Filters
total: 318
-
Catalog
- Publications 197 available results
- Journals 2 available results
- Publishing Houses 2 available results
- People 25 available results
- Projects 18 available results
- Research Teams 3 available results
- e-Learning Courses 50 available results
- Events 4 available results
- Open Research Data 17 available results
Search results for: OBJETOŚĆ MOLEKULARNA
-
Modelowanie właściwości elektrycznych mięśnia sercowego w warunkach niedokrwienia
PublicationW rozprawie przedstawiono możliwość rozszerzenia pomiarów bioimpedancyjnych o pomiary istotnych diagnostycznie efektów nieliniowych, wyniki pomiarów elektrycznych efektów nieliniowych na sercu świni, spójne z rozważaniami modelowymi, prawdopodobny biofizyczny/molekularny mechanizm odpowiedzialny za obserwowane efekty nieliniowe, symulacje komputerowe i badania modelowe wyjaśniające pochodzenie efektów nieliniowych, efekty nieliniowe...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublicationBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Zakażenia bakteryjne w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego - ocena przydatności diagnostyki molekularnej opartej o technikę PCR. Bacterial infection in chronic otitis media - assessment of usefulness of molecular diagnostic based in PCR method.
PublicationIdentyfikacja zakażeń w przewlekłym zapaleniu ucha środkowego jest trudna, o czym świadczą wysokie odsetki ujemnych wyników badań bakteriologicznych. Przyczyną tego jest trudność w uzyskiwaniu wiarygodnego materiału do badań oraz stosunkowo niska czułość klasycznych metod diagnostycznych. Amplifikacja bakteryjnego DNA techniką PCR jest badaniem, które może przyczynić się do zwiększenia efektywności i czułości badań bakteriologicznych....
-
Jarosław Chojnacki prof. dr hab. inż.
PeopleBorn in 1961 in Bydgoszcz, professional education started at the Chemical Technical Highschool (I. Łukasiewicz). He graduated from the Faculty of Chemistry at the Gdańsk University of Technology in 1986, defending the work on ion-selective electrodes. Subsequent studies were related to organic and siliconorganic synthesis and, from 2002 year on, to crystallography. The doctoral thesis concerned the Silanotiolanes of coinage metals...
-
From DNA damage to G2 arrest: the many roles of topoisomerase II. W: Prog-ress in Cell Cycle Research. Ed. Meijer L., Jezequel A., Roberge M. London: Plenum Publ. Comp. Ltd**2003 vol. 5 chapt. 30 s. 295-300 Od uszkodzeń DNA do bloku w G2: wiele ról dla topoizomerazy II.
PublicationInhibitory DNA topoizomerazy II sa jednymi z najbardziej szeroko stosowanymi lekami przeciwnowotworowymi. Związki te indukuja pekniecia nici DNA i bloku progresji cyklu komorkowego w fazie G2. Jednak topoizomeraza II jest nie tylko celem molekularnym dla lekow przeciwnowtworowych ale enzym ten pelniwazna role w odpowiedzi komorkowej na dzialanie wielu lekow uszkadzajacych DNA. Topoizomeraza tworzy kompleksy molekularne z bialkami...
-
Tadeusz Połoński prof. dr hab. inż.
People -
Molekularne mechanizmy selektywności działania antybiotyku przeciwgrzybowe- go: estru metylowego N-metylo-N-D-fruktozylo amfoterycyny B.**2002, 108 s. 23 rys. 15 tab. bibliogr. 83 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /17.04.2002/. P. Gdań., Wydz. Chemiczny. Promotor: prof. dr inż. E. Borowski.
Publication.
-
Preferential solvation in (amide+alcohol) binary mixtures. Part 2. The N-methylpyrrolidinone+methanol mixture at T = 313.15 K: thermodynamic resultsand molecular dynamics calculations.
PublicationBadano zjawisko preferencyjnej solwatacji amidu (N-metylopyrrolidonu) przez metanol wykorzystując dwie uzupełniające się metody: bezpośrednich pomiarów własności termodynamicznych roztworu oraz symulacji komputerowych. W metodzie pierwszej dokonano pomiarów wielkości termodynamicznych takich jak: nadmiarowa energia swobodna mieszania, nadmiarowa objętość mieszania oraz współczynnika ściśliwości izotermicznej mieszaniny,...
