Filters
total: 3489
-
Catalog
displaying 1000 best results Help
Search results for: MULTIBODY DYNAMICS
-
Editorial: smart modeling support for managing complexities and dynamics of knowledge-based systems-part 1
Publication -
Theoretical Investigation of the Electron-Transfer Dynamics and Photodegradation Pathways in a Hydrogen-Evolving Ruthenium-Palladium Photocatalyst
PublicationTime-dependent density functional theory calcula- tions combinedwith the Marcus theory of electron transfer (ET) were app lied on the molecular photocatalys t [(tbbpy) 2 Ru(tpph z)PdC l 2 ] 2 + in order to elucidate thelight-in- duced relaxation pathways populated upon excitation in the longer wavelength range of its absorption spectrum. The computational resultsshow that after the initial excitation, metal (Ru) to ligand (tpphz)chargetransfer...
-
Computational Fluid Dynamics Simulation of Gas–Liquid Multiphase Flow in T-junction for CO2 Separation
PublicationThe article presents the results of a computational fluid dynamics (CFD) analysis of gas-liquid multiphase flow. The simulation was conducted using CFD code and the Euler–Euler approach. The presented study relates to the non–reactive, steady-state, turbulent flow of water and carbon dioxide mixture in a 3D pipe. Separation phenomenon between phases is observed. The solution was obtained using a mixture model. Different values...
-
Pre‐exascale HPC approaches for molecular dynamics simulations. Covid‐19 research: A use case
PublicationExascale computing has been a dream for ages and is close to becoming a reality that will impact how molecular simulations are being performed, as well as the quantity and quality of the information derived for them. We review how the biomolecular simulations field is anticipating these new architectures, making emphasis on recent work from groups in the BioExcel Center of Excellence for High Performance Computing. We exemplified...
-
Solvent Exchange around Aqueous Zn(II) from Ab Initio Molecular Dynamics Simulations
PublicationHydrated zinc(II) cations, due to their importance in biological systems, are the subject of ongoing research concerning their hydration shell structure and dynamics. Here, ab initio molecular dynamics (AIMD) simulations are used to study solvent exchange events around aqueous Zn2+, for which observation in detail is possible owing to the considerable length of the generated trajectory. While the hexacoordinated Zn(H2O)62+ is the...
-
Improvements and new functionalities of UNRES server for coarse-grained modeling of protein structure, dynamics, and interactions
PublicationIn this paper we report the improvements and extensions of the UNRES server (https://unres-server.chem.ug.edu.pl) for physics-based simulations with the coarse-grained UNRES model of polypeptide chains. The improvements include the replacement of the old code with the recently optimized one and adding the recent scale-consistent variant of the UNRES force field, which performs better in the modeling of proteins with the β and the...
-
Free volume in physical absorption of carbon dioxide in ionic liquids: Molecular dynamics supported modeling
PublicationUnderstanding the mechanisms underlying the carbon dioxide (CO2) absorption in ionic liquids (ILs) is the key to their efficient utilization in industrial flue gas treatment. One of the parameters considered substantially important in the process is the Free Volume. In this study, the Fractional Free Volume (FFV) of 73 ILs was calculated using Molecular Dynamics (MD). A quantitative Structure-Property Relationship (QSPR) study...
-
Silica In Silico: A Molecular Dynamics Characterization of the Early Stages of Protein Embedding for Atom Probe Tomography
PublicationA novel procedure for the application of atom probe tomography (APT) to the structural analysis of biological systems, has been recently proposed, whereby the specimen is embedded by a silica matrix and ablated by a pulsed laser source. Such a technique, requires that the silica primer be properly inert and bio-compatible, keeping the native structural features of the system at hand, while condensing into an amorphous, glass-like...
-
Mechanical Properties of Twisted Carbon Nanotube Bundles with Carbon Linkers from Molecular Dynamics Simulations
PublicationThe manufacturing of high-modulus, high-strength fibers is of paramount importance for real-world, high-end applications. In this respect, carbon nanotubes represent the ideal candidates for realizing such fibers. However, their remarkable mechanical performance is difficult to bring up to the macroscale, due to the low load transfer within the fiber. A strategy to increase such load transfer is the introduction of chemical linkers...
-
Encapsulation of an anticancer drug Isatin inside a host nano-vehicle SWCNT: a molecular dynamics simulation
PublicationThe use of carbon nanotubes as anticancer drug delivery cargo systems is a promising modality as they are able to perforate cellular membranes and transport the carried therapeutic molecules into the cellular components. Our work describes the encapsulation process of a common anticancer drug, Isatin (1H-indole-2,3-dione) as a guest molecule, in a capped single-walled carbon nanotube (SWCNT) host with chirality of (10,10). The...
-
Formation of Protein Networks between Mucins: Molecular Dynamics Study Based on the Interaction Energy of the System
PublicationMolecular dynamics simulations have been performed for a model aqueous solution of mucin. As mucin is a central part of lubricin, a key component of synovial fluid, we investigate its ability to form cross-linked networks. Such network formation could be of major importance for the viscoelastic properties of the soft-matter system and crucial for understanding the lubrication mechanism in articular cartilage. Thus,the inter- and...
-
Molecular Dynamics to Predict Cryo-EM: Capturing Transitions and Short-Lived Conformational States of Biomolecules
PublicationSingle-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM) has revolutionized the field of the structural biology, providing an access to the atomic resolution structures of large biomolecular complexes in their near-native environment. Today’s cryo-EM maps can frequently reach the atomic-level resolution, while often containing a range of resolutions, with conformationally variable regions obtained at 6 Å or worse. Low resolution...
-
Anion–water interactions of weakly hydrated anions: molecular dynamics simulations of aqueous NaBF4 and NaPF6
PublicationIn aqueous ionic solutions, both the structure and the dynamics of water are altered dramatically with respect to the pure solvent. The emergence of novel experimental techniques makes these changes accessible to detailed investigations. At the same time, computational studies deliver unique possibilities for the interpretation of the experimental data at the molecular level. Here, using molecular dynamics simulations, we demonstrate...
-
Degradation of a nano-cutting tool: an MD simulation
PublicationW pracy przedstawiono wyniki symulacji wielokrotnego oddziaływania realistycznie ukształtowanego ostrza tnącego z modelowym, nieskończenie twardym ziarnem, przy zastosowaniu metody dynamiki molekularnej. Ostrze składało się z kilkuset tysięcy atomów metalu fcc, traktowanego za pomocą potencjału Suttona-Chena, przesuwane było ze stałą prędkością 20 m/s. Obserwowane deformacje plastyczne pojawiające się na skutek kontaktu ostrza...
-
Multicopy Suppressor Analysis of Strains Lacking Cytoplasmic Peptidyl-Prolyl cis/trans Isomerases Identifies Three New PPIase Activities in Escherichia coli That Includes the DksA Transcription Factor
PublicationConsistent with a role in catalyzing rate-limiting step of protein folding, removal of genes encoding cytoplasmic protein folding catalysts belonging to the family of peptidyl-prolyl cis/trans isomerases (PPIs) in Escherichia coli confers conditional lethality. To address the molecular basis of the essentiality of PPIs, a multicopy suppressor approach revealed that overexpression of genes encoding chaperones (DnaK/J and GroL/S),...
-
Dynamika piły tarczowej i wrzeciona przecinarki
PublicationOpisano metodykę określania właściwości dynamicznych układu wrzecionowego pilarki tarczowej w sposób eksperymentalny. Opisana metoda pozwala wykazać, że w określonych przypadkach o zachowaniu piły decydującą rolę może odgrywać wrzeciono pilarki i sposób jego napędu.
-
Dynamical properties of ordered Fe–Pt alloys
Publication -
Zatrudnienie i bezrobocie a dynamika wzrostu gospodarczego
PublicationW pierwszej części artykułu przedstawiono koncepcję teoretyczną opisującaą związki pomiędzy dynamiką wzrostu produktu krajowego a stopą wzrostu zatrudnienia i stopą bezrobocia w warunkach zmian nakładów kapitałowych i postępu technicznego. W następnej kolejności przedstawiono model teoretyczny opisujący te związki i sformułowano założenia leżące u jego podstaw. W końcowej części artykułu, na podstawie informacji kwartalnych z lat...
