Wyniki wyszukiwania dla: Biochemistry
-
Surface plasmon resonance imaging biosensor for cathepsin G based on a potent inhibitor: Development and applications
Publikacja -
The new fluorogenic substrates of neutrophil proteinase 3 optimized in prime site region
Publikacja -
A new proteinase 3 substrate with improved selectivity over human neutrophil elastase
Publikacja -
A novel cold-active β-D-galactosidase with transglycosylation activity from the Antarctic Arthrobacter sp. 32cB - gene cloning, purification and characterization
PublikacjaA gene encoding a novel β-D-galactosidase from the psychrotolerant Antarctic bacterium Arthrobacter sp. 32cB was isolated, cloned and expressed in Escherichia coli. The active form of recombinant β-D-galactosidase consists of two subunits with a combined molecular weight of approximately 257 kDa. The enzyme's maximum activity towards o-nitrophenyl-β-D-galactopyranoside was determined as occurring at 28 °C and pH 8.0. However, it...
-
Reactions of NO2 with chromium(III) complexes with histamine and pyridoxamine ligands studied by the stopped-flow technique
Publikacja -
Preclusion of irreversible destruction of Dr adhesin structures by a high activation barrier for the unfolding stage of the fimbrial DraE subunit
PublikacjaFimbrie Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli stanowią przykład eksponowanych powierzchniowo struktur adhezyjnych podlegających biogenezie według zakonserwowanego, pośród bakterii Gram-ujemnych, systemu "chaperone-usher" ("białko opiekuńcze-zewnątrzbłonowe białko kanałowe"). Powyższe struktury adhezyjne są niezbędne w procesie specyficznej adhezji bakterii do receptorów zlokalizowanych na powierzchni docelowych komórek gospodarza....
-
Protein transphosphorylation during the mutual interaction between phytochrome a and a nuclear isoform of nucleoside diphosphate kinase is regulated by red light
Publikacja -
The noncanonical disulfide bond as the important stabilizing element of the immunoglobulin fold of the Dr fimbrial DraE subunit
PublikacjaAdhezyny fimbrialne bakterii patogennych stanowią liniowe asocjaty białkowe odpowiedzialne za wiązanie do specyficznych receptorów na powierzchni komórek gospodarza. Biogeneza tych struktur odbywa się przez system sekrecji typu chaperone/usher zakonserwowany pośród bakterii Gram-ujemnych. Powyższe struktury adhezyjne charakteryzują się wysoką odpornością na denaturację i deasocjację, powodowane przez temperaturę lub chemiczne czynniki...
-
Mapping the Structural and Dynamic Determinants of pH-Sensitive Heparin Binding to Granulocyte Macrophage Colony Stimulating Factor
PublikacjaGranulocyte macrophage colony stimulating factor (GMCSF) is an immunomodulatory cytokine that is harnessed as a therapeutic. GMCSF is known to interact with other clinically important molecules, such as heparin, suggesting that endogenous and administered GMCSF has the potential to modulate orthogonal treatment outcomes. Thus, molecular level characterization of GMCSF and its interactions with biologically active compounds is critical...
-
Evaluation of solid phase extraction for downstream separation of propane-1,3-diol and butan-1-ol from fermentation broth
PublikacjaGlycerol is mainly a by-product of fat splitting and biodiesel production. This study examined the use of chemically modified silica gels for downstream separation of propane-1,3-diol and butan-1-ol from fermentation broths obtained through the glycerol fermentation process. The developed method was found to be simple and efficient for the isolation and purification of butan-1-ol from the other components in the fermentation mixture....
-
Increased resonance energy transfer between fluorophores bound to DNA in proximity to metallic silver particles.
PublikacjaZbadano wpływ nanocząstek metalicznego srebra na rezonansowe przekazywanie energii między fluoroforami związanymi z DNA. Donor (pochodna kumaryny) i akceptor (Cy3) umieszczono na przeciwległych końcach DNA o strukturze podwójnej helisy i o 23 parach bazowych. W nieobecności cząstek srebra wydajność przekazywania energii w tym układzie wynosiła ok. 9%, zaś po umieszczeniu go między kwarcowymi płytkami pokrytymi filmem wysepek...
-
Versatile method employing basic techniques of genetic engineering to study the ability of low molecular weight compounds to bind covalently with DNA in cell free systems.
PublikacjaMechanizm działania większości leków przeciwnowotworowych oraz związków rakotwórczych polega na ich kowalencyjnym wiązaniu z DNA. Poziom tego wiązania jest zazwyczaj bardzo niski, co powoduje, że potrzebne są niezwykle czułe metody aby kowalencyjna modyfikacja mogła być w ogóle wykryta. My podjęliśmy próbę zastosowania w tym celu prostych, szybkich i sprawdzonych technik inżynierii genetycznej: metody PCR do uzyskania fragmentu...
