Publications
Filters
total: 513
Catalog Publications
Year 2009
-
Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii - aktualny stan badań
PublicationToksoplazmoza wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest jedną z najbardziej rozpowszechnionych odzwierzęcych chorób na świecie o bardzo dużym znaczeniu medycznym. Stanowi ponadto bardzo poważny problem weterynaryjny, ponieważ jest główną przyczyną strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt (głównie owiec). Z tego względu bardzo ważne są prace dotyczące konstrukcji i opracowania nowych, skutecznych i tanich...
-
The Reduced Folate Carrier (SLC19A1) c.80G>A Polymorphism is Associated with Red Cell Folate Concentrations Among Women
Publication -
The solubilization of hydrocarbon mixtures as one of the mechanisms of hydrophobic pollutants removal from soil
PublicationBadano solubilizację mieszanin węglowodorów alifatycznych (dekanu, dodekanu, tetradekanu, heksadekanu) i aromatycznych (toluenu, o-xylenu) w roztworach micelarnych surfaktantów niejonowych - oksyetylenowanego alkoholu (Rokanol NL6) i alkilopoliglukozydów (Triton BG10, AG 6210). Najwyższą efektywność solubilizacji uzyskano dla Rokanolu NL6. Efektywność solubilizacji mieszaniny zależała od rozpuszczalności poszczególnych jej składników...
-
Thermodynamics of micellization of imidazolium ionic liquids in aqueous solutions
PublicationPodobieństwo pomiędzy strukturami niektórych cieczy jonowych, a surfaktamtami jonowymi wskazuje na możliwość wykazywania, przez te związki, tendencji do agregacji i adsorpcji na powierzchniach międzyfazowych. Mierząc w różnych temperaturach przewodnictwo elektryczne w funkcji stężenia oznaczono temperaturę Kraffta i zależność temperaturową krytycznego stężenia micelizacji (CMC) dla czterech, różniących się długościami łańcucha,...
-
Usefulness of PCR Melting Profile Method for Genotyping Analysis of Klebsiella oxytoca Isolates from Patients of a Single Hospital Unit
PublicationOpracowanie szybkich i prostych metod typowania jest wymagane w celu identyfikacji potencjalnych źródeł zakażenia ludzi drobnoustrojami oportunistycznymi. Klebsiella spp. należą do grupy bakterii oportunistycznych odpowiedzialnych za wzrost liczby wieloopornych zakażeń szpitalnych. Ostatnio pokazaliśmy wysoką różnorodność genetyczną K. oxytoca używając dużej kolekcji szczepów izolowanych przez 50 lat od pacjentów z kilku szpitali...
Year 2008
-
A nosocomial outbreak of Candida parapsilosis in southern Sweden verified by genotyping
PublicationIn a haematology ward, Candida parapsilosis was found in blood cultures from 4 patients within a month. As C. parapsilosis is known to have a restricted genetic diversity, a combined methodological approach was adopted to establish a possible epidemiological relationship among the isolates (n = 9). Multilocus sequence typing and random amplified polymorphic DNA analysis suggested a clonal origin of the isolates. The clonal origin...
-
ALIS-FLP: amplified ligation selected fragment-length polymorphism method for microbial genotyping
PublicationA DNA fingerprinting method known as ALIS-FLP (amplified ligation selected fragment-length polymorphism) has been developed for selective and specific amplification of restriction fragments from TspRI restriction endonuclease digested genomic DNA. The method is similar to AFLP, but differs in that only one specific restriction enzyme (TspRI) is used. The cohesive ends of the DNA fragments are ligated with two types of oligonucleotide....
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublicationW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
An insertion/deletion polymorphism of the dihydrofolate reductase (DHFR) gene is associated with serum and red blood cell folate concentrations in women
Publication -
Badanie przydatności biosurfaktantów w procesie oczyszczania zaolejonych gruntów metodą przemywania
PublicationUsuwanie z gruntu nierozpuszczalnych w wodzie, ciekłych zanieczyszczeń organicznych(NAPL - Non-Aqueous Phase Liquid) osiąga wyższe efektywności, gdy stosuje się zamiast wody roztwory związków powierzchniowo czynnych. Z uwagi na mniejszą toksyczność i lepszą biodegradowalność biosurfaktantów w porównaniu do surfaktantów syntetycznych przeprowadzono modelowe badania solubilizacji mieszanin węglowodorów (dekan, dodekan, tetradekan,...
