Filters
total: 25659
-
Catalog
- Publications 20488 available results
- Journals 51 available results
- Conferences 3 available results
- Publishing Houses 5 available results
- People 721 available results
- Inventions 102 available results
- Projects 288 available results
- Laboratories 18 available results
- Research Teams 43 available results
- Research Equipment 8 available results
- e-Learning Courses 1963 available results
- Events 610 available results
- Open Research Data 1359 available results
displaying 1000 best results Help
Search results for: RNA SEQUENCING
-
H2AX phosphorylation, its role in DNA damage response and cancer therapy
PublicationDouble-strand breaks (DSBs) are the most deleterious DNA lesions, which, if left unrepaired, may have severe consequences for cell survival, as they lead to chromosome aberrations, genomic instability, or cell death. Various physical, chemical, and biological factors are involved in DSB induction. Cells respond to DNA damage by activating the so-called DNA damage response (DDR), a complex molecular mechanism developed to detect...
-
Trójwymiarowe obrazowanie dna morskiego ze szczególnym uwzględnieniem wód płytkich
PublicationW ostatnim dziesięcioleciu nabrały znaczenia obserwacje szerokokątne (ang. swath scan) przy pomocy sonarów bocznych i sonarów wielowiązkowych. Wynikiem pomiarów dokonywanych przy pomocy sonarów wielowiązkowych jest jednak duża liczba danych geoprzestrzennych o precyzyjnie określonej referencji geograficznej, charakteryzujących się zróżnicowaną dynamiką i posiadających zróżnicowaną rozdzielczość. Stwarza to problemy w procesie...
-
Thermodynamic and electrostatic properties of ternary Oxytricha nova TEBP-DNA complex
PublicationZa pomocą metod chemi obliczeniowej badano właściwości molekularne kompleksu telomerowego białka TEBP z Oxytricha nova w kompleksie trójskkładnikowym z DNA o sekwencji telomerowej. Wyliczone wartości energii kompleksowania wskazują specyficznie na jedną z dróg tworzenia kompleksu, gdzie wpierw podjednostka alfa łaczy się z DNA a następnie podjednostka beta dołącza się do takiego dwuskładnikowego kompleksu. Policzone rozkłady molekularnego...
-
Central carbon metabolism influences fidelity of DNA replication in Escherichia coli
Publication -
Molecular differences in mitochondrial DNA genomes of dogs with malignant mammary tumours
Publication -
Analysis of differences in the stability of proteins encoded in mitochondrial DNA of model organisms
Publication -
Survivin DEx3 as a biomarker of thyroid cancers: A study at the mRNA and protein level
Publication -
Direct cloning of heavy metal resistance genes from metagenomic DNA
Publication -
Induced circularly polarized luminescence for revealing DNA binding with fluorescent dyes
Publication -
Regulation of the switch from early to late bacteriophage λ DNA replication
Publication -
Diagnosis of Brain Tumors Through Global Specific DNA Methylation Analysis
Publication -
Molecular Diagnostics of Brain Tumours by Measuring the 5-Methylcytosine Level in Their DNA
Publication -
P04.06 Temozolomide influence on global DNA methylation in glioblastoma cell lines
Publication -
Effects of Base π-Stacking on Damage to DNA by Low-Energy Electrons
Publication -
A Framework for Enhancing Supplier Selection Process by Using SOEKS and Decisional DNA
PublicationAbstract. Supplier selection process is one of the significant stages in supply chain management for industrial manufactured products. It plays an integral role in the success of any manufacturing organization and is an important part starting right from selecting raw material to dispatch of finished products. This paper contributes to enhance the supplier selection process by proposing a multi-criteria decision making framework...
