Wyszukiwarka
Filtry
wszystkich: 58
wybranych: 26
Wyniki wyszukiwania dla: AUTODOCK
-
Simplified AutoDock force field for hydrated binding sites
Publikacjahas been extracted from the Protein Data Bank and used to test and recalibrate AutoDock force field. Since for some binding sites water molecules are crucial for bridging the receptor-ligand interactions, they have to be included in the analysis. To simplify the process of incorporating water molecules into the binding sites and make it less ambiguous, new simple water model was created. After recalibration of the force field on...
-
Modal analysis of railway current collectors using Autodesk Inventor
PublikacjaThe paper presents the results of modal analysis of railway current collector type 160EC. In the first place, the analysis was carried out analytically for a simplified two lumped mass pantograph model. Then numerical analysis was conducted in the Autodesk Inventor (AI) on the prepared multibody model using the AI modal analysis algorithm, which is based on the finite element method (FEM). Model elements which are most relevant...
-
Wykorzystanie e-narzędzi w nauczaniu, egzaminacji i certyfikacji Autodesk
PublikacjaAutoryzowane Centrum Szkolenia Autodesk Politechniki Gdańskiej zostało założone w 1995 roku. Stanowiło odpowiedź na rosnące zainteresowanie zdobywaniem umiejętności obsługi oprogramowania typu CAD wśród studentów i młodych inżynierów. Rosnące zainteresowanie zaowocowało stopniowym wdrażaniem kolejnych narzędzi e-learningowych. Wraz ze zdobyciem statusu Autoryzowanego Akademickiego Partnera Autodesk w 2016 roku pojawiły się nowe...
-
Badania dynamiki ruchu odbieraków prądu z wykorzystaniem programu Autodesk Inventor
PublikacjaRozwój kolei dużych prędkości stawia coraz wyższe wymagania w zakresie konstrukcji i utrzymania sieci trakcyjnych oraz odbieraków prądu. Głównym problemem technicznym jest konieczność zapewnienia ciągłości styku pomiędzy przewodem jezdnym a nakładkami stykowymi ślizgacza. Współpraca pomiędzy elementami zestyku ślizgowego zależy w istotnym stopniu od zastosowanej konstrukcji odbieraka i wartości parametrów, zwłaszcza tych, które...
-
Autodesk Robot Structural Analysis = Wymiarowanie Konstrukcji Stalowych i Żelbetowych : Przyklady Obliczeń
PublikacjaW pracy przedstawiono przykłady wymiarowania konstrukcji stalowych i żelbetowych z wykorzystaniem programu Autodesk Robot Structural Analysis Professional.
-
Implementing SP4CE Learning Rooms concept and AUTODESK online certification in the preparation of a new generation of engineers.
PublikacjaIn academia, educators do not always cope with rapidly changing technologies. Yet keeping up with new trends is essential to graduates’ success in a competitive job market. In the article, the author will answer the question of how Autodesk University Open Educational Resources and Certiport exams including GMetrix can enhance students’ academic progress and prepare them for future career. The concept of co-operation between Authorized...
-
Zastosowanie modułu symulacji dynamicznej programu Autodesk Inventor do badań właściwości dynamicznych odbieraków prądu
PublikacjaW pracy przedstawiono wybrane zagadnienia komputerowego modelowania 3D podzespołów kolejowego odbieraka prądu typu 160 EC oraz jego złożenie jako integralnej konstrukcji w programie Autodesk Inventor. Omówiono sposób implementacji modelu 3D odbieraka w Module Symulacji Dynamicznej (MSD). W symulacji komputerowej badano proces unoszenia się odbieraka pod wpływem zadanego momentu obrotowego. Pokazano wybrane wyniki symulacji dynamicznej...
-
Design of new cholinesterase inhibitors based on phosphorus analogs of tacrine as potential anti-Alzheimer’s disease agents
PublikacjaBased on the analysis of the determined free binding energy (using the AutoDock Vina 1.1.2 docking program), the most potent cholinesterase inhibitors were selected. Moreover, studies of 3D visualization of the results of molecular modeling led to the identification of potential sites for the interaction of new potential inhibitors with amino acid residues building active sites of investigated cholinesterases.
-
COMPUTER-AIDED DESIGN OF ORGANOPHOSPHORUS INHIBITORS OF UREASE
PublikacjaBased on the structure of the most potential inhibitor diamidophosphate, various novel groups of inhibitors were developed by knowledge-based design approach with covalent carbon-phosphorus or carbon-phosphorus-carbon bond to improve hydrolytic stability to inhibit the microbial ureases. Designed compounds were evaluated with 10 (LigScore1, LigScore2, PLP1, PLP2, JAIN, PMF, PMF04, LUDI_1, LUDI_2 and LUDI_3) different scoring functions...
