Filters
total: 811
filtered: 338
-
Catalog
- Publications 338 available results
- Journals 138 available results
- Publishing Houses 2 available results
- People 124 available results
- Projects 21 available results
- Research Teams 4 available results
- e-Learning Courses 157 available results
- Events 10 available results
- Open Research Data 17 available results
Chosen catalog filters
Search results for: biotechnologia molekularna
-
The structure of porous and spontaneously densified amorphous PbSiO3: a Molecular Dynamics study.
PublicationW pracy zaproponowano nową metodę numerycznego otrzymywania strukturporowatych metodą dynamiki molekularnej. Metoda polega na rozpoczęciu symulacji z ładunkami ekranowanymi i stopniowym zwiększaniu ich do pełnych ładunków jonowych. Metodę zastosowano do układu PbSiO3.
-
Cation diffusion coefficients in CuAgI via molecular dynamics simulations
PublicationPraca prezentuje wyniki analizy strukturalnej otrzymane poprzez symulacje dynamiczno-molekularne (zespół NpT, dwuciałowy potencjał Vashisty-Rahmana) superjonowego związku o składzie (1-x)Cu-xAg-I, x = 0.0, 0.25, 0.5, 0.75, 1.0). Wyznaczono wartość współczynnika dyfuzji kationów i energii aktywacji w funkcji składu szkła i temperatury. Otrzymane rezultaty porównano z danymi literaturowymi.
-
New Method for the Synthesis of Azocrown Compounds Containing Oxygen, Nitrogen and Oxygen, or Sulfur Atoms in the Macroring.
PublicationW publikacji opisano nową metodę syntezy azokoron z różnymi heteroatomami w makrocyklu i o różnej wielkości molekularnej wnęki. Metoda ta polega na reakcji 2,2´-difluoroazobenzenu z diolami, diaminami, aminodiolami i ditiolamiw obecności zasady.
-
Naturalne związki organiczne.
PublicationNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowszeosiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Naturalne związki organiczne
PublicationNowoczesny podręcznik stanowiący kompendium podstawowych wiadomości o najważniejszych naturalnych związkach organicznych, takich jak: aminokwasy, peptydy, białka, cukry, lipidy, alkaloidy, steroidy, terpeny i terpenoidy. Omówiono w nim właściwości chemiczne i fizyczne, działanie fizjologiczne oraz otrzymywanie i zastosowanie tych związków. Przedstawiono również najnowsze osiągnięcia naukowe dotyczące produktów naturalnych, m.in....
-
Molecular modelling of membrane sterols with the use of the GROMOS 96 forcefield
PublicationPodstawowym zadaniem tego projektu było udowodnienie zasadności stosowania pola siłowego GROMOS 96 do symulacji steroli błonowych metodą dynamiki molekularnej. Uzyskane wyniki jasno wskazują, że to pole siłowe bardzo dobrze nadaje się do symulacji silnie lipofilowych układów.
-
Computer study of the lead-germanium alloy formation in over-reduced lead-germanate glass
PublicationPraca poświęcona jest badaniom dynamiczno-molekularnym struktury zredukowanego szkła ołowiowo-germanianowego o składzie 1Pb 1Ge 1GeO2. Analizie poddano strukturę matrycy szkła, GeO2 i osadzonej w niej fazy metalicznej, którą formują neutralne atomy Pb i Ge.
-
Synthesis and structural characterization of novel 2-benzimidazolylthioureas: adducts of natural isothiocyanatesand 2-amino-1-methylbenzimidazole
PublicationNa drodze syntezy chemicznej uzyskano addukty naturalnych izotiocyjanianów - alilu, benzylu i fenyloetylu i 2-amino-1-metylobenzoimidazolu. W następstwie optymalizacji warunków reakcji, poszczególne 2-benzimidazolilotiomoczniki otrzymano produkty z umiarkowanymi wydajnościami. Strukturę molekularną i krystaliczną produktów scharakteryzowano przy użyciu metod spektroskopowych i X-ray. Analiza uzyskanych widm pozwoliła stwierdzić,...
-
The reactions occuring on the implant as a result of contact with human tissue
PublicationObecnosc implantu w ciele czlowieka powoduje liczne, czesto nieprzewidywalne skutki. Powodem takiej sytuacji jest duza roznorodnosc interakcji materialu medycznego z kontaktujaca sie z nim tkanka. Stwierdzenie to dotyczy glownie oddzialywan i skutkow zachodzacych na poziomie molekularnym w poszczegolnych komorkach kontaktujacej sie tkanki.