-
Connection matrix theory for discrete dynamical systems
Publication -
Connection matrix theory for discrete dynamical systems
PublicationIn [C] and [F1] the connection matrix theory for Morse decomposition is developedin the case of continuous dynamical systems. Our purpose is to study the case of discrete timedynamical systems.
-
Badania dynamiki wybranych morskich obiektów pływających
PublicationPraca zawiera - w ujęciu skróconym materiał z zakresu ogólnych badań dynamiki morskich obiektów pływających - w ujęciu rozszerzonym i pogłębionym - materiał z badań dynamiki morskich obiektów pływających, należących do klasy pływakowych obiektów segmentowych. Dla obiektów segmentowych reprezentujących katamarany i trimarany załączone są wyniki obliczeń i badań modelowych.
-
Problem opisu dynamiki recyrkulacji w reaktorach.
PublicationOmówiono aktualne problemy związane z kwestią recyrkulacji w obiektach oczyszczalni ścieków. Wskazano na znaczny wzrost stosowanych stopni recyrkulacji w ostatnim czasie i przeanalizowano jego przypuszczalne przyczyny oraz konsekwencje. Omówiono wyniki badań przeprowadzonych w laboratoryjnym modelu osadnika.
-
Laboratorium Dynamiki i Automatyzacji Maszyn Technologicznych
PublicationW dokumencie zawarto opis profilu działalności Laboratorium Dynamiki i Automatyzacji Maszyn Technologicznych utworzonego w ramach Katedry Technologii Maszyn i Automatyzacji Produkcji. Na dołączonych ilustracjach przedstawiono najważniejsze stanowiska badawczo- dydaktyczne oraz kilka przykładowych wyników testów zautomatyzowanych napędów.
-
Wybrane elementy nieliniowej dynamiki struktur kratowych
PublicationW pracy jest dyskutowany problem nieliniowej dynamiki struktur kratowych. Zastosowano stacjonarny opis Lagrange'a (ang. Total Lagrange), pokazano silne i słabe sformułowanie dla pręta kratowego, jego aplikację do MES. W zakresie całkowania równań ruchu przedstawiono metodę Newmarka i metodę-a dla problemów liniowych i nieliniowych. Załączony przykład numeryczny ilustruje cechy przedstawionych metod.
-
Metody sprzęgania modeli dynamiki rurociągów przemysłowych
PublicationArtykuł opisuje dwie metody sprzęgania modeli dynamiki rurociągów przesyłowych. Stanowią one niezbędny element przy budowie efektywnych systemów symulacji rozległych i złożonych instalacji rurociągów stosowanych w przemyśle. Pierwsza z proponowanych metod (globalna metoda sprzęgania - GMS) wykorzystuje 'globalne' (w skali modelu) zależności (oraz fizyczne przybliżone zależności) pomiędzy ciśnieniem i przepływem masowym medium w...
-
Investigations of the passive layer cracking by means of Dynamic Electrochemical Impedance Spectroscopy
Publication -
Interline power flow controller - properties and control strategy in dynamic states
Publication -
Nonlinear modeling of traction transformer with coiled iron core for dynamic simulation
PublicationW referacie przedstawiono wyprowadzenie zastępczego modelu obwodowego transformatora trakcyjnego o rdzeniu zwijanym do analiz zachowania sie transformatora w układzie napedowym jednostki trakcyjnej. Model zakłada nieliniowa charakterystyke magnesowania B-H i anizotropowe właściwosci magnetyczne i elektryczne zwijanego rdzenia. Wyprowadzenie modelu oparto na metodzie energetycznej Lagrange'a. Uzwojenia zostały zamodelowanie jako...
-
State equations in the mathematical model of dynamic behaviour of multihull floating unit
PublicationPrzedstawiony artykuł dotyczy dynamiki wielokadłubowej jednostki pływającej typu katamaran poddanej wymuszeniom pochodzącym od falowania nieregularnego. Analiza dynamiki jednostki wielokadłubowej została przeprowadzona przy założeniu, że model układu jest modelem liniowym na który działa fala nieregularna. Model matematyczny takiego układu dynamicznego jest reprezentowany poprzez równania stanu. Zapisane zostały równania uwzględniające...
