Publications
Filters
total: 455
Catalog Publications
-
Antygeny rekombinantowe Toxoplasma gondii jako narzędzie w diagnostyce toksoplazmozy
Publication -
Konstrukcja i wstępna ocena użyteczności szczepionki anty-Toxoplasma gondii opartej na chimerycznych fimbriach Escherichia coli typu Dr z epitopami antygenów SAG1, GRA1 lub MAG1
Publication -
Five-hour diagnosis of dermatophyte nail infections with specific detection of Trichophyton rubrum
PublicationW publikacji przedstawiono szybką dwuetapową metodę oczyszczania DNA oraz opartą na technice multiplex PCR metodę wykrywania grzybów z rodzaju dermatofitów oraz gatunku Trichophyton rubrum z hodowli grzybów oraz bezpośrednio ze zmienionych chorobowo paznokci. Testy stu osiemnastu próbek z użyciem zaprojektowanej reakcji multiplex PCR i dwóch kolejnych (jedna wykrywająca grzyby z rodzaju dermatofitów, druga wykrywająca gatunek T....
-
Opracowanie zestawu diagnostycznego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych metodą PCR MP
PublicationOmówiono etapy tworzenia zestawu diagnostycznego przeznaczonego do genetycznego typowania szczepów bakteryjnych wykorzystującego procedurę PCR MP (PCR Melting Profiles). Dokonano optymalizacji warunków i walidacji metody w celu przystosowania jej do potrzeb epidemiologicznej oceny zakażeń szpitalnych. Opracowany zestaw stwarza możliwości zastosowania go w laboratoriach prowadzących rutynowo badania diagnostyczne.
-
ALIS-FLP: amplified ligation selected fragment-length polymorphism method for microbial genotyping
PublicationA DNA fingerprinting method known as ALIS-FLP (amplified ligation selected fragment-length polymorphism) has been developed for selective and specific amplification of restriction fragments from TspRI restriction endonuclease digested genomic DNA. The method is similar to AFLP, but differs in that only one specific restriction enzyme (TspRI) is used. The cohesive ends of the DNA fragments are ligated with two types of oligonucleotide....
-
A new MIC1-MAG1 recombinant chimeric antigen can be used instead of the Toxoplasma lysate antigen in the serodiagnosis of human toxoplasmosis
PublicationW niniejszej publikacji po raz pierwszy przedstawiono otrzymanie i oszacowanie przydatności diagnostycznej nowego chimerycznego antygenu MIC1-MAG1 Toxoplasma gondii do rozpoznawania toksoplazmozy u ludzi. Antygen chimeryczny MIC1-MAG1 został otrzymany jako białko fuzyjne zawierające dwie domeny oligohistydynowe na N- i C-końcu z użyciem systemu ekspresyjnego Escherichia coli. Po oczyszczeniu z wykorzystaniem metody chromatografii...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganisms Based on the Use of a Class IIS Restriction Enzyme and Ligation Mediated PCR
PublicationThis study details and examines a novel Ligation-Mediated - Polymerase Chain Reaction (LM-PCR) method. Named the LM-PCR/Shifter, it relies on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base, 5' overhangs, this being the Shifter, and the ligation of appropriate oligonucleotide adapters. A sequence of 4-base, 5' overhangs of the adapter and a 4-base sequence of the 3' end of the primer(s)...
-
Cardinal regenerative features of the MRL mouse
PublicationIn this review, we discuss recent studies relating to major features of adult MRL mouse biology that contribute to the regenerative responses seen. These include an increased inflammatory cell profile, a unique glycolytic metabolic state typically found during embryogenesis, and a cell cycle phenotype of DNA damage and G2/M arrest. These traits have been found in other mammalian and non-mammalian regenerative systems. How these...
-
The New LM-PCR/Shifter Method for the Genotyping of Microorganism
PublicationTechniques relies on the ligation of appropriates adapters (LM-PCR) as AFLP, PCR MP and ADSRRS are successfully used for epidemiological studies for prokaryotic and eukaryotic microorganisms. In this study we propose a new method, called the LM-PCR/Shifter, based on the use of a Class IIS restriction enzyme giving restriction fragments with different 4 base 5' overhangs (Shifter) and the ligation of appropriate oligonucleotide...
