Filtry
wszystkich: 1103
-
Katalog
- Publikacje 904 wyników po odfiltrowaniu
- Czasopisma 14 wyników po odfiltrowaniu
- Konferencje 1 wyników po odfiltrowaniu
- Osoby 26 wyników po odfiltrowaniu
- Wynalazki 11 wyników po odfiltrowaniu
- Projekty 11 wyników po odfiltrowaniu
- Laboratoria 1 wyników po odfiltrowaniu
- Zespoły Badawcze 2 wyników po odfiltrowaniu
- Kursy Online 23 wyników po odfiltrowaniu
- Wydarzenia 2 wyników po odfiltrowaniu
- Dane Badawcze 108 wyników po odfiltrowaniu
wyświetlamy 1000 najlepszych wyników Pomoc
Wyniki wyszukiwania dla: LS DYNA
-
The immune responses of sheep after DNA immunization with Toxoplasma gondii MAG1 antigen - with and without co-expression of ovine interleukin 6
PublikacjaW niniejszej pracy porównano odpowiedź immunologiczną owiec, którym podano domięśniowo plazmid DNA zawierający gen kodujący białko macierzy cyst tkankowych (MAG1) Toxoplasma gondii - pojedynczo bądź z DNA plazmidu kodującego owczą interleukinę 6 (IL-6). Dzięki wykorzystaniu plazmidu zawierającego gen mag1 odnotowano podwyższony poziom przeciwciał IgG1 oraz IgG2 w surowicach szczepionych zwierząt.
-
Evaluation of immune responses in sheep induced by DNA immunization with genes encoding GRA1, GRA4, GRA6 and GRA7 antigens of Toxoplasma gondii
PublikacjaW niniejszej pracy oszacowano odpowiedź immunologiczną owiec szczepionych domięśniowo szczepionkami DNA zawierającymi geny kodujące cztery antygeny granul o dużej gęstości (GAR1, GRA4, GRA6 oraz GRA7) Toxoplasma gondii. Wykazano, iż wykorzystanie DNA plazmidu pGRA7 indukuje znaczący poziom przeciwciał IgG-2 anty-GRA7 oraz IFN-gammma, podczas gdy iniekcja pGRA1, pGRA4 oraz pGRA6 stymuluje odpowiedź przeciwciał IgG1 z ograniczoną...
-
Numeryczna analiza wpływu budowy podpory mostu na rzece Wiśle na przepływ i rozmycie dna koryta rzeki
PublikacjaW artykule opisano wyniki hydraulicznej analizy wpływu jednego z filarów mostu w Kwidzynie na zmianę pola prędkości przepływu i warunków transportu rumowiska w rzece Wiśle, powodujących lokalne rozmywanie dna koryta rzeki w rejonie filara zlokalizowanego w nurcie rzeki. Bezpośrednią przyczyną podjęcia badań były zaobserwowane podczas budowy mostu lokalne rozmycia dna w sąsiedztwie podpory nr 24.
-
DNA-damaging imidazoacridinone C-1311 induces autophagy followed by irreversible growth arrest and senescence in human lung cancer cells
PublikacjaImidazoacridinone 5-diethylaminoethylamino-8-hydroxyimidazoacridinone (C-1311) is an antitumor inhibitor of topoisomerase II and FMS-like tyrosine kinase 3 receptor. In this study, we describe the unique sequence of cellular responses to C-1311 in human non-small cell lung cancer (NSCLC) cell lines, A549 and H460. In A549 cells, C-1311 (IC80 = 0.08 µM) induced G1 and G2/M arrests, whereas H460 cells (IC80 = 0.051 µM) accumulated...