-
Modyfikacje polimeraz DNA jako rozwiązania problemów w reakcjach PCR
PublicationReakcja PCR już od wielu lat jest podstawowym narzędziem stosowanym w biotechnologii molekularnej. Nadal napotykamy jednak liczne problemy podczas jej przeprowadzania związane z trudnymi matrycami, obecnością inhibitorów itp. Optymalizacja reakcji PCR jest więc niezbędna w celu poprawy wyników. Jednym z rozwiązań tych problemów może być modyfikowanie polimeraz DNA. W powyższym artykule opisano problemy i rozwiązania zależne polimerazy...
-
Decisional DNA based intelligent knowledge model for flexible manufacturing system
PublicationModeling an effective mechanism for design and control strategies for the implementation of a flexible manufacturing system (FMS) has been a challenge. Consequently, to overcome this issue various techniques have applied in the past but most of these models are effective only for some specific situation or an element of FMS. In this study, the knowledge representation technique of Decisional DNA (DDNA) is applied to FMS to develop...
-
RNS/TCS CONVERTER DESIGN USING HIGH-LEVEL SYNTHESIS IN FPGA
PublicationAn experimental high-level synthesis (HLS) of the residue number system (RNS) to two’s-complement system (TCS) converter in the Vivado Xilinx FPGA environment is shown. The assumed approach makes use of the Chinese Remainder Theorem I (CRT I). The HLS simplifies and accelerates the design and implementation process, moreover the HLS synthesized architecture requires less hardware by about 20% but the operational frequency is smaller...
-
Representing and Managing Experiential Knowledge with Decisional DNA and its Drimos® Extension
PublicationThe Semantic Web concept is proposing a future concept of the WorldWideWeb (WWW) where both humans and man-made systems are able to interconnect and exchange knowledge. One of the challenges of Semantic Web is smart and trusted accommodation of knowledge in artificial systems so it can be unified, enhanced, reused, shared, communicated and distributed with added aptitude. Our research represents an important component of addressing...
-
Experience Based Decisional DNA (DDNA) to Support Sustainable Product Design
PublicationThis paper presents the idea of providing engineering design knowledge to designers working on sustainable product design and development process. The new product development process often requires significant amount of design knowledge which can be saved and recalled by designers during the design process. This knowledge is very important for successful sustainable product development as it can include material selection, product...
-
Low-Molecular Pyrazine-Based DNA Binders: Physicochemical and Antimicrobial Properties
PublicationPyrazine and its derivatives are a large group of compounds that exhibit broad biological activity, the changes of which can be easily detected by a substituent effect or a change in the functional group. The present studies combined theoretical research with the density functional theory (DFT) approach (B3LYP/6-311+G**) and experimental (potentiometric and spectrophotometric) analysis for a thorough understanding of the structure...
-
Principles of target DNA cleavage and the role of Mg2+ in the catalysis of CRISPR–Cas9
PublicationAt the core of the CRISPR–Cas9 genome-editing technology, the endonuclease Cas9 introduces site-specific breaks in DNA. However, precise mechanistic information to ameliorate Cas9 function is still missing. Here, multimicrosecond molecular dynamics, free energy and multiscale simulations are combined with solution NMR and DNA cleavage experiments to resolve the catalytic mechanism of target DNA cleavage. We show that the conformation...
-
Wybrane metody badania poziomu metylacji DNA w komórkach eukariotycznych
PublicationMetylacja regionów promotorowych jest jednym z głównych mechanizmów regulacji transkrypcji genów u eukariota. W komórkach ssaczych metylacja DNA zachodzi głównie na reszcie cytozyny występującej w dinukleotydach CpG i jest katalizowana przez metylotransferazy DNA (DNMT1, DNMT3A i DNMT3B) (Turek Plewa, Jagodziński 2005). Mapowanie 5 metylocytozyny w DNA genomowym jest jednym z narzędzi do badania wpływu metylacji na tkankowo-specyficzną...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublicationSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNA insequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination. Although there are differences in amino...