-
Chapter 21. Investigation on sorption of 1-methyl-3-octylimidazolium chloride on sewage sludge in wastewater treatment
PublicationNiniejsza publikacja stanowi opis zjawiska sorpcji chlorku 1-metylo-3-oktylo imidazolu w wysuszonym osadzie czynnym pochodzącym z oczyszczalni ścieków. Uzyskana w toku badań izoterma sorpcji potwierdza wielowarstwową adsorpcję długołańcuchowych cieczy jonowych. Stosunkowo wysoki współczynnik podziału KD wynika z pH w jakim prowadzony był eksperyment oraz wysokiej zawartości węgla organicznego w sorbencie (50,49%) i potwierdza,...
-
Chapter 22. Antimicrobial and surface activity of 1-alkyl-3-methyl imidazolium derivatives
PublicationCiecze jonowe wykazują aktywność przeciwgrzybową oraz przeciwbakteryjną zależną od struktury badanego związku. Zbadano wpływ długości łańcucha alkilowego w kationie na aktywność przeciwmikrobiologiczną oraz przedstawiono zależność pomiędzy tą aktywnością a krytycznym stężeniem micelizacji imidazolowych cieczy jonowych.
-
Chapter 23. Fate assessment of ionic liquids in porous media
PublicationW ostatnich latach obserwowany jest wzrost zainteresowania zastąpieniem tradycyjnych lubrykantów cieczami jonowymi z uwagi na ich szczególne właściwości fizykochemiczne zwłaszcza brak lotności -istotny z punktu bezpieczeństwa stosowania. Ciecze jonowe, choć nielotne, są związkami stosunkowo toksycznymi w stosunku do mikroorganizmów i bezkręgowców. Z tego względu ich zachowanie się w środowisku oraz parametry transportu powinny...
-
Chapter 32. Method to predict the critical micelle concentration of ionic liquids from the molecular volume
PublicationAmfifilowość wielu imidazoliowych cieczy jonowych powoduje, że zjawiska powierzchniowe mają znaczny wpływ na właściwości układów zawierających te związki. Dotychczas przeprowadzono wiele badań w celu wyznaczenia krytycznego stężenia micelizacji cieczy jonowych o różnej budowie. Ze względu na możliwość modyfikacji budowy kationu i wyboru anionu oraz ich kombinacji, podjęto próbę opracowania empirycznego równania pozwalajacego na...
-
Chapter 34. Influence of salt on micellisation of 1-decyl-3-methyl imidazolium chloride in aqueous solution
PublicationZbadano wpływ prostych elektrolitów na micelizację chlorku 1-decylo-3-metyloimidazoliowego w środowisku wodnym. Zaobserwowano, że dodatek soli powoduje obniżanie krytycznego stężenia micelizacji (CMC) badanego związku z siłą zgodną z trendem opisanym szeregiem Hofmeistera. Przedstawiono również zależność między stężeniem dodanej soli a CMC.
-
Determination of the adsorption mechanism of imidazolium type ionic liquids onto kaolinite: implications for their fate and transport in the soil environment
PublicationNiniejsza publikacja szczegółowo opisuje sorpcję cieczy jonowych na powierzchni glin kaolinowych. Uzyskane wyniki wskazują na występowanie zjawiska sorpcji wielowarstwowej. Przy całkowitym wysyceniu najwyższy współczynnik podziału został zaaobserwowany dla cieczy jonowych podstawionych długim łańcuchem alkilowym. Średnie wartości energii swobodnej wyznaczone dla procesu sorpcji cieczy jonowych są niższe niż typowe energie swobodne...
-
Drożdżowe systemy ekspresyjne jako narzędzie nowoczesnej mikrobiologii przemysłowej
PublicationDrożdże łączą zalety prokariotycznych i eukariotycznych systemów ekspresyjnych. Charakteryzuje je szybki wzrost, osiągają też znacznie większą biomasę w porównaniu z bakteriami. W odróżnieniu od bakterii, drożdże zdolne są do przeprowadzania modyfikacji posttranslacyjnych białek. Kolejną zaletą drożdżowych systemów ekspresyjnych jest zdolność komórek drożdżowych do sekrecji białek do pożywki hodowlanej. W laboratoriach naukowych...
-
Evidence for sex differences in the determinants of homocysteine concentrations
Publication -
Experimental guinea pig model of dermatophytosis: a simple and useful tool for the evaluation of new diagnostics and antifungals
PublicationCelem badań było opracowanie prostego modelu zwierzęcego (świnki morskie) odpowiedniego do sprawdzania systemów diagnostycznych oraz terapii infekcji dermatofitów. Następujące zmienne były analizowane: przygotowanie skóry przez golenie versus użycie taśmy, testowy szczep Microsporum canis czy Trichophyton mentagrophytes jako czynnik etiologiczny, sposób inokulacji. Przebieg infekcji był oceniany poprzez ocenę zaczerwienienia i...
-
Extracellular secretion of Pseudoalteromonas sp. cold-adapted esterase in Escherichia coli in the presence of Pseudoalteromonas sp. components of ABC transport system
PublicationEnzymy lipolityczne, głównie lipazy i esterazy, stanowią cenną grupę biokatalizatorów wykorzystywanych w przemyśle. Coraz większe zainteresowanie tą klasą enzymów sprawiło, że poszukuje się alternatywnych źródeł ich pozyskiwania. W celu zbadania wpływu białek transportu ABC Pseudoalteromonas sp. 643A na ekspresję genu, sekrecję i aktywność esterazy EstA z tego mikroorganizmu w systemie ekspresyjnym E. coli skonstruowano układ do...
-
Genetic and biochemical determinants of serum concentrations of monocyte chemoattractant protein-1, a potential neural tube defect risk factor
Publication -
Metody molekularne w dochodzeniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych
PublicationW dochodzeniu epidemiologicznym wykorzystuje się zmienność genetyczną mikroorganizmów do tzw. typowania genetycznego drobnoustrojów. W pracy omówiono metody genotypowe wykorzystujące podstawowe narzędzia molekularne, ukazano możliwości wykorzystania typowania drobnoustrojów w różnych aspektach badań mikrobiologicznych.
-
Micelle formation of imidazolium ionic liquids in aqueous solution
PublicationCiecze jonowe (ILs) stanowią nową klasę związków o szerokich możliwościach przemysłowego zastosowania. Z przeglądu dostępnej literatury wynika, że niektóre ciecze jonowe tworzą agregaty w roztworach wodnych. W celu określenia jak tworzenie agregatów może wpływać na przebieg procesów technologicznych, dystrybucję w środowisku oraz toksyczność konieczne jest przeprowadzenie systematycznych badań dotyczących właściwości powierzchniowych...
-
Molecular characterization of a cryptic plasmid from the psychrotrophic antarctic bacterium Pseudoalteromonas sp. 643A
PublicationW ostatnich latach znacznie wzrosło zainteresowanie organizmami zimnolubnymi, głównie z powodu ich enzymów o biotechnologicznym znaczeniu. Jednak, aby wydajnie produkować takie enzymy w skali przemysłowej użyteczne jest stworzenie rekombinantowych systemów ekspresyjnych, które pozwolą na ich opłacalną produkcję. W osiągnięciu tego celu mogą pomóc odpowiednie wektory, konstruowane na bazie plazmidów pozyskiwanych z bakterii psychrofilnych/psychrotrofowych....
-
Naturally occurring mitochondrial DNA heteroplasmy in the MRL mouse
PublicationThe MRL/MpJ mouse is an inbred laboratory strain of Mus musculus, known to exhibit enhanced autoimmunity, increased wound healing, and increased regeneration properties. We report the full-length mitochondrial DNA (mtDNA) sequence of the MRL mouse (Accession # EU450583), and characterize the discovery of two naturally occurring heteroplasmic sites. The first is a T3900C substitution in the TpsiCloop of the tRNA methionine gene...
-
Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP
PublicationOmówiono etapy tworzenia zestawu diagnostycznego przeznaczonego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych wykorzystującego procedurę PCR MP (PCR Melting Profiles). Dokonano optymalizacji warunków i walidacji metody w celu przystosowania jej do potrzeb epidemiologicznej oceny zakażeń szpitalnych. Opracowany zestaw stwarza możliwości zastosowania go w laboratoriach prowadzących rutynowo badania diagnostyczne.
-
Quantification of key red blood cell folates from subjects with defined MTHFR 677C>T genotypes using stable isotope dilution liquid chromatography/mass spectrometry
Publication -
Risk assessment of biocides in roof paint. Part 1
PublicationSzereg pokryć dachowych, jak farby dachowe, zawiera w swoim składzie biocydy. Dotychczas nie wiadomo do jakiego stopnia biocydy wymywane są z farb dachowych, a ponadto jakie ich stężenie może występować w systemach zbierających wodę deszczową. Zbadano podatność na wymywanie biocydów z różnych niemieckich farb dachowych oraz oszacowano ich stężenie w zebranej wodzie deszczowej
-
Rozdział 5. Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń grzybiczych wywoływanych przez dermatofity = Novel diagnostic methods of funfal infections caused by dermatophytes
PublicationDermatofity są głównym czynnikiem etiologicznym grzybic powierzchownych. Do tej klasy grzybów należą przedstawiciele trzech rodzajów: Epidermophyton, Microsporum i Trichophyton. Klasyczne metody diagnostyczne polegają na bezpośredniej ocenie mikroskopowej oraz badaniu hodowlanym. Identyfikacja gatunkowa jest możliwa na podstawie cech makroskopowych kolonii: ich struktury, koloru, kształtu, oraz obserwacji mikroskopowych (kształt...
-
Rozdział 6. Epidemiologia molekularna - nowe metody typowania diagnostycznego mikroorganizmów = Molecular epidemiology new methods for diagnostic typing of microorganismus
PublicationMolekularne metody diagnostyczne oparte o analizę kwasów nukleinowych dają nowe możliwości laboratoriom w szybkim wykrywaniu i różnicowaniu mikroorganizmów patogennych. W pracy przedstawiono panujące tendencje w zastosowaniach metod typowania genetycznego znaczących klinicznie mikroorganizmów w Europie, a także omówiono niektóre techniki stosowane w laboratoriach mikrobiologicznych, z uwzględnieniem ich zdolności aplikacyjnych,...
-
Self-organization of imidazolium ionic liquids in aqueous solution
PublicationW pracy przeanalizowano i podsumowano wyniki badań nad samoorganizacją oraz tworzeniem micel cieczy jonowych w roztworach wodnych otrzymane przez wiele zespołów badawczych. Średnio i długołańcuchowe imidazoliowe ciecze jonowe wykazują aktywność powierzchniową zależną od długości łańcucha alkilowego w kationie, analogicznie do kationowych surfaktantów. Wskazano na liczne zagadnienia, które wymagają dalszych systematycznych badań
-
Toxoplasma gondii: Enzyme-Linked Immunosorbent Assay using different fragments of recombinant microneme protein 1 (MIC1) for detection of immunoglobulin G antibodies
PublicationTrzy rekombinantowe fragmenty białka antygenowego MIC1 Toxoplasma gondii (r-MIC1ex2, r-MIC1ex34 i r-MIC1) zostały wyprodukowane jako białka fuzyjne (zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu) w komórkach bakteryjnych Escherichia coli. Homogenne preparaty antygenów rekombinantowych otrzymane z zastosowaniem jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa, wykorzystano następnie do immunoidentyfikacji...
-
Type II secretory pathway for surface secretion of DraD invasin from the uropathogenic Escherichia coli Dr+ strain
PublicationWłaściwości wirulentne uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ IH11128 związane są z obecnością struktur fimbrialnych typu Dr i białka inwazyny DraD, które może na powierzchni komórki bakteryjnej pełnić rolę fimbrialnej podjednostki szczytowej. Ostatnie badania wykazały, że białko DraD jest eksponowane na powierzchni bakterii w dwóch formach: związanej ze strukturą fimbrialną i jako niezależna od fimbrii otoczka białkowa....
-
Wykorzystanie reakcji PCR do badania charakterystycznych obszarów genomu
PublicationW pracy zostały opisane metody wykorzystujące technię PCR do długo- i krótkoterminowych badań epidemiologicznych. Typowanie szczepów oparte jest na analizie fragmentów genów, bądź całego genomu w zależności od potrzeby posiadania potencjału różnicującego metody. Przez ostatnie 30 lat rozwijały się nie tylko metody badawcze, doszło również do rozwoju międzynarodowych baz danych i przepływu informacji o obecnych sytuacjach epidemiologicznych...
Year 2007
-
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactosidase
Publication -
A bifunctional chimeric protein consisting of MutS and beta-galactoside
PublicationPraca pokazuje konstrukcję DNA plazmidowego kodującego bifunkcjonalne białko chimeryczne złożone z MutS Thermus thermophilus i beta-galaktozydazy E.coli, optymalizację jego ekspresji i oczyszczania. Białko to testowano w metodzie wykrywania mutacji punktowych, wykorzystując kolorymetryczne mierzenie aktywności domeny reporterowej beta galaktozydazy.
-
A cold-adapted esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. strain 643A
PublicationDzięki zastosowaniu lipaz możliwa jest biotechnologiczna produkcja m.in. biodegradowalnych biopolimerów, biopaliw (tzw. biodiesel), wielu terapeutyków, herbicydów, pestycydów, kosmetyków, substancji smakowych, serów i in. Szczególnie interesującą grupę stanowią enzymy lipolityczne, pochodzące z organizmów psychrofilnych i psychrotrofowych, ze względu na zdolność do wydajnego katalizowania reakcji w temperaturach rzędu 10-20 ºC....
-
A freeze-thaw method for desintegration of Escherichia coli cells producing T7 lysozyme used in pBAD expression systems
PublicationPlazmid pLysN zawierający gen kodujący lizozym T7 pod kontrolą promotora lac został skonstruowany w celu ułatwienia dezintegracji komórek po ekspresji rekombinantowych białek w systemach ekspresji indukowanych arabinozą. Użyteczność plazmidu została przetestowana w komórkach Escherichia coli TOP10 i E. coli LMG194, niosących plazmid pBADMHADgeSSB, zawierający gen kodujący białko SSB Deinococcus geothermalis pod kontrolą promotora...
-
A two-plasmid Escherichia coli system for expression of Dr adhesins
PublicationPraca opisuje konstrukcję wydajnego systemu produkcji fimbrii Dr. System składa się z dwóch plazmidów. Plazmid pACYCpBAD-DraC-C-His zawiera pod kontrolą promotora arabinozowego gen draC kodujący białko kanałotwórcze DraC. Plazmid pET-30b-sygDraBE zawiera pod kontrolą promotora T7lac geny draB i draE kodujące odpowiednio białko opiekuńcze DraB oraz adhezynę DraE. Oba plzamidy posiadają różne ori replikacji co pozwala na ich jednoczesne...
-
ADSRRS-fingerprinting and PCR MP techniques for studies of intraspecies genetic relatedness in Staphylococcus aureus
PublicationW pracy pokazano użyteczność dwóch nowych metod do typowania molekularnego Staphylococcus aureus, ADSRRS-fingerprinting (Amplification of DNA fragments Surrounding Rare Restriction Sites) i PCR MP (PCR melting profile). Przebadano 37 szczepów Staphylococcus aureus izolowanych od pacjentów z czyracznością. Jako metodę referencyjną zastosowano REA-PFGE. Okazało się, że izolaty Staphylococcus aureus z nosa od niektórych pacjentów...
-
Aggregate formation of imidazolium ionic liquids in aqueous solution
PublicationCiecze jonowe (ILs) stanowią nową klasę związków o szerokich możliwościach przemysłowego zastosowania. Z przeglądu dostępnej literatury wynika, że niektóre ciecze jonowe tworzą agregaty w roztworach wodnych. Zrozumienie oddziaływań międzycząsteczkowych cieczy jonowych w środowisku wodnym jest niezbędne dla prawidłowego projektowania, przewidywania i kontroli ich właściwości jako współ-rozpuszczalników, a w konsekwencji procesów...
-
Antygeny rekombinantowe Toxoplasma gondii jako narzędzie w diagnostyce toksoplazmozy
Publication -
DAF - and collagen-binding properties of chimeric Dr fimbriae
PublicationEkspozycja białek heterologicznych na powierzchni mikroorganizmów jest jedną z nowych strategii stosowanych w mikrobiologii, biotechnologii oraz projektowaniu nowoczesnych szczepionek. W niniejszej pracy zbadano możliwość wykorzystania białka podjednostkowego DraE fimbrii Dr uropatogennych szczepów Escherichia coli jako nośnika heterologicznych sekwencji. W rejon odpowiadający N-terminalnej domenie 2 białka DraE wprowadzono epitopową...
-
Diagnostyka molekularna w zakażeniach szpitalnych
PublicationOpisano najczęściej wykorzystywane techniki genotypowania w badaniach zakażeń szpitalnych z uwzględnieniem ich powtarzalności i potencjału różnicującego oraz problemów technicznych i ponoszonych kosztów. Makrorestrykcyjna analiza genomowego DNA z wykorzystaniem PFGE (ang. Pulsed Field Gel Electrophoresis)jest uważana za ''złoty standard'' w typowaniu molekularnym. Jednak jest ona czasochłonna, pracochłonna i dlatego nie nadaje...
-
Five-hour diagnosis of dermatophyte nail infections with specific detection of Trichophyton rubrum
PublicationW publikacji przedstawiono szybką dwuetapową metodę oczyszczania DNA oraz opartą na technice multiplex PCR metodę wykrywania grzybów z rodzaju dermatofitów oraz gatunku Trichophyton rubrum z hodowli grzybów oraz bezpośrednio ze zmienionych chorobowo paznokci. Testy stu osiemnastu próbek z użyciem zaprojektowanej reakcji multiplex PCR i dwóch kolejnych (jedna wykrywająca grzyby z rodzaju dermatofitów, druga wykrywająca gatunek T....
-
Genetyczne metody różnicowania mikroorganizmów
PublicationPrzedstawiono przegląd i porównanie kilku najczęściej stosowanych technik różnicowania genetycznego mikroorganizmów, uwzględniając molekularne podstawy metod, ich powtarzalność, siłę dyskryminacji, łatwość i koszt użycia, aby dać czytelnikowi pogląd na możliwości klinicznego zastosowania dostępnych aktualnie narzędzi molekularnego różnicowania mikroorganizmów.
-
Immobilized preparation of cold-adapted and halotolerant Antarctic β-galactosidase as a highly stable catalyst in lactose hydrolysis
PublicationZimnolubna rekombinowana beta-galaktozydaza antarktycznej morskiej bakterii Pseudoalteromonas sp. 22b została immobilizowana na chitozanie za pomocą aldehydu glutarowego. Preparat immobilizowanego enzymu w przeciwieństwie do preparatu enzymu w buforze reakcyjnym nie był inhibowany przez glukozę. Immobilizacja enzymu wpłynęła na podwyższenie o 10°C optymalnej temperatury aktywności względem jego nieimmobilizowanego odpowiednika...
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Molecular typing of clinical isolates of Escherichia coli by a new PCR MP method
PublicationTypowanie epidemiologiczne bakterii jest rutynową procedurą stosowaną w badaniach zakażeń szpitalnych i wymaga stosowania odpowiednich metod o wysokim potencjale różnicującym. Przedstawiliśmy możliwości nowej techniki PCR MP w różnicowaniu szczepów E. coli. Rezultaty zostały porównane z wynikami uzyskanymi metodą PFGE.
-
Optymalizacja i walidacja metody ADSRRS-fingerprinting - konstrukcja zestawu diagnostycznego do różnicowania genetycznego drobnoustrojów
PublicationSpośród wszystkich metod typowania mikroorganizmów na szczególną uwagę zasługują metody oparte na analizie całego materiału genetycznego zawartego w komórce. Jedną z nich jest stosunkowo nowa technika ADSRRS-fingerprinting (ang. Amplification of DNA Fragments Surrounding Rare Restriction Sites). Na podstawie naszych badań można stwierdzić, iż charakteryzuje się ona wysokim potencjałem różnicującym, wiarygodnością, powtarzalnością...