-
Dynamic Modeling of COVID-19 Disease with Impact of Lockdown in Pakistan and Malaysia
PublicationBeing researchers, it is an utmost responsibility to provide insight on social issues thus, this work addresses the dynamic modeling of first and most contagious disease named as COVID-19 caused by coronavirus. The first case of COVID-19 appeared in Pakistan was on 26th February 2020 and in Malaysia on 27th February 2020; both patients had foreign travel history. In the paper, the number of total affected cases and total deaths...
-
Static and dynamic modelling blow- out type trauma of orbital wall
PublicationAuthors of the paper present initial results of finite element analysis of a blow-out type trauma of orbital wall. The research is liked with laboratory tests for the Young’s modulus of bones evaluation. In the finite element analysis the neighbourhood of orbital wall is modelled by triangle thin shell finite elements. In the paper results of nonlinear static and transient dynamic analysis (including damping) are compared. The...
-
Active Dynamic Thermography imaging of wound healing processes in cardio surgery
PublicationThe surgery is a branch of medicine, that is integrally connected to wounds. Despite using sterile tools and compliance with aseptic rolls, some of the surgery wounds become infected. In clinical practice there is a lack of cheap, objective methods and tools for quantitative definition and estimation of the surgery wound healing progress. This paper presents preliminary results of Active Dynamic Thermography (ADT) parametric imaging...
-
The study on dynamic properties of monolithic ball end mills with various slenderness
Publication -
Dynamic mechanical thermal analysis of polyamide 6/thermoplastic polyurethane blends
Publication -
Application of dynamic time warping and cepstrograms to text-dependent speaker verification
PublicationThis work provides a description of an automatic speaker verification (ASV) system. In particular, it documents the evolution of all individual stages of the proposed ASV system design from the phase of preprocessing to an operational decision making system. The aim of this research was to achieve the system of the best safety and ease of use in view of users. The objective estimation of this target has been accomplished by assessing...
-
Dynamic computation of acoustic field distribution in the city area employing a supercomputer
Publication -
Boundary value problems for dynamic equations of Volterra type on time scales
PublicationPraca dotyczy równań i nierówności dla problemów dynamicznych typu Volterry. Podano warunki dostateczne na istnienie ekstremalnych rozwiązań w obszarze ograniczonym przez dolne i górne rozwiązania. Praca zawiera również pewne uwagi dla konkretnych zagadnień różniczkowych i dyskretnych.
-
The process of developing dynamic capabilities: The conceptualization attempt and the results of empirical studies
Publication -
Dynamic current-voltage characteristics of dielectrics with extremely low heat conductivity
PublicationZaprezentowano teoretyczny opis metody dynamicznych charakterystyk prądowo-napięciowych w przypadku znacznego gradientu temperatury w ciałach stałych o przewodności jonowej. Otrzymano rozwiązania równania transportu oraz równania charakterystyk, odnoszące się do ruchu cienkiej warstwy nośników ostałej grubości oraz warstwy rozszerzającej się. Podano także przybliżone wyrażenia opisujące czas przelotu nośników. Wyniki zweryfikowano...
-
Evolutionary - fuzzy hybrid system of steering the moveable object in dynamic environment
Publication...
-
The application of dynamic electrochemical impedance spectroscopy for stress corrosion cracking studies
PublicationElektrochemiczna Spektroskopia Impedancyjna (ESI) od wielu lat stanowi jedno z najważniejszych narzędzi wykorzystywanych do badania różnych procesów elektrochemicznych. Możliwość przeprowadzania badań w łącznej dziedzinie czasowo-częstotliwościowej ułatwia analizę pomiarów impedancyjnych w czasie. ESI pozwala również na analizę mechanizmu procesów elektrochemicznych w dziedzinie czasu z uwzględnieniem bardzo szybkich zjawisk, takich...
-
Large dynamic range high frequency fully differential CMOS transconductanceamplifier.
PublicationW pracy zaproponowano nową koncepcję układową w pełni różnicowego wzmacniacza transkonduktancyjnego CMOS o dużym zakresie dynamiki i szerokim pasmie częstotliwości. Przeprowadzone badania teoretyczne i symulacyjne potwierdziły małe zniekształcenia harmoniczne (THD), szerokie pasmo przenoszonych częstotliwości oraz duży zakres dynamiki dla sygnałów różnicowych.
-
Investigations of the passive layer cracking by means of dynamic electrochemical impedance spectroscopy.
PublicationDynamiczna elektrochemiczna spektroskopia impedancyjna została wykorzystana do badania pękania warstwy pasywnej na austenitycznej stali wysokostopowej.Zbadano efekt narzuconego potencjału oraz naprężeń rozciągających na pękanie korozyjne stali wysokostopowej 304L w środowisku 0.5M NaCl w temperaturze pokojowej. Praca przedstawia chwilowe widma impedancyjne uzyskane dla badanego układu przy różnych wartościach potencjałów. Uzyskane...
-
Features of ammonium-ions sorption by natural zeolites under dynamic conditions.
PublicationW pracy przedstawiono: charakterystykę naturalnych zeolitów, obszar ich praktycznego wykorzystania w zakresie adsorpcyjnego usuwania niektórych zanieczyszczeń z wód oraz wyniki badań procesu adsorpcji jonów amoniowych z wodnych roztworów modelowych (w układzie dynamicznym) na wybranych zeolitach naturalnych.
-
Hierarchical dynamic hybrid models for aided design of ship power subsystems.
PublicationRozważa się wielopoziomowe modele systemu energetycznego statku. Elementy systemu są modelowane z użyciem ciągłych zmiennych stanu i uwzględnieniem zerowego związku przyczynowo-skutkowego. Poziom pierwszy opisuje wzajemne związki modeli zerowego poziomu, poziom drugi reprezentuje powiązania modeli pierwszego poziomu itd. W ten sposób opisuje się modele elementów zespołów i podsystemów. Każdy z modeli może być hybrydowym modelem...
-
Dynamic analysis including special constitutive model for PVC-coated fabrics.
PublicationW pracy przestawiono dynamiczne obliczenia membranowego przekrycia wiszącego w kształcie paraboloidy hiperbolicznej poddanej impulsowemu działaniu wiatru. Do opisu zachowania się powleczonej polichlorkiem winylu tkaniny technicznej zastosowano równania konstytutywne modelu sieci gęstej z uwzględnieniem sprężystych i sprężysto-lepkoplastycznych właściwości wątku i osnowy.
-
Dynamic Nanoimpedance Characterization of the Atomic Force Microscope Tip-Surface Contact
PublicationNanoimpedance measurements, using the dynamic impedance spectroscopy technique, were carried out during loading and unloading force of a probe on three kinds of materials of different resistivity. These materials were: gold, boron-doped diamond, and AISI 304 stainless steel. Changes of impedance spectra versus applied force were registered and differences in the tip-to-sample contact character on each material were revealed. To...
-
The initial selection of parameters for dynamic brake for car engine test dynamometer
PublicationThe article presents an analysis of the car engine loads. The aim of the analysis was to determine the parameters of the brake / electric motor on an engine test bad. Analysis of loads on the driving tests concerned on chassis dynamo to simulate them on an engine dynamometer. To check the range of dynamometer shaft angular acceleration inertial mass of a car was reduced on the crankshaft axis. The calculations of maximum shaft...
-
Application of the dynamic electrochemical impedance spectroscopy to investigation of spontaneous electrochemical oscillations
PublicationPrzedstawione zostały wyniki impedancyjne uzyskane podczas oscylacji prądowych miedzi w kwaśnym środowisku zawierającym jony chlorkowe. Kształt chwilowych widm impedancyjnych jest skorelowany z uzyskanym przebiegiem prądowym. Badany proces anodowego roztwarzania miedzi kontrolowany jest na przemian aktywacyjnie i dyfuzyjnie.
-
CAVER 3.0: A Tool for the Analysis of Transport Pathways in Dynamic Protein Structures
Publication