-
Rekombinowane białka fagowe - nowe narzędzie do wykrywania patogenów w żywności
PublicationArtykuł opisuje nowatorskie i rewolucyjne podejście do wykrywania patogenów w żywności, które polega na zastosowaniu w testach VIDAS specyficznych rekombinowanych białek pochodzących z bakteriofagów.
-
Nowe testy diagnostyczne oparte o antygeny rekombinantowe Toxoplasma gondii do wykrywania oraz różnicowania fazy wczesnej i przewlekłej toksoplazmozy
PublicationToksoplazmoza jest jedną z najbardziej powszechnych chorób pasożytniczych człowieka i zwierząt stałocieplnych. Na świecie jedna trzecia ludzkiej populacji jest chronicznie zarażona Toxoplasma gondii. Mimo, iż choroba ta u zdrowych,dorosłych osób zazwyczaj ma charakter bezobjawowy, bardzo poważne objawy mogą wystąpić w przypadku wrodzonego zarażenia oraz u osób z niedoborem odporności. Ponadto, pomimo dokładnego poznania jej etiologii...
-
DDLMS PCR double digestion Ligation Mediated Suppression PCR - a new technique for bacterial specific differentiation
PublicationA new diagnostic kit for K. oxytoca specific differentiation based on ddLMS PCR (ang. double digest ligation Mediated PCR) technique is shown. As a species-specific DNA fragment pehX gene, encoding the enzyme polygalactouronase, was chosen. The genome sequence of K. oxytoca is digested with two endonucleases: AclI and BclI which cut DNA before and after pehX gene. The polymorphic DNA fragments are ligated with AclI-end-specific...
-
D-Tagatoza - prosty cukier o ogromnym potencjale aplikacyjnym
PublicationD-Tagatoza jest naturalnym cukrem prostym, występującym w przyrodzie w niewielkich ilościach. D-Tagatoza jest ketoheksozą, epimerem D-fruktozy oraz izomerem D-galaktozy. Jest to związek dobrze rozpuszczalny w wodzie, stabilny w pH 2-7 i wykazujący słodki smak. Słodkość D-tagatozy wynosi 92% słodkości sacharozy, jednak jej kaloryczność jest znacznie niższa. Wysoka słodkość oraz niska wartość kaloryczna D-tagatozy sprawiają, iż stanowi...
-
Modulation of immune response to Toxoplasma gondii in sheep by immunization with a DNA vaccine encoding ROP1 antigen as a fusion protein with ovine CD154
PublicationNiniejszy artykuł prezentuje porównanie skuteczności działania w immunizacji owiec dwóch antytoksoplazmozowych szczepionek DNA: kodującej białko ROP1 Toxoplasma gondii oraz kodującej w/w antygen i owczą cząsteczkę CD154 lokalizowaną na powierzchni aktywowanych komórek T. Otrzymane wyniki badań pokazały, iż domięśniowe podanie szczepionki DNA zawierającej gen kodujący ROP1 i CD154 znacząco wzmacnia odpowiedź immunologiczną szczepionych...
-
Homocitrate synthase gene as a new molecular target in diagnostics of Candida spp. infections
PublicationNew potential molecular target which will be investigated during this research (homocitrate synthase gen) is the innovative target other than ribosomal DNA. This gene encodes enzyme present only in fungi and some Archaea what significantly increases specificity. It also reduces risk of contamination or influence of other factors (reaction with other DNA present in sample derived from bacteria or host cells) what excludes false...
-
Urinary Tract Infections of Escherichia coli Strains of Chaperone-Usher System
PublicationZakażenia dróg moczowych stanowią bardzo poważny problem zdrowotny i ekonomiczny dotyczący milionów ludzi, każdego roku na całym świecie. Najbardziej rozpowszechnionym czynnikiem etiologicznym tego typu infekcji bakteryjnych, obejmujących górne i dolne drogi moczowe, są szczepy E. coli, reprezentujące około 80% przypadków. Uropatogenne szczepy E. coli produkują kilka czynników urowirulentncyh, które można podzielić na dwa główne...