-
UV-induced electron transfer between triethylamine and 5-bromo-2′-deoxyuridine. A puzzle concerning the photochemical debromination of labeled DNA
Publikacja5-Bromo-2'-deoxyuridine (BrdU) photosensitizes DNA to strand break formation. However, this type of photodamage is completely quenched by the presence of triethylamine (TEA) which originates from RP-HPLC purification commonly employed by oligonucleotide providers. While the presence of TEA in oligonucleotide samples does not interfere with PCR or other molecular biology applications, the mechanism of photochemical reaction proceeding...
-
Molecular dynamics simulations reveal the balance of forces governing the formation of a guanine tetrad—a common structural unit of G-quadruplex DNA
PublikacjaG-quadruplexes (G4) are nucleic acid conformations of guanine-rich sequences, in which guanines are arranged in the square-planar G-tetrads, stacked on one another. G4 motifs form in vivo and are implicated in regulation of such processes as gene expression and chromosome maintenance. The structure and stability of various G4 topologies were determined experimentally; however, the driving forces for their formation are not fully...
-
One-tube cell lysis and DNA extraction procedure for PCR based detection of Mycobacterium ulcerans in aquatic insects, molluscs and fish.
PublikacjaMycobacterium ulcerans jest bakterią wywołującą choroby skóry u ludzi i zwierząt. W trakcie prowadzonych badań opracowano prostą w wykonaniu metodę ekstrakcji DNA Mycobacterium ulcerans z próbek środowiskowych oraz klinicznych. Opracowana metoda izolacji DNA może być przydatna w badaniu źródeł infekcji oraz dróg szerzenia się Mycobacterium ulcerans.
-
Induction of unique structural changes in guanine-rich DNA regions by the triazoloacridone C-1305, a topoisomerase II inhibitor with antitumor activities.
PublikacjaCelem pracy było scharakteryzowanie odziaływania związku C-1305 z DNA w porównaniu do innych inhibitorów topoizomerazy II. Badania pokazują, że C-1305 odziaływuje preferencyjnie z parami CG, interkaluje do DNA i zaburza sąsiednie otoczenie w bardzo charakterystyczny sposób, który nie został zaobserwowany u pozostałych 22 badanych związków.
-
Identification and characterization of single-stranded-DNA-binding proteins from Thermus thermophilus and Thermus aquaticus - new arrangement of binding domains
PublikacjaOkreślono molekularne właściwości białek SSB-podobnych z Thermus thermophi-lus i T. aquaticus. Zbadano aktywność białek oraz termostabilność. Ponadto, dowiedziono homodimeryczność obu białek i ustalono minimalną sekwencję wiążącą ssDNA.
-
In vitro affinity of Deinococcus radiodurans MutS towards mismatched DNA exceeds that of its orthologues from Escherichia coli and Thermus thermophilus
PublikacjaThe mismatch binding protein MutS is responsible for the recognition of mispaired and unpaired bases, which is the initial step in DNA repair. Among the MutS proteins most extensively studied in vitro are those derived from Thermus thermophilus, Thermus aquaticus and Escherichia coli. Here, we present the first report on the in vitro examination of DNA mismatch binding activity of MutS protein from Deinococcus radiodurans and confront...
-
Modulation of immune response to Toxoplasma gondii in sheep by immunization with a DNA vaccine encoding ROP1 antigen as a fusion protein with ovine CD154
PublikacjaNiniejszy artykuł prezentuje porównanie skuteczności działania w immunizacji owiec dwóch antytoksoplazmozowych szczepionek DNA: kodującej białko ROP1 Toxoplasma gondii oraz kodującej w/w antygen i owczą cząsteczkę CD154 lokalizowaną na powierzchni aktywowanych komórek T. Otrzymane wyniki badań pokazały, iż domięśniowe podanie szczepionki DNA zawierającej gen kodujący ROP1 i CD154 znacząco wzmacnia odpowiedź immunologiczną szczepionych...
