Filters
total: 678
-
Catalog
- Publications 394 available results
- Journals 1 available results
- Publishing Houses 2 available results
- People 44 available results
- Inventions 1 available results
- Projects 22 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 4 available results
- e-Learning Courses 187 available results
- Events 9 available results
- Open Research Data 13 available results
Search results for: klonowanie molekularne
-
Agnieszka Witkowska dr hab. inż.
People -
Immunologia molekularna 2022/2023
e-Learning CoursesCelem kursu jest przekazanie podstawowej wiedzy w zakresie immunologii molekularnej, omówienie molekularnych podstaw procesów odpornościowych. Kierunek: Biotechnologia, II stopień Specjalność: Biotechnologia molekularna
-
Immunologia molekularna 2023/2024
e-Learning CoursesCelem kursu jest przekazanie podstawowej wiedzy w zakresie immunologii molekularnej, omówienie molekularnych podstaw procesów odpornościowych. Kierunek: Biotechnologia, II stopień Specjalność: Biotechnologia molekularna
-
Agnieszka Potęga dr inż.
People -
Daniel Kaszubowski dr hab.
People -
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains
PublicationOkreślono molekularne właściwości białek SSB-podobnych z Thermus thermophi-lus i T. aquaticus. Zbadano aktywność białek oraz termostabilność. Ponadto, dowiedziono homodimeryczność obu białek i ustalono minimalną sekwencję wiążącą ssDNA.
-
Instytut Fizyki Molekularnej Polskiej Akademii Nauk
Publishing Houses -
Evaluation and cellular responses of modulators of TRF1/TRF2 protein’s function as potential anticancer drugs interfering with telomeric shelterin’s function
PublicationA number of proteins that interact with telomeres have been identified in human cells, indicating the high plasticity of human nucleoprotein complex organization. The most important complex is the "shelterin" complex, which consists of six proteins: TRF1, TRF2, TIN2, POT1, TPP1. The TRF1 and TRF2 directly bind to telomeric double-stranded DNA and the TIN2 protein. The TIN2 protein also binds to the TPP1 protein, stabilizing the...
-
Gel glass transition in silica and nitrided silica aerogels experiment and computer modelling.
PublicationPrzedstawiono dane eksperymentalne i symulacje komputerowe metodą dynamiki molekularnej procesu densyfikacji do szkła aerożeli krzemianowych i azotowanych aerożeli krzemianowych.
-
Reactivity induced at 25 K by low-energy electron irradiation of condensed NH3-CH3COOD (1:1) mixture
PublicationW wyniku bombardowania niskoenergetycznymi elektronami skondensowanej mieszaniny kwasu octowego (CH3COOD) i amoniaku (NH3) następuje synteza najprostszego aminokwasu - glicyny - bez potrzeby dodatkowej aktywacji termicznej. Filmy molekularne przed i po bombardowaniu elektronami były badane techniką HREELS.
-
Solvation of N-methylformamide by ethanol: a comparison of molecular dynamics calculations with the experimental data
PublicationWykonano obliczenia metodami dynamiki molekularnej dla tytułowego układu. Rezultaty porównano z uzyskanymi wcześniej wynikami pomiarów termodynamicznych oraz wnioskami z nich wyciągniętymi.
-
Hydratacja domeny katalitycznej kinezyny
PublicationKinezyna należy do białek zwanych motorami molekularnymi, które są zdolne do wykonywania pracy mechanicznej. Konwencjonalna kinezyna wyposażona jest w dwie domeny motoryczne. Potrafi ona poruszać się w uporządkowany sposób przemieszczając się po szlakach wyznaczanych przez tzw. mikrotubule, które tworzone są przez białko tubulinę. Jej rola polega m.in. na transporcie białek i organelli komórkowych. Naturalnym środowiskiem działania...