-
Using Decisional DNA to Enhance Industrial and Manufacturing Design: Conceptual Approach
PublicationDuring recent years, manufacturing organizations are facing market changes such as the need for short product life cycles, technological advancement, intense pressure from competitors and the continuous customers’ expectation for high quality products at lower costs. In this scenario, knowledge and its associated engineering/management of every stage involved in the industrial design has become increasingly important for manufacturing...
-
Algorytmy obróbki danych dla diagnostyki ran pooperacyjnych w kardiochirurgii
PublicationDo oceny procesu gojenia ran pooperacyjnych wykorzystana została koncepcja aktywnej termografii dynamicznej (ATD) z pobudzeniem w postaci nawiewu mieszaniny powietrza i rozprężonego CO2. Specyficzne dla aplikacji oceny gojenia ran jest przetwarzanie uzyskanych sekwencji termogramów polegające na analizie rozkładów parametrów modelu dwueksponencjalnego wzdłuż linii cięcia w kolejnych dwóch badaniach - w trzeciej i szóstej dobie...
-
Toward Smart Innovation Engineering: Decisional DNA-Based Conceptual Approach
PublicationABSTRACT Knowledge and experience are essential requirements for product innovation. The presented paper proposes a systematic approach for product innovation support using a Smart Knowledge Management System comprising a Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). This proposed system is dynamic in nature because it updates itself every time a new decision related to innovation is made. Through this...
-
Characterization of single-stranded DNA-binding proteins from the psychrophilic bacteria
PublicationSingle-stranded DNA-binding proteins (SSBs) are indispensable elements in the cells of all living organisms. SSB proteins interact with ssDNAinsequence in an independent manner, preventing them from forming secondary structures and from degradation by nucleases. In this way, SSB-binding proteins participate in all processes involving ssDNA, such as replication, repair and recombination.Although there are differences in amino acid...
-
Typing of Scopulariopsis and Microascus fungi by Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
PublicationOBJECTIVES Scopulariopsis species and their teleomorphs of the genus Microascus are commonly isolated from soil, decaying plant material and indoor environments. Moreover, certain Scopulariopsis and Microascus species are recognised as opportunistic human pathogens. Although most species can be identified by detailed morphological study, phenotypic characters appear to overlap in several cases and morphology seems to be insufficient...
-
Przetwarzanie i analiza obrazów sonarowych powierzchni dna basenu portowego
PublicationW artykule przedstawiono problemy związane z poszukiwaniem obiektów zalegających na dnie basenu portowego.
-
Toward Intelligent Vehicle Intrusion Detection Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper, we propose a novel intrusion detection approach using past driving experience and the neural knowledge DNA for in-vehicle information system security. The neural knowledge DNA is a novel knowledge representation method designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing systems. We examine our approach for classifying malicious vehicle control commands...
-
Applying Decisional DNA to Internet of Things: The Concept and Initial Case Study
PublicationIn this article, we present a novel approach utilizing Decisional DNA to help the Internet of Things capture decisional events and reuse them for decision making in future operations. The Decisional DNA is a domain-independent, standard and flexible knowledge representation structure that allows its domains to acquire, store, and share experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. We apply this approach...
-
Integration of the sulfate reduction and anammox processes for enhancing sustainable nitrogen removal in granular sludge reactors
PublicationThe Anammox and Sulfate Reduction Ammonium Oxidation processes were compared in two granular sequencing batch reactors operated for 160 days under anammox conditions. It was hypothesized that increasing the concentration of SO42− may positively influence the rate of N removal under anaerobic conditions and it was tested whether SO42− reduction and anammox occur independently or are related to each other. The cooperation of N-S...
-
Ana Namikata master
People -
Polityka regionu na rzecz rozwoju miast - na przykładzie województwa pomorskiego
PublicationCelem artykułu jest wskazanie uwarunkowań polityki regionu na rzecz rozwoju miast, wynikających z tego rozwiązań oraz osiągniętych do tej pory efektów podjętych decyzji. Rola miast, jako ośrodków koncentracji licznych potencjałów i problemów oraz konieczność lepszej koordynacji działań na rzecz ich rozwoju, jest przedmiotem szczególnego zainteresowania Unii Europejskiej. Podnoszona potrzeba stworzenia - zarówno na szczeblu krajowym...