-
The extended version of restriction analysis approach for the examination of the ability of low-molecular-weight compounds to modify DNA in a cell-free system
PublikacjaOne of the primary requirements in toxicology is the assessment of ability of chemicals to induce DNA covalent modification. There are several well-established methods used for this purpose such as 32P-Postlabeling or HPLC-MS. However, all of these approaches have difficult to overcome limitations, which prevents their use in genotoxin screening. Here, we describe the simple protocol exploiting specificity of restriction enzymes...
-
Changes in Epigenetic Patterns Related to DNA Replication in Vicia faba Root Meristem Cells under Cadmium-Induced Stress Conditions
PublikacjaExperiments on Vicia faba root meristem cells exposed to 150 µM cadmium chloride (CdCl2) were undertaken to analyse epigenetic changes, mainly with respect to DNA replication stress. Histone modifications examined by means of immunofluorescence labeling included: (1) acetylation of histone H3 on lysine 56 (H3K56Ac), involved in transcription, S phase, and response to DNA damage during DNA biosynthesis; (2) dimethylation of histone...
-
Why do G-quadruplexes dimerize through the 5’-ends? Driving forces for G4 DNA dimerization examined in atomic detail
PublikacjaG-quadruplexes (G4) are secondary structures formed by guanine-rich nucleic acid sequences and shown to exist in living cells where they participate in regulation of gene expression and chromosome maintenance. G-quadruplexes with solvent-exposed guanine tetrads show the tendency to associate together through cofacial stacking, which may be important for packaging of G4-forming sequences and allows for the design of higher-order...
-
ArchBGal32cB 441Glu mutein gene analysis dataset
Dane Badawcze -
The influence of G2 arrest abrogation on the long-term cytotoxicity of different genotoxic lesions
PublikacjaJak się uważa, zdolność komórek nowotworowych z uszkodzeniami DNA do zatrzymywania progresji w cyklu komórkowym w fazie G2 wydłuża czas na reperację tych uszkodzeń i zwiększa zdolność do przeżycia tych komórek. W pracy badaliśmy wpływ skrócenia bloku w fazie G2 w komórkach dwóch typów białaczek, poddanych działaniu związków przeciwnowotworowych indukujących różne typy uszkodzeń DNA, na efekt cytotoksyczny tych związków. Zwiększenie...
-
System for characterisation and multidimensional imaging of seafloor using multibeam sonar data
PublikacjaMultibeam sonars are widely used in applications like high resolution bathymetry measurements, underwater object detection and imaging, etc. Also, they are the promising tool in seafloor characterisation and classification, having several advantages over conventional single beam echosounders. The proposed approach to seafloor classification relies on the combined use of three different techniques. In each of them, a set of descriptors...
-
Andrzej Dyka dr hab. inż.
Osoby -
Synthesis and photoelectrochemical behaviour of hydrogenated titania nanotubes modified with conducting polymer infiltrated by redox active network
PublikacjaIn this work, we show preparation of ordered inorganic-organic composite electrode material where hydrogenated titania nanotubes H-TiO2 with tubularly developed surface modified with poly(3,4-ethylenedioxythiophene) matrix permeated by Prussian Blue (PB) inorganic redox network in order to reach highly photoactive heterojunction. The polymer deposition was realized via two subsequent processes covering: i) potentiostatic polymerization...
-
Analytical calculations of scattering lengths for a class of long-range potentials of interest for atomic physics
PublikacjaWe derive two equivalent analytical expressions for an $l$th partial-wave scattering length $a_{l}$ for central potentials with long-range tails of the form % \begin{math} \displaystyle V(r)=-\frac{\hbar^{2}}{2m}\frac{Br^{n-4}}{(r^{n-2}+R^{n-2})^{2}} -\frac{\hbar^{2}}{2m}\frac{C}{r^{2}(r^{n-2}+R^{n-2})}, \end{math} % ($r\geqslant r_{s}$, $R>0$). % For $C=0$, this family of potentials reduces to the Lenz potentials discussed in...
