Wyniki wyszukiwania dla: Biochemistry
-
Light-Dependent Protochlorophyllide Oxidoreductase: Phylogeny, Regulation, and Catalytic Properties
Publikacja -
Does morphology of carotid plaque depend on patient's oxidative stress?
Publikacja -
Critical factors for the performance of chip array-based electrical detection of DNA for analysis of pathogenic bacteria
Publikacja -
Detection of DNA Replication Intermediates after Two-Dimensional Agarose Gel Electrophoresis Using a Fluorescein-Labeled Probe
Publikacja -
Gene-based identification of bacterial colonies with an electric chip
Publikacja -
Detection of bacteriophage infection and prophage induction in bacterial cultures by means of electric DNA chips
Publikacja -
A novel cold-active β-D-galactosidase with transglycosylation activity from the Antarctic Arthrobacter sp. 32cB - gene cloning, purification and characterization
PublikacjaA gene encoding a novel β-D-galactosidase from the psychrotolerant Antarctic bacterium Arthrobacter sp. 32cB was isolated, cloned and expressed in Escherichia coli. The active form of recombinant β-D-galactosidase consists of two subunits with a combined molecular weight of approximately 257 kDa. The enzyme's maximum activity towards o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside was determined as occurring at 28 °C and pH 8.0. However, it...
-
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublikacjaAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublikacjaZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Evaluation of solid phase extraction for downstream separation of propane-1,3-diol and butan-1-ol from fermentation broth
PublikacjaGlycerol is mainly a by-product of fat splitting and biodiesel production. This study examined the use of chemically modified silica gels for downstream separation of propane-1,3-diol and butan-1-ol from fermentation broths obtained through the glycerol fermentation process. The developed method was found to be simple and efficient for the isolation and purification of butan-1-ol from the other components in the fermentation mixture....
-
Mapping the Structural and Dynamic Determinants of pH-Sensitive Heparin Binding to Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor
PublikacjaGranulocyte macrophage colony stimulating factor (GMCSF) is an immunomodulatory cytokine that is harnessed as a therapeutic. GMCSF is known to interact with other clinically important molecules, such as heparin, suggesting that endogenous and administered GMCSF has the potential to modulate orthogonal treatment outcomes. Thus, molecular level characterization of GMCSF and its interactions with biologically active compounds is critical...
-
Importance of the combined effects of dissolved oxygen and pH on optimization of nitrogen removal in anammox-enriched granular sludge
PublikacjaThe combined effects of dissolved oxygen (DO) and pH on nitrogen removal were investigated in a laboratory-scale sequencing batch reactor (SBR) with anammox-enriched granular sludge obtained from a nitritation/anammox system. The highest specific nitrogen removal rate (SNRR) (1.1 gN gVSS−1 d−1) was observed under non-aerated conditions, resulting in the nitrogen removal efficiency of 81.6%. Although nitrogen removal was readily...
-
A simple modification to improve the accuracy of methylation-sensitive restriction enzyme quantitative polymerase chain reaction
PublikacjaDNA digestion with endonucleases sensitive to CpG methylation such as HpaII followed by polymerase chain reaction (PCR) quantitation is commonly used in molecular studies as a simple and inexpensive solution for assessment of region-specific DNA methylation. We observed that the results of such analyses were highly overestimated if mock-digested samples were applied as the reference.We determined DNA methylation levels in several...
-
Unusual odd-chain and trans-octadecenoic fatty acids in tissues of feral European beaver (Castor fiber), Eurasian badger (Meles meles) and raccoon dog (Nyctereutes procyonoides).
PublikacjaW lipidach wyizolowanych z różnych partii ciała bobrów, borsuków i jenotów stwierdzono obecność znaczących ilości niezwykłych jak na zwierzęta jednożołądkowe kwasów tłuszczowych - nieparzystowęglowych nasyconych i jednonienasyconych KT (15:0, 17:0, 15:1 i 17:1) oraz (w lipidach tkanek bobra i jenota) oktadecenowych KT konfiguracji trans, w tym kwasu wakcenowego - KT charakterystycznych dla tkanek i mleka przeżuwaczy. Obecność tych...