-
Polityka regionu na rzecz rozwoju miast - na przykładzie województwa pomorskiego
Publication -
Wpływ parametrów obróbkowych na jakość powierzchni po toczeniu na twardo
PublicationW referacie przedstawiono wyniki analizy powierzchni po toczeniu na twardo, jako alternatywnej dla szlifowania. Przedstawiono wyniki z badań wpływu parametrów obróbkowych na dokładność wymiarowo kształtową ze szczególnym uwzględnieniem uzyskiwanej struktury geometrycznej powierzchni w skali mikro. Do analizy powierzchni wykorzystano profilogramy, krzywe udziału nośnego oraz wybrane parametry chropowatości i falistości powierzchni.
-
Ocena zagrożenia na sieci dróg na podstawie doświadczeń programu EuroRAP
PublicationW artykule przedstawiono syntezę technik stosowanych w ramach programu EuroRAP i innych podobnych, przy ocenie zagrożenia w ruchu drogowym. Przedstawione zostały metody automatyzacji procesu zbierania danych i metodyka klasyfikacji dróg pod kątem bezpieczeństwa
-
Nauczanie na odległość w sektorze MSP na przykładzie projektu MESIMA
PublicationW ostatnich latach warunki, w jakich zmuszone są działać małe i średnie przedsiębiorstwa (MSP) stały się bardzo trudne. W obliczu konkurencji, rosnącej zarówno na globalnych, jak i lokalnych rynkach, przedsiębiorcy zostali zmuszeni do poszukiwania źródeł przewagi konkurencyjnej. Jednym z takich źródeł może być utrzymywanie płynności finansowej przedsiębiorstwa, jako że jedną z największych przeszkód w funkcjonowaniu MSP jest właśnie...
-
Internacjonalizacja przedsiębiorstw na obszarze Euroazjatyckiej Unii Gospodarczej na przykładzie Kazachstanu
PublicationAutorka podjęła badania nad wpływem Euroazjatyckiej Unii Gospodarczej (EUG) na internacjonalizację kazachskich przedsiębiorstw, motywowana aktualnością tematu i brakiem kompleksowych badań w tej dziedzinie. Celem pracy jest analiza wpływu EUG na proces internacjonalizacji firm w Kazachstanie. Rozprawa składa się z czterech rozdziałów, z których pierwsze trzy mają charakter teoretyczny, a czwarty jest empiryczny. W rozdziałach teoretycznych...
-
Systemy finansowania opieki zdrowotnej na świecie na przykładzie wybranych państw
PublicationArtykuł traktuje o sposobach finansowania opieki zdrowotnej w USA, Kanadzie, Republice Federalnej Niemiec i na Ukrainie. Przedstawione zostały cztery różne systemy finansowe, począwszy od systemu opartego na zupełnie prywatnych i dobrowolnych ubezpieczeniach po system typowo budżetowy oparty na finansowaniu z kasy państwowej bez ubezpieczeń indywidualnych.
-
Bezpieczeństwo człowieka na statku w kontekście współczesnych zagrożeń na morzu
PublicationStatek jest zarówno środkiem transportu oraz miejscem pracy i wypoczynku. Współczesne zagrożenia na morzu dotyczą m. in. warunków eksploatacji statku, zagrożenia pożarem oraz zagrożenia atakami piractwa i terroryzmu. Przepisy międzynarodowe, krajowe oraz normy branżowe mają na celu zapewnienie bezpieczeństwa załodze, pasażerom, ładunkom oraz środowisku naturalnemu.
-
Badania odporności na pękanie mieszanek mineralno-asfaltowych na próbkach półwalcowych
PublicationW artykule przedstawiono metodykę badań parametrów mechaniki pękania na próbkach półwalcowych, która jest stosowana na Politechnice Gdańskiej. Przedstawiono również wyniki badań mieszanek mineralno-asfaltowych do warstwy ścieralnej i warstwy wiążącej oraz dokonano klasyfikacji badanych materiałów pod kątem odporności na pękanie.
-
Analiza wpływu zmęczenia kierowców na ryzyko wypadków na drogach krajowych
PublicationPrzedstawiono charakterystykę czynników wpływających na zmęczenie kierowców. Zidentyfikowano przyczyny, okoliczności i konsekwencje wypadków spowodowanych zmęczeniem kierowców. Wykorzystując wyniki badań opracowano model objaśniający intensywność wypadków i ofiar wypadków w zależności od pory doby. Określono poziom względnego ryzyka wypadków w porze nocnej w stosunku do pory dziennej oraz mapę ryzyka wypadków z ofiarami śmiertelnymi...
-
Biblioteka e-pokolenia. Na przykładzie Czytelni na WETI Politechniki Gdańskiej
Publication -
Metoda oceny ryzyka na podstawowej sieci ulic na przykładzie Warszawy
PublicationW artykule przedstawiono wykorzystanie oceny ryzyka do zarządzania bezpieczeństwem infrastruktury drogowej. W pierwszej części przedstawiono uwarunkowania prawne oraz doświadczenia zagraniczne, które były przesłankami do opracowania metody oceny ryzyka na elementach liniowych i punktowych podstawowej sieci dróg miejskich w Warszawie. W drugiej części przedstawiono przyjęte założenia, opis obiektów analizy, okres analizy, specyfikację...
-
Prognozowanie zapotrzebowania na energię elektryczną na etapie projektu wstępnego statku.
PublicationPrzedstawiono metody wyznaczania zapotrzebowania na energię elektryczną na statkach, celem doboru wielkości i ilości źródeł energii elektrycznej. Scharakteryzowano metody dotychczas stosowane oraz zaprezentowano nową metodę analityczno-wskaźnikową pozwalającą na określanie zapotrzebowania na energię wytypowanych grup odbiorników przy znajomości ich mocy zainstalowanych oraz współczynników wykorzystania.
-
DNA modification by 1-nitroacridine derivatives. Comparison of 32P-Postlabeling and restriction enzyme analysis method for the detection of DNA adducts formed by 1-nitroacridines C-1748 and C-857
Publication4-podstawione 1-nitroakrydyny reprezentują nową grupę pochodnych akrydyny, zsyntetyzowanych na Politechnice Gdańskiej. Metoda 32P-postlabellingu wykazała, że pochodne C-1748 i C-857 tworzą od 4-6 adduktów DNA w systemie komórkowym i bezkomórkowym o innym rozkładzie plam chromatograficznych, jednakże niezależnym od zastosowanego systemu aktywacyjnego. Metoda enzymatycznej analizy restrykcyjnej pozwoliła natomiast śledzić kinetykę...
-
Combined spline wavelet decomposition for 3d seafloor imaging from multibeam sonar echoes
PublicationThe paper proposes combined spline-wavelet approach to the raw echoes seaflor imaging from Multibeam Sonar System (MBSS) records. Wavelet representation is closely related to image representation, due to its unique approximations properties. Splines have the best approximation properties among all known wavelets of a given order, so they are best suited for approximating of smooth seafloor surface. Additionaly, wavelet bases have...
-
A cryptic ribosome binding site, false signals in reporter systems and avoidance of protein translation chaos
PublicationThe expression of reporter gene may be induced by activation of cryptic signalling sequences, as we found while constructing the mutS-lacZ fusion gene. We cloned the Escherichia coli lacZ gene encoding beta-galactosidase into a plasmid vector carrying the Thermus thermophilus mutS gene. The clones expected to produce beta-galactosidase as the C-terminal fusion were selected for the complementation of beta-galactosidase activity...