-
Jedno- i wielordzeniowe heteroleptyczne silanotiolany Co(II) i Ni(II) - badania strukturalne, spektroskopowe i magnetyczne
PublicationDoniesienia literaturowe wskazują na możliwość zastosowania związków kompleksowych Co(II) i Ni(II) jako jednocząsteczkowe magnesy molekularne (SMM). Wysiłki naukowców skupiają się na poznaniu zależności pomiędzy strukturą molekularną związków, a ich właściwościami magnetycznymi. Znane są przykłady związków typu SMM opartych na jonach Co(II) i Ni(II), w których metal koordynowany jest przez miękkie S-donorowe ligandy tiolanowe,...
-
Waldemar Stampor dr hab. inż.
People -
Fizyka molekularna
e-Learning CoursesKurs dla studentów Konwersji Energii.
-
MM/PBSA analysis of molecular dynamics simulations of bovine beta-lactoglobulin: free energy gradients in conformational transitions?
PublicationPraca dotyczy pH zależnych zmian konformacyjnych EF pętli beta-laktoglobuliny. Zmiany te są śledzone za pomocą metod obliczeniowych chemii (dynamika molekularna oraz metody MM/PBSA).
-
Krzysztof Jan Kaliński prof. dr hab. inż.
PeopleKrzysztof J. Kaliński completed his MSc study at Gdańsk University of Technology (GUT) Faculty of Production Engineering (1980, result – get a first). He obtained PhD at GUT Faculty of Machine Building (1988, result – get a first), DSc at GUT Faculty of Mechanical Engineering (ME) (2002, result – get a first), and professor’s title – w 2013 r. In 2015 r. he became full professor.His research area includes: theoretical and applied...
-
Regulacja aktywności syntazy glukozamino-6-fosforanu z Candida albicans – badania metodami obliczeniowymi
PublicationNiniejsza praca przedstawia wyniki badań, prowadzonych metodami obliczeniowymi, poświęconych enzymowi syntazie GlcN-6-P pochodzącemu z drożdży C. albicans. Enzym ten odpowiedzialny jest między innymi za biosyntezę kluczowych składników ściany komórkowej grzybów i bakterii, ma również wpływ na regulację metabolizmu glukozy. Przedstawione badania stanowią jeden z etapów poszukiwania molekularnego mechanizmu inhibicji, której eukariotyczna...
-
From metal dithiocarbamates to metal sulfides
PublicationLigandy ditiokarbamianowe są szeroko stosowane w chemii koordynacyjnej. Układy zawierające metal mogą być z powodzeniem wykorzystane do otrzymania odpowiednich siarczków. W pracy przedstawiono syntezę, strukurę, właściwości, zastosowanie związków z tej grupy. Scharakteryzowano ich rozkład termiczny, jak równeiż zaprezentowano metody umożliwiające wykorzystanie ich jako pojedyncze prekursory molekularne
-
The structure of porous and spontaneously densified amorphous PbSiO3: a Molecular Dynamics study.
PublicationW pracy zaproponowano nową metodę numerycznego otrzymywania strukturporowatych metodą dynamiki molekularnej. Metoda polega na rozpoczęciu symulacji z ładunkami ekranowanymi i stopniowym zwiększaniu ich do pełnych ładunków jonowych. Metodę zastosowano do układu PbSiO3.
-
Chemia defektów oraz zagadnienie dyfuzji tlenu w mieszanych przewodnikach jonowo – elektronowych na bazie związków typu ABO3.
PublicationPublikacja opisująca teoretyczne zagadnienia związane z dyfuzją molekularnego i jonowego tlenu w ceramikach na bazie struktur ABO3.
-
New Method for the Synthesis of Azocrown Compounds Containing Oxygen, Nitrogen and Oxygen, or Sulfur Atoms in the Macroring.
PublicationW publikacji opisano nową metodę syntezy azokoron z różnymi heteroatomami w makrocyklu i o różnej wielkości molekularnej wnęki. Metoda ta polega na reakcji 2,2´-difluoroazobenzenu z diolami, diaminami, aminodiolami i ditiolamiw obecności zasady.
-
Maria Szpakowska prof. dr hab. inż.
PeopleProf. dr hab. inż. Maria Jolanta Szpakowska jest absolwentką Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej, na którym uzyskała stopnie i tytuły naukowe. W latach 1969–1995 pracowała w Zakładzie Chemii Fizycznej a w latach 1995 – 2022 na Wydziale Zarządzania i Ekonomii (WZiE). Pełniła kolejno funkcję kierownika Pracowni, Zakładu Towaroznawstwa a następnie Katedry Zarządzania Jakością i Towaroznawstwa. W latach 2008-2010 była prodziekanem...
-
Cation diffusion coefficients in CuAgI via molecular dynamics simulations
PublicationPraca prezentuje wyniki analizy strukturalnej otrzymane poprzez symulacje dynamiczno-molekularne (zespół NpT, dwuciałowy potencjał Vashisty-Rahmana) superjonowego związku o składzie (1-x)Cu-xAg-I, x = 0.0, 0.25, 0.5, 0.75, 1.0). Wyznaczono wartość współczynnika dyfuzji kationów i energii aktywacji w funkcji składu szkła i temperatury. Otrzymane rezultaty porównano z danymi literaturowymi.
-
Molecular modelling of membrane sterols with the use of the GROMOS 96 forcefield
PublicationPodstawowym zadaniem tego projektu było udowodnienie zasadności stosowania pola siłowego GROMOS 96 do symulacji steroli błonowych metodą dynamiki molekularnej. Uzyskane wyniki jasno wskazują, że to pole siłowe bardzo dobrze nadaje się do symulacji silnie lipofilowych układów.
-
Konferencja BioMillenium 2017
EventsTematem głównym konferencji będą trendy i rozwiązania w biotechnologii i mikrobiologii.
-
Raman diagnostics in manufacturing of polymer planar optical waveguides. Optical Fibers and Their Applications VIII.
PublicationZastosowano spektroskopię ramanowską do diagnostyki procesu syntezy nowego typu materiałów cienkowarstwowych polimerów hybrydowych, przeznaczonych do wytwarzania światłowodów planarnych. Zbadano poprawność poszczególnych etapów procesu technologicznego oraz strukturę molekularną materiału. Zademonstrowano możliwość kontroli procesu technologicznego w czasie rzeczywistym.
-
(μ-Tri-tert-butoxysilanethiolato)bis[(tetrahydrofuran)lithium(I)] and catena-poly[[bis(μ-tri-tert-butoxysilanethiolato)dilithium(I)]-μ-dimethoxyethane]: solvent coordination as the structure-forming factor.
PublicationOpisano syntezę oraz wyznaczono strukturę molekularną i krystaliczną dwóch solwatowanych tri-tert-butoksysilanotiolanów litu. W przypadku użycia tetrahydrofuranu obserwuje się tworzenie struktury, zawierającej izolowane dimery. Zastosowanie dimetoksyetanu powoduje utworzenie struktury łańcuchowej, którą można uznać za przykład polimeru koordynacyjnego.
-
Międzynarodowy Instytut Biologii Molekularnej i Komórkowej w Warszawie
Publishing Houses -
Comparative molecular dynamics simulations of amphotericin B-cholesterol/ergosterol membrane channels
PublicationBadania polegały na przeprowadzeniu porównawczej dynamiki molekularnej dla dwóch typów kanałów amfoterycyny B. Obie symulacje różniły się rodzajem sterolu (cholesterol lub ergosterol). Na podstawie wyników przeprowadzonych prac ustalono jakie elementy strukturalne badanych kanałów mogą być odpowiedzialne za selektywne działanie amfoterycyny B.
-
Anna Toruńska-Sitarz
PeopleAnna Toruńska-Sitarz, Msc in Oceanography, PhD in Earth Sciences. She is a cyanobacteriologist and academic teacher, working in the Division of Marine Biotechnology, University of Gdańsk. Her main scientific interests concern antibacterial compounds from marine organisms, regulation of cyanometabolites production in cyanobacteria and cyanobacterial molecular diversity. Further information
-
Glucosamine-6-phosphate synthase - the multi-facets enzyme
PublicationAmidotransferaza L-glutamina: D-frukozo-6-fosforan, nazywana zwyczajowo syntazą glukozamino-6-fosforanu, jako jedyny enzym należący do grupy amidotransferaz, nie wykazuje aktywności amoniakozależnej. Enzym ten, katalizujący pierwszy wyjątkowy etap w szlaku metabolicznym prowadzącym do ostatecznego wytworzenia 5´difosfourydyno-N-acetylo-D-glukozaminy (UDG-GlcNAc) stanowi ważny punkt kontroli metabolicznej biosyntezy makromolekuł...
