhibitorem syntazy GlcN-6-P. W dwóch kolejnych grupach, cząsteczki FMDP oraz cispentacyny, inhibitora syntetazy...
-
Structural features responsible for control of the eukaryotic GlcN-6-P synthase activity
PublicationGlucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase is responsible for catalysis of the first and practically irreversible step in hexosamine metabolism. As UDP-GlcNAc, the final product of the hexosamine path, constitutes one of the essential substrates for assembly of bacterial and fungal cell walls, the enzyme is an interesting target for antimicrobial therapy.The structure of E. coli enzyme, known since 2001, forms a dimer of two identical...
-
Modification of quaternary structure of Candida albicans GlcN-6-P synthase and its desensitization to inhibition by UDP-GlcNAc by site-directed mutagenesis
PublicationSite-directed mutagenesis of the CaGFA1 gene encoding glucosamine-6-phosphate synthase from Candida albicans was performed. Desensitization of the enzyme to inhibition by UDPGlcNAc was achieved upon T487I and H492F substitutions at the UDP-GlcNAc binding site, exchange of D524, S525 and S527 for Ala at the dimer:dimer interface and construction of the tail-lock array (L434R and L460A) at the C-tail region. The first two sets if...
-
Regulacja aktywności syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans – badania metodami obliczeniowymi
PublicationNiniejsza praca przedstawia wyniki badań, prowadzonych metodami obliczeniowymi, poświęconych enzymowi syntazie GlcN-6-P pochodzącemu z drożdży C. albicans. Enzym ten odpowiedzialny jest między innymi za biosyntezę kluczowych składników ściany komórkowej grzybów i bakterii, ma również wpływ na regulację metabolizmu glukozy. Przedstawione badania stanowią jeden z etapów poszukiwania molekularnego mechanizmu inhibicji, której eukariotyczna...
-
Nowe estrowe i amidowe pochodne inhibitorów syntazy glukozamino-6-fosforanu - synteza i aktywność biologiczna
PublicationPrzedmiotem rozprawy doktorskiej są modyfikacje chemiczne analogów glutaminy – kwasu N3-(4-metoksyfumaroilo)-S-2,3-diaminopropanowego (FMDP) oraz kwasu N3-[(E)-4-fenylo-4-okso-2-butenoilo]-S-2,3-diaminoaminopropanowego (BADP). Związki te są inhibitorami syntazy glukozamino-6-fosforanu i mimo ich silnych właściwości inhibicyjnych, nie wykazują zdolności do hamowania wzrostu drobnoustrojów. Brak aktywności przeciwdrobnoustrojowej...
-
Mechanizmy regulacji aktywności syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans.
Publication.
-
Inhibitory syntazy glukozamino-6-fosforanu o zwiększonej lipofilowości i ich peptydy - synteza i właściwości biologiczne
Publication.
-
P-544 Biochemical markers as a predictor of clinical pregnancy on day 6 after embryo transfer
Publication -
Modyfikacje chemiczne syntazy glukozamino-6-fosforanu z S. cerevisiae**2002 124 s. 69 rys. 12 tab. bibliogr. 124 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /27.06.2002/. P. Gdań., Wydz. Chemiczny. Promotor: prof. dr hab. inż. S. Milewski.
Publication.
-
Synthesis of 2-amino-2,6-dideoxy-D-glucitol-6-sulfonic acid as a potential antifungal agent.
PublicationGlucosamine-6P (GlcN-6P) synthase catalyzes the first committed step in the biosynthetic pathway leading to the formation of UDP-GlcNAc, a sugar nucleotide precursor providing D-glucosamine for the formation of chitin and manoproteins. 2-Amino-2,6-dideoxy-D-glucitol-6-sulfonic acid is an analog of 2-amino-2-deoxy-D-glucitol 6-phosphate (GlcN-ol-6-P), a known inhibitor of GlcN-6-P synthase, in which the phosphate group of the latter...
-
Front Cover: Chiral Molecular Cages Based on Cyclotriveratrylene and Sucrose Units Connected with p ‐Phenylene Linkers (Eur. J. Org. Chem. 6/2021)
Publication -
Holonowe systemy produkcyjne. W: Inżynieria zarządzania przedsięwzięciami.Red. L. Zawadzka. Gdańsk: P. Gdań.**2003 s. 53-58 bibliogr. 6 poz.
PublicationNiniejszy artykuł pokazuje możliwości stosowania technologii holonowych welastycznej produkcji.
-
Construction of glucosamine-6-phosphate synthase with an internal hexahistydyl fragment
PublicationL-Glutamine: D-fructose-6-phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.16), known also as glucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) syntase, catalyzes the first committed step in the amino sugar biosynthetic pathway in prokaryotic and eukaryotic organisms. The enzyme carries out a complex reaction involving ammonia transfer and sugar phosphate isomerization. GlcN-6-P syntase is an important point of metabolic control of amino sugar biosynthesis...