-
Molecular docking studies towards development of novel Gly-Phe analogs for potential inhibition of Cathepsin C (dipeptidyl peptidase I).
PublikacjaCathepsin C is a cysteine protease required for activation of various pro-inflammatory serine proteases and, essentially, is of interest as a therapeutic target. Cathepsin C coordinate system was employed as a model to study the interaction of some already available inhibitors of Cathepsin C. Compounds containing Gly-Phe fragment with functional groups at its ends were designed by knowledge based approach. Using AutoDock and...
-
Design, synthesis and biological evaluation of novel N-phosphorylated and O-phosphorylated tacrine derivatives as potential drugs against Alzheimer’s disease
PublikacjaIn this work, we designed, synthesised and biologically investigated a novel series of 14N- and O-phosphorylated tacrine derivatives as potential anti-Alzheimer’s disease agents. In the reaction of 9-chlorotacrine and corresponding diamines/aminoalkylalcohol we obtained diamino and aminoalkylhydroxy tacrine derivatives. Next, the compounds were acid to give final products 6–13 and 16–21 that were characterised by 1H, 13 C, 31P...
-
TRWAŁOŚĆ PROJEKTU ERASMUS+ SP4CE - STUDIUM PRZYPADKU
PublikacjaProjekt ERASMUS+ Partnerstwo Strategiczne na Rzecz Kreatywności i Przedsiębiorczości (ang. Strategic Partnership for Creativity and Entrepreneurship - SP4CE) dotyczył wdrażania i upowszechniania innowacyjnych rozwiązań wzmacniających współpracę europejską w dziedzinie kształcenia i szkolenia zawodowego. Działania projektowe były związane z promowaniem innowacyjnych praktyk w edukacji oraz szkoleniach poprzez wspieranie spersonalizowanych...
-
Molecular modeling and evaluation of novel dibenzopyrrole derivatives as telomerase inhibitors and potential drug for cancer therapy
PublikacjaDuring previous years, many studies on synthesis, as well as on anti-tumor, anti-inflammatory and anti-bacterial activities of the pyrazole derivatives have been described. Certain pyrazole derivatives exhibit important pharmacological activities and have proved to be useful template in drug research. Considering importance of pyrazole template, in current work the series of novel inhibitors were designed by replacing central...
-
Zastosowanie modułu symulacji dynamicznej programu CAD w analizie układu napędowego elektronarzędzia
PublikacjaW referacie przedstawiono analizę mechanicznego układu przeniesienia napędu elektronarzędzia (wyrzynarki elektrycznej) przy zastosowaniu Modułu Symulacji Dynamicznej (MSD) programu Autodesk Inventor (AI). Opracowano modele 3D poszczególnych części elektronarzędzia i połączono je przy zachowaniu tzw. kinematyki odwrotnej. Przeprowadzono analizę wpływu poszczególnych węzłów kinetycznych na przebieg momentu na wale silnika elektrycznego....
-
Analiza obudowy wykopu dla budynku z kondygnacją podziemną
PublikacjaW pracy poruszono tematykę analizy obudowy wykopu dla budynku z jedną kondygnacją podziemną, zlokalizowanego w gęstej zabudowie śródmiejskiej. Obliczenia przeprowadzono za pomocą dwóch programów obliczeniowych: GEO5 (moduł: Ściana analiza) i Autodesk Robot Structural Analysis Professional. Całość wyników podsumowano, a wnioski sformułowano w odniesieniu do obecnej sytuacji na rynku budowlanym, charakteryzującej się coraz to trudniejszymi...
-
Identification of 1H‐indene‐(1, 3, 5, 6)‐tetrol derivatives as potent pancreatic lipase inhibitors using molecular docking and molecular dynamics approach
PublikacjaPancreatic lipase is a potential therapeutic target to treat diet-induced obesity in humans, as obesity-related diseases continue to be a global problem. Despite intensive research on finding potential inhibitors, very few compounds have been introduced to clinical studies. In this work, new chemical scaffold 1H-indene-(1,3,5,6)-tetrol was proposed using knowledge-based approach, and 36 inhibitors were derived by modifying its...
-
Geometry optimization of steroid sulfatase inhibitors - the influence on the free binding energy with STS
PublikacjaIn the paper we review the application of two techniques (molecular mechanics and quantum mechanics) to study the influence of geometry optimization of the steroid sulfatase inhibitors on the values of descriptors coded their chemical structure and their free binding energy with the STS protein. We selected 22 STS-inhibitors and compared their structures optimized with MM+, PM7 and DFT B3LYP/6–31++G* approaches considering separately...
-
Structure-based design and evaluation of novel N-phenyl-1H-indol-2-amine derivatives for fat mass and obesity-associated (FTO) protein inhibition
PublikacjaFat mass and obesity-associated (FTO) protein contributes to non-syndromic human obesity which refers to excessive fat accumulation in human body and results in health risk. FTO protein has become a promising target for anti-obesity medicines as there is an immense need for the rational design of potent inhibitors to treat obesity. In our study, a new scaffold N-phenyl-1H-indol-2-amine was selected as a base for FTO protein inhibitors...
-
Zastosowanie AutoCAD Civil3D w nauczaniu projektowania dróg szynowych
PublikacjaNa Wydziale Inźynierii Lądowej i Środowiska Politechniki Gdańskiej od kilku lat głównym programem typu CAD wykorzystywanym w procesie kształcenia jest AutoCAD Civil 3D. Wersja edukacyjna tego programu jest zainstalowana w uczelnianych laboratoriach komputerowych, a studenci i pracownicy uczelni mogą go instalować na swoich komputerach w ramach programu Autodesk Student Engineering & Design Community. Jednak sposób rozwiązywania...
-
Docking simulations, Molecular properties and ADMET studies of novel Chromane6,7diol analogues as potential inhibitors of Mushroom tyrosinase
PublikacjaResearch on inhibition of tyrosinase enzyme has attained significant value, because tyrosinase inhibitors have potential applications in medicine, cosmetics (as whitening agents) and in agriculture (as bioinsecticides). Determination and elucidation of new tyrosinase inhibitors are not only beneficial for medical purposes, but their promising applications in improving food quality and nutritional...
-
TECHNIKI CAD W INŻYNIERII ELEKTRYCZNEJ - WYBRANE ZAGADNIENIA
PublikacjaW pracy przedstawiono różne techniki CAD (ang. Computer Aided Design) wykorzystywane w inżynierii elektrycznej dla potrzeb komputerowego modelowania 3D przetworników elektromechanicznych. Wirtualne modele 3D różnych urządzeń są użyteczne nie tylko przy opracowywaniu dokumentacji technicznej ale są także wykorzystywane w obliczeniach inżynierskich:...
-
Modele numeryczne uwzględniające tarczową pracę pokrycia dachowego z blach trapezowych
PublikacjaW artykule porównano wybrane sposoby uwzględniania w modelowaniu numerycznym tarczowej pracy pokrycia dachowego z blachy trapezowej, możliwe do zrealizowania w programie Autodesk Robot Structural Analysis Professional 2015, w celu oceny słuszności stosowania ich do obliczeń konstrukcji nośnej współpracującej z poszyciem z blachy trapezowej. Analizy przeprowadzono dla pojedynczej przepony. Za pomocą powłokowych elementów skończonych...
-
Experimental and Computational Fluid Dynamics Studies on Straight and U-Bend Double Tube Heat Exchangers with Active and Passive Enhancement Methods
PublikacjaIn this work, the authors wanted to demonstrate the possibility to increase the heat transfer efficiency by using simple wire coil inserts to create turbulent flow in the boundary layer as well as air blowing into the annulus of the pipe. Experimental investigations were carried out for four heat exchanger constructions, i.e., plain double tube, turbulized double tube, plain U-bend double tube, U-tube with turbulator, plain double...
-
Three-dimensional modeling and automatic analysis of the human nasal cavity and paranasal sinuses using the computational fluid dynamics method
PublikacjaPurpose The goal of this study was to develop a complete workflow allowing for conducting computational fluid dynam- ics (CFD) simulation of airflow through the upper airways based on computed tomography (CT) and cone-beam computed tomography (CBCT) studies of individual adult patients. Methods This study is based on CT images of 16 patients. Image processing and model generation of the human nasal cavity and paranasal sinuses...
-
Stateczność kratownic ze sprężystymi podporami bocznymi
PublikacjaW rozprawie doktorskiej podjęto temat stateczności kratownic płaskich, które często stanowią zadaszenie stalowych budynków halowych i innych obiektów budowlanych. Głównym celem pracy było badanie zależności pomiędzy sztywnością na przesuw i obrót, sprężystych podpór bocznych a obciążeniem krytycznym i granicznym kratownic. W pracy przedstawiono rezultaty analiz numerycznych stateczności i nośności rzeczywistych kratownic poddanych...
-
Podstawy obliczeń układów powierzchniowych w systemie MSC.Marc/Mentat
PublikacjaW skład prezentowanej monografii wchodzi pięć przykładów analizy elementów konstrukcyjnych wykonanych przy użyciu systemu MSC.Marc/Mentat. Każdy przykład został rozwiązany dwa razy: za pomocą klasycznej i tzw. nowej wersji interfejsu (w wersji 13.1). Przykłady opatrzono rozwiązaniami problemów wykonanymi w taki sposób, że czytelnik może uzyskać rozwiązanie danego problemu, powtarzając opisane szczegółowo instrukcje na własnym komputerze....