-
Preferential solvation in (amide+alcohol) binary mixtures. Part 1. The N- methylpyrrolidinone+ethanol mixture at T = 313.15 K: thermodynamic resultsand molecular dynamics calculations.
PublicationBadano zjawisko preferencyjnej solwatacji amidu (N-metylopyrrolidonu) przez etanol wykorzystując dwie uzupełniające się metody: bezpośrednich pomiarów własności termodynamicznych roztworu oraz symulacji komputerowych. W metodzie pierwszej dokonano pomiarów wielkości termodynamicznych takich jak: nadmiarowa energia swobodna mieszania, nadmiarowa objętość mieszania oraz współczynnika ściśliwości izotermicznej mieszaniny,...
-
Anna Brillowska-Dąbrowska dr hab. inż.
PeopleAnna Brillowska-Dąbrowska, born in 1971 in Gdańsk, Poland, graduated in 1996 in Biotechnology from the Faculty of Chemistry, Gdańsk University of Technology (GUT). In 2001 she got her PhD, in 2013 became a DSc (habilitation). She was employed in 2004 as a researcher in Statens Serum Institut in Denmark. Currently she is an Associate Professor (adiunkt) in the Department of Molecular Biotechnology and Microbiology and Vice-dean...
-
Immunologia molekularna 2022/2023
e-Learning CoursesCelem kursu jest przekazanie podstawowej wiedzy w zakresie immunologii molekularnej, omówienie molekularnych podstaw procesów odpornościowych. Kierunek: Biotechnologia, II stopień Specjalność: Biotechnologia molekularna
-
Immunologia molekularna 2023/2024
e-Learning CoursesCelem kursu jest przekazanie podstawowej wiedzy w zakresie immunologii molekularnej, omówienie molekularnych podstaw procesów odpornościowych. Kierunek: Biotechnologia, II stopień Specjalność: Biotechnologia molekularna
-
ANALELE STIINTIFICE ALE UNIVERSITATII ALEXANDRU IOAN CUZA DIN IASI-SERIE NOUA-SECTIUNEA II a. GENETICA SI BIOLOGIE MOLECULARA
Journals -
Fizyka molekularna
e-Learning CoursesKurs dla studentów Konwersji Energii.
-
MM/PBSA analysis of molecular dynamics simulations of bovine beta-lactoglobulin: free energy gradients in conformational transitions?
PublicationPraca dotyczy pH zależnych zmian konformacyjnych EF pętli beta-laktoglobuliny. Zmiany te są śledzone za pomocą metod obliczeniowych chemii (dynamika molekularna oraz metody MM/PBSA).
-
Experimental and mathematical modelling study of gas combustion under the high-temperature and oxygen-deficient oxidizers
PublicationPraca przedstawia wyniki badań eksperymentalnych i modelowania numerycznego wpływu parametrów utleniacza za długość i objętość płomienia przy spalaniu paliwa gazowego w środowisku o wysokiej temperaturze i ubogim w tlen.
-
Agnieszka Witkowska dr hab. inż.
People -
Jedno- i wielordzeniowe heteroleptyczne silanotiolany Co(II) i Ni(II) - badania strukturalne, spektroskopowe i magnetyczne
PublicationDoniesienia literaturowe wskazują na możliwość zastosowania związków kompleksowych Co(II) i Ni(II) jako jednocząsteczkowe magnesy molekularne (SMM). Wysiłki naukowców skupiają się na poznaniu zależności pomiędzy strukturą molekularną związków, a ich właściwościami magnetycznymi. Znane są przykłady związków typu SMM opartych na jonach Co(II) i Ni(II), w których metal koordynowany jest przez miękkie S-donorowe ligandy tiolanowe,...
-
Application of single drop extraxtion (SDE) gas chromatography method for the determination of carbonyl compounds in spirits and vodkas
PublicationW pracy przedstawiono metodę oznaczania związków karbonylowych w spirytusach i wódkach, wykorzystującą do izolacji i wzbogacania technikę mikroekstrakcji do pojedynczej kropli (SDE)po derywatyzacji analitów O-(2,3,4,5,6-pentafluorobenzylo)hydroksylaminą. Określono optymalne parametry izolacji i wzbogacania aldehydów z roztworów alkoholowych (objętość próbki, objętość kropli, zawartość alkoholu, temperaturę i czas ekstrakcji)....
-
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains
PublicationOkreślono molekularne właściwości białek SSB-podobnych z Thermus thermophi-lus i T. aquaticus. Zbadano aktywność białek oraz termostabilność. Ponadto, dowiedziono homodimeryczność obu białek i ustalono minimalną sekwencję wiążącą ssDNA.
-
Instytut Fizyki Molekularnej Polskiej Akademii Nauk
Publishing Houses -
Chapter 32. Method to predict the critical micelle concentration of ionic liquids from the molecular volume
PublicationAmfifilowość wielu imidazoliowych cieczy jonowych powoduje, że zjawiska powierzchniowe mają znaczny wpływ na właściwości układów zawierających te związki. Dotychczas przeprowadzono wiele badań w celu wyznaczenia krytycznego stężenia micelizacji cieczy jonowych o różnej budowie. Ze względu na możliwość modyfikacji budowy kationu i wyboru anionu oraz ich kombinacji, podjęto próbę opracowania empirycznego równania pozwalajacego na...
-
Evaluation and cellular responses of modulators of TRF1/TRF2 protein’s function as potential anticancer drugs interfering with telomeric shelterin’s function
PublicationA number of proteins that interact with telomeres have been identified in human cells, indicating the high plasticity of human nucleoprotein complex organization. The most important complex is the "shelterin" complex, which consists of six proteins: TRF1, TRF2, TIN2, POT1, TPP1. The TRF1 and TRF2 directly bind to telomeric double-stranded DNA and the TIN2 protein. The TIN2 protein also binds to the TPP1 protein, stabilizing the...
-
Reactivity induced at 25 K by low-energy electron irradiation of condensed NH3-CH3COOD (1:1) mixture
PublicationW wyniku bombardowania niskoenergetycznymi elektronami skondensowanej mieszaniny kwasu octowego (CH3COOD) i amoniaku (NH3) następuje synteza najprostszego aminokwasu - glicyny - bez potrzeby dodatkowej aktywacji termicznej. Filmy molekularne przed i po bombardowaniu elektronami były badane techniką HREELS.
-
SEMINARIUM DYPLOMOWE
e-Learning CoursesSeminarium dyplomowe dla kierunku Biotechnologia, specjalność Biotechnologia molekularna.
-
Gel glass transition in silica and nitrided silica aerogels experiment and computer modelling.
PublicationPrzedstawiono dane eksperymentalne i symulacje komputerowe metodą dynamiki molekularnej procesu densyfikacji do szkła aerożeli krzemianowych i azotowanych aerożeli krzemianowych.
-
Raman diagnostics in manufacturing of polymer planar optical waveguides. Optical Fibers and Their Applications VIII.
PublicationZastosowano spektroskopię ramanowską do diagnostyki procesu syntezy nowego typu materiałów cienkowarstwowych polimerów hybrydowych, przeznaczonych do wytwarzania światłowodów planarnych. Zbadano poprawność poszczególnych etapów procesu technologicznego oraz strukturę molekularną materiału. Zademonstrowano możliwość kontroli procesu technologicznego w czasie rzeczywistym.
-
Hydratacja domeny katalitycznej kinezyny
PublicationKinezyna należy do białek zwanych motorami molekularnymi, które są zdolne do wykonywania pracy mechanicznej. Konwencjonalna kinezyna wyposażona jest w dwie domeny motoryczne. Potrafi ona poruszać się w uporządkowany sposób przemieszczając się po szlakach wyznaczanych przez tzw. mikrotubule, które tworzone są przez białko tubulinę. Jej rola polega m.in. na transporcie białek i organelli komórkowych. Naturalnym środowiskiem działania...
-
Genetyczne metody różnicowania mikroorganizmów
PublicationPrzedstawiono przegląd i porównanie kilku najczęściej stosowanych technik różnicowania genetycznego mikroorganizmów, uwzględniając molekularne podstawy metod, ich powtarzalność, siłę dyskryminacji, łatwość i koszt użycia, aby dać czytelnikowi pogląd na możliwości klinicznego zastosowania dostępnych aktualnie narzędzi molekularnego różnicowania mikroorganizmów.
-
Solvation of N-methylformamide by ethanol: a comparison of molecular dynamics calculations with the experimental data
PublicationWykonano obliczenia metodami dynamiki molekularnej dla tytułowego układu. Rezultaty porównano z uzyskanymi wcześniej wynikami pomiarów termodynamicznych oraz wnioskami z nich wyciągniętymi.