-
Discovery and characterization of RecA protein of thermophilic bacterium Thermus thermophilus MAT72 phage Tt72 that increases specificity of a PCR-based DNA amplification
Publikacja -
Urinary Measurement of Epigenetic DNA Modifications: A Non-Invasive Assessment of the Whole-Body Epigenetic Status in Healthy Subjects and Colorectal Cancer Patients
Publikacja -
Indukcja procesu pseudostarzenia komórkowego przez inhibitory DNA topoizomerazy II i jego rola w oporności na leki przeciwnowotworowe
Publikacja -
New Polymethoxyflavones from Hottonia palustris Evoke DNA Biosynthesis-Inhibitory Activity in An Oral Squamous Carcinoma (SCC-25) Cell Line
Publikacja -
The changes of antioxidant defense system caused by quercetin administration do not lead to DNA damage and apoptosis in the spleen and bone marrow cells of rats
Publikacja -
Combination of ABT-737 and resveratrol enhances DNA damage and apoptosis in human T-cell acute lymphoblastic leukemia MOLT-4 cells
Publikacja -
Molecular Characterization of a DNA Polymerase from Thermus thermophilus MAT72 Phage vB_Tt72: A Novel Type-A Family Enzyme with Strong Proofreading Activity
Publikacja -
Dual inhibition of PI3K/Akt signaling and the DNA damage checkpoint in p53-deficient cells with strong survival signaling: implications for cancer therapy
PublikacjaOporność komórek nowotworowych na leki uszkadzjące DNA związana jest ściśle ze zdolnością do utrzymywania blok z fazie G2 cyklu komórkowego. Blok ten regulowany jest przez mechanizmy punktu kontrolnego G2/M oraz szlaki przeżycia komórkowego. W pracy badaliśmy rolę szlaku kinazy PI3K/Akt w funkcjonowaniu punktu kontrolnego cyklu komórkowego i wpływ na przeżycie komórek traktowanych lekiem przeciwnowotworowym - cisplatyną. Nasze...
-
Novel anticancer strategy aimed at targeting shelterin complexes by the induction of structural changes in telomeric DNA: hitting two birds with one stone.
PublikacjaThe ends of chromosomes in mammals are composed of telomeric DNA containing TTAGGG repeats, which bind specific proteins called shelterins. This telomeric DNA together with shelterins form a cap that protects the ends of chromosomes from being recognized as sites of DNA damage and from chromosomal fusions. Many very successful antitumor drugs used in the treatment of cancer patients bind to DNA, some of them with a prominent sequence...
-
A New Double Digestion Ligation Mediated Suppression PCR Method for Simultaneous Bacteria DNA-Typing and Confirmation of Species: An Acinetobacter sp. Model
PublikacjaWe have designed a new ddLMS PCR (double digestion Ligation Mediated Suppression PCR) method based on restriction site polymorphism upstream from the specific target sequence for the simultaneous identification and differentiation of bacterial strains. The ddLMS PCR combines a simple PCR used for species or genus identification and the LM PCR strategy for strain differentiation. The bacterial identification is confirmed in the...
-
Characterization of a single-stranded DNA-binding-like Protein from Nanoarchaeum equitans - a nucleic acid binding protein with broad substrate specificity
PublikacjaBackground SSB (single-stranded DNA-binding) proteins play an essential role in all living cells and viruses, as they are involved in processes connected with ssDNA metabolism. There has recently been an increasing interest in SSBs, since they can be applied in molecular biology techniques and analytical methods. Nanoarchaeum equitans, the only known representative of Archaea phylum Nanoarchaeota, is a hyperthermophilic, nanosized,...
-
Osiadanie dużych grup palowych, obliczenia i pomiary terenowe.
PublikacjaPrzedstawiono charakterystykę nowoczesnej metody obliczania osiadań grup palowych. Wyniki obliczeń porównano z wynikami pomiarów geodezyjnych osiadań dla 4 obiektów, odpowiednio dla 50, 83, 264 oraz 437 sztuk pali
-
Osiadanie pali i fundamentów palowych.