-
The reactions of dialkyl phosphites and phosphine oxides with iodosylbenzene
PublicationThe reaction of iodosylbenzene with >P(O)H type of acids (dialkyl phosphites, secondary phosphine oxides) was studied. The acids of >P(O)H type add to iodosylbenzene to yield intermediate 6 which in the aprotic solvents yields oxidation products, it means >P(O)OH acids and/or anhydride of >P(O)OP(O)< type. On the other hand if the reaction is performed in alcohol as a solvent in the presence of sodium alcoholate >P(O)OR ester is...
-
Long range molecular dynamics study of regulation of eukaryotic glucosamine-6-phosphate synthase activity by UDP-GlcNAc
PublicationGlucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase catalyses the first and practically irreversible step in hexosamine metabolism. The final product of this pathway, uridine 5' diphospho N-acetyl-D-glucosamine (UDPGlcNAc), is an essential substrate for assembly of bacterialand fungal cell walls. Moreover, the enzyme is involved in phenomenon of hexosamine induced insulin resistance in type II diabetes, which makes it a potential target...
-
Glucosamine-6-phosphate synthase with an oligoHis insert
PublicationGlucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase known also as L-Glutamine: D-fructose-6-phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.16), catalyzes the first committed step in the amino sugar biosynthetic pathway in prokaryotic and eukaryotic organisms. The final product of this pathway is an activated precursor of numerous macromolecules containing amino sugars, including chitin and mannproteins in fungi, peptydoglican and lipopolysaccharides...
-
Napędy elektryczne i hydrauliczne, P, OCE, sem 6, lato 2021-22, (PG_00045113)
e-Learning CoursesProjekt z zakresu układów napędowo-technologicznych jednostek pływających z elektryczną i hydrauliczną transmisją mocy. WIMiO, IO, kier. Oceanotechnika, Specjalność: Siłownie i Urządzenia Oceanotechniczne, rok 3, sem 6
-
Ekonomia obliczeniowa oparta na systemach agendowych. W: Inżynieria zarzą- dzania przedsięwzięciami. Red. L. Zawadzka. Gdańsk: P. Gdań.**2003 s. 19-22bibliogr. 6 poz.
PublicationNiniejszy artykuł prezentuje problematykę ekonomii obliczeniowej opartej nasystemach agentowych. Przedstawiono ogólne założenia systemów ACE, koncepcje rozwiązań dotyczące architektury i implementacji oraz dokonano prezentacji wybranych obszarów badawczych nad systemami ACE.
-
Praca projektowa III, P, sem.6, lato23/24, PG_00055303
e-Learning CoursesSpecjalność: Budowa Okrętów i Jachtów (WOiO), I stopnia - inżynierskie, stacjonarne, 2021/2022 - zimowy (obecnie sem. 5) Wykonanie modelu komputerowego 3D bloku statku z uwzględnieniem wybranych aspektów konstrukcyjno-technologicznych. Analiza transportu bloku. (Wykonanie projektu usztywnień transportowych, uchwytów transportowych, itp.). Wykonanie listy kompletacyjnej bloku statku.
-
Praca przejściowa, P, Energetyka, sem. 6, letni 22/23
e-Learning Courses -
Przygotowanie Produkcji Okrętowej, P, sem.6, lato23/24, PG_00056430
e-Learning Courses -
Janusz Rachoń prof. dr hab. inż.
PeopleSprawował urząd rektora w latach 2002-2008 Urodził się 11 sierpnia 1946 r. w Nowym Sączu. Studia wyższe ukończył w 1969 r. na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej, uzyskując tytuł magistra inżyniera chemika. W 1969 r. rozpoczął pracę na Wydziale Chemicznym Politechniki Gdańskiej, na którym uzyskał w 1975 r. doktorat, a w 1985 r. habilitację. Na stanowisko docenta został powołany w 1989 r., na stanowisko profesora nadzwyczajnego...
-
Wiktoria Wojnicz dr hab. inż.
PeopleDSc in Mechanics (in the field of Biomechanics) - Lodz Univeristy of Technology, 2019 PhD in Mechanics (in the field of Biomechanics) - Lodz Univeristy of Technology, 2009 (with distinction) List of papers (2009 - ) Wojnicz W., Wittbrodt E., Analysis of muscles' behaviour. Part I. The computational model of muscle. Acta of Bioengineering and Biomechanics, Vol. 11, No.4, 2009, p. 15-21 Wojnicz W., Wittbrodt E., Analysis of...
-
Chemistry of the phosphinophosphinidene tBu2P-P, a novel ă-electron ligand.Appl. Organomet. Chem. [online]**2003 vol. 17 [6 December 2002] s. 28-35, 10 rys. bibliogr. 53 poz. Dostępny w Internecie www.interscience.wiley.com Chemia fosfinofosfinidenu tBu2P-P, nowego liganda ă-elektronowego.