-
(μ-Tri-tert-butoxysilanethiolato)bis[(tetrahydrofuran)lithium(I)] and catena-poly[[bis(μ-tri-tert-butoxysilanethiolato)dilithium(I)]-μ-dimethoxyethane]: solvent coordination as the structure-forming factor.
PublicationOpisano syntezę oraz wyznaczono strukturę molekularną i krystaliczną dwóch solwatowanych tri-tert-butoksysilanotiolanów litu. W przypadku użycia tetrahydrofuranu obserwuje się tworzenie struktury, zawierającej izolowane dimery. Zastosowanie dimetoksyetanu powoduje utworzenie struktury łańcuchowej, którą można uznać za przykład polimeru koordynacyjnego.
-
Wpływ zasolenia wody na konsystencję i pęcznienie bentonitu
PublicationBentonit ma szerokie zastosowanie w przemyśle budowlanym jako ochrona fundamentów i tuneli przed szkodliwym efektem niekorzystnego ruchu wody gruntowej. Geotechniczne zachowanie się bentonitu, a w szczególności aktywowanego granulatu, wynika przede wszystkim z oddziaływania wodą. Rozszerzając swoją objętość zmienia się w tiksotropowy żel, uniemożliwiając przepływ filtracyjny, jednocześnie wydłużając czas konsolidacji.
-
Waldemar Stampor dr hab. inż.
People -
Glucosamine-6-phosphate synthase - the multi-facets enzyme
PublicationAmidotransferaza L-glutamina: D-frukozo-6-fosforan, nazywana zwyczajowo syntazą glukozamino-6-fosforanu, jako jedyny enzym należący do grupy amidotransferaz, nie wykazuje aktywności amoniakozależnej. Enzym ten, katalizujący pierwszy wyjątkowy etap w szlaku metabolicznym prowadzącym do ostatecznego wytworzenia 5´difosfourydyno-N-acetylo-D-glukozaminy (UDG-GlcNAc) stanowi ważny punkt kontroli metabolicznej biosyntezy makromolekuł...
-
Diagnostyka molekularna w medycynie 2022
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studenta z nowoczesnymi, molekularnymi metodami stosowanymi w diagnostyce medycznej.
-
Elektronika molekularna WFTiMS 2022 - Nowy
e-Learning Courseskier Fizyka techniczna i Nanotechnologia
-
Diagnostyka molekularna w medycynie 2023
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studenta z nowoczesnymi, molekularnymi metodami stosowanymi w diagnostyce medycznej oraz nabycie umiejętności posługiwania się programami do obróbki danych z poziomu DNA.
-
Nonradiative long range energy transfer in donor-acceptor systems with excluded volume
PublicationW pracy analizowano bezpromienisty długozasięgowy transfer energii w układach donor-akceptor z uwzględnieniem objętości wyłączonej. Stwierdzono, że zanik fluorescencji pierwotnie wzbudzonych donorów jest wolniejszy, jeżeli uwzględnia się objętość wyłączoną. Ten efekt jest znacznie wzmocniony, gdy akceptory znajdują się w pewnej objętości niedostępnej dla donorów. Analizę numeryczną przeprowadzono stosując metodę symulacji Monte...
-
Opracowanie procedury oznaczania lotnych produktów utleniania olejów roślinnychtechniką statycznej analizy fazy nadpowierzchniowej = The development of a new procedure for determination of volatile oxidation products in edible oils with the use of static headspace analysis
PublicationW publikacji przedstawiono dobór optymalnych parametrów w celu opracowania nowej metody diagnozowania jakości olejów poprzez oznaczenie lotnych związków będących produktami reakcji utleniania olejów. Próbki rafinowanych olejów roślinnych przed analizą poddano procesowi przyspieszonego utleniania, stosując naświetlanie promieniowaniem ultrafioletowym (12 W, 254 nm). Jako technikę ekstrakcji lotnej frakcji próbki zastosowano statyczną...