PublikacjaPrzedstawiono metody obliczeń pali pojedynczych oraz pali w grupie. Omówiono metody klasyczne oraz metody nowoczesne, uwzględniające parametry geotechniczne dla małych i dużych odkształceń.
-
Applications of Chebyszehev minimax deconvolution filtering to the estimation of deterended data
PublikacjaW pracy wyznaczono empirycznie, że sygnał wyjściowy rozplotowego filtru względem nieparzystej pary impulsów Kroneckera , z użyciem minimaksowej normy Czebyszewa, jest bardzo "bliski" pozbawionemu trendu sygnałowi wejściowemu. Obliczenia dla znacząco dużej liczby rzeczywistych danych z rynków kapitałowych i walutowych wykazały, że średnia miara rzeczonej "bliskości" , określona definicją znormalizowanego w L2 współczynnika kowariancji,...
-
Searching for in vitro biomarkers of susceptibility to prostate and cervical cancers by analysis of chromosomal instability, γ-H2AX foci, polymorphisms in DNA repair genes and apoptosis
Publikacja -
Author Correction: Decreased integrity of exercise-induced plasma cell free nuclear DNA – negative association with the increased oxidants production by circulating phagocytes
Publikacja -
High efficiency protocol of DNA extraction from Micromys minutus mandibles from owl pellets: a tool for molecular research of cryptic mammal species
Publikacja -
In vivo evidence of ascorbate involvement in the generation of epigenetic DNA modifications in leukocytes from patients with colorectal carcinoma, benign adenoma and inflammatory bowel disease
Publikacja -
Intercalation complex of imidazoacridinone C-1311, a potential anticancer drug, with DNA helix d(CGATCG)2: stereostructural studies by 2D NMR spectroscopy.
PublikacjaImidazoacridinone C-1311 (Symadex®) is a powerful antitumor agent, which successfully made its way through the Phase I clinical trials and has been recommended for Phase II few a years ago. It has been shown experimentally that during the initial stage of its action C-1311 forms a relatively stable intercalation complex with DNA, yet it has shown no base-sequence specificity while binding to DNA. In this paper, the d(CGATCG)2:C-1311...
-
Exploring novel Cd(ii) complexes with 5-methyl-4-imidazolecarboxaldehyde: synthesis, structure, computational insights, and affinity to DNA through switchSense methodology
PublikacjaA series of four Cd(II) complexes with 5-methyl-4-imidazolecarboxaldehyde (L) with different inorganic anions within or outside the coordination sphere of general formula: [CdCl2 L2 ] (1), [CdBr2 L 2] (2), [CdI2L 2] (3), and [CdL4 ](PF6 )2 ·3H2 O (4) was synthesized through one-step and two-step reactions, respectively. All complexes were obtained as colorless crystals without the need for recrystallization and exhibited solubi- lity...
-
The Product of Matrix Metalloproteinase Cleavage of Doxorubicin Conjugate for Anticancer Drug Delivery: Calorimetric, Spectroscopic, and Molecular Dynamics Studies on Peptide–Doxorubicin Binding to DNA
PublikacjaMatrix metalloproteinases (MMPs) are extracellular matrix degradation factors, promoting cancer progression. Hence, they could provide an enzyme-assisted delivery of doxorubicin (DOX) in cancer treatment. In the current study, the intercalation process of DOX and tetrapeptide-DOX, the product of the MMPs' cleavage of carrier-linked DOX, into dsDNA was investigated using stationary and time-resolved fluorescence spectroscopy, UV-Vis...
-
Intramolecular Proton Transfer in the Radical Anion of Cytidine Monophosphate Sheds Light on the Sensitivities of Dry vs Wet DNA to Electron Attachment-Induced Damage
PublikacjaSingle-strand breaks (SSBs) induced via electron attachment were previously observed in dry DNA under ultrahigh vacuum (UHV), while hydrated electrons were found not able to induce this DNA damage in an aqueous solution. To explain these findings, crossed electron-molecular beam (CEMB) and anion photoelectron spectroscopy (aPES) experiments coupled to density functional theory (DFT) modeling were used to demonstrate the fundamental...
-
Implementing Virtual Engineering Objects (VEO) with the Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS)
PublikacjaThis paper illustrates the idea of Virtual Engineering Object (VEO) powered by Set of Experience Knowledge Structure (SOEKS) and Decisional DNA (DDNA). A VEO is the knowledge representation of an engineering object, having embodiment of all its associated knowledge and experience within it. Moreover, VEO is a specialization of Cyber-Physical System (CPS) in terms of that its extension in knowledge gathering and reuse, whereas CPS...
-
DEPO: A dynamic energy‐performance optimizer tool for automatic power capping for energy efficient high‐performance computing
PublikacjaIn the article we propose an automatic power capping software tool DEPO that allows one to perform runtime optimization of performance and energy related metrics. For an assumed application model with an initialization phase followed by a running phase with uniform compute and memory intensity, the tool performs automatic tuning engaging one of the two exploration algorithms—linear search (LS) and golden section search (GSS), finds...
-
Wiązanie się do DNA oraz jego międzyłańcuchowe sieciowanie DNA przez tria-zoloakrydony i aktynomycynę D.**2003, 125 s. 35 rys. 10 tab. bibliogr. 202 poz. maszyn. Rozprawa doktorska /03.07.2003/ P. Gdań. Wydz. Chem. Promotor: prof. dr hab. inż. J. Konopa.
Publikacja.
-
Rynkowe podstawy przedsiębiorczości 2020
Kursy OnlineCelem przedmiotu jest uzyskanie przez Studenta wiedzy w zakresie kierowania firmą hi-tech we wszystkich aspektach jej działalności, ze szczególnym uwzględnieniem zagadnień marketingu.
-
Zarządzanie przedsiębiorstwem 2020
Kursy OnlineCelem przedmiotu jest dostarczenie studentowi wiedzy z zakresu psychologii, filozofii, etyki i podstaw makroekonomii niezbędnej do zarządzania organizacjami ludzkimi.
-
Minimum inhibitory concentrations (MICs) determination of selected human topoisomerase II alpha and bacterial DNA gyrase inhibitors against fungal strains
Dane BadawczeThe datasets contain the results of determining the MIC (Minimal Inhibitory Concentration) value of known compounds* (inhibitors of human topoisomerase II alpha and bacterial DNA gyrase) against C. albicans SC5314, C. glabrata ATCC 90030, C. krusei ATCC 6258 and C. parapsilosis ATCC 22019 and Saccharomyces cerevisiae ATCC 9763 by the modified M27-A3...
-
Effect of antitumor compounds on the yeast topoisomerase II relaxation activity
Dane BadawczeThe datasets contain results of antitumor compounds* (known inhibitors of human topoisomerase alpha II) inhibitory activity against yeast topoisomerase II. DNA topoisomerases (Topo) are enzymes that catalyze changes in the spatial structure of DNA and play an important role in replication, transcription and recombination. Beyond their normal functions,...
-
Application of potential theory in calculating wave-induced vertical forces on horizontal cylinders near a plane boundary
PublikacjaHydrodynamiczne obciażenia wywołane falowaniem morskim działajace na poziomo ułożoną przy dnie rurę, rozpatrywane są w ujęciu dyfrakcyjnym przy założeniu istnienia funkcji potencjału. Potencjał zdefiniowano jako superpozycję potencjału fali inicjującej oraz potencjału perturbacji spowodowanej istnieniem obiektu przy dnie. Wyniki rozwiązań teoretycznych porównano z wynikami doswiadczeń przeprowadzonych w Wielkim Kanale falowym w...