PublicationFosfanofosfiniden tBu2P-P w kompleksach z metalami przejściowymi jest z re-guły kompleksowany na sposób hapta-2 i przyjmuje geometrię 1,1-ditertbutyl-difosfenu. W reakcjach z cyklicznymi olefinami związek ten wykazuje właści-wości elektrofilowego singletowego karbenu.
-
Isolation of the GFA1 gene encoding glucosamine-6-phosphate synthase of Sporothrix schenckii and its expression in Saccharomyces cerevisiae
PublicationGlucosamine-6-phosphate synthase (GlcN-6-P synthase) is an essential enzyme involved in cell wall biogenesis that has been proposed as a strategic target for antifungal chemotherapy. Here we describe the cloning and functional characterization of Sporothrix schenckii GFA1 gene which was isolated from a genomic library of the fungus. The gene encodes a predicted protein of 708 amino acids that is homologous to GlcN-6-P synthases...
-
Inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase as potential antimicrobials or antidiabetics – synthesis and properties
PublicationGlucosamine-6-phosphate synthase (GlcN-6-P synthase) is known as a promising target for antimicrobial agents and antidiabetics. Several compounds of natural or synthetic origin have been identified as inhibitors of this enzyme. This set comprises highly selective L-glutamine, amino sugar phosphate or transition state intermediate cis-enolamine analogues. Relatively low antimicrobial activity of these inhibitors, poorly penetrating...
-
Techniki magazynowe PG_00054487, P, STW, sem. 6, letni 22/23
e-Learning CoursesIstota i znaczenie magazynu i magazynowania w systemie logistycznym, zarządzanie łańcuchem dostaw. Przepływ informacji w logistyce, funkcjonowanie łańcucha dostaw oraz sieci logistycznych, Systemy informatyczne w logistyce. Funkcjonowanie magazynu, Formy i typy magazynów (centra logistyczne, magazynowe i dystrybucyjne). Technologia i organizacja prac magazynowych, Składowanie towaru w magazynie. Rynek magazynowy w Polsce, Europie...
-
Projekt zespołowy, P, ZiIP sem.6, letni, 2023/2024 (PG_00055261)
e-Learning Courses -
Instalacje ciepłownicze, W/P, E, sem.6, letni 23/24
e-Learning CoursesPrzekazanie wiedzy i umiejętności w zakresie sposobu działania miejskich systemów zaopatrzenia w ciepło, obejmujących: źródło ciepła średniej mocy, sieć cieplną i węzły cieplne.
-
Zarządzanie projektem (PG_00056222) P, TiL, sem. 6, letni 2023/24
e-Learning Courses -
Wymienniki Ciepła, W/P, Energetyka, sem. 6, letni, 2023/24
e-Learning Courses -
Projektowanie jednostek szybkich II P, sem.6, letni 2023/24
e-Learning Courses -
Glucosamine-6-phosphate synthase - the multi-facets enzyme
PublicationAmidotransferaza L-glutamina: D-frukozo-6-fosforan, nazywana zwyczajowo syntazą glukozamino-6-fosforanu, jako jedyny enzym należący do grupy amidotransferaz, nie wykazuje aktywności amoniakozależnej. Enzym ten, katalizujący pierwszy wyjątkowy etap w szlaku metabolicznym prowadzącym do ostatecznego wytworzenia 5´difosfourydyno-N-acetylo-D-glukozaminy (UDG-GlcNAc) stanowi ważny punkt kontroli metabolicznej biosyntezy makromolekuł...
-
Desensitization of glucosamine-6-phosphate synthase to inhibition by UDP-GlcNAc
PublicationGlucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase, known also as L-Glutamine: D-fructose-6-phosphate amidotransferase, catalyzes the first committed step in the pathway leading to the ultimate formation of UDP-GlcNAc. The final product of this pathway is an activated precursor of numerous macromolecules containing amino sugars, including chitin and mannproteins in fungi, peptidoglycan and lipopolysaccharides in bacteria, and glycoproteins...
-
Emerging anticancer activity of candidal glucoseamine-6-phosphate synthase inhibitors upon nanoparticle-mediated delivery
PublicationNumerous glutamine analogues have been reported as irreversible inhibitors of the glucosamine-6-phosphate (GlcN-6-P) synthase in pathogenic Candida albicans in the last 3.5 decades. Among the reported inhibitors, the most effective N3-(4-methoxyfumaroyl)-L-2,3- diaminopropanoic acid (FMDP) has been extensively studied in order to develop its more active analogues. Several peptide−FMDP conjugates were tested to deliver FMDP to its...
-
Podstawy konstrukcji maszyn III, P, MiBM, sem. 6, letni, 2023/24
e-Learning Courses -
Praca projektowa II (PG_000411682), P, TiL, sem. 6, letni 2023/24
e-Learning Courses -
Organizacja prac spawalniczych, W, P, ZIP, Sem.6, Lato 2023/2024
e-Learning Courses -
Praca projektowa III, PG_00041794, P, SiUO, sem.6, letni 2023/2024
e-Learning CoursesRealizacja projektu wstępnego siłowni statku morskiego.