-
From metal dithiocarbamates to metal sulfides
PublicationLigandy ditiokarbamianowe są szeroko stosowane w chemii koordynacyjnej. Układy zawierające metal mogą być z powodzeniem wykorzystane do otrzymania odpowiednich siarczków. W pracy przedstawiono syntezę, strukurę, właściwości, zastosowanie związków z tej grupy. Scharakteryzowano ich rozkład termiczny, jak równeiż zaprezentowano metody umożliwiające wykorzystanie ich jako pojedyncze prekursory molekularne
-
Chemometryczne podejście do optymalizacji dyspersyjnej mikroekstrakcji w układzie ciecz-ciecz (DLLME), jako metody przygotowania próbek do rozdzielania i oznaczania krezoli w ściekach rafineryjnych
PublicationW pracy przedstawiono procedurę optymalizacji dyspersyjnej mikroekstrakcji w układzie ciecz-ciecz (DLLME), z zastosowaniem frakcyjnych planów czynnikowych tj. planu Placketta-Burman’a oraz centralnego planu kompozycyjnego. Zdefiniowano parametry mające istotny wpływ na efektywność ekstrakcji krezoli i dla nich przeprowadzono procedurę optymalizacyjną, w wyniku której wyznaczono wartości optymalne parametrów w tym pH 6 oraz objętość...
-
The structure of porous and spontaneously densified amorphous PbSiO3: a Molecular Dynamics study.
PublicationW pracy zaproponowano nową metodę numerycznego otrzymywania strukturporowatych metodą dynamiki molekularnej. Metoda polega na rozpoczęciu symulacji z ładunkami ekranowanymi i stopniowym zwiększaniu ich do pełnych ładunków jonowych. Metodę zastosowano do układu PbSiO3.
-
Zastosowanie tomografii do pomiaru zagęszczenia materiałów sypkich w silosach.
PublicationW artykule omówiono pomiary zagęszczenia materiałów sypkich przy zastosowaniu tomografii. Przedmiotem badań były zmiany objetości podczas przepływu w silosie modelowym. Badania wykonano dla różnych materiałów i ich zagęszczeń początkowych oraz szorstkości ścian silosu.
-
Cation diffusion coefficients in CuAgI via molecular dynamics simulations
PublicationPraca prezentuje wyniki analizy strukturalnej otrzymane poprzez symulacje dynamiczno-molekularne (zespół NpT, dwuciałowy potencjał Vashisty-Rahmana) superjonowego związku o składzie (1-x)Cu-xAg-I, x = 0.0, 0.25, 0.5, 0.75, 1.0). Wyznaczono wartość współczynnika dyfuzji kationów i energii aktywacji w funkcji składu szkła i temperatury. Otrzymane rezultaty porównano z danymi literaturowymi.
-
New Method for the Synthesis of Azocrown Compounds Containing Oxygen, Nitrogen and Oxygen, or Sulfur Atoms in the Macroring.
PublicationW publikacji opisano nową metodę syntezy azokoron z różnymi heteroatomami w makrocyklu i o różnej wielkości molekularnej wnęki. Metoda ta polega na reakcji 2,2´-difluoroazobenzenu z diolami, diaminami, aminodiolami i ditiolamiw obecności zasady.
-
Molecular modelling of membrane sterols with the use of the GROMOS 96 forcefield
PublicationPodstawowym zadaniem tego projektu było udowodnienie zasadności stosowania pola siłowego GROMOS 96 do symulacji steroli błonowych metodą dynamiki molekularnej. Uzyskane wyniki jasno wskazują, że to pole siłowe bardzo dobrze nadaje się do symulacji silnie lipofilowych układów.
-
Computer study of the lead-germanium alloy formation in over-reduced lead-germanate glass
PublicationPraca poświęcona jest badaniom dynamiczno-molekularnym struktury zredukowanego szkła ołowiowo-germanianowego o składzie 1Pb 1Ge 1GeO2. Analizie poddano strukturę matrycy szkła, GeO2 i osadzonej w niej fazy metalicznej, którą formują neutralne atomy Pb i Ge.
-
Fizyka molekularna dla IBM 2022/23
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z podstawowymi zagadnieniami fizyki oraz biofizyki molekularnej. Kurs przeznaczony jest dla studentów studiów II stopnia kierunku Inżynieria Biomedyczna.
-
Diagnostyka biochemiczna i molekularna chorób tarczycy
e-Learning Courses -
Fizyka molekularna dla IBM 2023/24
e-Learning CoursesCelem przedmiotu jest zapoznanie studentów z podstawowymi zagadnieniami fizyki oraz biofizyki molekularnej. Kurs przeznaczony jest dla studentów studiów II stopnia kierunku Inżynieria Biomedyczna.