Filters
total: 1453
filtered: 1229
-
Catalog
- Publications 1229 available results
- Journals 12 available results
- Conferences 1 available results
- People 49 available results
- Inventions 13 available results
- Projects 18 available results
- Laboratories 1 available results
- Research Teams 8 available results
- e-Learning Courses 43 available results
- Events 1 available results
- Open Research Data 78 available results
Chosen catalog filters
displaying 1000 best results Help
Search results for: ODDZIAŁYWANIA FIZYKOCHEMICZNE Z DNA
-
Taq DNA polymerase fused with DNA binding protein with increased resistance to inhibitors from clinical samples
PublicationNowadays PCR method is commonly used in molecular diagnostic. However, in many cases PCR is limited, by the presence of inhibitory substances in biological, soil or food samples Efficiency and fidelity of amplification is strongly connected with DNA polymerase and reaction conditions. To meet the requirements of modern diagnostic methods it is essential to seeking for new DNA polymerases with better properties useful in these field....
-
Viability of decisional DNA in robotics
PublicationThe Decisional DNA is an artificial intelligence system that uses prior experiences to shape future decisions. Decisional DNA is written in the Set Of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and is capable of capturing and reusing a broad range of data. Decisional DNA has been implemented in several fields including Alzheimer’s diagnosis, geothermal energy and smart TV. Decisional DNA is well suited to use in robotics due to the...
-
Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting
PublicationPCR has become an essential tool in biological science. However, researchers often encounter problems with difficult targets, inhibitors accompanying the samples, or PCR trouble related to DNA polymerase. Therefore, PCR optimization is necessary to obtain better results. One solution is using modified DNA polymerases with desirable properties for the experiments. In this article, PCR troubleshooting, depending on the DNA polymerase...
-
Ocena wpływu pokarmowych kwasów nukleinowych i ich komponentów na replikacyjną i naprawczą syntezę DNA w modelach komórek ludzkiego układu pokarmowego
PublicationKwasy nukleinowe, do których należą DNA i RNA, są podstawowymi elementami każdej komórki niezbędnymi do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Pomimo, że cząsteczki te stanowią również nieodłączne składniki produktów żywnościowych spożywanych przez człowieka, to badania na temat ich zawartości w żywności oraz wartości odżywczej są ograniczone. Wyniki uzyskane w niniejszej pracy doktorskiej pokazały istotne różnice w ilości, wielkości...
-
Fusion of Taq DNA polymerase with single-stranded DNA binding-like protein of Nanoarchaeum equitans—Expression and characterization
PublicationDNA polymerases are present in all organisms and are important enzymes that synthesise DNA molecules. They are used in various fields of science, predominantly as essential components for in vitro DNA syntheses, known as PCR. Modern diagnostics, molecular biology and genetic engineering need DNA polymerases which demonstrate improved performance. This study was aimed at obtaining a new NeqSSB-TaqS fusion DNA polymerase from the...
-
Wpływ niszczącego oddziaływania wody i mrozu na trwałość zmęczeniową betonu asfaltowego
PublicationArtykuł przedstawia badania zmęczeniowe betonu asfaltowego poddanego niszczącemu oddziaływaniu wody i mrozu. Laboratoryjną symulację oddziaływania wody i mrozu oparto na oryginalnej i zmodyfikowanej procedurze normy AASHTO T283. Modyfikacja procedury polegała na wprowadzeniu zamiast 1 cyklu zamrażania i odmrażania 50 i 150 cykli. Badania zmęczeniowe betonu asfaltowego wykonano w aparacie NAT w schemacie pośredniego rozciągania....
-
Adding Interpretability to Neural Knowledge DNA
PublicationThis paper proposes a novel approach that adds the interpretability to Neural Knowledge DNA (NK-DNA) via generating a decision tree. The NK-DNA is a promising knowledge representation approach for acquiring, storing, sharing, and reusing knowledge among machines and computing systems. We introduce the decision tree-based generative method for knowledge extraction and representation to make the NK-DNA more explainable. We examine...
-
Pieszy na kładkach, formy oddziaływania
PublicationPraca zawiera syntezę badań eksperymentalnych i teoretycznych dotyczących dynamiki mostów dla pieszych.Na tle dotychczasowego dorobku naukowego przedstawiony jest wkład autora w określenie obciążeń jakie pieszy przekazuje na przęsło. Dzięki przeprowadzonym badaniom określił nieliniową funkcję obciążenia pochodzącego od idącego człowieka. Korzysrając z doświadczenia zdobytego w badaniu pieszych na drgaacym podłożu autor dokonał...
-
Analiza niszczącego oddziaływania wody i mrozu na mieszanki mineralno-asfaltowe.
PublicationNiniejsza praca doktorska dotyczy zniszczeń nawierzchni asfaltowych powodowanych oddziaływaniem wody oraz łącznie wody i mrozu. Woda i mróz wpływa na osłabienie kohezji mieszanki i adhezji asfaltu do kruszywa, dąży do odmycia otoczki asfaltu z powierzchni kruszywa, prowadząc do obniżenia wytrzymałości mieszanki i degradacji nawierzchni.Na podstawie studiów literatury autor przedstawił istotę adhezji asfaltu do kruszywa, teorie...
-
Dual inhibition of PI3K/Akt signaling and the DNA damage checkpoint in p53-deficient cells with strong survival signaling: implications for cancer therapy
PublicationOporność komórek nowotworowych na leki uszkadzjące DNA związana jest ściśle ze zdolnością do utrzymywania blok z fazie G2 cyklu komórkowego. Blok ten regulowany jest przez mechanizmy punktu kontrolnego G2/M oraz szlaki przeżycia komórkowego. W pracy badaliśmy rolę szlaku kinazy PI3K/Akt w funkcjonowaniu punktu kontrolnego cyklu komórkowego i wpływ na przeżycie komórek traktowanych lekiem przeciwnowotworowym - cisplatyną. Nasze...
-
Regulacja topologii DNA przez topoizomerazę typu II, czyli jak struktura DNA wpływa na funkcjonowanie genów
PublicationW wielu ważnych procesach jakie zachodzą w komórce zmienia się topologia DNA i struktura chromatyny. Enzym, topoizomeraza typu II, jest jednym z ważnych czynników, który reguluje zmiany topologiczne i strukturalne w jądrze, przez co ma bezpośredni lub pośredni wpływ na takie procesy jak uporządkowanie struktury chromatyny poprzez wiązanie pętli chromatyny do szkieletu jądrowego, transkrypcję i replikację DNA, reperację uszkodzeń...
-
Badania fizykochemiczne bursztynu bałtyckiego na terenie Gdańska – wczoraj i dziś
PublicationPrzedstawiono zarys badań nad bursztynem bałtyckim z uwzględnieniem szczególnej roli Gdańska w tym obszarze.
-
The development of Decisional DNA digital TV
PublicationZaproponowano koncepcje opartej na wiedzy i doswiadczeniu telewizji cyfrowej z wbudowanym decyzyjnym DNA.
-
Gentiana asclepiadea exerts antioxidant activity and enhances DNA repair of hydrogen peroxide- and silver nanoparticles-induced DNA damage
PublicationExposure to high levels of different environmental pollutants is known to be associated with induction of DNA damage in humans. Thus DNA repair is of great importance in preventing mutations and contributes crucially to the prevention of cancer. In our study we have focused on quantitative analysis of Gentiana asclepiadea aqueous or methanolic extracts obtained from flower and haulm, their antioxidant potency in ABTS post-column...
-
Decisional DNA applied to digital TV
PublicationPrzedstawiono nowoczesną koncepcje integracji decyzyjnego DNA z telewizją cyfrową w celu pozyskiwania wiedzy o oglądalności poszczególnych programów.
-
Fusion of DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase with TaqStoffel DNA polymerase as a useful tool in PCR with difficult targets
PublicationThe DNA coding sequence of TaqStoffel polymer- ase was fused with the DNA-binding domain of Pyrococcus furiosus ligase. The resulting novel recombinant gene was cloned and expressed in E. coli. The recombinant enzyme was purified and its enzymatic features were studied. The fusion protein (PfuDBDlig-TaqS) was found to have enhanced processivity as a result of the conversion of the Taq DNA polymerase from a relatively low processive...
-
Testing the usability of decisional DNA in robotics
PublicationW pracy poddano dyskusji i nalizie obszary mozliwych zastowac reprezentacji wiedzy zwanej Decisional DNA w zagadnieniach zwiazanych z robotyka.
-
Preparation of DNA films for studies under vacuum conditions
PublicationExperiments were carried out to determine the optimum conditions required for the preparation of uniform films of supercoiled plasmid DNA to be used in irradiation experiments under high vacuum conditions. Investigations reveal that significant damage to the DNA molecules occurs due to the evacuation process when films were formed from DNA samples in ultra high purity water only. A variety of bases were tested for their possible...
-
Thermodynamics aspects of interactions between acridine derivatives and DNA
PublicationDNA is a molecular target for many anticancer and antiviral drugs. Therefore, a clear understanding of the interaction of small molecules with DNA is important in the rational design of ligands that can bind to DNA with high affinity and selectivity. There are several methods to investigate interactions between drug and DNA. Some of them measure changing into DNA structures, such as lengthening and untwisting of helix of DNA. Other...
-
Ład przestrzenny w procesach rozwojowych - metoda oceny oddziaływania na środowisko
PublicationReferat prezentuje cele, zakres, zasady i efekty edukacji w zakresie ocen oddziaływania na środowisko (OOŚ) dla architektów, urbanistów i planistów przestrzennych. Przedmiot ten, wzbogacający ofertę kształcenia, prowadzony jest od kilku lat na Wydziale Architektury Politechniki Gdańskiej. Celem zajęć jest zaprezentowanie OOŚ (części systemu ocen środowiskowych) jako narzędzia wspomagającego system planowania przestrzennego i stwarzającego...
-
Early models of DNA damage formation
PublicationPrzeanalizowano jedne z pierwszych modeli opisujących uszkodzenia nici DNA. Przeanalizowano uszkodzenia powstające w pojedynczych i podwójnych niciach, pod wpływem czynników fizycznych i chemicznych.
-
Isoform-specific inhibition of DNA topoisomerase II as the mechanism of action of novel anticancer agent C-1305
Publication -
Ocena oddziaływania na krajobraz obwodnicy Augustowa [analiza planu zagospodarowania przestrzennego -
PublicationPrzedmiotem oceny oddziaływania na krajobraz była planowana obwodnica Augustowa przecinająca Dolinę Rospudy. Ocenie podlegały cztery warianty trasy, wraz z podwariantami. Studia różnego rodzaju objęły:1. zebranie materiałów wyjściowych (materiały archiwalne z różnych urzędów i instytucji, opracowania branżowe udostępnione w ramach projektu, studia literaturowe, materiały własne)2. określenie uwarunkowań planistycznych dotyczących...
-
Toward Intelligent Recommendations Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper we propose a novel recommendation approach using past news click data and the Neural Knowledge DNA (NK-DNA). The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation method designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing systems. We examine our approach for news recommendation tasks on the MIND benchmark dataset. By taking advantages of NK-DNA, deep...
-
An insight into the mixed quantum mechanical-molecular dynamics simulation of a ZnII-Curcumin complex with a chosen DNA sequence that supports experimental DNA binding investigations
PublicationAn important aspect of research pertaining to Curcumin (HCur) is the need to arrest its degradation in aqueous solution and in biological milieu. This may be achieved through complex formation with metal ions. For this reason, a complex of HCur was prepared with ZnII, that is not likely to be active in redox pathways, minimizing further complications. The complex is monomeric, tetrahedral, with one HCur, an acetate and a molecule...
-
The Decisional DNA-Based Smart Bike for Internet of Things
PublicationIn this paper, we introduce a novel application of the Internet of Things, the Decisional DNAbased Smart Bike. The Decisional DNA is a domain-independent, flexible and standard knowledge representation structure; it allows its domains to acquire and store experiential knowledge and formal decision events in an explicit way. By using Decisional DNA, the sensor-equipped bicycle is able to learn its user’s weight, riding habits, etc....
-
Measuring the density of DNA films using ultraviolet-visible interferometry
PublicationIn order to determine a proper value for the density of dry DNA films we have used a method based upon the measurement of interference effects in transmission spectra of thin DNA layers. Our results show that the methodology is effective and the density of DNA in this state, 1.407 g/cm3, is much lower than the commonly used 1.7 g/cm3. Obtaining accurate values for the DNA film density will allow the optical constants for DNA to...
-
Ciecze jonowe w technikach mikroekstrakcyjnych - cz. I. Struktura i właściwości fizykochemiczne
PublicationCiecze jonowe stanowią bradzo rozbudowaną grupę substancji, cechującą się ogromnym potencjałem zastosowania w różnych dziedzinach chemii.
-
Badanie i porównanie zdolności wybranych leków i związków przeciwnowotworowych do międzyłańcuchowego sieciowania DNA mitochondrialnego i jądrowego w komórkach nowotworowych
PublicationCelem pracy było zbadanie zdolności przeciwnowotworowych związków do indukowania międzyłańcuchowych wiązań sieciujących DNA mitochondrialne w ludzkich komórkach nowotworowych oraz porównanie ze zdolnością do sieciowania DNA jądrowego. Pochodna 4-metylo-1-nitroakrydyny C-1748, Ledakrin i mitomycyna C wykazują zdolność do sieciowania mtDNA i jDNA w komórkach raka okrężnicy HCT-8 w sposób zależny od dawki; C-1748 w komórkach raka...
-
A case study of constructing decisional DNA on finanse
PublicationPrzedstawiono koncepcję i rozwiązanie analityczne opisu rynku finansowego przy pomocy reprezentacji wiedzy zwanej ''decyzyjne DNA''.
-
Problem of aggregation in dye-DNA interaction, calorimetry studies
PublicationNucleic acids are the biological target for many antimicrobial, antitumor and antiviral drugs. Ligand-DNA interactions can be classified into two major categories: 1. covalent binding, which can provide to intermolecular adducts, 2. physico-chemical interactions, which can be divided into intercalation (e.g. adriamycin) or groove binding (e.g. dystamycin). There are several methods to investigate interactions between drug and DNA....
-
Decisional DNA and Optimization Problem
PublicationMany researchers have proved that Decisional DNA (DDNA) and Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS or SOE) is a technology capable of gathering information and converting it into knowledge to help decision-makers to make precise decisions in many ways. These techniques have a feature to combine with different tools, such as data mining techniques and web crawlers, helping organization collect information from different sources...
-
Decisional DNA: the concept and its implementation platforms
PublicationOmowiono kopncepcje zarzadzania wiedza oparta na decyzyjnym DNA gdzie wiedza jest reprezentowana poprzez zbiory doswiadczen. Przedstawiono obecne oraz przyszle zastosowania omawianej koncepcji.
-
Metylacja DNA w rozwoju, diagnostyce i terapii nowotworów
PublicationDotychczas kowalencyjna modyfikacja DNA, jaką jest zarówno naturalna metylacja DNA, jak i addukty DNA egzogennych niskocząsteczkowych związków chemicznych, były ropatrywane z punktu widzenia genomu. W świetle obecnej wiedzy dotyczącej epigenomu można sądzić, że stosunkowo niewielkie modyfikacje czy to w postaci metylacji cytozyny, czy adduktu DNA mogą mieć znaczący wpływ na działanie komórki, a co za tym idzie także jej transformację...
-
Therapeutic intervention by the simultaneous inhibition of DNA repair and type I or type II DNA topoisomerases: one strategy, many outcomes
PublicationMany anticancer drugs reduce the integrity of DNA, forming strand breaks. This can cause mutations and cancer or cell death if the lesions are not repaired. Interestingly, DNA repair-deficient cancer cells (e.g., those with BRCA1/2 mutations) have been shown to exhibit increased sensitivity to chemotherapy. Based on this observation, a new therapeutic approach termed 'synthetic lethality' has been developed, in which radiation...
-
Framework for Product Innovation Using SOEKS and Decisional DNA
PublicationProduct innovation always requires a foundation based on both knowledge and experience. The production and innovation process of products is very similar to the evolution process of humans. The genetic information of humans is stored in genes, chromosomes and DNA. Similarly, the information about the products can be stored in a system having virtual genes, chromosomes and decisional DNA. The present paper proposes a framework for...
-
Wykorzystanie wyników badań składu wód atmosferycznych orazpowierzchniowych do oceny oddziaływania transportu drogowegona środowisko
PublicationZasadniczym celem pracy doktorskiej było określenie poziomu stężeń szeregu toksycznych składników śladowych obecnych w próbkach opadów atmosferycznych i wód spływnych oraz powierzchniowych zbieranych na terenie miejskim (centrum Gdańska) oraz na obszarze zlokalizowanym w zasięgu oddziaływania arterii komunikacyjnej o wysokim natężeniu ruchu pojazdów mechanicznych (Obwodnica Trójmiejska). Założeniem wykonanych badań było: (1) opracowanie...
-
Application of decisional DNA in web data mining
PublicationPrzedstawiono pilotową koncepcję i aplikację integracji reprezentacji wiedzy opartej na decyzyjnym DNA oraz systemów pozyskiwania wiedzy i danych z Internetu. Wskazano na zalety proponowanej integracji oraz przedstawiono kierunki przyszłych badań w tym zakresie.
-
Adding Intelligence to Cars Using the Neural Knowledge DNA
PublicationIn this paper we propose a Neural Knowledge DNA based framework that is capable of learning from the car’s daily operation. The Neural Knowledge DNA is a novel knowledge representation and reasoning approach designed to support discovering, storing, reusing, improving, and sharing knowledge among machines and computing devices. We examine our framework for drivers' classification based on their driving behaviour. The experimental...
-
Decisional DNA based embedded systems: a new perspective
PublicationOmówiono nowe kierunki i perspektywy badań w zakresie systemów podporządkowanych opartych na decyzyjnym DNA.
-
Decisional DNA digitral TV: concept and initial experiments
PublicationPrzedstawiono pierwsze wyniki eksperymentalnej integracji telewizji cyfrowej z decyzyjnym DNA reprezentujacym wiedze o odbiorcy programow.
-
Wpływ równości nawierzchni i dynamicznego oddziaływania pojazdów ciężkich na trwałość zmęczeniową nawierzchni podatnych
PublicationPodczas ruchu pojazdu obserwuje się odchylenia nacisków osi pojazdów od nacisku statycznego, co jest spowodowane nierównościami nawierzchni. Dynamiczne obciążenia pojazdów w większym stopniu wytężają konstrukcję nawierzchni drogowej. Rozkład obciążeń dynamicznych ma kształt rozkładu normalnego i jest opisywany poprzez obciążenie statyczne oraz wskaźniki dynamiczne DI lub DLC. Wraz z pogorszeniem równości i zwiększeniem prędkości...
-
VUV irradiation studies of plasmid DNA in aqueous solution
PublicationInteractions of VUV light and DNA samples in aqueous solutions are reported. The damage induced by such radiation is quantified by monitoring both loss of supercoiled DNA and formation of single and double strand breaks using agarose gel electrophoresis. Irradiations were performed using synchrotron VUV photons of 130, 150, 170 and 190 nm. VUV irradiation experiments revealed enhanced damage upon irradiation with 170 nm photons...
-
Set of Experience and Decisional DNA: Experience-Based Knowledge Structures
PublicationThis chapter presents a description of Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA), argumentation for a knowledge representation, composition, configuration and metrics. SOEKS is a combination of filtered and amalgamated information obtained from formal decision events. It facilitates effective explicit representation of decisional experience taken from different technologies. SOEKS comprises variables,...
-
Wybrane metody badania poziomu metylacji DNA w komórkach eukariotycznych
PublicationMetylacja regionów promotorowych jest jednym z głównych mechanizmów regulacji transkrypcji genów u eukariota. W komórkach ssaczych metylacja DNA zachodzi głównie na reszcie cytozyny występującej w dinukleotydach CpG i jest katalizowana przez metylotransferazy DNA (DNMT1, DNMT3A i DNMT3B) (Turek Plewa, Jagodziński 2005). Mapowanie 5 metylocytozyny w DNA genomowym jest jednym z narzędzi do badania wpływu metylacji na tkankowo-specyficzną...
-
Binding free energy of selected anticancer compounds to DNA - theoreticalcalculations
PublicationPraca dotyczy swobodnej energii wiązania z DNA trzech związków o działaniu przeciwnowotworowym (mitoksantronu i dwóch pochodnych pirymidoakrydyny). Obliczenia wykorzystywały metody Poissona-Boltzmanna (udział elektrostatyczny) i metody SASA (udział nieelektrostatyczny). W wyniku badań zaproponowano struktury kompleksów jakie tworzą badane ligandy z DNA.
-
Physicochemical aspects of the application of surfactants and biosurfactants in soil remediation
PublicationZaprezentowano właściwości zwilżające, emulgujące oraz solubilizujące surfaktantów niejonowych Rokanolu L10, Tritonu X-100 oraz biosurfaktantu JBR 425. Jako modelowe zanieczyszczenia wybrano tetrachloroetylen (PCE) oraz o-dichlorobenzen (o-DCB). Stabilność emulsji rosła wraz ze stężeniem surfaktantu. Rozpuszczalnośc PCE i o-DCB była największa w roztworach micelarnych biosurfaktantu JBR.
-
Molecular Recognition in Complexes of TRF Proteins with Telomeric DNA
PublicationTelomeres are specialized nucleoprotein assemblies that protect the ends of linear chromosomes. In humans and many other species, telomeres consist of tandem TTAGGG repeats bound by a protein complex known as shelterin that remodels telomeric DNA into a protective loop structure and regulates telomere homeostasis. Shelterin recognizes telomeric repeats through its two major components known as Telomere Repeat-Binding Factors, TRF1...
-
H2AX phosphorylation, its role in DNA damage response and cancer therapy
PublicationDouble-strand breaks (DSBs) are the most deleterious DNA lesions, which, if left unrepaired, may have severe consequences for cell survival, as they lead to chromosome aberrations, genomic instability, or cell death. Various physical, chemical, and biological factors are involved in DSB induction. Cells respond to DNA damage by activating the so-called DNA damage response (DDR), a complex molecular mechanism developed to detect...
-
Badania eksperymentalne przy wykorzystaniu układu monitoringu dynamicznego oddziaływania odbieraka prądu na sieć trakcyjną
PublicationW ramach projektu badawczego, realizowanego w Zakładzie Trakcji Elektrycznej Politechniki Gdańskiej, opracowano układ służący do punktowego pomiaru oddziaływania odbieraków na sieć trakcyjną. Pomiar jest realizowany w rzeczywistych warunkach eksploatacyjnych - na linii kolejowej o dużym natężeniu ruchu, w odpowiednio wybranym miejscu, w którym pociągi poruszają się ze znaczną prędkością, zaś profil toru i stan torowiska minimalizują...