-
Raman investigation of hybrid polymer thin films
PublicationPrzestawiono problemy diagnostyki ramanowskiej transparentnych struktur cienkowarstwowych wykonanych metodą zol-żel z polimerów hybrydowych. Analizowano możliwości badania struktury molekularnej i grubości, a także określania jakości wykonania struktur falowodowych. Przedstawiono wyniki badań wykonanych mikroskopem ramanowskim dla polimerowych struktur cienkowarstwowych osadzonych na podłożach szklanych i krzemowych.
-
Monosaccharides as internal probes for the determination of the absolute configuration of 2-butanol
PublicationD-dlukoza, D-mannoza i L-ramnoza zostały poddane reakcji z mieszaniną racemiczną 2-butanolu. Otrzymane w ten sposób glikozydy były analizowane za pomocą spektroskopii NMR, z wykorzystaniem eksperymentów COSY i NOESY. Analiza konformacyjna wiązania glikozydowego (dokonana w oparciu o modelowanie molekularne i heteronuklearne stałe sprzężenia) wraz z analizą sprzężeń dipolowych obserwowanych w widmie NOESY umożliwiła określenie konfiguracji...
-
Silanethiolates - synthesis, properties and structures.
PublicationW pracy wskazano podstawowe drogi syntezy oraz podano zwięzłą charakterystykę silanotiolanów - w większości związków kompleksowych posiadających jako główny ligand grupę silanotiolanową, na ogół (t-BuO)3SiS. Przy pomocy odpowiednio dobranych przykładów zilustrowano właściwości tych związków - wskazano ciekawsze elementy struktury molekularnej oraz specyficzne cechy spektralne.
-
Diagnostyka zakażeń Candida spp. oparta o amplifikację DNA techniką PCR
PublicationZakażenia wywoływane przez oportunistyczne grzyby z rodzaju Candida są poważnym problemem klinicznym. Niezbędne jest poszukiwanie nowych szybkich, czułych i pewnych metod do identyfikacji gatunkowej tych drobnoustrojów. W artykule przedstawiono opisane w literaturze metody diagnostyki molekularnej drożdżaków z rodzaju Candida oparte o amplifikację DNA techniką PCR.
-
Radosław Szmytkowski prof. dr hab.
People -
Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych
PublicationGrzyby należące do rodzajów Microsporum, Trichophyton i Epidermophyton są główną przyczyną powierzchownych zakażeń grzybiczych. Klasyczna identyfikacja gatunkowa czynnika etiologicznego tych grzybic oparta na obserwacjach mikro- i makroskopowych możliwa jest dopiero po uzyskaniu czystej hodowli dermatofitów. W związku z powolnym tempem wzrostu jest ona możliwa po dwóch, trzech tygodniach po pobrania próbki. Molekularne metody diagnostyczne...
-
Mieczysław Siemiątkowski dr inż.
People -
Syntetyczne wskaźniki oceny stanu toru
PublicationJakość geometryczna toru analizowana jest w różnych celach, a dane podlegają różnemu stopniowi agregacji. Pojedyncze nierówności toru analizowane są zazwyczaj z uwagi na bezpieczeństwo i służą do planowanie napraw w krótkich terminach. Natomiast agregacja pomierzonych parametrów pozwala na planowanie robót w terminach średniookresowych i budowę modeli predykcji. W artykule przedstawiono zagregowane wskaźniki jakości geometrycznej...
-
Modele i metody kolorowania grafów. Część II
PublicationNiniejszy artykuł jest drugą częścią 2-odcinkowego cyklu przeglądowego na temat modeli i metod kolorowania grafów. Przedstawiono w nim najważniejsze, z punktu widzenia zastosowań, modele kolorowania grafów. W szczególności pokazano różne kryteria i ograniczenia modyfikujące kolorowanie klasyczne. Ponieważ kolorowanie we wszystkich tych odmianach i wariantach jest NP-trudne, podano oszacowania na liczbę chromatyczną (indeks chromatyczny)...