-
Chemical kinetic approach to the mechanism of coupled transport of Cu(II) Ions through bulk liquid membranes
PublicationW celu lepszego zrozumienia transportu jonów miedzi przez ciekłe membrany zaproponowano schemat kinetyczny na poziomie molekularnym oparty o dwie nastepujące po sobie reakcje odwracalne. Zasegurowano uzywając membrany ciekłej o wysokiej polarności i polaryzowalności oraz szybkiego mieszania mozna zwiekszyć wydajnośc transportu.
-
Comparative molecular dynamics simulations of amphotericin B-cholesterol/ergosterol membrane channels
PublicationBadania polegały na przeprowadzeniu porównawczej dynamiki molekularnej dla dwóch typów kanałów amfoterycyny B. Obie symulacje różniły się rodzajem sterolu (cholesterol lub ergosterol). Na podstawie wyników przeprowadzonych prac ustalono jakie elementy strukturalne badanych kanałów mogą być odpowiedzialne za selektywne działanie amfoterycyny B.
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
Monosaccharides as internal probes for the determination of the absolute configuration of 2-butanol
PublicationD-dlukoza, D-mannoza i L-ramnoza zostały poddane reakcji z mieszaniną racemiczną 2-butanolu. Otrzymane w ten sposób glikozydy były analizowane za pomocą spektroskopii NMR, z wykorzystaniem eksperymentów COSY i NOESY. Analiza konformacyjna wiązania glikozydowego (dokonana w oparciu o modelowanie molekularne i heteronuklearne stałe sprzężenia) wraz z analizą sprzężeń dipolowych obserwowanych w widmie NOESY umożliwiła określenie konfiguracji...
-
Interaction of amphotericin B and its selected derivatives with membranes: molecular modeling studies
PublicationJest to praca przeglądowa obejmująca krytyczną analizę danych dotyczących oddziaływania amfoterycyny B (AmB) i jej wybranych, mniej toksycznych pochodnych, z błonami lipidowymi. Amfoterycyna B jest antybiotykiem przeciwgrzybowym ale ze względu na jej toksyczność trwają prace nad modyfikacjami chemicznymi tego związku. Celem molekularnym dla tego antybiotyku jest błona lipidowa i dlatego różnicowe powinowactwo AmB i jej pochodnych...
-
Raman investigation of hybrid polymer thin films
PublicationPrzestawiono problemy diagnostyki ramanowskiej transparentnych struktur cienkowarstwowych wykonanych metodą zol-żel z polimerów hybrydowych. Analizowano możliwości badania struktury molekularnej i grubości, a także określania jakości wykonania struktur falowodowych. Przedstawiono wyniki badań wykonanych mikroskopem ramanowskim dla polimerowych struktur cienkowarstwowych osadzonych na podłożach szklanych i krzemowych.
-
Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych
PublicationGrzyby należące do rodzajów Microsporum, Trichophyton i Epidermophyton są główną przyczyną powierzchownych zakażeń grzybiczych. Klasyczna identyfikacja gatunkowa czynnika etiologicznego tych grzybic oparta na obserwacjach mikro- i makroskopowych możliwa jest dopiero po uzyskaniu czystej hodowli dermatofitów. W związku z powolnym tempem wzrostu jest ona możliwa po dwóch, trzech tygodniach po pobrania próbki. Molekularne metody diagnostyczne...
-
A new cold-adapted beta-D-galactosidase from the Antarctic Arthrobacter sp. 32c - gene cloning, overexpression, purification and properties
PublicationThe development of a new cold-active β-D-galactosidases and microorganisms that efficiently ferment lactose is of high biotechnological interest, particularly for lactose removal in milk and dairy products at low temperatures and for cheese whey bioremediation processes with simultaneous bio-ethanol production. In this article, we present a new β-D-galactosidase as a candidate to be applied in the above mentioned biotechnological...
-
Early stage of critical clusters growth in phenomenological and Molecular Dynamic simulation models.
PublicationOpisano proces kondensacji pary wodnej w ujĘciu fenomenologicznymi dynamiczno-molekularnym. Wczesne fazy wzrostu klastra opisano w ramach klasycznej teorii Hertza-Knudsena. Obszernie przedstawiono wyniki symulacji dynamiczno-molekularnych zjawiska kondensacji pary wodnej z jednorodnej fazy gazowej (przebieg powstawania małych klastrów H2O i szybkość wzrostu klastrów ponadkrytycznych).