-
Unusual odd-chain and trans-octadecenoic fatty acids in tissues of feral European beaver (Castor fiber), Eurasian badger (Meles meles) and raccoon dog (Nyctereutes procyonoides).
PublikacjaW lipidach wyizolowanych z różnych partii ciała bobrów, borsuków i jenotów stwierdzono obecność znaczących ilości niezwykłych jak na zwierzęta jednożołądkowe kwasów tłuszczowych - nieparzystowęglowych nasyconych i jednonienasyconych KT (15:0, 17:0, 15:1 i 17:1) oraz (w lipidach tkanek bobra i jenota) oktadecenowych KT konfiguracji trans, w tym kwasu wakcenowego - KT charakterystycznych dla tkanek i mleka przeżuwaczy. Obecność tych...
-
Epigenetic modifications and NF-κB pathway activity in Cu,Zn-SOD-deficient mice
Publikacja -
Plasma lipidomic profile signature of rheumatoid arthritis versus Lyme arthritis patients
Publikacja -
Molecular basis and potential activity of HIV-1 reverse transcriptase toward trimethylamine-based compounds
PublikacjaReverse transcriptase (RT) inhibitors are currently used to treat human immunodeficiency virus (HIV)-1 infections. In this work, novel triethylamine derivatives were designed and studied by rigid and flexible docking and molecular dynamics (MD) approaches. An apo form of HIV-1 RT was also studied by MD simulation to analyze comparative response of protein in ligand-bound and ligand-unbound forms. Among newly designed HIV-1 RT inhibitors,...
-
Solubilization of keratins and functional properties of their isolates and hydrolysates
PublikacjaThe keratinous wastes of the textile industry and poultry slaughterhouses may be used as sources of soluble keratins or hydrolysates. This review presents methods for processing raw keratin-based materials into bioproducts with functional and bioactive properties suitable for biomedical, cosmetic, food, and agricultural applications. Soluble keratin can be obtained by thermal treatment in some organic solvents, reduction, or oxidation...
-
Functionalized Magnetic Bacterial Cellulose Beads as Carrier for Lecitase® Ultra Immobilization
Publikacja -
Carotenoid binding to proteins: Modeling pigment transport to lipid membranes
Publikacja -
Lipids Composition in Plant Membranes
Publikacja -
Phthalocyanines functionalized with 2-methyl-5-nitro-1H-imidazolylethoxy and 1,4,7-trioxanonyl moieties and the effect of metronidazole substitution on photocytotoxicity
Publikacja -
Antimicrobial and anticancer photodynamic activity of a phthalocyanine photosensitizer with N -methyl morpholiniumethoxy substituents in non-peripheral positions
Publikacja -
Photochemical studies and nanomolar photodynamic activities of phthalocyanines functionalized with 1,4,7-trioxanonyl moieties at their non-peripheral positions
Publikacja -
Antiplasmodial activity of quinones: Roles of aziridinyl substituents and the inhibition of Plasmodium falciparum glutathione reductase
Publikacja -
Quantitative Structure–Activity Relationships in Two-Electron Reduction of Nitroaromatic Compounds by Enterobacter cloacae NAD(P)H:Nitroreductase
Publikacja -
Two-electron reduction of quinones by rat liver NAD(P)H:quinone oxidoreductase: quantitative structure–activity relationships
Publikacja -
Nitrobenzimidazoles as Substrates for DT-Diaphorase and Redox Cycling Compounds: Their Enzymatic Reactions and Cytotoxicity
Publikacja -
Cytotoxicity of RH1 and related aziridinylbenzoquinones: involvement of activation by NAD(P)H:quinone oxidoreductase (NQO1) and oxidative stress
Publikacja -
Flavoenzyme-catalyzed redox cycling of hydroxylamino- and amino metabolites of 2,4,6-trinitrotoluene: implications for their cytotoxicity
Publikacja -
Redox reactions of the FAD-containing apoptosis-inducing factor (AIF) with quinoidal xenobiotics: A mechanistic study
Publikacja -
Quinone- and nitroreductase reactions of Thermotoga maritima peroxiredoxin–nitroreductase hybrid enzyme
Publikacja -
Antiplasmodial Activity of Nitroaromatic and Quinoidal Compounds: Redox Potential vs Inhibition of Erythrocyte Glutathione Reductase
Publikacja -
Two-electron reduction of quinones by Enterobacter cloacae NAD(P)H:nitroreductase: quantitative structure-activity relationships
Publikacja -
Erratum to: Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publikacja -
Blood free Radicals Concentration Determined by Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy and Delayed Cerebral Ischemia Occurrence in Patients with Aneurysmal Subarachnoid Hemorrhage
Publikacja -
Effects of flavonoids on expression of genes involved in cell cycle regulation and DNA replication in human fibroblasts
Publikacja -
Towards plant-mediated chemistry – Au nanoparticles obtained using aqueous extract of Rosa damascena and their biological activity in vitro
Publikacja -
Development of the first internally-quenched fluorescent substrates of human cathepsin C: The application in the enzyme detection in biological samples
Publikacja -
Entrapment of DyP‐type peroxidase from Pseudomonas fluorescens Pf‐5 into Ca‐alginate magnetic beads
Publikacja -
Silicon nanoparticles enhanced the growth and reduced the cadmium accumulation in grains of wheat (Triticum aestivum L.)