-
Ewa Wagner-Wysiecka dr hab. inż.
PeopleEwa Wagner-Wysiecka is a graduate of the Faculty of Chemistry at Gdańsk University of Technology (specializing in Chemical Technology, with a focus on Inorganic Technology and a sub-specialty in Technical and Industrial Analytics). She completed her master's thesis, entitled "Identification of Contaminants in Pharmacopoeial Sulfaquinoxaline," under the supervision of Professor Jan F. Biernat. After completing her master's degree...
-
Molecular modelling of amphotericin B-ergosterol primary complex in water
PublicationBadano właściwości pierwotnego kompleksu amfoterycyny B z ergosterolem przy pomocy symulacji dynamiki molekularnej. Otrzymane w wyniku naszych symulacji rezultaty słabo odpowiadają postulowanym przez innych autorów modelom kompleksu antybiotyk-sterol. Z drugiej strony uzyskane geometrie nie są sprzeczne z wynikami eksperymentów biofizycznych dotyczących powstawania kompleksów w wodzie i w środowisku wodno-alkoholowym.
-
SEMINARIUM DYPLOMOWE
e-Learning CoursesSeminarium dyplomowe dla kierunku Biotechnologia, specjalność Biotechnologia molekularna.
-
Planowanie finansowe a strategia przedsiębiorstwa. W: Wewnętrzne i zewnę-trzne determinanty procesów decyzyjnych w zarządzaniu finansami przed-siębiorstw. Monografia Katedry Finansów nr 1. Gdańsk: Kated. Finan. Wydz.Zarz. i Ekon. P. Gdań.**2003 s. 5-17, 1 rys. 1 tab. 1 bibliogr. 8 poz.
PublicationArtykuł obejmuje studium problematyki planowania finansowego wzbogaconego teoriami zarządzania strategicznego. Autor identyfikuje kategorie planowania w świetle koncepcji rozumienia strategii przedsiębiorstwa. Na tej podstawie określa nowe związki i definicje.
-
T-coloring of graphs.
PublicationNiniejszy rozdział omawia kontrastowe kolorowanie grafów. Podana została jego definicja i podstawowe własności, zastosowania oraz złożoność obliczeniowa problemów rozważanych w ramach tej dziedziny.
-
Computer study of the lead-germanium alloy formation in over-reduced lead-germanate glass
PublicationPraca poświęcona jest badaniom dynamiczno-molekularnym struktury zredukowanego szkła ołowiowo-germanianowego o składzie 1Pb 1Ge 1GeO2. Analizie poddano strukturę matrycy szkła, GeO2 i osadzonej w niej fazy metalicznej, którą formują neutralne atomy Pb i Ge.
-
Zespół Fizyki Materii Molekularnej
Research TeamsGłówną tematyką badań Zespołu Fizyki Materii Molekularnej jest wyjaśnianie struktury i własności fizycznych układów molekularnych oraz hybrydowych (materiał organiczny / materiał nieorganiczny)
-
Weekend Muzeów online na Politechnice Gdańskiej
EventsZapraszamy do udziału w Weekendzie Muzeów – wykładach online, podejmujących aktualne zagadnienia zdrowotne. Transmisja na żywo na kanale YouTube Politechnika Otwarta, z możliwością zadawania pytań prelegentom w komentarz
-
Minimalizacja krotności użycia kolorów przy uporządkowanym kolorowaniu krawędzi drzew
PublicationUporządkowane kolorowanie grafu polega na takim etykietowaniu jego wierzchołków liczbami naturalnymi, że każda ścieżka łącząca dwa wierzchołki o tym samym kolorze zawiera wierzchołek o kolorze wyższym. O uporządkowanym pokolorowaniu mówimy, że jest optymalne, jeśli liczba wykorzystanych kolorów jest minimalna. W referacie rozważano optymalne uporządkowane kolorowanie z dodatkowym warunkiem, aby krotność użycia koloru, który pojawił...