-
Silanethiolates - synthesis, properties and structures.
PublicationW pracy wskazano podstawowe drogi syntezy oraz podano zwięzłą charakterystykę silanotiolanów - w większości związków kompleksowych posiadających jako główny ligand grupę silanotiolanową, na ogół (t-BuO)3SiS. Przy pomocy odpowiednio dobranych przykładów zilustrowano właściwości tych związków - wskazano ciekawsze elementy struktury molekularnej oraz specyficzne cechy spektralne.
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublicationZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Glucosamine-6-phosphate synthase,a novel target for antifungalagents.Molecular modelling studies in drug design
PublicationPraca dotyczy modelowania zarówno samych inhibitorów syntazy glukozamino-6-fosforanu jak i ich oddziaływania z obydwiema domenami tego enzymu. Enzym syntaza glukozamino-6-fosforanu został zaproponowany jako nowy cel molekularny w chemoterapii infekcji grzybowych. Zaprojektowano i zsyntezowano szereg inhibitorów tego enzymu - potencjalnych nowych leków przeciwgrzybowych. Dzięki modelowaniu molekularnemu udało się wyjaśnić mechanizm...
-
Thermodynamic and electrostatic properties of ternary Oxytricha nova TEBP-DNA complex
PublicationZa pomocą metod chemi obliczeniowej badano właściwości molekularne kompleksu telomerowego białka TEBP z Oxytricha nova w kompleksie trójskkładnikowym z DNA o sekwencji telomerowej. Wyliczone wartości energii kompleksowania wskazują specyficznie na jedną z dróg tworzenia kompleksu, gdzie wpierw podjednostka alfa łaczy się z DNA a następnie podjednostka beta dołącza się do takiego dwuskładnikowego kompleksu. Policzone rozkłady molekularnego...
-
Organiczne baterie słoneczne ze zdyspergowanym złączem na bazie polimerów półprzewodnikowych o wąskiej przerwie energetycznej
PublicationPrzeprowadzono badania nad zwiększeniem wydajności prądowej organicznych baterii słonecznych ze złączem objętościowym, zbudowanych z syntetycznych polimerów półprzewodnikowych, posiadających rozległe wiązania π-sprzężone i charakteryzujących się długofalową granicą absorpcji optycznej. Przeanalizowano wpływ domieszek typu n i zmiany materiału katody na molekularny proces transferu nośników ładunku w złączu. Przeprowadzono pomiary...
-
Pre-clinical evaluation of 1-nitroacridine derived chemotherapeutic agent that has preferential cytotoxic activity towards prostate cancer
PublicationPraca zawiera wyniki badań przedklinicznych pochodnej 1-nitroakrydyny C-1748 wobec komórek ludzkiego raka prostaty CaP in vitro, jak i przeszczepialnego na zwierzęta. W oparciu o fosforylację histonu H2AX jako markera podwójnych cięć DNA wykazano, że C-1748 jest bardziej aktywny w komórkach CaP niż HL60. Zidentyfikowano poza tym receptor androgenny (AR) jako cel molekularny badanego związku. W doświadczeniach na zwierzętach stwierdzono...
-
Removal of organic compounds from water by solvent sublation. Criteria for solvent selection.
PublicationProces flotoekstrakcji zastosowano do usuwania z wody następujących związków organicznych: tetrachlorku węgla, chloroformu, 1,3,5-trimetylobenzenu (mezytylenu), fenolu i 2,4,5-trichlorofenolu. Jako odbierające fazy organiczne użyto: olej mineralny, 1-dekanol, 1-oktanol, octan amylu, dodekan i tetradekan. Mechanizmem decydującym o usuwaniu lotnych związków organicznych (VOC) było odparowanie do wnętrza pęcherzyków gazu, podczas...
-
Molecular modelling of amphotericin B-ergosterol primary complex in water
PublicationBadano właściwości pierwotnego kompleksu amfoterycyny B z ergosterolem przy pomocy symulacji dynamiki molekularnej. Otrzymane w wyniku naszych symulacji rezultaty słabo odpowiadają postulowanym przez innych autorów modelom kompleksu antybiotyk-sterol. Z drugiej strony uzyskane geometrie nie są sprzeczne z wynikami eksperymentów biofizycznych dotyczących powstawania kompleksów w wodzie i w środowisku wodno-alkoholowym.
