Wyniki wyszukiwania dla: SEKWENCJE GENÓW
-
Rola polimorfizmu i zróżnicowanej ekspresji genów cytochromu P450 w metabolizmie ksenobiotyków.
PublikacjaZdolność do metabolizmu ksenobiotyków przez cytochromy P450 (CYP) określona jest przez polimorfizm i poziom ekspresji genów tych białek. Najwięcej, 40 odmian polimorficznych o zróżnicowanej aktywności enzymatycznej, poznano dla CYP2D6, natomiast tylko dwie w przypadku CYP2C9, których obecność powoduje zahamowanie metabolizmu wielu leków. Z kolei polimorfizm genu CYP3A4 nie miał istotnego wpływu na aktywność metaboliczną jego produktu...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł dopasowań
PublikacjaBiologia molekularna jest obecnie bardzo dynamicznie rozwijającą się dziedziną nauki. Wzrost mocy obliczeniowej komputerów pozwala na coraz szybszą i dokładniejszą analizę wielocząsteczkowych biologicznych polimerów. Poniższy artykuł przedstawia jeden z modułów programu AlignGator - modułowego systemu przeznaczonego do analizy DNA. Omawiany moduł pozwala na tworzenie, oraz edycję wielodopasowań. W początkowej części artykułu opisane...
-
Identyfikacja sekwencji markerowych w mikologicznej diagnostyce molekularnej
PublikacjaProcedury diagnostyki mikologicznej coraz częściej wykorzystują metody molekularne, oparte na analizie kwasów nukleinowych. Pozwala to na skrócenie czasu analizy oraz polepszenie wielu innych, istotnych dla procesu diagnostycznego parametrów takich jak: czułość, powtarzalność, specyficzność oraz potencjał różnicujący. Istotnym etapem przy projektowaniu układów do diagnostyki molekularnej grzybów jest wybór celu molekularnego. Powszechnie...
-
Aplikacja wspomagająca przetwarzanie sekwencji dna: moduł edycji chromatogramu
PublikacjaModuł edycji chromatogramu jest częścią większej aplikacji, służącej do wspomagania przetwarzania danych pochodzących z sekwencjonowania DNA. Aplikacja skonstruowana jest z odrębnych, samodzielnych programów, które współpracują dwiema drogami - poprzez popularne formaty plików, co umożliwia wprowadzenie do modułów danych opracowanych częściowo w aplikacjach zewnętrznych, oraz poprzez przesyłanie danych pomiędzy modułami, co usprawnia...
-
Dopasowanie obrazów podczerwieni przy pomocy sekwencji obrazów widzialnych
Publikacja -
Sekwencyjne algorytmy antypodalnego kolorowania radiowego grafów.
PublikacjaPraca zawiera charakterystykę suboptymalnych algorytmów antypodalnego kolorowania grafów, stanowiących adaptację algorytmów sekwencyjnych S, SL, LF stosowanych przy klasycznym kolorowaniu grafów. Dla tych algorytmów wskazano grafy dość trudne i trudne do pokolorowania (HC i SHC). Porównano ich funkcję dobroci i rozpiętości uzyskiwanych pokolorowań dla grafów o różnej gęstości krawędziowej.
-
Analiza PCA sekwencji aktywnej termografii dynamicznej w diagnostyce oparzeń
PublikacjaCelem niniejszej pracy jest analiza metod przetwarzania obrazów opartych na analizie składowychgłównych oraz analizie składowych niezależnych, które pozwola na uzyskanie nowych informacji obadanym obiekcie. W ramach pracy powstało oprogramowanie, które pozwala na analizezarejestrowanych sekwencji termograficznych metoda składowych głównych - Principal ComponentAnalysis - PCA. Została przeprowadzona weryfikacja działania powyższych...
-
Analiza PCA sekwencji aktywnej termografii dynamicznej w diagnostyce oparzeń
Publikacja -
Regulacja topologii DNA przez topoizomerazę typu II, czyli jak struktura DNA wpływa na funkcjonowanie genów
PublikacjaW wielu ważnych procesach jakie zachodzą w komórce zmienia się topologia DNA i struktura chromatyny. Enzym, topoizomeraza typu II, jest jednym z ważnych czynników, który reguluje zmiany topologiczne i strukturalne w jądrze, przez co ma bezpośredni lub pośredni wpływ na takie procesy jak uporządkowanie struktury chromatyny poprzez wiązanie pętli chromatyny do szkieletu jądrowego, transkrypcję i replikację DNA, reperację uszkodzeń...
-
przyrostowa metoda budowy hierarchicznej sieci neuronowej dla przewidywania sekwencji znakowych
PublikacjaZaprezentowano sposób wykorzystania hierarchicznej, opartej na przewidywaniu sieci neuronowej do nauki (bez nadzoru) oraz rozpoznawania sekwencji znaków w wejściowym strumieniu tekstu. Dla powyższej struktury zaproponowano algorytm jej przyrostowej rozbudowy w miarę zapamiętywania sekwencji pozwalający na optymalizację procesu uczenia oraz ograniczenie wymagań pamięciowych prezentowanego rozwiązania. Wskazano również jej możliwe...
-
Pakiet oprogramowania do obróbki sekwencji termograficznych w aktywnej termografii dynamicznej
Publikacja.
-
Analiza dokładności pomiarów pulsu na podstawie zarejestrowanej sekwencji wideo obszaru twarzy
PublikacjaZa pomocą prostej kamery internetowej zarejestrowano sekwencje wideo obszaru twarzy, równolegle wykonując pomiar EKG. Sekwencje wideo poszczególnych składowych (R,G,B) uśredniono w następujących obszarach: całej twarzy, czoła oraz policzków uzyskując w ten sposób dla każdego z kanałów RGB serie czasowe odpowiadające wybranym obszarom twarzy. Aby usunąć zakłócenia związane m.in. z oddechem i ruchem zastosowano filtr pasmowy (FIR)....
-
Wpływ sekwencji złóż na efektywność usuwania zanieczyszczeń w hybrydowych systemach hydrofitowych
PublikacjaHybrydowe Systemy Hydrofitowe (HSH) to obiekty złożone z co najmniej dwóch złóż o zmiennym pionowym i poziomym przepływie ścieków. Dotychczas stosowano dwa rodzaje konfiguracji hybrydowych systemów hydrofitowych: z poziomym względnie pionowym złożem usytuowanym na początku biologicznego oczyszczania. W Polsce eksploatowane są tylko systemy HSH ze złożem poziomym na początku a potem ze złożem pionowym. W Europie również są popularne...
-
Charakterystyka genetyczna szczepów Klebsiella pneumoniae izolowanych od pacjentów po przeszczepieniu nerki oraz badanie wpływu leków immunosupresyjnych na ekspresję genów bakteryjnych
PublikacjaBakterie z gatunku Klebsiella pneumoniae należą do oportunistycznych patogenów odpowiedzialnych za zakażenia szpitalne. Drobnoustroje te wykazują skłonność do oporności wielolekowej i wysokiej wirulencji, co stanowi poważne zagrożenie dla pacjentów nieimmunokompetentnych. Wśród pacjentów po transplantacji nerki zakażenia układu moczowego (ZUM) stanowią najczęstszą przyczynę powikłań infekcyjnych. Mechanizmy molekularne leżące u...
-
Port knocking - alternatywne rozwiązania
PublikacjaOmówiono techniki pukania w porty (ang. Port Knocking). Zaproponowano nowe wersje mechanizmu oparte o wykonanie sekwencji puknięć wieloma pakietami w jeden port: pukanie pakietami o różnej długości, przy czym długości te stanowiłyby sekwencję kodową, oraz pukanie, w którym sekwencją kodową są odcinki czasu pomiędzy pojawianiem się na porcie kolejnych pakietów. Rozważono możliwości zastosowania tego typu port knockingu i zaproponowano...
-
Występowanie oraz polimorfizm genów kodujących syntezę autotransporterów proteaz serynowych (SPATE) wśród bakterii Escherichia coli wywołujących biegunki u dzieci w regionie Gdańska
PublikacjaW grupie 96 szczepów bakterii Escherichia coli wyizolowanych w rejonie Gdańska od dzieci z biegunką zbadano obecność oraz polimorfizm sekwencji genów kodujących grupę białek o wspólnej nazwie: SPATE (Serine Protease Autotransporters of Enterobacteriaceae). Za pomocą analizy restrykcyjnej zidentyfikowano 8 różnych genów kodujących białka z tej grupy. Obecność jednego genu stwierdzono w 39 szczepach, w 15 szczepach występowały dwa,...
-
Molecular typing of Staphylococcus aureus isolated from cows with mastitis in the east of Poland on the basis of polymorphism of genes coding protein A and coagulase
PublikacjaPolimorfizm genów kodujących białko A i koagulazę wykorzystano do badania zmienności genetycznej bakterii Staphylococcus aureus wyizolowanych z gruczołów mlekowych krów u których stwierdzono stan zapalny. W badanej grupie 82 szczepów wyróżniono 24 genotypy.
-
Wpływ wyboru elementu strukturalnego użytego w przetwarzaniu morfologicznym na skuteczność nowej metody usuwania tła z sekwencji MRI
PublikacjaZaprezentowano nową metodę usuwania zaszumionego tła z sekwencji skanów MRI. Na każdy skan składają się dwa obszary: przekrój mózgu i tło, oba zawierające szum. Tło powinno być odseparowane i wykluczone z dalszej analizy. Cel ten został osiągnięty dzięki zastosowaniu opisanego algorytmu, aplikującego podstawowe operacje morfologiczne: dylację, erozję, otwarcie i zamknięcie do uprzednio zbinaryzowanych zbiorów MRI. Pokazano rezultaty...
-
Projektowanie strategii frezowania złożonych kieszeni w komponentach mechanicznych
PublikacjaPrzedstawiono metody wyznaczania optymalnych sekwencji narzędziowych w projektowaniu strategii frezowania złożonych kieszeni przy wykorzystaniu określonego zestawu narzędziowego. W doborze sekwencji dopuszczalnych uwzględniano eliminację sekwencji nieefektywnych. Alternatywne sekwencje narzędziowe modelowano w postaci ważonych grafów acyklicznych dla generowanych wariantów ścieżek kolejnych narzędzi, dokonując ich oceny kosztowej.
-
Comparative studies of the Acinetobacter genus and the species identification method based on the recA sequences
PublikacjaZaproponowano metodę genotypowania bakterii rodzaju Acinetobacter, opartą o analizę sekwencji genów recA, amplifikację fragmentów genu recA i analizę profili fragmentów restrykcyjnych po cięciu produktów reakcji PCR enzymami restrykcyjnymi (recA PCR/RFLP). Profile RFLP otrzymane za pomocą enzymu Tsp509I są użyteczne w identyfikacji poszczególnych gatunków bakterii rodzaju Acinetobacter. Na podstawie analizy otrzymanych sekwencji...