-
Antibacterial and antioxidant activity of the secondary metabolites from in vitro cultures of alice sundew (drosera aliciae)
PublikacjaRośliny owadożerne (D. aliciae) produkują metabolity wtórne, farmakologicznie czynne substancje. Na wzrost akumulacji tychże substancji w tkankach roślin owadożernych ma wpływ dodatek elicytora. W pracy przedstawiono zarówno optymalizacje warunków hodowli roślin, jak również prawdopodobne mechanizmy działania bakteriobójczego. Końcowego oznaczenia zawartości metabolitów w ekstraktach roślinnych dokonano techniką chromatografii...
-
Gene Expression and Activity Profiling Reveal a Significant Contribution of Exo‐Phosphotransferases to the Extracellular Nucleotides Metabolism in HUVEC Endothelial Cells
Publikacja -
High Quality Independent From a Donor: Human Amniotic Fluid Derived Stem Cells—A Practical Analysis Based on 165 Clinical Cases
Publikacja -
Activity and primary characterization of enzyme from Thermus ruber cells catalyzing conversion of maltose into trehalose
PublikacjaTermofilna bakteria Thermus ruber wytwarza syntazę trehalozy użyteczną do jednoetapowego przekształcania maltozy w trehalozę. Enzym ten wykazuje największą aktywność w temperaturze 65 C przy pH 6,5. Największą wydajność wytwarzania enzymu osiągano podczas hodowli drobnoustroju w temp. 55 stC w podłożu zawierającym 0,5% peptonu,0,1% ekstraktu drożdżowego oraz 0,% maltozy lub skrobi.
-
Intrinsic effects of AM4113, a putative neutral CB1 receptor selective antagonist, on open-field behaviors in rats
PublikacjaW pracy przedstawiono wyniki testów otartego pola na zachowanie szczurów po iniekcji zwierzętom WIN55,21-2 (WIN; 3 mg/kg) agonisty receptora kanabinoidowego CB1R, bądź AM4113 (0.3−5.6 mg/kg) przypuszczalnie neutralnego antagonisty receptora kanabinoidowego CB1R oraz mieszaniny obu związków. W badaniach pod uwagę brano następujące zachowania zwierząt; ilość kwadratów, którą szczury przechodziły na czterech nogach, częstotliwość...
-
Plasma lipidomic profile signature of rheumatoid arthritis versus Lyme arthritis patients
Publikacja -
Functionalized Magnetic Bacterial Cellulose Beads as Carrier for Lecitase® Ultra Immobilization
Publikacja -
Carotenoid binding to proteins: Modeling pigment transport to lipid membranes
Publikacja -
Lipids Composition in Plant Membranes
Publikacja -
Phthalocyanines functionalized with 2-methyl-5-nitro-1H-imidazolylethoxy and 1,4,7-trioxanonyl moieties and the effect of metronidazole substitution on photocytotoxicity
Publikacja -
Antimicrobial and anticancer photodynamic activity of a phthalocyanine photosensitizer with N -methyl morpholiniumethoxy substituents in non-peripheral positions
Publikacja -
Photochemical studies and nanomolar photodynamic activities of phthalocyanines functionalized with 1,4,7-trioxanonyl moieties at their non-peripheral positions
Publikacja -
Cu(II) complexes with peptides from FomA protein containing -His-Xaa-Yaa-Zaa-His and -His-His-motifs. ROS generation and DNA degradation
Publikacja -
Copper(II) complexes with Fusobacterium nucleatum adhesin FadA: Coordination pattern, physicochemical properties and reactivity
Publikacja -
Development of the first internally-quenched fluorescent substrates of human cathepsin C: The application in the enzyme detection in biological samples
Publikacja -
Entrapment of DyP‐type peroxidase from Pseudomonas fluorescens Pf‐5 into Ca‐alginate magnetic beads
Publikacja -
Structural analogues of reactive intermediates as inhibitors of glucosamine-6-phosphate synthase and phosphoglucose isomerase
PublikacjaCentra aktywne izomerazy fosfoglukozowej (PGI) oraz domeny izomerazowej (HPI) syntazy glukozamino-6-fosforanu (GlcN-6-P), wykazują podobieństwo ułożenia przestrzennego kluczowych reszt aminokwasowych, z wyjątkiem reszty Arg272 PGI i reszt Lys603 i Lys485 HPI. Dziesięć pochodnych D-heksitolo-6-P, kwasu 5-fosfoarabonowego i kwasu 6-fosfoglukonowego, strukturalnych analogów cis-enolaminy lub cis-enolanu, przypuszczalnych stanów przejściowych...