Publikacja -
Beta-galactosidase activity of Meiothermus ruber cells
PublikacjaFreeze-dried cells of Meiothermus ruber catalyses cleavage of o-nitrophenyl-b-D-galactopiranoside (oNPb-gal) and conversion of lactose into glucose and galactose. The permeabilization with 2%toluene,20%ethanol and 20%acetone increased enzymatic activity from 74.87 U/g of lyophilized cells up to 129.44,114.38 and 90.19 U/g,respectively. Ethanol was an effective permeabilizing agent and its efficiency was dependent on the concentration,...
-
In Vitro Studies on the Relationship Between the Antioxidant Activities of Some Berry Extracts and Their Binding Properties to Serum Albumin
PublikacjaThe aim of this study was to investigate the possibility to use the bioactive components from cape gooseberry (Physalis peruviana), blueberry (Vaccinium corymbosum), and cranberry (Vaccinium macrocarpon) extracts as a novel source against oxidation in food supplementation. The quantitative analysis of bioactive compounds (polyphenols, flavonoids, flavanols, carotenoids, and chlorophyll) was based on radical scavenging spectrophometric assays...
-
Antibacterial and antioxidant activity of the secondary metabolites from in vitro cultures of alice sundew (drosera aliciae)
PublikacjaRośliny owadożerne (D. aliciae) produkują metabolity wtórne, farmakologicznie czynne substancje. Na wzrost akumulacji tychże substancji w tkankach roślin owadożernych ma wpływ dodatek elicytora. W pracy przedstawiono zarówno optymalizacje warunków hodowli roślin, jak również prawdopodobne mechanizmy działania bakteriobójczego. Końcowego oznaczenia zawartości metabolitów w ekstraktach roślinnych dokonano techniką chromatografii...
-
Manganese(II) tri-tert-butoxysilanethiolate complexes with imidazole based coligands. A neutral complex with four independent ligands and MNOS2 core (M=Mn) related to the liver alcohol dehydrogenase catalytic center (M=Zn)
PublikacjaReakcja silanotiolanu manganu(II) z imidazolem oraz dwiema jego metylowymi pochodnymi prowadzi do uzyskania kompleksów heteroleptycznych o różnym typie. Gdy do syntez wykorzystano 2-metyloimidazol uzyskano związek zawierający w komórce elementarnej dwie różniące się od siebie cząsteczki, powiązane wiązaniami wodorowymi typu N-H…S. W jednej z tych molekuł centralny atom manganu jest skoordynowany z czterema ligandami: dwoma podstawnikami...
-
Expression and intein-mediated purification of novel staphylokinase SakSTAR with reduced immunogenicity and antiplatelet and antithrombin activation
PublikacjaSkonstruowano nową formę stafylokinazy zawierającej na swoim C-końcu domenę pochodzącą z C-konieca ----(KOŃCA)---??? hirudyny. Wprowadzono do sekwencji stafylokinazy sekwencje RGD i DGR, odpowiedzialne za zmniejszenie agregacji płytek krwi (52% do 38%) a tym samym zwiększenie skuteczności działania tego białka jako potencjalnego leku. Otrzymany nowy wariant stafylokinazy posiadał zwiększoną aktywność fibrynolityczną, czego przejawem...
-
Efficient production of Staphylococcus simulans lysostaphin in a benchtop bioreactor by recombinant Escherichia coli.
PublikacjaLysostaphin is an enzyme with bactericidal activity against Staphylococcus aureus and other staphylococcal species. In spite of many advantages and promising results of preliminary research, the enzyme is still not widely used in medicine, veterinary or as a food preservative. One of the most important factors limiting application of the enzyme in clinical or technological practice is the high costs of its production. In the present...
-
Cu(II) complexes with peptides from FomA protein containing -His-Xaa-Yaa-Zaa-His and -His-His-motifs. ROS generation and DNA degradation
Publikacja -
Copper(II) complexes with Fusobacterium nucleatum adhesin FadA: Coordination pattern, physicochemical properties and reactivity
Publikacja -
Unlocking the biosynthetic potential of Penicillium roqueforti for hyperproduction of the immunosuppressant mycophenolic acid: Gamma radiation mutagenesis and response surface optimization of fermentation medium
Publikacja -
Structure, physicochemical and biological properties of new complex salt of aqua-(nitrilotriacetato-N,O,O′,O″)-oxidovanadium(IV) anion with 1,10-phenanthrolinium cation
Publikacja