-
Immunization with an anti-idiotypic antibody against the broadly lipopolysaccharide-reactive antibody WN1 222-5 induces Escherichia coli R3-core-type specific antibodies in rabbits
PublicationThe mouse monoclonal antibody (mAb) WN1 222-5 recognizes a carbohydrate epitope in the inner core region of LPS that is shared by all strains of Escherichia coli and Salmonella enterica and is able to neutralize their endotoxic activity in vitro and in vivo. Immunization of mice with mAb WN1 222-5 yielded several anti-idiotypic mAbs one of which (mAb S81-19) competitively inhibited binding of mAb WN1 222-5 to E. coli and Salmonella...
-
Detection of Toxoplasma gondii oocysts in environmental samples
PublicationToxoplasma gondii is an obligate intracellular parasite that has capacity to infect warm-blooded animals. Human toxoplasmosis is usually asymptomatic, whereas severe complications may occur in immunocompromised patients (e.g. AIDS) or in case of congenitalinfection. One of the sources of acquiring human toxoplasmosis is ingestion of T. gondii oocysts. It is known that newly infected cats can shed millions of oocysts into the environment,...
-
Detection of Toxoplasma gondii in meat - available techniques
PublicationToxoplasma gondii, which belongs to the phylum Apicomplexa, is an absolute intercellular parasite that infects a wide range of hosts, including warm-blooded animals and humans. An infection with this parasite causes toxoplasmosis, which in most cases remains latent. However, this disease is a major threat to immunocompromised people and pregnant women. In extreme cases, it can damage nervous system or case fatal abortion. Infected...
-
Grzyby środowiskowe jako biologiczne wskaźniki jakości powietrza w budynkach
PublicationAnaliza mikrobiologiczna powietrza ulega ciągłym usprawnieniom począwszy od lat czterdziestych XX wieku. Dzięki temu wykazano, iż grzyby środowiskowe (ich elementy lub substancje przez nie produkowane) mogą wpływać na stan powietrza w budynkach. Wysunięcie tych wniosków zeszło się w czasie z odkryciem Zespołu Chorego Budynku. Podczas gdy w normalnym powietrzu w budynkach dominuje rodzaj Cladosporium, w chorych budynkach znajduje...
-
Problem reakcji krzyżowych w immunodiagnostyce na przykładzie neosporozy i toksoplazmozy
PublicationW niniejszej pracy przedstawiono problem reakcji krzyżowych występujących w immunodiagnostyce chorób zakaźnych. Zagadnienie opisano szerzej na przykładzie dwóch blisko spokrewnionych pasożytów należących do typu Apicomplexa - Neospora caninum i Toxoplasma gondii. Zaprezentowano także, sposoby ulepszania testów wykorzystywanych w diagnostyce neosporozy i toksoplazmozy u zwierząt.
-
Genetic predisposition to inflammatory bowel disease
PublicationInflammatory bowel disease (IBD) is a chronic, incurable inflammatory disease of the digestive system. The two main disease entities included in the IBD are ulcerative colitis and Crohn's disease. According to epidemiological studies there are more and more new cases every year. In especially among the youngest patients with symptoms of malnutrition and growth inhibition to land up in hospitalwith cancer suspected. The purpose...
-
Production of Toxoplasma gondii MAG1 recombinant antigen in Leishmania tarentolae expression system
PublicationThe results of the work associated with the production of the Toxoplasma gondii matrix antigen 1 (MAG1) in the eukaryotic expression system of Leishmania tarentolae are shown.
-
Postępy w zakresie analizy powietrza mającej na celu identyfikację grzybów środowiskowych
PublicationPowietrze jest środowiskiem znacznie bliższym człowiekowi niż woda i gleba. Zatem jakość powietrza, szczególnie w pomieszczeniach, w których człowiek spędza nawet 80-95% czasu dnia jest jednym z najistotniejszych czynników wpływających na ogólną jakość życia ludzi. Skażenie powietrza w pomieszczeniach może wywoływać problemy zdrowotne. Jednym ze składników zanieczyszczeń powietrza są grzyby środowiskowe, które mogą wpływać na zdrowie...
-
Reakcje krzyżowe w immunodiagnostyce
PublicationZaprezentowano problem reakcji krzyżowych w immunodiagnostyce.
-
Nieswoiste zapalenie jelit
PublicationNieswoiste zapalenie jelit jest przewlekłą, nieuleczalną choroba zapalną układu pokarmowego. W niniejszej pracy przedstawiono dane epidemiologiczne, możliwe przyczyny wystąpienia choroby oraz opisano dwie główne jednostki chorobowe zaliczane do nieswoistego zapalenia jelit takie jak wrzodziejące zapalenie jelita grubego oraz choroba Leśniowskiego-Crohn'a.
-
Molecular detection of Candida krusei
PublicationThe species identification of fungi belonging to genus Candida is an important issue as this genus becomes the emerging problem of nosocomial infections. As Candida krusei presents intrinsicresistance to the fluconazole that is the drug of the first choice in case of invasive candidiasis the PCR identifying the DNA of C. krusei was elaborated. The analytical sensitivity of the assay on spiked blood samples was estimated at 3-5...
-
Podłoże nieswoistego zapalenia jelit
PublicationZaprezentowano możliwe czynniki ryzyka wystąpienia nieswoistego zapalenia jelit.
-
Covalent DNA modification by products of myrosinase catalysed glucosinolate degradation in cell-free system
PublicationThe bioactive phytochemicals found in Brassica vegetables belonging to glucosinolates (GLS) and especially the products of their degradation isothiocyanates (ITC) and indoles are regarded as the most promising cancer chemopreventive compounds. These secondary metabolites constitute defence system repelling or preventing the development of agrophages attacking brassica plants. The antibiological properties of these compounds suggest...
-
Real-Time PCR: molecular technique of many applications
PublicationReal-Time PCR is a sensitive DNA amplification technique initially applied in genetics and molecular biology. It enables in vivo copying of the selected DNA fragment (flanked by two primers) by the thermostable polymerase (in the presence of magnesium ions and deoxynucleotide triphosphates) and simultaneous measurement of the fluorescence. For one or more specific sequences in a DNA sample, real-time PCR enables both detection...
-
PCR detection of Scopulariopsis brevicaulis
PublicationScopulariopsis brevicaulis is known as a most common etiological factor of the mould toenail infections. There are also reports indicating that S. brevicaulis could cause organ and disseminated infections. Nowadays microscopic observations from the direct sample and culture are crucial for the appropriate recognition of the infection. In this paper is presented a PCR-based method for S. brevicaulis detection. The specificity of...
-
Increased concentration of Taq DNA polymerase as a solution for GC-rich templates from clinical and environmental samples
PublicationDNA polymerase is an enzyme which plays crucial role in replication and DNA repair. It found application in PCR (polymerase chain reaction) where catalyses process of in vitro DNA synthesis. To meet the demands posed by mod- ern diagnostic, molecular biology or genetic engineering it is necessary to improve DNA polymerases to obtain new or better features useful in these fields. So far implemented modifications in majority are...
-
Drożdżowe systemy ekspresyjne jako narzędzie nowoczesnej mikrobiologii przemysłowej
PublicationDrożdże łączą zalety prokariotycznych i eukariotycznych systemów ekspresyjnych. Charakteryzuje je szybki wzrost, osiągają też znacznie większą biomasę w porównaniu z bakteriami. W odróżnieniu od bakterii, drożdże zdolne są do przeprowadzania modyfikacji posttranslacyjnych białek. Kolejną zaletą drożdżowych systemów ekspresyjnych jest zdolność komórek drożdżowych do sekrecji białek do pożywki hodowlanej. W laboratoriach naukowych...
-
Amplification of a single-locus variable-number direct-repeats with restriction fragment length polymorphism (DR-PCR/RFLP) for genetic typing of Acinetobacter baumannii strains
PublicationW celu poszukiwania nowych metod typowania genetycznego szczepów Acinetobacter baumannii przydatnych w szpitalnych badaniach epidemiologicznych przeprowadzono analizę dostępnych w banku genów sekwencji szczepów referencyjnych na obecność nowych motywów repetytywnych. Do badania polimorfizmu sekwencji repetytywnych w szczepach Acinetobacter sp. wykorzystano proste powtórzenia typu "direct repeat" (DR) zlokalizowane w jednym miejscu...
-
Wykorzystanie reakcji PCR do badania charakterystycznych obszarów genomu
PublicationW pracy zostały opisane metody wykorzystujące technię PCR do długo- i krótkoterminowych badań epidemiologicznych. Typowanie szczepów oparte jest na analizie fragmentów genów, bądź całego genomu w zależności od potrzeby posiadania potencjału różnicującego metody. Przez ostatnie 30 lat rozwijały się nie tylko metody badawcze, doszło również do rozwoju międzynarodowych baz danych i przepływu informacji o obecnych sytuacjach epidemiologicznych...
-
Metody molekularne w dochodzeniach epidemiologicznych zakażeń szpitalnych
PublicationW dochodzeniu epidemiologicznym wykorzystuje się zmienność genetyczną mikroorganizmów do tzw. typowania genetycznego drobnoustrojów. W pracy omówiono metody genotypowe wykorzystujące podstawowe narzędzia molekularne, ukazano możliwości wykorzystania typowania drobnoustrojów w różnych aspektach badań mikrobiologicznych.
-
Rozdział 5. Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń grzybiczych wywoływanych przez dermatofity = Novel diagnostic methods of funfal infections caused by dermatophytes
PublicationDermatofity są głównym czynnikiem etiologicznym grzybic powierzchownych. Do tej klasy grzybów należą przedstawiciele trzech rodzajów: Epidermophyton, Microsporum i Trichophyton. Klasyczne metody diagnostyczne polegają na bezpośredniej ocenie mikroskopowej oraz badaniu hodowlanym. Identyfikacja gatunkowa jest możliwa na podstawie cech makroskopowych kolonii: ich struktury, koloru, kształtu, oraz obserwacji mikroskopowych (kształt...
-
Nowoczesne metody diagnostyki zakażeń dermatofitowych
PublicationGrzyby należące do rodzajów Microsporum, Trichophyton i Epidermophyton są główną przyczyną powierzchownych zakażeń grzybiczych. Klasyczna identyfikacja gatunkowa czynnika etiologicznego tych grzybic oparta na obserwacjach mikro- i makroskopowych możliwa jest dopiero po uzyskaniu czystej hodowli dermatofitów. W związku z powolnym tempem wzrostu jest ona możliwa po dwóch, trzech tygodniach po pobrania próbki. Molekularne metody diagnostyczne...
-
Białko DraD uropatogennych szczepów Escherichia coli Dr+ - mechanizm transportu na powierzchnię komórki i rola w procesie polimeryzacji struktur fimbrialnych
Publication -
Rozdział 6. Epidemiologia molekularna - nowe metody typowania diagnostycznego mikroorganizmów = Molecular epidemiology new methods for diagnostic typing of microorganismus
PublicationMolekularne metody diagnostyczne oparte o analizę kwasów nukleinowych dają nowe możliwości laboratoriom w szybkim wykrywaniu i różnicowaniu mikroorganizmów patogennych. W pracy przedstawiono panujące tendencje w zastosowaniach metod typowania genetycznego znaczących klinicznie mikroorganizmów w Europie, a także omówiono niektóre techniki stosowane w laboratoriach mikrobiologicznych, z uwzględnieniem ich zdolności aplikacyjnych,...
-
Benzonaza(R): możliwości praktycznych zastosowań.
PublicationBenzonaza znajduje zastosowanie w efektywnym obniżaniu lepkości i usuwaniu kwasów nukleinowych z roztworów białkowych. Zbadano w praktyce jej możliwości aplikacyjne w oczyszczaniu białek rekombinantowych wiążących jednoniciowe DNA (ang. SSB - single stranded DNA binding protein).
-
Adaptowana do zimna esteraza Pseudoalteromonas sp. 643A - produkcja w systemach ekspresyjnych Escherichia coli, oczyszczanie i charakterystyka
Publication -
An MTA-phosphorylase gene discovered in the metagenomic library derived from Antarctic top soil during screening for lipolytic active clones confers strong pink fluorescence in the presence of rhodamine B.
PublicationIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichiacoli using the pUC19 vector and environmental DNA directly isolated fromAntarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. Unexpectedly, the screeningon agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one unusual pinkfluorescent clone (PINKuv) out of 85 000 clones. This clone harbored a plasmid,pPINKuv, which has an insert of 8317 bp that...
-
Optimised five-hour multiplex PCR test for the detection of Tinea ungium: performance in a routine PCR laboratory
PublicationWe recently published the development of a 5-hour multiplex PCR test for the detection of dermatophyte nail infection. We have optimized this test by inclusion of an inhibition control and evaluated the test in a routine laboratory when compared to the conventional microscopy and culture. A total of 109 clinical samples received at the mycology reference lab at Statens Serum Institute were included. The samples were divided equally...
-
Structure of EstA esterase from psychrotrophic Pseudoalteromonas sp. 643A covalently inhibited by monoethylphosphonate.
PublicationThe crystal structure of the esterase EstA from the cold-adapted bacteriumPseudoalteromonas sp. 643A was determined in a covalently inhibited form at aresolution of 1.35 A˚. The enzyme has a typical SGNH hydrolase structureconsisting of a single domain containing a five-stranded beta-sheet, with threehelices at the convex side and two helices at the concave side of the sheet, and isornamented with a couple of very short helices...
-
GRA2 and ROP1 recombinant antigens as potential markers for detection of Toxoplasma gondii-specific immunoglobulin G in humans with acute toxoplasmosis.
PublicationArtykuł przedstawia oszacowanie przydatności w serodiagnostyce toksoplazmozy dwóch rekombinatowych białek antygenowych GRA2 i ROP1 Toxoplasma gondii. Białka rekombinantowe otrzymano z wykorzystaniem bardzo wydajnego, bakteryjnego systemu ekspresyjnego, który pozwolił na otrzymanie miligramowych ilości antygenów z 1 litra hodowli po zastosowaniu jednoetapowego oczyszczania metodą chromatografii metalopowinowactwa. Użyteczność diagnostyczna...
-
A new B-D-galactosidase with a low temperature optimum isolated from the Antarctic Arthrobacter sp. 20B: gene cloning, purification and characterization.
PublicationA psychrotrophic bacterium producing a coldadaptedB-galactosidase upon growth at low temperatureswas classiWed as Arthrobacter sp. 20B. A genomic DNAlibrary of strain 20B introduced into Escherichia coliTOP10F' and screening on X-Gal (5-bromo-4-chloro-3-indolyl-B-D-galactopyranoside)-containing agar plates ledto the isolation of B-galactosidase gene. The B-galactosidasegene (bgaS) encoding a protein of 1,053 amino acids,with a...
-
Badania epidemiologiczne populacji kobiet gminy Przodkowo w kierunku toksoplazmozy
PublicationW pracy przedstawiono badania dotyczące rozpowszechnienia toksoplazmozy wśród grupy kobiet w wieku 12-81 lat zamieszkujących teren typowej wiejskiej gminy Przodkowo w województwie pomorskim. Analizowano częstość występowania specyficznych przeciwciał IgG i IgM anty-Toxoplasma gondii oraz awidność przeciwciał IgG w tej grupie społecznej.
-
Szczepionki DNA i antygeny rekombinantowe w prewencji zarażeń Toxoplasma gondii - aktualny stan badań
PublicationToksoplazmoza wywoływana przez wewnątrzkomórkowego pasożyta Toxoplasma gondii jest jedną z najbardziej rozpowszechnionych odzwierzęcych chorób na świecie o bardzo dużym znaczeniu medycznym. Stanowi ponadto bardzo poważny problem weterynaryjny, ponieważ jest główną przyczyną strat reprodukcyjnych w hodowli zwierząt (głównie owiec). Z tego względu bardzo ważne są prace dotyczące konstrukcji i opracowania nowych, skutecznych i tanich...
-
Identification and molecular modeling of a novel lipase from an Antarctic soil metagenomic library.
PublicationIn this work, we present the construction of a metagenomic library in Escherichia coli using pUC19 vector and environmental DNA directly isolated from Antarctic topsoil and screened for lipolytic enzymes. The screening on agar supplemented with olive oil and rhodamine B revealed one clone with lipolytic activity (Lip1) out of 11,000 E. coli clones. This clone harbored a plasmid, pLip1, which has an insert of 4722 bp that has been...