-
Expression and intein-mediated purification of novel staphylokinase SakSTAR with reduced immunogenicity and antiplatelet and antithrombin activation
PublikacjaSkonstruowano nową formę stafylokinazy zawierającej na swoim C-końcu domenę pochodzącą z C-konieca ----(KOŃCA)---??? hirudyny. Wprowadzono do sekwencji stafylokinazy sekwencje RGD i DGR, odpowiedzialne za zmniejszenie agregacji płytek krwi (52% do 38%) a tym samym zwiększenie skuteczności działania tego białka jako potencjalnego leku. Otrzymany nowy wariant stafylokinazy posiadał zwiększoną aktywność fibrynolityczną, czego przejawem...
-
Unlocking the biosynthetic potential of Penicillium roqueforti for hyperproduction of the immunosuppressant mycophenolic acid: Gamma radiation mutagenesis and response surface optimization of fermentation medium
Publikacja -
Epigenetic modifications and NF-κB pathway activity in Cu,Zn-SOD-deficient mice
Publikacja -
Antiplasmodial activity of quinones: Roles of aziridinyl substituents and the inhibition of Plasmodium falciparum glutathione reductase
Publikacja -
Quantitative Structure–Activity Relationships in Two-Electron Reduction of Nitroaromatic Compounds by Enterobacter cloacae NAD(P)H:Nitroreductase
Publikacja -
Two-electron reduction of quinones by rat liver NAD(P)H:quinone oxidoreductase: quantitative structure–activity relationships
Publikacja -
Nitrobenzimidazoles as Substrates for DT-Diaphorase and Redox Cycling Compounds: Their Enzymatic Reactions and Cytotoxicity
Publikacja -
Cytotoxicity of RH1 and related aziridinylbenzoquinones: involvement of activation by NAD(P)H:quinone oxidoreductase (NQO1) and oxidative stress
Publikacja -
Flavoenzyme-catalyzed redox cycling of hydroxylamino- and amino metabolites of 2,4,6-trinitrotoluene: implications for their cytotoxicity
Publikacja -
Redox reactions of the FAD-containing apoptosis-inducing factor (AIF) with quinoidal xenobiotics: A mechanistic study
Publikacja -
Quinone- and nitroreductase reactions of Thermotoga maritima peroxiredoxin–nitroreductase hybrid enzyme
Publikacja -
Antiplasmodial Activity of Nitroaromatic and Quinoidal Compounds: Redox Potential vs Inhibition of Erythrocyte Glutathione Reductase
Publikacja -
Two-electron reduction of quinones by Enterobacter cloacae NAD(P)H:nitroreductase: quantitative structure-activity relationships
Publikacja -
Erratum to: Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publikacja -
Blood free Radicals Concentration Determined by Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy and Delayed Cerebral Ischemia Occurrence in Patients with Aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage
Publikacja -
Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publikacja -
Towards plant-mediated chemistry – Au nanoparticles obtained using aqueous extract of Rosa damascena and their biological activity in vitro
Publikacja -
In Vitro Studies on the Relationship Between the Antioxidant Activities of Some Berry Extracts and Their Binding Properties to Serum Albumin
PublikacjaThe aim of this study was to investigate the possibility to use the bioactive components from cape gooseberry (Physalis peruviana), blueberry (Vaccinium corymbosum), and cranberry (Vaccinium macrocarpon) extracts as a novel source against oxidation in food supplementation. The quantitative analysis of bioactive compounds (polyphenols, flavonoids, flavanols, carotenoids, and chlorophyll) was based on radical scavenging spectrophometric assays...
-
Identification of 1H‐indene‐(1, 3, 5, 6)‐tetrol derivatives as potent pancreatic lipase inhibitors using molecular docking and molecular dynamics approach
PublikacjaPancreatic lipase is a potential therapeutic target to treat diet-induced obesity in humans, as obesity-related diseases continue to be a global problem. Despite intensive research on finding potential inhibitors, very few compounds have been introduced to clinical studies. In this work, new chemical scaffold 1H-indene-(1,3,5,6)-tetrol was proposed using knowledge-based approach, and 36 inhibitors were derived by modifying its...