-
DAF - and collagen-binding properties of chimeric Dr fimbriae
PublicationEkspozycja białek heterologicznych na powierzchni mikroorganizmów jest jedną z nowych strategii stosowanych w mikrobiologii, biotechnologii oraz projektowaniu nowoczesnych szczepionek. W niniejszej pracy zbadano możliwość wykorzystania białka podjednostkowego DraE fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jako nośnika heterologicznych sekwencji. W rejon odpowiadający N-terminalnej domenie 2 białka DraE wprowadzono epitopową...
-
Beta-Galactosidases of Pseudoalteromonas sp. – Characteristics and application for lactose hydrolysis and galactopyranosides synthesis
PublicationBeta-galactosidase [EC 3.2.1.23] is an enzyme that catalyzes the hydrolysis of O-glycosidic linkages in galactosides. It has biotechnological applications in the dairy industry for the production of milk with a low content of lactose and galactooligosacharides for use in healthy food. The transgalactosylation activity of beta-galactosidase can be used in the synthesis of alkyl galactopyranosides. Due to the fact that conditions of...
-
Cold-adapted bacterial lipolytic enzymes and their applications
PublicationLipolytic enzymes, esterases and lipases catalyze the hydrolysis and transesterification of fatty acid esters. This class of enzymes is the most important group of biocatalysts for biotechnological applications. From this perspective, coldactive lipolytic enzymes from cold adapted bacteria display attractive properties for some industrial purposes, including high catalytic activity at low temperatures and low thermostability. To...
-
Protein thermal stabilization in aqueous solutions of osmolytes
PublicationProteins’ thermal stabilization is a significant problem in various biomedical, biotechnological, and technological applications. We investigated thermal stability of hen egg white lysozyme in aqueous solutions of the following stabilizing osmolytes: Glycine (GLY), N-methylglycine (NMG), N,N-dimethylglycine (DMG), N,N,N-trimethylglycine (TMG), and trimethyl-N-oxide (TMAO). Results of CD-UV spectroscopic investigation were compared...
-
(3,5-Dimethylpyridine)bis(tri-tert-butoxysilanethiolato)cadmium(II)
PublicationTytułowy związek jest molekularnym, heteroleptycznym tiolanem kadmu zawierającym jako dodatkowy ligand 3,5-dimetylopirydynę. Jon kadmu(II) znajduje się w centrum bipiramidy o podstawie trójkątnej, utworzonej przez 5 atomów - 2 atomy siarki, 2 atomy tlenu i jeden atom azotu. Między cząsteczkami kompleksu upakowanymi w krysztale nie ma oddziaływań innych niż oddziaływania van der Waalsa.
-
Voriconazole and multidrug resistance in Candida albicans
PublicationPorównano aktywność grzybostatyczną in vitro worikonazolu, flukonazolu, ketokonazolu i klotrimazolu wobec opornych na flukonazol szczepów klinicznych Candida albicans oraz rekombinowanych szczepów Saccharomyces cerevisiae eksprymujących jeden z genów kodujących białka oporności wielolekowej (MDR) C. albicans: Cdr1p. Cdr2p lub CaMdr1p. Stwierdzono, że nadekspresja genów MDR czyni komórki drożdżaków mniej wrażliwymi na działanie...
-
Application of the near-infrared spectroscopy in the pharmaceutical technology
PublicationNear-infrared (NIR) spectroscopy is currently the fastest-growing and the most versatile analytical method not only in the pharmaceutical sciences but also in the industry. This review focuses on recent NIR applications in the pharmaceutical technology. This article covers monitoring, by NIR, of many manufacturing processes, such as granulation, mixing or drying, in order to determine the end-point of these processes. In this...
-
Predicting the critical micelle concentration of aqueous solutions of ionic liquids and other ionic surfactants
PublicationNiektóre ciecze jonowe, szczególnie te będące kombinacją organicznego i nieorganicznego jonu, wykazują strukturalne podobieństwo do surfaktantów. Krytyczne stężenie micelizacji jest podstawowym parametrem w chemii powierzchni i nauce o koloidach. Parametr ten został zmierzony dla wielu cieczy jonowych, jednakże ze względu na ogromną ilość możliwych kombinacji anionów i kationów jego eksperymentalny pomiar dla wszystkich struktur...
-
Komputerowy model 3D stawu biodrowego
PublicationW pracy przedstawiono stworzony w programie ANSYS komputerowy model 3D stawu biodrowego. Model wykonano w oparciu o budowę anatomiczną oraz zebrane dane dotyczące stałych materiałowych kości i elementów chrzęstnych. Analiza i porównanie modelu biochemicznego, lepkosprężystego, mieszanego oraz molekularno – agregacyjnego służy ułatwieniu stworzenia modelu najbliższego rzeczywistości, który można by wykorzystać w projektowaniu endoprotez...
-
Application of organic materials in electronics
PublicationRozwój urządzeń elektronicznych na bazie materiałów organicznych przestawia jedno z najbardziej spektakularnych osiągnięć nauki w XXI wieku. Do produkcji zostały wdrożone urządzenia zbudowane na cienkich warstwach organicznych, i poczynione zostały pierwsze kroki w kierunku rozwoju elektroniki molekularnej. Celem publikacji jest dostarczenie podstawowych informacji dotyczących urządzeń elektronicznych zbudowanych na bazie cienkich...
-
Structure recognition in MD-simulated materials: a case study of boroxyl rings in borate glasses
PublicationZanalizowano statystyczne właściwości geometryczne losowo deformowanej jednostki strukturalnej AC_3, gdzie trzy kationyC znajdują się w wierzchołkach trójkąta równobocznego, a anionA - w jego środku. W szczególności opisano rozkłady kątów AAA,ACA i CAA oraz dwóch estymatorów kształtu w funkcji amplitudydeformacji trójkąta. Wyniki analizy stochastycznej zastosowanodo ilościowej oceny stopnia nieuporządkowania w szkle B_2O_3,symulowanym...
-
Chemical reactivity and antimicrobial activity of N-substituted maleimides
PublicationZsyntezowano kilkanaście N-podstawionych maleimidów, zawierających w swojej strukturze podstawniki o różnej wielkości i polarności.Maleimidy o charakterze obojętnym wykazywały silny efekt przeciwgrzybowy; ich aktywność przeciwbakteryjna była zróżnicowana. Niską aktywność przeciwbakteryjną, ale wysoką aktywność cytostatyczną stwierdzono dla maleimidów o charakterze zasadowym. Reaktywność chemiczna i lipofilowość miały wpływ na aktywność...
-
Crystal and molecular structure of lithium iodide complex of 13-membered azoxycrown ether
PublicationPublikacja zawiera uzupełniające informacje do znalezionej wcześniej korelacji między typem kationu, rozmiarem makrocyklu i cechami struktury krystalicznej kompleksów a selektywnością elektrod membranowych dotowanych odpowiednimi azo- lub azoksykoronami. Ustalono strukturę krystaliczną i molekularną kompleksu 13-członowej azoksykorony (L13-O) z jodkiem litu. Stechiometria kompleksu jest 1:1. Kryształ zbudowany jest z hydratowanych...
-
Long-working-distance Raman system for monitoring of uPA ECR CVD process of thin diamond/DLC layers growth
PublicationW artykule przedstawiono konstrucję systemu optoelektronicznego do monitoringu ramanowskiego in-situ procesu μPA ECR CVD (ang.: Microwave Plasma Assisted Electron Cyclotron Resonance Chemical Vapour Deposition), stosowanego do osadzania cienkich warstw diamentowych i diamentopodobnych DLC. System ma budowę modułową i wyposażony jest w dedykowane sondy optyczne. Przedstawiono wyniki pomiarów testowych, potwierdzjące, że system posiada...
-
On the light intensity dependence of short-circuit current of bilayer organic photovoltaic cells
PublicationPraca przedstawia model zależności prądu zwarcia w organicznych dwuwarstwowych układach fotowoltaicznych od natężenia światła. Model jest oparty na założeniu jednorodnego pola elektrycznego w obu warstwach organicznych. Uwzględniona jest bimolekularna i monomolekularna rekombinacja nośników ładunku przy heterozłączu. Przedstawione zostało porównanie obliczeń teoretycznych i wyników doświadczalnych dla układów z barwnikiem perylenowym...
-
Application of magnetic nanoparticles for magnetic solid-phase extraction in preparing biological, environmental and food samples
PublicationThe need to obtain meaningful results as the basis for determining the content of trace amounts of analytes has become the driving force behind the development of modern analytical techniques, including sample-preparation techniques, such as solid-phase extraction (SPE). Recently, great interest was aroused in the use of magnetic nanoparticles (MNPs) in SPE. These materials exhibit high selectivity, and, in small amounts, can provide...
-
Drożdżowe systemy ekspresyjne jako narzędzie nowoczesnej mikrobiologii przemysłowej
PublicationDrożdże łączą zalety prokariotycznych i eukariotycznych systemów ekspresyjnych. Charakteryzuje je szybki wzrost, osiągają też znacznie większą biomasę w porównaniu z bakteriami. W odróżnieniu od bakterii, drożdże zdolne są do przeprowadzania modyfikacji posttranslacyjnych białek. Kolejną zaletą drożdżowych systemów ekspresyjnych jest zdolność komórek drożdżowych do sekrecji białek do pożywki hodowlanej. W laboratoriach naukowych...
-
Typing of Candida isolates from patients with invasive infection and concomitant colonization
PublicationWe investigated the relationship between colonizing and invasive isolates from patients with candidaemia. Molecular typing was performed using random amplification of polymorphic DNA (RAPD) and multilocus sequence typing (MLST). We found MLST to be sufficient for typing Candida isolates, and that surveillance cultures are helpful in predicting concomitant invasive isolates, but not necessarily the pathogen involved in subsequent...
-
Molecular aspects of the interaction between amphotericin B and a phospholipid bilayer: molecular dynamics studies.
PublicationAmfoterycyna B jest antybiotykiem z grupy polienów makrolidowych. Stosowany jest on w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Wiadomo że związek ten oddziałuje ze składnikami błon lipidowych i tworzy kanały. W przedstawianej pracy prezentowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną układu składającego się z 200 cząsteczek lipidów DMPC i jednej cząsteczki amfoterycyny ułożonej na powierzchni błony. Z przeprowadzonej...
-
Stardust - Investigation of Microbes in the Stratosphere
PublicationThe stratospheric microbiome has been investigated several times using the methods of classical microbiology. In this experiment, we have combined them with some novel approaches including whole- metagenome amplification, Maldi TOF mass spectrometry and Sanger DNA sequencing. The results of the experiment may provide the scientists with knowledge about the mechanisms of survivability of microorganisms in stratospheric conditions...
-
Toward Mechanosynthesis of Diamondoid Structures: VI. Quantum-Chemical Molecular Dynamics Comparison of Conditions for the STM Tip Driven Mechanosynthesis on Hydrogenated Si(111), Si(110) and Si(100) Surfaces.
Publicationmożliwość prototypowania przejściowych generacji nano-urządzeń otrzymanych drogą pozycjonowanej mechanosyntezy za pomocą stm wyposażonego w ostrze typu swcnt są analizowane metodą kwantowo-chemicznej dynamiki molekularnej. proponowana strategia syntezy polega na insercji atomów si oraz cząsteczek sih2 we wiązania si-h na uwodornionej powierzchni si(111), si(110) oraz si(100) kryształu krzemu. rezultaty modelowania sugerują, że...
-
Novel thermostable single-stranded DNA-binding protein (SSB) from Deinococcus geothermalis
PublicationW celu zbadania właściwości biochemicznych białka wiążącego się do jednoniciowego DNA (SSB) pochodzącego z Deinococcus geothermalis (DgeSSB), sklonowano gen ssb otrzymany w reakcji PCR, a następnie uzyskano wydajną biosyntezę białka DgeSSB. Gen składa się z 900 par zasad, kodujących białko złożone z 300 reszt aminokwasowych, o wyliczonej masie molekularnej równej 32.45 kDa. Sekwencja aminokwasowa wykazuje 43, 44% i 75% identyczności...
-
Electrochemical formation of the adduct between antitumor agent C_1311 and DNA nucleoside dG. 75.
PublicationPrzyjmuje się, że metaboliczna aktywacja przeciwnowotworowej pochodnej C_1311 jest procesem koniecznym dla jej aktywności przeciwnowotworowej. Wykazano wcześniej, że taka aktywacja prowadzi do kowalencyjnego wiązania się leku z DNA w komórce nowotworowej. Aby zbadać molekularny mechanizm powyższej reakcji metabolicznej przeprowadzono badania elektrochemicznego utleniania pochodnej C_1311. Wykazano w pracy, że dwa produkty elektrochemicznego...
-
A universal method for the identification of genes encoding amatoxins and phallotoxins in poisonous mushrooms
PublicationABSTRACT Background. As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. Objective. The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic...