Filters
total: 2841
displaying 1000 best results Help
Search results for: molecular biology and genetics
-
Nanomechanical Stability of Aβ Tetramers and Fibril-like Structures: Molecular Dynamics Simulations
Publication -
Shape resonance of H[sub 2][sup −] anion stabilized in a molecular trap
Publication -
Molecular insights into receptor binding energetics and neutralization of SARS-CoV-2 variants
Publication -
Anticancer properties of low molecular weight oat beta-glucan – An in vitro study
Publication -
Molecular Mechanisms Associated with ROS-Dependent Angiogenesis in Lower Extremity Artery Disease
Publication -
Selected molecular and physiological aspects of mammalian ovarian granulosa cells in primary culture
Publication -
Human Granulosa Cells—Stemness Properties, Molecular Cross-Talk and Follicular Angiogenesis
Publication -
Molecular dynamics study of amyloid formation of two Abl-SH3 domain peptides
Publication -
Investigation of Protein Folding by Coarse-Grained Molecular Dynamics with the UNRES Force Field
Publication -
Molecular simulation study of cooperativity in hydrophobic association: clusters of four hydrophobic particles
Publication -
Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library.
PublicationIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichia coli using pUC19 vector and environmental DNA directly isolated from Antarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. The screening on agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one clone with lipolytic activity (Lip1) out of 11,000 E. coli clones. This clone harbored a plasmid, pLip1, which has an insert of 4722 bp that has been...
-
Effects of surface nonuniformity and molecular association on mechanism of butanol adsorption from solution
Publication -
Superconducting state in the atomic metallic hydrogen just above the pressure of the molecular dissociation
Publication -
Molecular dynamics insights into protein‐glycosaminoglycan systems from microsecond‐scale simulations
Publication -
Role of Glycosaminoglycans in Procathepsin B Maturation: Molecular Mechanism Elucidated by a Computational Study
Publication -
Molecular mechanism of the enzymatic oxidation investigated for imidazoacridinone antitumor drug C-1311.
PublicationPraca miala na celu określenie molekularnego mechanizmu enzymatycznej utleniającej aktywacji wymienionego związku przeciwnowotworowego w takim układzie modelowym, w którym wcześniej wykazano jego kowalencyjne wiązanie się do DNA. Badania struktur chemicznych produktów enzymatycznej aktywacji wykazały, że dwa z nich powstają w wyniku dealkilacji łańcucha bocznego cząsteczki, natomiast dwa inne w wyniku aktywacji pierścienia imidazoakrydonu....
-
Molecular Dynamics study of short and medium range order in modified BGO glasses.
PublicationArtykuł przedstawia wyniki symulacji dynamiczno-molekularnychniemodyfikowanych i modyfikowanych szkieł BGO o różnych stechiometriach. Otrzymane wyniki dokładnie przedyskutowano pod kątem blisko- i średnio-zasięgowego uporządkowania atomów i porównano z innymi dostępnymi danymi literaturowymi.
-
A study of electron impact excitation of molecular oxygen at a scattering angle of 180 st.
PublicationZbadano wzbudzenie tlenu cząsteczkowego w zderzeniu z elektronem dla rozproszenia do tyłu, pod kątem 180 st. Do pomiarów wykorzystano nowe źródło lokalnego pola magnetycznego o geometrii stożkowej.
-
Early stage of critical clusters growth in phenomenological and Molecular Dynamic simulation models.
PublicationOpisano proces kondensacji pary wodnej w ujĘciu fenomenologicznymi dynamiczno-molekularnym. Wczesne fazy wzrostu klastra opisano w ramach klasycznej teorii Hertza-Knudsena. Obszernie przedstawiono wyniki symulacji dynamiczno-molekularnych zjawiska kondensacji pary wodnej z jednorodnej fazy gazowej (przebieg powstawania małych klastrów H2O i szybkość wzrostu klastrów ponadkrytycznych).
-
Molecular modelling of membrane activity of amphotericin B, a polyene macrolide antifungal antibiotic
PublicationPraca dotyczy różnego typu modelowań molekularnych cząsteczki przeciwgrzybowego antybiotyku (amfoterycyny B). Praca przeglądowa obejmuje opis badań nad właściwościami molekularnymi samej cząsteczki antybiotyku, jej oddziaływań z powierzchnią błony oraz struktur kanałowych jakie tworzą cząsteczki amfoterycyny wewnątrz błony lipidowej.
-
Solvation of N-methylformamide by ethanol: a comparison of molecular dynamics calculations with the experimental data
PublicationWykonano obliczenia metodami dynamiki molekularnej dla tytułowego układu. Rezultaty porównano z uzyskanymi wcześniej wynikami pomiarów termodynamicznych oraz wnioskami z nich wyciągniętymi.
-
Comparative molecular dynamics simulations of amphotericin B-cholesterol/ergosterol membrane channels
PublicationBadania polegały na przeprowadzeniu porównawczej dynamiki molekularnej dla dwóch typów kanałów amfoterycyny B. Obie symulacje różniły się rodzajem sterolu (cholesterol lub ergosterol). Na podstawie wyników przeprowadzonych prac ustalono jakie elementy strukturalne badanych kanałów mogą być odpowiedzialne za selektywne działanie amfoterycyny B.
-
Crystal and molecular structure of lithium iodide complex of 13-membered azoxycrown ether
PublicationPublikacja zawiera uzupełniające informacje do znalezionej wcześniej korelacji między typem kationu, rozmiarem makrocyklu i cechami struktury krystalicznej kompleksów a selektywnością elektrod membranowych dotowanych odpowiednimi azo- lub azoksykoronami. Ustalono strukturę krystaliczną i molekularną kompleksu 13-członowej azoksykorony (L13-O) z jodkiem litu. Stechiometria kompleksu jest 1:1. Kryształ zbudowany jest z hydratowanych...
-
Optimization of white light interferometric temperature sensor. Workshop on Atomic and Molecular Physics.
PublicationW artykule przedstawiono metodę optymalizacji parametrów niskokoherencyjnego interferometrycznego czujnika temperatury wykorzystującego miniaturowy interferometr Farby Perota, pracujący w modzie odbiciowym.
-
Raman and infrared investigation of ferroelectric ceramics. IV Workshop on Atomic and Molecular Physics.
PublicationZastosowano spektroskopię absorbcyjną w podczerwieni i spektroskopię Ramana do badania ceramik ferroelektrycznych o kompozycji Ba(Ti1-xZrx)O3. Ceramiki te charakteryzują się możliwością przestrajania przenikalności elektrycznej za pomocą pola elektrycznego.
-
Bifunctional catalyst based on molecular structure: Spherical mesoporous TiO2 and gCN for photocatalysis
Publication -
A general approach to study molecular fragmentation and energy redistribution after an ionizing event
PublicationWe propose to combine quantum chemical calculations, statistical mechanical methods, and photoionization and particle collision experiments to unravel the redistribution of internal energy of the furan cation and its dissociation pathways. This approach successfully reproduces the relative intensity of the different fragments as a function of the internal energy of the system in photoelectron–photoion coincidence experiments and...
-
The effect of sunscreen 4‐methylbenzylidene camphor in different and reproductive models, its bioaccumulation and molecular effects on ligand‐receptor interaction, and protein expression
Publication4-Methylbenzylidene camphor (4-MBC) is a photo-absorbing UV filter prevalently used in cosmetics, which can be absorbed into circulation and cause systemic effects. 4-MBC is continued to be released in the environment despite the growing knowledge about its bioaccumulation and endocrine disrupting effects. Previous reviews have mentioned UV-filter together but this review considers 4-MBC alone, due to its prevalence and concerning...
-
The influence of the type of halogen substituent and its position on the molecular conformation, intermolecular interactions and crystal packing for a series of 1-benzoyl-3-(halogenophenyl)thioureas
PublicationBy the reaction of benzoyl chloride, potassium isothiocyanate and the appropriate halogenoaniline, i.e. 2/3/4-(bromo/iodo)aniline, we have obtained five new 1-benzoyl-3-(halogenophenyl)thioureas, namely, 1-benzoyl-3-(2-bromophenyl)- thiourea and 1-benzoyl-3-(3-bromophenyl)thiourea, C14H11BrN2OS, and 1-benzoyl-3-(2-iodophenyl)thiourea, 1-benzoyl-3-(3-iodophenyl)thiourea and 1-benzoyl-3-(4-iodophenyl)thiourea, C14H11IN2OS. Structural...
-
The effect of high molecular weight bio-based diamine derivative of dimerized fatty acids obtained from vegetable oils on the structure, morphology and selected properties of poly(ether-urethane-urea)s
PublicationIn this work, the effect of the high molecular weight bio-based diamine on the chemical structure and selected properties of poly(ether-urethane-urea)s has been investigated. The ether-urethane prepolymer was cured using 1,4-butanediol and/or bio-based diamine. Mentioned chain extenders were used separately or in the mixture, and their different molecular weight and chemical structure resulted in obtaining materials with diversified...
-
Molecular Characterization of a Novel Lytic Enzyme LysC from Clostridium intestinale URNW and Its Antibacterial Activity Mediated by Positively Charged N-Terminal Extension
Publication -
“Biological Adhesion” is a Significantly Regulated Molecular Process during Long-Term Primary In Vitro Culture of Oviductal Epithelial Cells (Oecs): A Transcriptomic and Proteomic Study
Publication -
Forensic Science International Genetics Supplement Series
Journals -
Deciphering the Molecular Mechanism of Substrate-Induced Assembly of Gold Nanocube Arrays toward an Accelerated Electrocatalytic Effect Employing Heterogeneous Diffusion Field Confinement
PublicationThe complex electrocatalytic performance of gold nanocubes (AuNCs) is the focus of this work. The faceted shapes of AuNCs and the individual assembly processes at the electrode surfaces define the heterogeneous conditions for the purpose of electrocatalytic processes. Topographic and electron imaging demonstrated slightly rounded AuNC (average of 38 nm) assemblies with sizes of ≤1 μm, where the dominating patterns are (111) and...
-
Ligation Mediated PCR methods, their possibilities and limitations
PublicationThe application of molecular diagnostics for bacterial strain typing or identifying bacteria at the strain level is of particular importance at present. However, among the many genotyping methods that are currently available, no single one is universally ideal. In this article, we thus review the Ligation Mediated PCR group methods as prospects from which to choose. We discuss different strategies for selecting the amplified PCR...
-
Golden artefacts, resin figurines, body adhesives and tomb sediments from the pre-Columbian burial site El Caño (Gran Coclé, Panamá): tracing organic contents using molecular archaeometry
PublicationThis research aimed to determine the origin of organic residues from funerary contexts in the El Ca~no settlement (Gran Cocl�e area, Panam�a, Central America) by means of multiple molecular probing techniques (GC-MS of organic solvent extracts and pyrolysis-GC-MS, THM-GC-MS and FTIR of solid samples). The samples include particles of precious resin figurines, fillings of golden objects, tomb sediments, plant exudates from extant...
-
Nanomechanical Properties of Metallic fcc Nanorods from Molecular Simulations with the Sutton-Chen Potential
Publication -
Pharmacological Profile and Molecular Modeling of Cyclic Opioid Analogues Incorporating Various Phenylalanine Derivatives
Publication -
THE EFFECT OF DIFFERENT MOLECULAR WEIGHTS OF CHITOSAN ON THE YIELD, QUALITY, AND HEALTH-PROMOTING PROPERTIES OF STRAWBERRIES
Publication -
Porphyrazines Peripherally Functionalized with Hybrid Ligands as Molecular Scaffolds for Bimetallic Metal-Ion Coordination
Publication -
Triticale extrudates – Changes of macrostructure, mechanical properties and molecular water dynamics during hydration
Publication -
MEL zeolite nanosheet membranes for water purification: insights from molecular dynamics simulations
Publication -
Chiral Molecular Cages Based on Cyclotriveratrylene and Sucrose Units Connected with p ‐Phenylene Linkers
Publication -
Molecular characteristics of community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains for clinical medicine
Publication -
Expression of molecular equivalent of hypothalamic–pituitary–adrenal axis in adult retinal pigment epithelium
Publication -
Developmental competence of mammalian oocytes-insights into molecular research and the promise of microfluidic technology: a review
Publication -
Dynamic Formation and Breaking of Disulfide Bonds in Molecular Dynamics Simulations with the UNRES Force Field
Publication -
Conformation Properties, Chiroptical Spectra, and Molecular Self-Assembly of 2,3-Piperazinodiones and Their Dithiono Analogues
PublicationRodzina chiralnych cyklicznych oksamidów została otrzymana przez kondensację optycznie czynnych 1,2-diamin ze szczawianem dietylu. Tionowanie produktów odczynnikiem Lawessona doprowadziło do chiralnych 2,3-dipiperazynodionów. Geometrie cząsteczkowe badano z użyciem obliczeń kwantowo-mechanicznych DFT i porównano z wynikami analizy krystalograficznej. Sześcioczłonowy pierścień heterocykliczny przyjmuje konformację półkrzesłową,...
-
Combining tight-binding and molecular dynamics methods to model the behaviour of metals in the plastic regime
PublicationOpisujemy zastosowanie metody dwuskalowej (kwantowo-klasycznej) w zastosowaniu do metali. Region energetycznie najważniejszy jest traktowany kwantowo, podczas gdy reszta układu jest traktowana klasycznie. Wprowadzamy własną implementację metody oraz przedstawiamy uzyskane wyniki dla metali.
-
Molecular characterization of a cryptic plasmid from the psychrotrophic antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A
PublicationW ostatnich latach znacznie wzrosło zainteresowanie organizmami zimnolubnymi, głównie z powodu ich enzymów o biotechnologicznym znaczeniu. Jednak, aby wydajnie produkować takie enzymy w skali przemysłowej użyteczne jest stworzenie rekombinantowych systemów ekspresyjnych, które pozwolą na ich opłacalną produkcję. W osiągnięciu tego celu mogą pomóc odpowiednie wektory, konstruowane na bazie plazmidów pozyskiwanych z bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych....