Filtry
wszystkich: 2968
-
Katalog
- Publikacje 2527 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 221 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 3 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 36 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 4 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 13 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 2 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 162 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: molecular umbrellas
-
New Peptide Based Fluconazole Conjugates with Expanded Molecular Targets
PublikacjaInfections of Candida spp. etiology are frequently treated with azole drugs. Among azoles, the most widely used in the clinical scenario remains fluconazole (FLC). Promising results in treatment of dangerous, systemic Candida infections demonstrate the advantages of combined therapies carried out with combinations of at least two different antifungal agents. Here, we report five conjugates composed of covalently linked FLC and...
-
Understanding homogenous nucleation: the recent phenomenological and molecular dynamic approaches
PublikacjaPraca przedstawia dwa podejścia do problemu homogenicznej nukleacji. Pierwsze jest podejściem fenomenologicznym. Nukleacja jest tu rozumiana jako wzrost kropel krytycznych, które po przejściu określonego wymiaru, warunku równowagi termodynamicznej, mają tendencje do wzrostu. W tym podejściu problem wzrostu kropel oraz problem populacji kropel jest określany poprzez parametry makroskopowe. Przedstawiono nowe rozwiązania uzyskane...
-
Molecular targets for antifungals in amino acid and protein biosynthetic pathways
PublikacjaFungi cause death of over 1.5 million people every year, while cutaneous mycoses are among the most common infections in the world. Mycoses vary greatly in severity, there are long-term skin (ringworm), nail or hair infections (tinea capitis), recurrent like vaginal candidiasis or severe, life-threatening systemic, multiorgan infections. In the last few years, increasing importance is attached to the health and economic problems...
-
Synthesis and hydrogen evolving catalysis of a panchromatic photochemical molecular device
PublikacjaA dinuclear hydrogen evolution photocatalyst [(tbbpy)2Os(tpphz)PtI2](PF6)2 (tbbpy = 4,4′-tert-butyl-2,2′-bipyridine; tpphz = tetrapyrido[3,2-a:2′,3′-c:2′′,3′′-h:2′′′,3′′′-j]phenazine) is synthesized in order to make use of the broader range of visible light absorption mitigated by the osmium center. In a first step, the activity of the complex for hydrogen evolution is investigated by evaluating the role of different electron donors...
-
Hydration of amino acids: FTIR spectra and molecular dynamics studies
PublikacjaThe hydration of selected amino acids, alanine, glycine, proline, valine, isoleucine and phenylalanine, has been studied in aqueous solutions by means of FTIR spectra of HDO isotopically diluted in H2O. The difference spectra procedure and the chemometric method have been applied to remove the contribution of bulk water and thus to separate the spectra of solute-affected HDO. To support interpretation of obtained spectral results,...
-
Positron binding to alkali-metal hydrides: The role of molecular vibrations
PublikacjaThe bound vibrational levels for J=0 have been computed for the series of alkali-metal hydride molecules from LiH to RbH, including NaH and KH. For all four molecules the corresponding potential-energy curves have been obtained for each isolated species and for its positron-bound complex (e+XH). It is found that the calculated positron affinity values strongly depend on the molecular vibrational state for which they are obtained...
-
Electron-impact dissociation of molecular hydrogen: benchmark cross sections
PublikacjaWe present a joint experimental and theoretical investigation of a fundamental process in atomic and molecular physics: electron impact excitation of molecular hydrogen’s (H2) most dominant transition (X1Σg+ → b3Σu+). Excitation of this state is by far the main channel that causes the dissociation of H2 into H + H atoms at low energies. The Convergent Close-Coupling (CCC) calculations predicted significant, more than factor of...
-
The significance of the properties of water for the working cycle of the kinesin molecular motor
PublikacjaExplicit solvent molecular dynamics simulations were performed in this study to investigate and discuss several aspects of the influence of the properties of water on the working cycle of a molecular motor from the kinesin superfamily. The main objects of attention were: the binding of the neck linker and the association of the kinesin and the tubulin. The docking of the neck linker is considered a crucial event during the working...
-
Evaluating experimental molecular physics studies of radiation damage in DNA*
PublikacjaThe field of Atomic and Molecular Physics (AMP) is a mature field exploring the spectroscopy, excitation, ionisation of atoms and molecules in all three phases. Understanding of the spectroscopy and collisional dynamics of AMP has been fundamental to the development and application of quantum mechanics and is applied across a broad range of disparate disciplines including atmospheric sciences, astrochemistry, combustion and environmental...
-
ortho-Fluorobenzanilides and ortho-fluorothiobenzanilides: Molecular conformations and crystal packing
PublikacjaSeries of 2-fluoro and 2,6-difluorobenzanilides and their thiobenzanilide analogs have been synthesized to investigate the influence of the fluorine atom on their crystal structures and self-assembly in the crystal lattice. The X-ray analysis of the single crystal revealed that the synthesized molecules adopt a geometry being deflected from planarity. The deflection was investigated by analysis of dihedral angles between mean planes...
-
The Ellenbogen's "Matter as Software" Concept for Quantum Computer Implementation: II Bonding Between the C60 and X@C60 Molecules as Available Molecular Building Blocks (MBBs) for Tip-Based Nanofabrication (TBN) of Quantum Computing Devices
PublikacjaThe binding energy, BE of the X@C60-X@C60 homodimer and the X@C60-Y@C60 heterodimer resulting from the bond formation between the occupied X@C60 MBB and the C60 molecule was studied by means of semiempirical PM7 calculations, where X and Y denote atoms from H to Bi, excluding Tc and lanthanides. All possible combinations of N = 68 guest atoms were considered, which resulted in K = 2346 of different calculated dimers of (X@C60-Y@C60)...
-
Molecular modeling of amphotericin B - ergosterol primary complex in water II
PublikacjaPrezentowane badania dotyczą oddziaływania antybiotyku polienowego anfoterycyny B (AmB) i ergosterolu (ERG) (typowego sterolu błonowego komórek grzybowych) na poziomie molekularnym. W odróżnieniu od badanego poprzednio kompleksu binarnego analizowany obecnie kompleks AnB/ERG/AmB charakteryzuje się zdecydowanie wiekszą stabilnością i wzglednie sztywną, sandwiczową geometrią. Za trwałość i geometrie kompleksu odpowiedzialne są oddziaływania...
-
The FMO analysis of the molecular interaction of fentanyl derivatives with the μ-opioid receptor
Publikacja -
Effect of Nanohydroxyapatite on Silk Fibroin–Chitosan Interactions—Molecular Dynamics Study
PublikacjaFibroin–chitosan composites, especially those containing nanohydroxyapatite, show potential for bone tissue regeneration. The physicochemical properties of these biocomposites depend on the compatibility between their components. In this study, the intermolecular interactions of fibroin and chitosan were analyzed using a molecular dynamics approach. Two types of systems were investigated: one containing acetic acid and the other...
-
Structure of liquid gold from tight-binding driven molecular-dynamics
PublikacjaPraca przedstawia wyniki symulacji ciekłego złota w nadkomórce periodycznej przy użyciu stworzonego przez autorów programu komputerowego, za pomocą połączonych metod dynamiki molekularnej (MD) i ciasnego wiązania (TB). Omówiono strukturę tak symulowanej cieczy, porównując ją z dostępnymi danymi doświadczalnymi oraz wynikami innych symulacji, pod kątem radialnej i kątowej funkcji rozkładu i elektronowej gęstości stanów.A tight-binding...
-
Molecular Profiling for Predictors of Radiosensitivity in Patients with Breast or Head-and-Neck Cancer
Publikacja -
Brain/blood distribution described by a combination of partition coefficient and molecular mass
Publikacja -
Multiplatform metabolomics provides insight into the molecular basis of chronic kidney disease
Publikacja -
Separation of zinc from aqueous samples using a molecular imprinting technique
Publikacja -
Molecular differences in mitochondrial DNA genomes of dogs with malignant mammary tumours
Publikacja -
Molecular features of thymidine analogues governing the activity of human thymidine kinase
Publikacja -
Molecular dynamics simulations of the growth of poly(chloro-para-xylylene) films
Publikacja -
Processing and Maturation of Cathepsin C Zymogen: A Biochemical and Molecular Modeling Analysis
Publikacja -
Theory and Practice of Coarse-Grained Molecular Dynamics of Biologically Important Systems
Publikacja -
Selected molecular and microfluidic aspects of mammalian oocyte maturation-perspectives: a review
Publikacja -
Simulation of the Opening and Closing of Hsp70 Chaperones by Coarse-Grained Molecular Dynamics
Publikacja -
The immunological, biochemical and molecular bases of canine senescence and carcinogenesis: a review
Publikacja -
Albumin–Hyaluronan Interactions: Influence of Ionic Composition Probed by Molecular Dynamics
PublikacjaThe lubrication mechanism in synovial fluid and joints is not yet fully understood. Nevertheless, intermolecular interactions between various neutral and ionic species including large macromolecular systems and simple inorganic ions are the key to understanding the excellent lubrication performance. An important tool for characterizing the intermolecular forces and their structural consequences is molecular dynamics. Albumin...
-
Interactions of amphotericin B derivatives with lipid membranes - a molecular dynamics study
PublikacjaW pracy analizowano oddziaływanie dwóch nisko-toksycznych pochodnych amfoterycyny B (związki SAmE i PAmE) z modelami błon lipidowych. Badania wykonane zostały za pomocą dynamiki molekularnej. Modele błon oprócz fosfolipidów DMPC zawierały odpowiednio cholesterol (model błony zwierzęcej) lub ertosterol (model błony grzybowej). Analiza wyników wykazała, że obie pochodne amfoterycyny B zachowują się inaczej w błonie cholesterolowej...
-
Study of the transport properties of a molecular junction as a function of the distance between the leads
Publikacja -
Molecular epidemiology of chronic hepatitis B virus infection in northern Poland
Publikacja -
Analysis of molecular structure of starch citrate obtained by a well-stablished method
Publikacja -
Molecular action of isoflavone genistein in the human epithelial cell line HaCaT
Publikacja -
The molecular mechanism of genistein action in lysosomal storage diseases: A transcriptomic approach
Publikacja -
Molecular Diagnostics of Brain Tumours by Measuring the 5-Methylcytosine Level in Their DNA
Publikacja -
Separation of variables in molecular-dynamics simulations: A criterion to estimate the quality of the approximation
Publikacja -
Molecular Diffusion Simulation on ARUZ – Massively-parallel FPGA-based Machine
Publikacja -
A Model of Thermally Activated Molecular Transport: Implementation in a Massive FPGA Cluster
Publikacja -
Molecular dynamics simulations of the growth of poly (chloro-para-xylylene) films.
PublikacjaParylene C, poly(chloro-para-xylylene) is the most widely used member of the parylene family due to its excellent chemical and physical properties. In this work we analyzed the formation of the parylene C film using molecular mechanics and molecular dynamics methods. A five unit chain is necessary to create a stable hydrophobic cluster and to adhere to a covered surface. Two scenarios were deemed to take place. The obtained results...
-
Molecular and structural characteristics of cod gelatin films modifiedwith EDC and TGase
PublikacjaCod gelatin films before and after cross-linking of gelatin with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide (EDC) or transglutaminase (TGase) have been characterized by FT-IR spectroscopy and DSC analysis. For comparison, a film prepared from unmodified pig gelatin has been also analysed. The difference spectra showed that cod gelatin during the film formation involved first of all water-to-amide hydrogen bonds, and the film...
-
Interaction of amphotericin B with phospholipids in the model membrane - molecular dynamics study.
PublikacjaAmfoterycyna B jest antybiotykiem używanym w leczeniu układowych infekcji grzybowych. Jej mechanizm działania polega na tworzeniu kanałów wewnątrz błon lipidowych. W przedstawianej pracy publikowane są wyniki symulacji przeprowadzonej dynamiką molekularną monomerycznej i dimerycznej formy antybiotyku wewnątrz błony lipidowej zbudowanej z cząsteczek DMPC. Wyniki te wskazują, że powinowactwo cząsteczek amfoterycyny wewnątrz dimeru...
-
The structure of porous and spontaneously densified amorphous PbSiO3: a Molecular Dynamics study.
PublikacjaW pracy zaproponowano nową metodę numerycznego otrzymywania strukturporowatych metodą dynamiki molekularnej. Metoda polega na rozpoczęciu symulacji z ładunkami ekranowanymi i stopniowym zwiększaniu ich do pełnych ładunków jonowych. Metodę zastosowano do układu PbSiO3.
-
The structure of Pb-PbO-SiO2 glass via molecular dynamics simulation
PublikacjaPraca poświęcona jest badaniom struktury blisko i średniozasięgowej częściowo zredukowanego szkła ołowiowo-krzemianowego o stechiometrii 1Pb1PbO1SiO2 uzyskanego na drodze symulacji dynamiczno-molekularnych. Otrzymane rezultaty porównamy z danymi otrzymanymi dla szkła niemodyfikowanego (2PbO1SiO2) i całkowicie zredukowanego (2Pb1SiO2).
-
Ab initio molecular treatment for charge transfer by S3+ ion on hydrogen.
PublikacjaPoliczono adiabatyczne potencjały oddziaływania między jonem siarki i wodoru. Dokonano obliczeń nieadiabatycznych sprzężeń pomiędzy tymi potencjałami. Obliczenia wykazały, że należy wziąć pod uwagę niezbadany wcześniej poziom energetyczny jonu siarki aby dokładnie wyjaśnić mechanizm przechwytu ładunku.
-
On the possibility of molecular recognition of taste substances studied by Gabor analysis of oscillations
PublikacjaBadano wpływ substancji odpowiedzialnych za wrażenia smakowe należące do czterech klas smaku (słodki, słony, gorzki i kwaśny) na charakterystyki oscylacyjne w nitrometanowym oscylatorze zawierającym kationowy surfaktant: chlorek benzylodimetylotetradecyloamoniowy. Zapropnowano nowe podejście oparte o transformację Gabora za pomocą której otrzymano widma mocy dla posczególnych układów. Wykazano, że dwuwymiarowa forma tych widm może...
-
A Molecular dynamics study of the influence of chemical reduction on the structure of amorphous germania
PublikacjaPraca poświęcona jest badaniom struktury blisko- i średniozasięgowej redukowanego amorficznego tlenku germanu o składzie 1Ge 1GeO2 za pomocą symulacji dynamiczno-molekularnych. Symulacje MD realizowano w zespole mikrokanonicznym (NVE), z wykorzystaniem dwuciałowego potencjału oddziaływania miedzyatomowego Borna-Mayera-Hugginsa. Wyraźnie widoczna tendencja do aglomeracji neutralnych atomów Ge została porównana z tendencją do aglomeracji...
-
Hydration of N-Hydroxyurea from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations
PublikacjaN-Hydroxyurea (HU) is an important chemotherapeutic agent used as a first-line treatment in conditions such as sickle cell disease and β-thalassemia, among others. To date, its properties as a hydrated molecule in the blood plasma or cytoplasm are dramatically understudied, although they may be crucial to the binding of HU to the radical catalytic site of ribonucleotide reductase, its molecular target. The purpose of this work...
-
Molecular self-assembly and optical activity of chiral thionooxalamic acid esters
PublikacjaZsyntezowano kilka optycznie czynnych estrów dietylowych kwasu bis(tiooksamowego). Związki te, z powodu ich zdolności do tworzenia ze sobą komplementarnych cyklicznych wiązań wodorowych, są potencjalnie użytecznym materiałem budulcowym większych układów supramolekularnych. Odpowiednie układy modelowe otrzymano z optycznie czynnych 1,2-diamin, które poddano acylowaniu chlorooksooctanem etylu, a następnie otrzymane półprodukty tionowano...
-
Structure and Molecular Dynamics in Renewable Polyamides from Dideoxy-Diamino Isohexide
PublikacjaThe chemical structure, the conformation, andthe flexibility of the polymer chain fragments present in thepolyamides synthesized from 2,5-diamino-2,5-dideoxy-1,4;3,6-dianhydrosorbitol, 1,4-diaminobutane, and either sebacic orbrassylic acid have been studied by liquid-state 2D NMRspectroscopy viz. correlation spectra (COSY) and heteronuclearmultiple-bond correlation spectra (gHMBC), by 13Ccross-polarization/magic-angle spinning...
-
Low-Molecular Pyrazine-Based DNA Binders: Physicochemical and Antimicrobial Properties
PublikacjaPyrazine and its derivatives are a large group of compounds that exhibit broad biological activity, the changes of which can be easily detected by a substituent effect or a change in the functional group. The present studies combined theoretical research with the density functional theory (DFT) approach (B3LYP/6-311+G**) and experimental (potentiometric and spectrophotometric) analysis for a thorough understanding of the structure...